Lag0031348 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTTGGGCATTATTGGCAGTTCGTTTAGGAGCAATGGGAGTTTGATTTTGAATGGTTTTTCAAGATCATCAGTGCATGAAGAAGACGAGGAGGCTCTGAAATGGGCAGCCATTGAAAAGCTTCCAACTTTCAGACGTTTGAGGAAAGGGTTGATGATTAATTTGGATGGTAAAGCCAATGAAGTGGATGTTCTCAATCTTGGCTTTCAAGACAGGAAGAATTTGATTGAGAAGTTGGTTAAAGTTGCTGAAGAGGATAACGAGAAGTTCTTGTTGAAGCTGCAAAATCGCCTCGATAGGTAAATTCCCCGTTTTCGTTAAAGAAAAATTACAAATTTAGACCCCGTTTGATAATCATTTGGGCCCCGTTTGATAACCATTTCGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTGAAAATTAAGCTTATACACACCTACTTTCACCCATAAGTTTCTTTGTTTTATAACCAATCTTTTCCCTTGTTTTCAAAAATCAAGTCCAATTTTGAAAACAAAAAAAAAAAAAAGTAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTAGAATTTGACTAGGAATTCAAATGGATCTTTAACAAGGATCAAAGCCATGGTAGGAAATTTAGGAGAAAACAAGCATAATTTTCAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAATGGTTATCAAACGGGGCCTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAGGCTTGTTTCCTTTTAAATTTCTTCATGATGGTTTTCATTTTTGTTAAAGACACACTTGAATTCCTAACCAAATTCTAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAAACTACTTTTTTTAGTTTTAAAAAATTGGTGGTTTTTGAAAACATGGGAAGAAAGTAGGTGAAAAACCAAAGAAACTTAGAGTTGGAAATAGTGTTTATAAGCTTAAAAACCAAAAACCAAAAACCAAAAACAAAAAACCAAATGGTTATCAAACAGGGCCTTAGTTCACCAACTTTTAAGACCTGTGTTTTAACAATTCATACTTCTGAAGTTTTTTTTTCTTTGATTTGCACCTCTTTACCTTGAAAAATTTTTAGGTGTTCCTGGGATAGTTTTTGCACCGTTGGATGTAAGAGAGAAATGATAAAAGTACCTCGATTTTGTATCCAACGGTTATTAGGGGTTAGACAAATTTGAAGATTTACCTCCAATGATTTTAAAGAGTGAGCTTGATTGCATCGAAAATGTCTAATAGTATGTCCTCCACCTCTTGGTTGAGAAACAAAGCAGATTACTGCTATGAACTATACTCACTTTAGCTATACTCTCCAACTTATTTGATTGAGTTGTTGTAAAATGTTTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAATCTCTACAAAAGTTATTAGGATATTTTTTTCTATGTTAAGATTTAATGAAGGTTGATAGGGTCATTGAATTTTTTATTGAGTATTTAATAATAAGTTGAAATTTAAAGAATGTCTAATAAGTGAGAGAACTATCATATACATAAAGTTTAAAGTTCGTAAATTTACTGGACGTCCATTGAAAGTTTAAGAATAATTAGACATTTCTTAAAGATTAAACATTTATTAGCTATAATTATTCTCTAAATGCGTTTATGGACTAAATTTATAATTTAACATTTTTTCCTGAAATGTTGTTTATTTGATCGCGATCTTTTTCATGTATGTTTCTTAAAACTTTCAGAGTCGGAATCGAACTTCCAACGATCGAGGTTCGTTTCGAGCATTTGAACGTCGAAGCAGATGCTTATGTGGGAAGTAGAGCTTTGCCAACCATTCTCAATTTTACACTCAATATGTTGGAGGTAACATTTTGATTGATGAATTGATAACTTTCTTCTTCATTCCATGTGATTGTTTTTTGTTTTTCTGATGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTACAAAAGGGTTTCTTGGGTTACTTTCATATGTTTTCCAGTCGAAAGAAGCAGTTAAAAATCCTTCATAATGTCAGTGGAATCGTCAAGCCTGGAAGGTAACAAGAGAAAAATAAAAAAAAAAAAGAGAAAAATAAAAAGTTCCATTTTTTTTAATAATTATTTAGGTTCATTCCATGATAATTCTAGTTTATTTTTCTGTTATTTTTTTAAAGTTAAAAATCTTTTTTCTTTTTTAAAACATCAATAATTGGGGGTGGGATTTGAAACCTCATGGTCGAGGGTACATGTCAATTTCACCAAACTATGCTCGCTTTGTCAAAAATTAAAAAGCTTAAAATATCTTCTCATACCGTCAAGTTTTTTACTTTTTTAAAAAATATTTTTGAAACTCTGACCAAATTTAAAAAGAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAACGTTTTTGAAAGTTAGCTATGATTTTAAAAATGTTTTTGAAATTAAATTGCTAGAATATTAAACAAAGGAAGAAGTTGGTAAATAAGTGCTATCTTTAAAAACCAAAAACCAAAATATTAGGCTCCACTTCCTAACTATTTTAGGTCCCGTTTGATAACCATCTTGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTAAAAATTAAGCCTATAAGCACTACTTCCACTACTAAGTTTCTTTGTTTTGTTCTCTACAATCTTCCCATGTTTTAAAAAACCAACTCAAGTTTTGAAAACTAAAAAAAGTAGTTTCCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGACTAGTAATTCAAATGTGTCATTATCAATGATGAAAACAATGGTAAGAAATTTGGGGTGAAATTGTCAGAAATAACCTATTTAAGTTTTGGGTTTTCAAAAATGACCTCTTTGTAAAAAACTTGTTTTTTTAACCTAGCTAATAAAACCCATGAATGTAAATTTACAGCAATGCCCTTGAATCTAAAAGGTCAAAAAAAACAACGAGCCATTTGTTCTTCTTCTTCGTAAAAGTAAAACCCATTCCTTCTTATTTTTTTTTTTTTTAAAAAAACCCATTCTCTCCGCACTCCTTTCTTCTCTTCTAAATCTTCCCATCCGTTCTTCTCCCCTTAAAACCTCAACCCTCCTCCTTCTTCTCCTTAGCAACGCTCGAACGACGCCTTCGTGGGTTTCATTGTGCATCTGACGGCTACTTGCATTTCAAACAACGCTTCCGGCAGCTTCTTCGTTTCGTCTTCTTGCGACAGTTGCCCATTATTAATTGAAGTTTTTCCATCCATCAAAATTGCTCTAAAATACAAGAGTATTGATTTCTATAAAAAGTTAAAAAAAGGGAGTAAACAAGAAGAAAAAGAAGGAATGAAGAGCAAAGGAAGGAAGAGGAAGAAGAAAGAAGAAATGGAGAAAAAAAATCAAAAAATCAAAAAATCAAAAAAATCGTGGCAGCTTGCTGCCTTTTGTCCCGGTCACGTTCCTGACAGGGACAATAGGCAGTTTACTGCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTAATTTAATTTTAATTTAAATGTTAATATTTAATATTTAATATTAACATTTTTTCTTTATTTCTTATTATTATTGTTCTTTCTTACTTAATTCCTTCTTCTATATATATCCAACATTAATATAATTTTTAAAAAATGTGGAATTGGTAAAAAAATTGTTTTCGACATTTTTGAAAAAATTTTTGGTCGATTTTCGACCAATAAATCTCGATCGAGAACTGATCTTATGTTTTGTGTCCAATATTAATATAATTTTAAAAAAATGATGAAATTGGTCATAAAAAAAATTTCAAAAAAAAATGTTTTCAAAATTTTTTGGTTAAATTCAAAATTTTTGAAAAAATTATCGGTCGATTTCCTGACCAAGATTTCTTGGTTGTCCTGACCAAGAAATCCCGGTCGGAAAATGATGAATCCCGACCGGAAAATTATGAATCCATGGGATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTCCAGATTTTCATAAAAGTTTGTTATACAAACTCCTTGCTATCTAAACCATGTAATACATACATATTTAAAAAATGTTGACAATATGAAAATTTTGATGTGGATCCACCCGTGTTTTGACGATTTCCTTTAGAATATTGTGGGTAAAAAACCATGTTAAGATTTTTGGAATTAGTTTTAAATGGTTCTTAGGTGAAATTAGTTGGTTGAAATTTAATTCATCAATGAAGATTGAAGAAGGACAAAAAAAAACTTTTCACAATGTGGGTCCCAAAAAAAAGTAGCAAACTTTCTAGAGAATGGGTAAAAAAAAAACAAGTTTTTTAAAAAGTAGGTTAATTTTGAAAATCCAAAACCTATTTAGGTCAAAATTGACAATTTCCCAAATTTTGGAGAAAACAAGCTTAGGGTCTGTTTGGTTGGTGATCTGAAAACAAGAATTTGAAAACAAGGGATTCAATGAAAACAGAGTTGTATTTCATGTTTTCAGATTTGTGTTTGGTAGCAGATTCAGAAATTGGATCTGAATTTTAATAATGGTTCAAAATGTGTTTGATAATATATTTATAAGCCATAAGTTATTTGTAGTTATCAACTAAATACTAAGTTGAATATAAAATATTATGAATTAATTTATAAAAGTGTTATGTATTATAAATTTATTATTATTATTTTAGAATATCATATAATTTATAATACATTATATTATACAAATTTTAATTTCGCAAAAATAATTTGAGTTTATAACATGAAATACTATATTTATTAAAGTTTTTATTTTTTTAAAATTAATTCTGCATTTAAAAATTTGAAATTCAAAATCTGGATACAACGAAAACATTAAAAAGTTGTTTTCAGAATTTCCATTATTTGGATCACAGAATCCGGAAACAGTTTTCAGAAACACGTTTGCCAAACACATATTCACTAATTTCAGTGAATCTGAAAACATAAAACAGAATCCGGATTGCTTACCGAACAGGCCCTTAATTTTCAAAAACAAAAAACCAAATGGTTATCAAACGTGGCCTTAGTTTTTGATTTTTTGTTTTTGAAAATTAGGGTTTGTTTTCTTCTAATTTTTCCTTATCATGAGTT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BLAST of Lag0031348 vs. NCBI nr
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BLAST of Lag0031348 vs. NCBI nr
Match: KAG7036489.1 (Pleiotropic drug resistance protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1132.1 bits (2927), Expect = 0.0e+00 Identity = 571/627 (91.07%), Postives = 597/627 (95.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. NCBI nr
Match: XP_023524614.1 (pleiotropic drug resistance protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1124.8 bits (2908), Expect = 0.0e+00 Identity = 569/627 (90.75%), Postives = 594/627 (94.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. NCBI nr
Match: XP_022997879.1 (pleiotropic drug resistance protein 1-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1123.6 bits (2905), Expect = 0.0e+00 Identity = 567/627 (90.43%), Postives = 594/627 (94.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. NCBI nr
Match: XP_038878862.1 (LOW QUALITY PROTEIN: pleiotropic drug resistance protein 1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1117.4 bits (2889), Expect = 0.0e+00 Identity = 568/634 (89.59%), Postives = 600/634 (94.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q76CU2 (Pleiotropic drug resistance protein 1 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=PDR1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 937.2 bits (2421), Expect = 1.1e-271 Identity = 463/620 (74.68%), Postives = 541/620 (87.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q949G3 (Pleiotropic drug resistance protein 1 OS=Nicotiana plumbaginifolia OX=4092 GN=PDR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 919.5 bits (2375), Expect = 2.3e-266 Identity = 456/620 (73.55%), Postives = 533/620 (85.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: H6WS93 (Pleiotropic drug resistance protein 1 OS=Petunia axillaris OX=33119 GN=PDR1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 914.1 bits (2361), Expect = 9.9e-265 Identity = 439/607 (72.32%), Postives = 532/607 (87.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: H6WS94 (Pleiotropic drug resistance protein 1 OS=Petunia hybrida OX=4102 GN=PDR1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 913.7 bits (2360), Expect = 1.3e-264 Identity = 438/607 (72.16%), Postives = 532/607 (87.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O24367 (Pleiotropic drug resistance protein TUR2 OS=Spirodela polyrhiza OX=29656 GN=TUR2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 865.9 bits (2236), Expect = 3.1e-250 Identity = 426/607 (70.18%), Postives = 513/607 (84.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GAN7 (pleiotropic drug resistance protein 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452288 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/627 (91.23%), Postives = 598/627 (95.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KCS8 (pleiotropic drug resistance protein 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492704 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1123.6 bits (2905), Expect = 0.0e+00 Identity = 567/627 (90.43%), Postives = 594/627 (94.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L875 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G550680 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1112.1 bits (2875), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/630 (89.84%), Postives = 593/630 (94.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DJH2 (pleiotropic drug resistance protein 1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1095.9 bits (2833), Expect = 0.0e+00 Identity = 552/628 (87.90%), Postives = 591/628 (94.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GTK6 (pleiotropic drug resistance protein 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457414 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1084.3 bits (2803), Expect = 0.0e+00 Identity = 546/627 (87.08%), Postives = 583/627 (92.98%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. TAIR 10
Match: AT1G15520.1 (pleiotropic drug resistance 12 ) HSP 1 Score: 864.8 bits (2233), Expect = 4.9e-251 Identity = 426/609 (69.95%), Postives = 510/609 (83.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. TAIR 10
Match: AT2G36380.1 (pleiotropic drug resistance 6 ) HSP 1 Score: 788.1 bits (2034), Expect = 5.8e-228 Identity = 384/611 (62.85%), Postives = 481/611 (78.72%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. TAIR 10
Match: AT1G66950.1 (pleiotropic drug resistance 11 ) HSP 1 Score: 785.8 bits (2028), Expect = 2.9e-227 Identity = 384/611 (62.85%), Postives = 480/611 (78.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. TAIR 10
Match: AT1G59870.1 (ABC-2 and Plant PDR ABC-type transporter family protein ) HSP 1 Score: 760.4 bits (1962), Expect = 1.3e-219 Identity = 374/630 (59.37%), Postives = 489/630 (77.62%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0031348 vs. TAIR 10
Match: AT1G15210.1 (pleiotropic drug resistance 7 ) HSP 1 Score: 757.7 bits (1955), Expect = 8.4e-219 Identity = 374/613 (61.01%), Postives = 478/613 (77.98%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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