Lag0030297 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0030297
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr8: 46225696 .. 46232750 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0030297
SyntenyLag0030297
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAGGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAATAAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCACACCGGCTTCGATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAGAATAGAGAATATAGAATAGTGTTTAAAGGATAGAATTCGGGATCCCCTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTACTAATCCTCCTAGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCAGCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACAAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGCAGGCGGTCGGGCCAAAAACCTGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTGCGAGCGGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTGCGAGCGGGCCGAGTAGGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTCCCGCCTGTCGGCTCCGCCTCCTTGGCTCGTATCCCAACCCGATTTCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTCGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCTTATAACACACTCCAACTTTATATCGTTGATTCTTTTTAACAATACGTGGGGTGGAGGATTTGAAACACCAACATCTTTGTACAAGTTTTATGTCAGTTGAATTATATTCAGGTTGATTTTATATTTTCAATTATATGTACGTATAGCAATATTACCATTTATTTAGATAAACAACAACAAAAAAACACATTACAAGCATATATCTTGAGAATAAAGTATTTGAAAAGGGCGATGTTGACATGGAGTAATAAAACCATAGTTTGTTTTGTCTTCCTCTTTTGATCGACTAGAGAGGTAAGATTCATTTAATATTGGGGGACTCAATAAATTCGATGTCACTAATTTTCCTTAAAAGAAAAGGTTTACTTTTGAACATTCAAATAACTAGAGTGCTCTTGATGTGCCTTACCCAGGTTAAAAAAATATATATATATTAGGTCATGTTTGATAACTATTTGATTTTTGAAAATTAAGTCTATAAACACTACTTCCACCTACAAATTTCTTTGTTTTCCTAATACATTCTTTCCATGTTTTCAAAAACCAAGCCAAATTTTTAAGACTAAAAAAAGTAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGGCTAGGAATTTAAATGTGCCTTTGACAAAGATTAAAACCATGGTAGGAAAATTGGGAGAAAACAAGTTTAATTTTCAAAAACCAAAAACAAAAAATGAAATAGTTATCAAACGGGTCCTCAACTTTTCATTATTATTTATTAAAAAAACTATTGAGTTAAAGTTGGAGGATTTAGAAACACATGATCTTATGTTAACATATTTTATTTGATATTTTTTAAAAAAATTTATGGTATCTTGATAATTTAGAATGAATCCACTTCCTTATTAGCCATGTAAAATTGCAAAAGATGATAAGTCCATGTGTATTTATCCACCGATTTTATGATGGTGATGAAAGTATTAAAACTATGCTGACTTATAGATAAAATGTCATGTATAAAACCAATTAGCTTGTGTTTTGCTATTGACTTAAGGGGGGGAAAAATAATGTAAAAAATGAAAAATCAAAATTATTTTTGTTGTGTAGTGTAGCTCAAATCTATCATTTGTAAAAGTAAAGTATAGTAATGTGATTATTTGAATCATTGAGATTAATCTTGTTGATGTGACTTTACACATTCTTTTATATATATATATTTAAAGTTTGCAAGAATTCTGTAATCTGTATATAGGGTATTTTTAAACTTCATTGGTAGATATATTAATGTTTTGGATATTTTGATAGTTAGGTTTTGTTTTGCATGAAAAAGGAAAGTTAATATTTAGATAGCATAAACTCTATGAAAATGGCTTTTGCAAAAAAGAATATATATAAATTATAAATAAATGTAATCTCAATAATATATATAAATTATAAATAAATGTAATCTCAATAATAATATTGTTTTTTTTTTCTTTAACCAAATTAAACCAATAGAATCTAACTCTATAAATTAAATTAATTCCATGTGTTAGATTGGTCGAGTTAATTTAATATTTTATTATAAATTACATATTAGATTATACTAGTTTAAACTTAAGATCTTGATTGAAACTAATTAAAATTTGTATCAAATGCTAGAATGTTCAATTTTAGAAGAATTTTACTTTAATCAATGTAATTGAATGTAAATTTAATTGATACATCAATTCAACCTAATTGCCTTTTAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATGATAAGATTGTTTTTGGAAGAATTCTACTTTAATCAATGTTTTCAGCCGTAAATTTAATAGACAAATAAATTCAACTTAGTTAAAAATTTTCAAATGGAAGAAAGTCTAGTTTTAGAAGAATTCTTCTTTAATCAAATTCATTAAATCCAAATTGAAATATACAACTTTGATTTTTTTTTAGAAGAAATATACAAATTTGATGGAATATATATAATTATAAAGACGCCATTAAAAAAGAAAAAAGAAAGTCATAGTACATTTAATGTCATTAAATGTACATGAAAATTCAAATCTAAAAATGTTGTCTCAATTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACGTTGTCTCAAGGTTGAATTACCAAACATTTTTTTTTTCTATTTTCAATTTTGATCTTTAATTTTTTACATTAGTTTATTTTTAATATATTGAAAATTCTCAATTAAGTCATTCCATAAACAAATTATTAAATTAAATTTTACCAGTAGAAAACTAATGCATTGTTAACTTATTACTTTATTAGCATATTGAGACATGAGACCATATTACTCGAACATATCAACTTTGGAAGAAGTTAAATATGTTGAATGGTAAGTCAAATTTTGATGATGGATCAATTGTGTTTTTTTTTTCATTCTTTCTTTCCGTTTTCATTTGTTTGTTTTTTTTTTATGTTAATATATGAAAGGATGATGTTAATTAACTTAATGTGTGTTAAGTAGCATCTGAATAGCATGTTGGCATGTTCAACAAGTTAAATATTAAAAACGTTTAGAGAAAAAACTTAATTGAGATTTTTTTTATTACATCAAGAATGAAATAGAGAATTTCATAGCATGAAAAATCAATTTGATATTTATTGGAGACCATTTAATATACCTGGTCATTTTTTTTTTAACAAATATACCTGGTCATTATATTTGGAAAGTTTTTAAAGAGATAGAATATATATGTACAAAATATTATGGACGAAAATAGTTATTTTTGAAATTTCATATTAAAATATTATAAAGTTAAAAGTAGAAAAAAGAAATAAATTAAAGTATGAATATAAACTCAAGAGAAAATGGAACAAAAGAAAGACACCCTTCTTTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATTTCAACCATGTCCTCAATATAAAATATAGCAAAATTCAAACCCACCCTTCAACTTCATTTCAATCAAACTCTCAAACTATAAAATTCTTACTATCAACCCAAATTCTTTATATTCATTTTTTATCTTAAATCAAGAAGGTAACTCAAAACCCTTTCCAAATGGTCAATATTACCATTTTCAAATTTTATAGAGTTTAGAAAAAAGATTAATTAAATTATAACAATTTCATAGTTCGAAAATTTAATGATACCATATCTATAGTTGAGGACTAGTTGGTGCATTTTACAATAATTAAGATGTTAAATTTAAAATTTCGTTTGATGTAATTTAGAAGGCTAATCTACAAAATTGCAATTTTCTAAAAAACCTAAAAATCTAAATTTGAGGAAGTATAGTAGCATTGGAGAAGGAAGGAGTCGAAATTGAATTTAATATAATTTTCAGATGTTCAGTGCAGAACTATAAAGACTGTGACTGTGAGAGAGGCAGAGGCATCAACATCACCATCATAACCCATTCTTGTCGCCACATTTACACTATTCTTTTCTTTTCTTTCATTTTATTTCCCTTTTCTCCATATTCCTTTGTTTTCTTTGGGGCCCTTCCTTCCTACTCCCATCTTTAATTATTTTCAATCTTTAGGGTCACCCTCCAAAAGGGAGTCCTAAATTTTCAATCCTAGTGAAGTCTTTTAATTTTGTGTTTAATAGATCGTCCTTGACATAATTATCATTTATGCTATTAAAGTATGAAGATTTTGCATGACATGAGAAGTAAATACATGTTAGCTAATGTAGGTGTTGATGCCAAAATTTGGCCAAGGGACTCACCTGACCTCCACGTGCCACCAACGGTAAATTTGTAGATGAAGGGGAAGACGTGGTCTGCAAGACAGTAAACCTGCGCACCGGTGTGGTGCTCGCCACACTGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAGCAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAGAGAGTAGAGAATGTAAAAAATAGCGTTTAGGGATAGAATCTCCCCCCTTCTTCAGTGGTGAAGTGGGGTATCAATACATGTTCATCCTCCTAGCGTTTTTAGGGTTTCAGAGGCATTTTCGGTCAAACCAGGCAACCCCGGGGCAGAGGGAAGCAGTGGGGACCTAACGGCACCAGACGGGCTCGGCCCGCGAGGCCGAGCACGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCCCACTTACCGGTTTTGCTCCTTGGTCCATCTCTCAGCCCGATTTCTCCTCGGTTGCCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACAGTAGGTAGATCTTGTAGGGTACAATAAATCATAGCTGGTACGAGAAACGTAGTGGATGGAAAAATGATTGGAGAGACTAGTTAATCATCCAAAAGAAGAGCAATAGGGGAATGCTGAGTCATCAGGTGTCGAATTCTAAGTTTCGAACCATGGACCTAGAGCATTACAATATGAAC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mRNA sequence

ATGAGGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAATAAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCACACCGGCTTCGATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTACTAATCCTCCTAGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCAGCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACAAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGCAGGCGGTCGGGCCAAAAACCTGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTGCGAGCGGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTGCGAGCGGGCCGAGTAGGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTCCCGCCTGTCGGCTCCGCCTCCTTGGCTCGTATCCCAACCCGATTTCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTCATGAAGGGGAAGACGTGGTCTGCAAGACAGTAAACCTGCGCACCGGTGTGGTGCTCGCCACACTGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAGCAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGGTTTCAGAGGCATTTTCGGTCAAACCAGGCAACCCCGGGGCAGAGGGAAGCAGTGGGGACCTAACGGCACCAGACGGGCTCGGCCCGCGAGGCCGAGCACGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCCCACTTACCGGTTTTGCTCCTTGGTCCATCTCTCAGCCCGATTTCTCCTCGGTTGCCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACAGTAGGCGTGGCTACCGGAATAATAGGAACCGTTTTCCGGAATGTTTTTTGACGTTTTTACCCCTGGTCACGATTTTGTTTGGTGGTGTCTGGAGTGCTGGGGTATTTACAGTGATTTCAAGTCCGGAAGCGTGGATGTTAGAATTGATTCGAGTCTCCAAGAGTTTAAAGTATGTCTGGCGAAATACCTTCAGCTCCAGGACGAAGAAGAAAGGGTTGAGCATGCAATACGTGTTCGTCGGCGTACCGGATGAAGGTCGCGGGGACGGCAGGGGGGGCGTCGACGTGATGCGAGAGGTAGTAAATATGCAGATGGACAAGAATGTTGTTCCTGATCAATGGAGTTCAGAGGTGTTTCTCTCTACTGACGGGGTGGTTGAACTTTGTACTCATTGTCCGACAAGATGGACAGGAATGTTGTTCCCGATCAACATTGCAGCAGATGTGTCATAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAATAAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCACACCGGCTTCGATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTACTAATCCTCCTAGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCAGCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACAAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGCAGGCGGTCGGGCCAAAAACCTGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTGCGAGCGGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTGCGAGCGGGCCGAGTAGGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCAGCCTTGGCCCGTCCCGCCTGTCGGCTCCGCCTCCTTGGCTCGTATCCCAACCCGATTTCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTCATGAAGGGGAAGACGTGGTCTGCAAGACAGTAAACCTGCGCACCGGTGTGGTGCTCGCCACACTGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAGCAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGGTTTCAGAGGCATTTTCGGTCAAACCAGGCAACCCCGGGGCAGAGGGAAGCAGTGGGGACCTAACGGCACCAGACGGGCTCGGCCCGCGAGGCCGAGCACGGGGTCGGGCCAAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCCCACTTACCGGTTTTGCTCCTTGGTCCATCTCTCAGCCCGATTTCTCCTCGGTTGCCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACAGTAGGCGTGGCTACCGGAATAATAGGAACCGTTTTCCGGAATGTTTTTTGACGTTTTTACCCCTGGTCACGATTTTGTTTGGTGGTGTCTGGAGTGCTGGGGTATTTACAGTGATTTCAAGTCCGGAAGCGTGGATGTTAGAATTGATTCGAGTCTCCAAGAGTTTAAAGTATGTCTGGCGAAATACCTTCAGCTCCAGGACGAAGAAGAAAGGGTTGAGCATGCAATACGTGTTCGTCGGCGTACCGGATGAAGGTCGCGGGGACGGCAGGGGGGGCGTCGACGTGATGCGAGAGGTAGTAAATATGCAGATGGACAAGAATGTTGTTCCTGATCAATGGAGTTCAGAGGTGTTTCTCTCTACTGACGGGGTGGTTGAACTTTGTACTCATTGTCCGACAAGATGGACAGGAATGTTGTTCCCGATCAACATTGCAGCAGATGTGTCATAA

Protein sequence

MRGEDVACKTINLHTGVVLATPAHRLRCLSQQTERGEEGYKYLLILLGFLGIRRRFRSNQAKPGQPEAVGTRQDRTGSARASGPSRRSGQKPDPFSLGPCERAEQGVGPKTRPLQPWPVRAGRVGGRAKNPTPSALARPACRLRLLGSYPNPISPRLSSSAPHEGEDVVCKTVNLRTGVVLATLAPMLKSASRTVGSGKGFRGIFGQTRQPRGRGKQWGPNGTRRARPARPSTGSGQKPDPFGLGPSHLPVLLLGPSLSPISPRLPSSAPCISGWSKIAYNSRRGYRNNRNRFPECFLTFLPLVTILFGGVWSAGVFTVISSPEAWMLELIRVSKSLKYVWRNTFSSRTKKKGLSMQYVFVGVPDEGRGDGRGGVDVMREVVNMQMDKNVVPDQWSSEVFLSTDGVVELCTHCPTRWTGMLFPINIAADVS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 198..241
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 58..136

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0030297.1Lag0030297.1mRNA