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Lag0028612 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAGAGAAAGGAGGAGGGAGGACTCCTTCCTCCGTTTTCCGGCGCCGAAACGGAGGGAGGAGGTCCCTCCCTCCCTCCCCGTTACAGATCTCTAATGGGGAGGGAGGGAGGGACCTCCTCCCTCCGTTCCGGCGCCGGAAAACGGAGGAGGGAGTCCTCCCTCCTCCTTTCTCTTTCATTTACAAAAAAAAAGTTGTTGAAACTTTGAGGAAGGAGAGGAAGAAGAGAAGAAGAAGGAAGAAAGAAAGAAAGGGAAAAAAAAAAACTTTAGCCGCCGGCAAGCGGCGGCCGGCGACGGCATGTGGGCGGCGCGACCATCGAAGGTTTGAAGAAGAAGATGGAGGGGATGAGGGAAGAGGATGAAGAAGAAGAGATGGAGGGTTGAGTTTTAAGAATAATTAAAATAATAATATTTTTATTTATTTTTATTTGTTTTTATTTTAAAATAAAAAAATAATTTTTTTTATTAAAATAATAGTGCCACGTCAGCCACCGTTAGTATTTAACAGAAAAATAGACGGCAGGGACCAAAGTGCTCCTTATTTCAAAACTCAGGGGTATTTTTGTTGAGTTTGAAAACTCAGGGACCAAACTGTCACTTAACCCAAACCTCAGGGACCAAAAATGTATTTTTCCCTATAATATAATATAAAAATAATATTATCATTGTAAATAATTATAATATATATAATATATAATTTTTTAAGAAATAAATAACGGGGACTCGAAAAGGATCCCCAGCTTGACCCCCATGCCCGATCAAACTAGAGTACGAATTTTTGCCATCCTTACATGTGAGGGTGGTGGAATTCAAACGAAAGACCTTTTGGTCATCAGTACAGGTTTTATGCCACTTGATGCTCATGTTGACAATATAAGATTGAGTTTTGTTTGTGTATAAAGTAAGTTTAAATTTTTGTTTAGAATTTATGATTTTTTTTAGAATGAAATAATTTTATTGTTAAGATTTATGGTTTTTCATTGTGTATAATCGATGCAAGTTCAAATCTAATTACAATTTGAATATAAATTCTCCTATAAATTGTGCATCTCCTTTAATTGGTTTTTCGGTCTAAAATTGGTCATCTTCTCTCATTTTTCATTGTGTTTCAGGTACATTTTTTTAAAATTTTTTTTGTTAGCCCCCTATTTTTTTTATAAAGAAAATGACCAATATGTCAAGTGAATAATATAATGTCATTTACTAATTTGTGAATGGGCGAGAGTTTGTAAATGTTAGAACATAATTTTATGATCTAATTACATTTTATTATGCAAACTACATAAATGCCTCTAATACATAAGAATGTGATTACTTGCTTGATTGATCCTTGAAAATGTGTATTTTTTTTTTAATTTTAATTTTTTATTGATGTAAATGGACTTATACTCATTAATGTAATGATATAGAGATTTGTTATCATAGGAAAAAAATACACTTTTGGTCCCTGAAGTTTGAGTTAGGTTTCATTTTGGTCCCTGAGTTTTCAAACTGACATTTTAGTCCTGGGGTTTGAATTTCGTTTCATTTTGGTCCCTCCATCCATTTTTCCTTTAATTTGTTTTAATATCTATTTTGATTTTGTTGTTATACTGACGAGACTTGTCGAAGGTCCAAATCAAAGCAAATTTATAATCCACGAACATTAAACTACTTGCAGTAGTAGTGGCCGGGGGTCGATCACAGGAAGTGGCGGTTGGTTATTTATTTCCTATTTATTTTGAGTTGTGAAAGATGTAAATGGGGGGATTGGAAAATTGGATAAATGAACGTGTAAGGAATTTAAAATACAAGAATTTAAATGACAGAAAATTAAAAGGGACAAAGAATAAAAATAAGCAGGAACCATAAACAAACGAGAAAATTAATTAAATTAGGCGACACCGATTGGAGAGATTATTGGGGTTGAATGACTTACTTTGATCATTGCCTTCCTTCCTCATTAAGGCTAAGTTAAATTGCTTAATTGCCCAATCGATCTAATCTGAACACAGAAAAGACCCAAAGCCCACCTAAGCCATCTAACCCGATCATACAACGTCCATCGAATTAGACTCTAATTGACTAATTAATTAATCTGATTAGACTACCAAATCAAATAATCAACCAATTGCCTTAAGTCTAGTGGATTGATTAGGACATTAGAAATAATTAGGCCTAGATTACTTCTAACGTTATTTTGGATCCTAGACTTATCATGTCAAGTAACAAAGTCAGAGTCTGCTCTTGGGACCCGTGCCCACGAATCAGTCTATGCGCTAACTATTAAACCAATATTCCATTAGCTACTTGGAAATCAATTTCTTAGCAAGTTATTAACATACAAACTGCGAGTTAAGGCGCCAATCTAACCTACTGCACATGCAAATAATACGAACTAAATCCAAAATACAATTGCAATATGGATTTAAATACAGAATCAGAACATGAAACTCGCAAAGAAATACATTTATAACCCAATAATCATCCAATCAGCATCAACGAGTTTAGACGGCGGTTAAGCCGACTAAAACCCGCGACCCTACGCTACAATAACAAGAAAATACAAAGAAAATCAATAAGAAAACTTACACCTCTTAATTCTGGTCTTGAGGGACAGAGAGAACGGAGAGAGAGACTAAAAACAAACCTTAAAAACTCTCTTCTTTGGCGGAAAATAAAAGAGGGAATTTATAGAAAATTTTATAGGGGTGTCGAGGCATGGCGTCTCGACGTCGTGCCGTATGGGTCTAGGGGTTTGAAACGTGCCAGTGTCGAGACGCTGGCCACGGCGTCTCGACGCTTGGCCTTTTTCCAACGTGCTTTGACTTCAATCTTCTTTGTTTCTTGCTCGATTCAGGTCTCGAACCTTTGATTCCTTGGAACCGTTCTTCGGGCTCGTCACGATCCTCACGGTCTTCTCACCTTCTCGAGATCCATGGCCCTCAAGTAAGCTCGAAAACTCTCTAAATTGCCCGAATTAACTTCAATTTGTTTAGTTCGTCCCTGATGCCCTCAATGCACAAATAATCTACAAAACAGACAAATAAAGAGTAAAGTGCACCCTAACAAGTCTAGATTAACAACAAATAAATAGGAAAAATTAGGTCCTATCATATACTCTTAAAATTTTAAAGTGAATTACAAAAACTATCTAAGACGTAACAATTACTACAGTTACATTAAGATTTTAATGGTGAAAATTAAACTCTCATATTTATACTAGTGGTAAAATTGAGTTTGTTGTTTCCACGAGAAAAAAATTCATCGAGAAGTTTCATATGAAGCTTGTATCTTAAGAAATGACTCTCTCTACCATACTTCATTTTTGAAAAGTTTCTTTTTTTATTTCTAACAAACTCATCCCCTACAAAAATCTCTCTACCTCTAACAAGAGTTTCTCTTAATTAAAAAAAGAAAAAGGAAAAAAGTCCCCCCCGCCCCAAAAAAAAAGTTTTAGACAACTTTAAAATAAGCCGAGTCATGTTCAAGTTGGTTTCTTCTTTATTTTGATTGCATATTTGGCTATTTACATAAGACTTAGATGTCTAACCATTCAGTTTCTAATTTAGGCACTTAACACTTGCAATGGATAAAAGTTGGATAAATTTTAAAGATCGAGGTGTAGTCAATATTCAAATGGTGTTGATAACTTTATTGAAGTTGCTAAGGGGCATTTAGGTGAAGAAGGAAGAACAAGATGTCCTTGTTCAAACTGTTAGAATAAACTAGATGAGATAGATTGTCTTTTATTTAAATATGACATGTTTACGACTTATAGTCGATGGATATTCCATGGAGATAAGGTGGACATTTCTCCCTTTTTAAGACCCAATTCAAGGTTTCTTAGTGCTACATCTTTAGATTCAGTTGATGGGAATCTAAGAGCAGATGTCAGAGTTAGAAAAATTGTGGATGATGAGATGCTCGAAATGATGGATGATTTGCATGGTCCAATGTTTGAAAACATTACTAGGGAATCAAATGTGCAAGATGAGACAAATAGATTTAGCCGAATGTTTCATGAAGTAGAAGAAGGGTTATAAGCCCAAGATGTCTAAAGTTCACTTCATTTAATTTTTTGGTCAAACTTATGCACATTAATTGAGGTGCTTAATCGTTGGAGCGATAAATCATGTGATATGTTACTAGAATTATTATGACTTTCCAAATGGTGTAAGGTTACCAACCTCATACTAAAAAGCAAAGAAAAGACTAAGGGTGTGTTTGGGTTGCCAGTGTCTGAAGCCCGTGTTCTTAAGCTCGCTGAAGTCCGTGTTTGGGCGGCCATTTTTCGAAGCCCGTGTTTGGAAATCAGACTTCAATAGTGCCAACTATTGAAATCGCCCCGATTCTCTCTCCGTCTGTCTAGATCGCTCCCCCTGTTTCTCTTCATTGTCTTTGATTCTCTCTGCCTCTTCGTTACTCTCAAATGTGCCTTCTTATCTCTTTGGATCTTCATTTCTCTAAGGTCCCATGCCGCTTCAACTTCCCCTCGCTTCATCCTCCTCGTTTCCGTCAATAGGTTCGTGGATCTAATGTTTTTTGGTTTTATTTTCTTGTTGTTGACCTAACCCGACACCCTCCCCTCTCTTCATCCTCTTCGAACCCTAGATCTATCTTCCCTTTGTTCATCCTCTTCGAAACCTTAGATCTAACTTCCATTTTTCATCCTCTTTGAAACCTTAGATCGATCTTCCCTTTCTTCATCCTCTTCGAAACCTTAGATCTATTACCAGATCTAAATGCTTATTGATTTTTTATGTTTCAGATCCCCACCCAATGTCGCTTCAACTTGTCGCGTCCGTCGACATTCCTTCAACGATATTAGGCTGGGTCTGCATGGTAGGTTATTGAAGCACGGTGAGGGGTGGGAAACAGGTAAGATCTCTTCTCCCTAGTAGCTGGCCGATGATGAATAAATGCATGCAAGCATGTTTTGATTTTTTTGGTTTCCTCTAAAATTTCCTTTTTTCTGATTTAGGTGTTCAAACGCTGATGACTAAACGCA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MKEKGGGRTPSSVFRRRNGGRRSLPPSPLQISNGEGGRDLLPPFRRRKTEEGVLPPPFSFIYKKKVVETLRKERKKRRRRKKERKGKKKTLAAGKRRPATACGRRDHRRSRTFDSLEPFFGLVTILTVFSPSRDPWPSIDGNLRADVRVRKIVDDEMLEMMDDLHGPMFENITRESNVQDETNRFSRMFHEVEEGSHAASTSPRFILLVSVNRSPPNVASTCRVRRHSFNDIRLGLHGRLLKHGEGWETVEVIECSRREKMQRKEKNQMEKKSKFGQKVASVLTLALRRLNASIPYSDRREIVAVSRRCDLSVSTLPLHSLHLFQVLIFIAEQSHPKRFSQSISLMFVGAAISISLPFSISSARPIEQYENSTSPCHIHLALSSLSSSLAWLIYLSSKNRVVSSSSARSSIRKNRAWFGISPTASWVDIGVRRIPITRTALGLNAHKLGAWFAWYQLELTRVIFLQGLILFDGALKDSNLFQVVDLVAELESKFGFGAFQAFRGSFFLFFRSALHLGYKWPRGDAQFEALGINGQGSNAELRREHCGPGYKWSGDSVTQRISLGEPSVNKFVE Homology
BLAST of Lag0028612 vs. NCBI nr
Match: KAA0041118.1 (Transposon, En/Spm-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 8.4e-09 Identity = 45/117 (38.46%), Postives = 66/117 (56.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. NCBI nr
Match: TYK21912.1 (Transposon, En/Spm-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 8.4e-09 Identity = 45/118 (38.14%), Postives = 67/118 (56.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. NCBI nr
Match: KAA0051654.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold60G00190 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 7.1e-08 Identity = 44/105 (41.90%), Postives = 60/105 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. NCBI nr
Match: TYK01933.1 (hypothetical protein E5676_scaffold808G00210 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 2.1e-07 Identity = 32/55 (58.18%), Postives = 42/55 (76.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. NCBI nr
Match: KAA0066411.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold21G004890 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 2.7e-07 Identity = 32/53 (60.38%), Postives = 41/53 (77.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TDS5 (Transposon, En/Spm-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold128G00230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 4.0e-09 Identity = 45/117 (38.46%), Postives = 66/117 (56.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DE88 (Transposon, En/Spm-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold494G00520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 4.0e-09 Identity = 45/118 (38.14%), Postives = 67/118 (56.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U8K6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold60G00190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 3.4e-08 Identity = 44/105 (41.90%), Postives = 60/105 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BQH1 (DUF4218 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold808G00210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 1.0e-07 Identity = 32/55 (58.18%), Postives = 42/55 (76.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028612 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CUR8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold45G00090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 1.3e-07 Identity = 32/53 (60.38%), Postives = 40/53 (75.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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