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Lag0028590 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTATGACATGATCTCCAAACGCCCGAAAACTATTCTTGTTCCATTGCACAAACCATTAGATGGGTCTAAATTTTGTAGCAATGTAATTGGACAATTCACCTTCAACGTTAATTTATGTGGAGGTACTCCATTTGGCAATAATGTATTAAAAATTCTTCTTGATAATAATTGTTTATATCATCTATTGCTTGATCAAACTAAAGAATTCCTGTTTTCTCCTGGAAAAGATCTATCAATATTCCATTTAATTGATCGACTTGGTCATTTATTGTTGCAAGAATTGCCCGATTTGTGACAATCATTTGATTGTGCTTGATTTTGTAGATCGGAGTAAATATTATTGATCAACTCTTGTATTCCATTGTTTCCAAAGTTACGTATCAGTATTTCCTTCGGCAATTGTATGAAGTCATCTTCTATATGCGGTTCATCTCCATTTCCAACTCTTAATAAGAAGTCTGCAAAACGTAAATATTTTTTTCCCTCATATTTGTTTGTAATTATATCTTATGCATTTCATTCCATAGATAAGATCTACTCAAGCTAGCAACAACCGTTTGTTCTCTTGTAGCTTTGGGAAGCATTGGAAGAACTTGACGAAAATTAGCTTCGAAGACAAATATCTTTCCACCAAATGGTTTTGAAGAATCCATTAAATCTCGAAATGTTCTATCAACAGTCTCAATTGTATGTTTTTTAGCCATTGGTGTTTCATCCCATATTATTAGTTTTGCCATATGAAGCAATTCAGCACTTGAACTCTGCTTTGATATACTGCACAAATTGTTTCATTTTGTTTGCAAAGGTATTTTGAATCTTGAATGTGTCGTTCGACCGCCAGACATAATTCCACCAGCTACACCTGATGTTGCGGTTGCTAAAGCTATCATACCTTTTGACCTTATAGTTGTTAAAGCTGCACGATATAAAAAGGTTTTACTTGTTCCACCAGGTCCATCAATGAAACACATTCCTCTTTCATCATTATTTATTTTTTCCATAATTTTGTCAAATGAAAACCTTTGACGTTCATTCAAGATAAAGGATGCTTGAAGGTCTTCTTCTCTTATTTCAATTGATTTCTCTTCTATGATTTCTCTAGATGAATTCATGTCTTCTAAAGAGTTATTCTGTTGTAGCATTGACATGTCAAAATATTTAATGTTCGTTCCCATAGATTCTAAAAAGAAATCGATATCTTTCAATATCATTTGCAGTTTATCTGACGAAGACATTTGAATGTGCTTGTCAAAATCTTGTGACATGGTTTCATAATAAGTATTTCACAACTTTCTAACTTCAGTAGGCTCACAATAGACCAATAAGGCTGCAAAAAGCTGTCTAAATGTGTATGGCATTTCATAAACTACAGCTTCATCTAAGCATTCAAGGATGCTTTGATCTTATTCAAGCAACCCTCGTTTTAAAGCTGATTCTTTAAATGTAGAATATTTGATTCCTTCAACAGTCATCAAATGTTTAAAAGATTGAGGCCCTCTGACATGATTCCGTAAAACGCGTAGATAATATTGCTCTCCTTTAGATGGATTTGCTCCATTAATTCTTGAAATTACTTCTCCTCTTTTTCGAGGTGACCATTTCTTTATTCTTTAGTCCCATACATAATGCTCAGGAAATTCTTTATAAAGAAGAGTCCTTGAATTTTCATTATTTGTACACATGTCAAAGTATTCCGTCAACATTGTTCTCGATGTACCTTCCATCTAAACAACTTCCTTCAGATTTTGATTGTCCTAATATGAGACATATTGTTGATTTGGTAAATGTAGTTGTAAGTTTATAACAGGTGCAGATATCTCATTTAATCTAAAATCGTAAATTCTCCACGATGCTTCTTGTGCTGAAATCCATCTTGCATCTTGAAAATTCCGTATTTCGTTGATTATTGTCTCTTCCTCATCGCTGGTTATGGAAGCTGCTGCTTTATCATGACCTTTGTAGATAAATTTCTATAAATACTTGACAACCTTGATAGTAGAACAAATTTCAACATTTATATGACAATTATATCTTGTAAGGAGATATGAATTATAAGGAGCTACCCATTGATTGTTCAAGGTTGCATTCCTAACATTTATCTGTGAATTTAAGATAAAAAAAATTAATAATTTATTTAAATTTTAATTGGATGTAAAAATATAATTTGAATATGGAAAATATCAAGTTTAATCTAAATATGAAACATACATGTATGCCATTATTTCTCCTTCGATATATTGGATATAAATCTTTTCCTTGTATCGTCTTTGCAGAAAATGGTCTTGGATAGTGAAATCTACATGTTCCATTGATCATACATGAACTTGTGTTGTTAAAGCTTCCACATGGTCCATGTATCATATGTTTGACGACGACATCATGAAAACTAGAAGATTCATTTCTATTTGGAATTTCAGCACACACATATTTATCATATTGATTTGCATTTGTGATTTTGTATCCATTCTTAAAAATTATGAGGATGTGTGCATGTGGCAGGCCCTGCTTCTGAAATTCAATCACATAAACAAATGCAGCCACTTTTCCAAATATTTCTTTCTTAAACAATTGGTGTTTGAGATCTTGTAACTTAGCTCTGAAAACTCGTAATGTCATATCAGGCCTATCTTAAGACTGTTGACCTTCTTTAAGGTTGTCTTTGATCTACTTCCAATCTAGATTACATGTCATTAAGATGAAAAGATCTAGTTTTCCAAATTGTTGGACCAAAGCCATTGCATAAAGATATCTTTTTCGTATATGTCTTGGACCCCAATAAACGAAGCACGAAGTACAATTCTTTTTCCTACTTTATTAGCTCTCGTTTCTCCACATTTACAACGTCTACCAATCCTTGATATAGTTCAGACCTAATATGAGATTGTTGTGTCCTAAAGAAGTCTATTCTTGTTGTCTCCAACTTTATGTACATATCCACTACATATTGTTGCATCAATTATCCAATAAGAAGAATGGTCTCGATGCATTATTCCTGATTTGGAACTTAAAACAACAGTATTCTCTACATGAAATATTCCCAGACGTTTTTTTTTAGCTTTTCTGTTAATAACAAACATTTAGTATTGTTATAAAATATAAAATCAATTACTAATTAATACTAAAAATAATTAAGATATTCATACCTTGATATTCATTTTGTAGAACTTGGTGGATATCAAACGATCTCACTATGCAATTATCATTTCGTGATTTTCAATAGTATTTTTCTTTCTATTAGAATACTTATTTCTGTTTATCTGTTGGTCACAAGCCAACTCTCCCTTCGGAAACAATAATGGATATTGTAGAGAGCCATAACAACTAAAATAATGATTTATTCAATGTCGATTTCCTAAATGTTCAGTCAACACAATGTCCCTTTCAAAAGGGATGTCTCCATTGTTTCCTTCAATCCATATAGCAGCTACTTGACTAACCGTTGGTGCATTATATACTCTTTGGTCAACCTTTATATTGCTTGCAATATGAAGATGAATGTCTGTCAAGTTTGGATAGTCTTTTAGGCTTCAGAAGATTTTTTGCATATGGATTTTCATCTAGGGTGACTCTTAGTTTTGCAACAATATCTTTATCAATTTGTCCATCTTCAAATATTTCAATTCTATTGTCAATTTCATTCTCAGTGTCATAAAAATATAACTAAAAGTATCTAGGGCAATCTTGAGGAACTAAAGTAGGCAAATCATGGTAAATTTGTCCTTGTGCTCTAAAAGTGTAAACACCCTTTCTTGATGATGCTAAAGTTTTGTCCAAATTGACTCCAAATGATGTGAATGAAAAAAGACTATTGTATGCTCGAATATTTTTTTCTAAAGAATATCCCTTCTTGTGATTGAGATGTAAAAAGATGAAGTAACTGATCAGGGATCTCATTGTCTGCAAGGCGAACCTCTCCATTGTAGCAACAAAAAGTTGGTGTTTCATATTCAAACCTTTTTGCTTTGCAATGTTTGCATGGTGGAACCACTTTCAATTCATAACATATTGTTTCTTGAGGAAAAAAACATATTCCTATTTTACAATAACACAATTCATCTAATAAATATTTGTATAACTTAAATATGCTATGTTACATGATAAAATAAAATATGTATGAAAAATAAATATTCTAACCTTCACTCTGGTAGTGAGATAGGCCTTCTATTAATAAATTGTTCCTTGGATTCATTGTTTTTGGGGGAAGTTTAATTCTTTGATGAGATGACGTCTCAATTTTTTTTAATCGGTCTTCCATTGATAACTCTACATATTTTTTCCTCTTTCTTTCATTTGCTTTCATTTTTTGTAACTCTGCAATTAAAATAACCAATAGTCAGTTATCATAGAAGATTGAAATTTATCATTGTTTATTTCTATAGAATATTTTTTTATTTAATTTATCCTTGCGTGAAACACTTGTAGAACTGGTTGATGTCATTATAACTGCAATAACTTATAAGTATATCTGTACAAAACATTAAAAGAATATGATTATTATATAATTTTCTTTTATTGTAATTAAGAATAAATTTGTGATAGAGAAAAAAAATATGTTTATTTGATAGAACTTCATGCATATGTTCTTGCAGAAAAAAATCATCATCTTCACCAAGCTTATTTTGAGTTTATTTAAACCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGGAATAGAAAGAGCTTAATTTGAGTCTACTTAGAAGTTGGGAAGAAGAGAGGAGCTCAACATTGGGAAAGGCGAGCCAAACGATGAATTGAAGGCTTGGTGCTGGAATGTGGTAATTTGGGATATTTATGGAAGGGCAAATTGGTTTTATCGAAGTTCATCTAGGAAATGCATCGTTCGTTGGATTTAAAATCAATCGACGGCTGTAAAGGTCGATCCTTGTGAAAGCTCTGCGGATTGTGCTTTAGAAAGTAAATTTGTTCTATTTTAGTCCTTGAATTTTTAAAATGTCTATTTCAATTACAAATTTAGAATTCCAATTTGAAATAGTTTATTT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ATGTATGACATGATCTCCAAACGCCCGAAAACTATTCTTGTTCCATTGCACAAACCATTAGATGGGTCTAAATTTTGTAGCAATGTAATTGGACAATTCACCTTCAACGTTAATTTATGTGGAGGTATTTTGAATCTTGAATGTGTCGTTCGACCGCCAGACATAATTCCACCAGCTACACCTGATGTTGCGGTTGCTAAAGCTATCATACCTTTTGACCTTATAGTTGTTAAAGCTGCACGATATAAAAAGGTTTTACTTGTTCCACCAGGTGCTCGGGGCGTGAAAAATAAGCAAAGGAATGAAAAGAGTAAAAAAGGAAAAAAGTCAAATCTCGGTCAACAGCAGGCTAGCGTCGAGACGCTAGCCCTTGAGCGTCTCGACGCTCACATTCCATATCAGATTAGGCGCGTAAAGCTTACAGCGTCGAGACGCTATGATAGGAAGCGTCCCGACGCTACCGTTTTTCCTTATTCAGAACGCGCGTTAAAGAGGCAGCGTCGCGACGCTGTCTTGACAGCGTCTCGACGCTAA ATGTATGACATGATCTCCAAACGCCCGAAAACTATTCTTGTTCCATTGCACAAACCATTAGATGGGTCTAAATTTTGTAGCAATGTAATTGGACAATTCACCTTCAACGTTAATTTATGTGGAGGTATTTTGAATCTTGAATGTGTCGTTCGACCGCCAGACATAATTCCACCAGCTACACCTGATGTTGCGGTTGCTAAAGCTATCATACCTTTTGACCTTATAGTTGTTAAAGCTGCACGATATAAAAAGGTTTTACTTGTTCCACCAGGTGCTCGGGGCGTGAAAAATAAGCAAAGGAATGAAAAGAGTAAAAAAGGAAAAAAGTCAAATCTCGGTCAACAGCAGGCTAGCGTCGAGACGCTAGCCCTTGAGCGTCTCGACGCTCACATTCCATATCAGATTAGGCGCGTAAAGCTTACAGCGTCGAGACGCTATGATAGGAAGCGTCCCGACGCTACCGTTTTTCCTTATTCAGAACGCGCGTTAAAGAGGCAGCGTCGCGACGCTGTCTTGACAGCGTCTCGACGCTAA MYDMISKRPKTILVPLHKPLDGSKFCSNVIGQFTFNVNLCGGILNLECVVRPPDIIPPATPDVAVAKAIIPFDLIVVKAARYKKVLLVPPGARGVKNKQRNEKSKKGKKSNLGQQQASVETLALERLDAHIPYQIRRVKLTASRRYDRKRPDATVFPYSERALKRQRRDAVLTASRR Homology
BLAST of Lag0028590 vs. NCBI nr
Match: KAA0052364.1 (putative Zinc finger, BED-type [Cucumis melo var. makuwa] >TYK09425.1 putative Zinc finger, BED-type [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 3.5e-06 Identity = 32/39 (82.05%), Postives = 34/39 (87.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028590 vs. NCBI nr
Match: KAG5532562.1 (hypothetical protein RHGRI_027004 [Rhododendron griersonianum]) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.1e-04 Identity = 35/64 (54.69%), Postives = 40/64 (62.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028590 vs. NCBI nr
Match: KAG5532560.1 (hypothetical protein RHGRI_027004 [Rhododendron griersonianum]) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.9e-04 Identity = 32/54 (59.26%), Postives = 37/54 (68.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028590 vs. NCBI nr
Match: KAG0543458.1 (hypothetical protein BDA96_02G192400 [Sorghum bicolor]) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 3.3e-04 Identity = 30/50 (60.00%), Postives = 34/50 (68.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028590 vs. NCBI nr
Match: KAG5532561.1 (hypothetical protein RHGRI_027004 [Rhododendron griersonianum] >KAG5532563.1 hypothetical protein RHGRI_027004 [Rhododendron griersonianum]) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 4.3e-04 Identity = 34/64 (53.12%), Postives = 41/64 (64.06%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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