
Lag0028372 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGGTGTATGGTTCGAAGGATCAGATCCTTACTGGTTACACCGACTCTGACTTTCAAACTGACATAGATTCACGGAAATCTACACTAGGGTCAATATTTACTCTGAATGAAGGAGCAGTAGTATGGGGAAACATTAAACAAGGATGCATCGTTGACTCCACCATGGAAGCAGAGTATGTTGCTGCATGTGAAGCAGCCAAAGTAGTAGTGTGCTAACGAAAGTTCCTGACAGACTTAGAAGTTGTTCCAAACATGAACTTGCCCATCACTTTATATTGTGATAACAGTGGGGTAGTAGCCAATTCTGAAGAGCCTCGCAGTCACAAATGAGGCAAACACATCGAGAGGAAGTATCACTTAATTCGGGAGATAGTGCAGCGTGGGGATGTAATAGTCACGAAGATCGCTTCAGAACACAACATCACTAATCCTTTTACAAAAAATCTATTGACTAAAGTGTTTGAGGGTCATCTACAAAACTTAGGTTTACAAGATATGTATATAGCATAACCTAGGGAAAGTGGGAGATGTACAAGGTATAAGAGTGCCCTAGTTTATTGTATTTGTAACATTTCCTTGCTTTGGTATTATTAAATGCATATACATTTCCGCTCACTATAGTTTTAGTGCAAGTGGGAGTTTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTAACATTTAACTTGCTTCAATGAAGTATTATTTCTATATATTTGTTTTGCCTAAAATATAACCACAAATCCATTAAACTAAGAACCCATGACTATATTATGTATACTTGAAGTTTATGTGTGACATAAGTATGGATCGAGTTCAAGTAAATAGTCTAAACGATCTATAGTATATGGATAAGGTTGGGTACCTTAATCCTGGGGATACTATTGGCGTGGCTCGCTTTGTTCTTTAAAGACAGACGATGTGATCCTAATCGTTCATGTATAAGACATGTTAGTGAGAGCGTCCTATGCAAAGAGTTTGCATAGAGATCGGACCAAGAGATAAGTCACTTTCACTTTACAACACCGTTTACTGCTGAAACTGAACATCTCATACATATAACCTAGGTAACTCGATCTTAATCCTGAGCTAACTATGAACTCATGTTTATTTAGGATTATCCTTTGATTTGCATGGGTGAGAGTGGTCAAACATCACCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGAGGATAAGACTAAATGGATAGCTGGGGACATAGCTTTGTAAGATGGAATTCACTGCTACCCGTTTTAGGGTTAGTAAAGGTTGTTCTCTTATGTGCTGACTCCGAGTCTTGAACAAAGGGGCCCCACCCTCTCATAACCTTGAGAGGGACTTGGTTCAGTGATTGTATCACGAACTAGTTGTTCATTAGAGGATCAGTGGAATTTAAGGAACAAGATGTAACTATAGGGGTAAAACGGACTTTTGACCTAGCTCTAGTTACGAACAACCGGTGAATGGTCAACTTACTAATCATGGTTATTTTATGTGGACAAGAAATATATCTACAGTGAGGGGAGTATAGCTACGGGCTATAGTGGAGTGTCCCGAAAGCTAACAAACGATGAATAACTAGGTTAATGAGATTAATCGGTTATCATCATTTCGTTGGAGCCCATGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCTCTACTAACTCAATAGGAATAAAACTTGGAACAATATGATCAGATAAAATTTGAAACGTTCAAATTCGGATAAGGATACAAAAGTCTGTTATATACAATATTTAACGACTTATTAGTTTAATTATAAATTAAAAATGAGAGTTTGATATATTTAAATATGATTTAAATATTAAACATGTGAATAAAGATTCATGTTTGAGAAATTTCGTTGGGAGAAAACCAAGATTGCACAAGTGGTATTAATTTAATCTAAGATATTAAATTAAATGATTTTATTTTAAATTAAATAAGTTTTATTTAAATTAAAATAAAATTATAATTGAGTGGGATTATTCATATTTTATATTGAAAATTAACAATTTTGAATTTAAAAGAAATTAAAAAAAAATTGGTAATTTTTGGAGGTGGTGCTTAGTGACTGATCACCTTAGATTAACCTTCTTGCACCACCTAATCCATGACTCAAATCACTCCCAAATTGTTGTCAATTTTTTGTTCAATTCTTGTGCATGATTTTCCTCTATATGTAGAGAATGAGCTGATGAAAATTAGTGTAATTCTTCAACCTAAAATGCTCCAAAATTCTCCCAAGAACTTCCATGTTCATACTCTCAAGTTTGCTTTTACCCATAAGCTTTCTTTACCAATTCCTATCAATTGAGGATCCCACAATCCGTTCCAAGGCCTGAGGATAATAAAGAAGATCCAAGTGGTTGTCCAAAAGTCATTTGTGTGAATTATAAAGCATCGAATTATATGAATTGGGAGCTCCAAGAGGTAGGTACCTTATTAATCTATTTTTGTTCTTTTGGACAACATGTCTTCTAGGATTAAATTAATCAAATTGTGTGTCTAAGATCCAAAATTGCTTCCGCATGAGTGATATTAACACCTACAGATGGAAATTTTCGGATTGTTTTAACACTAACATAAAATTTGACTTTTCAAACCGTCAAGTTTTATCTTAATTTACTTGCCACGTTTTAGATGTCAAGGATAATTTGATTTCAAATAAAATAACTTTCTCAAGCTTCTTCTTCCCCAGCATTCACAATTTTAGCCGCCCTAACTCACCATCTCACTCCTCTCACCATCTCTTTCTCCCAGCCGTGCGTGTCCCCTCCCCTCTGGCGAACAACTTCGACGACGGCGCAGCAGCAACGACGGTTCGTCGGCGTCGAGCACTCCTTCGCGCGACCAACCGCGATTTCTACATGGGTTAGTGTATTTCTCTCAGTTTTTCGCTCCTCAAGGCCTGATTCCTTTCTCTCCTTCGTTCTCTCCCTCACTCGTGATCTCCTTCTCTGTTTTCCAACATTTTTCCAGTGAGTTTCAAGCGGGGCAGTGGTTGTTTTCGCAATTTTCTGGCAGGTGCTCTGTTTAGGCGCGAACACTAGTGTTTTTGGGCATTTTTAGTGGGGTTTTTAGTGAATTTGACCTTGGGTAAGTCGGATTGAAGGTTGTATTTGTTTATTCTCATGTTTAATTGAATACCCACACACTATTAGTTCTATTCAGCAAGCTTTACCTTCAAATTTCGGCGATTCAAGCAGTGGGTCTTCAACTTTCAACGTCTTTGAGCAATTTTGGCATTGGGTAATTTTTTTACGTCAAGGATTGGGGTTGATTTTAGTGTTTATTCAAATACCCATTGATGTTACCCATTGATCTATGGTATGGTCTACCCGATCCTGGACCCTCATTTGGAGGCTTTGGCAGCAGGTGATTTTGATATTTAGTTGAAAAGATTGTCATTTTAAATTGCTTTCGTTTTAGTCACCTTATTAGATCCTCACTTCTGTAATCTTTATGCTTTGTCAAGATACTTTGATGCCAACAGAACTTCCCTATTAGATCCTCAGACTCCCAGTTCATCTGGAATTAGACAAGTTGATGCTGAAGAAAAGTCTGAACTTAGACTCGCACAGCTTCAACACCAACTTCCCTTAAACGAGCCAACTACATTAATGCATCTTTGTTGAAGATGTAGCTGGTAAGGACGATGATCAGGGTGAGGATGAAGATACTAGAGAGTGTAAGAAACTTTTTAAGAACATGAAGTTCTTCTTAAGCCGTGTGGTAAGCTTATGCTCCATTTTATACTATTGTGTTTACGTTGTTTGCATTGTTACTTAAAAAGATTTAGTTTAGTTGTGGGGAGTGAAATTTTTTGGTGAAATGTCACTGTGGGTCTGTCTCTGCTTTGAACTTGAGGTGGGAAAAAGGTATTCCAAAATCAACCTCGAGATGTTGTTCTCCATTAAGTTGTGAAAATAGCAGTGTTTTAGCATTTTGGGGTAATGAGTTTGTGGGCGATGACTTGAAAGTATCTATGACATACCAATGGCAGACATGTTAATAGGAATGTAAACCCGAGACTTTTCTTGTATCATTTCCTCTTGTATTGTCACTACTACAATTTTGACATTCTATGACACCATAGTCCAACCAAATAAAGGAAAGGGAGGAAAAAAACGTCATAAATAATTGGGGGCACGTTTTTGGCAGGAAAAAACGCAGATTTTCGGATTTTTGATATTTTATGACATTTTTTCAACTTCATAAATTTATGACTTTGATTAACTGTACTTAATTAAAAATAATTAAAAAAATTTAGCGCCTTTTGTTTTAATCTTTTTTAATTAAACTGAAAACTCCGTGCGTTTTCTATATTAGGTTTAGAGTCTTCTTCTTCCAACATCGATTGTTTGTAGCTTTCTCCTTCCATTGGTCGGTCGTCTTCAATCGTTCATTGTTGGCGTGCGACCGTTTTAGTTATCTCTCGGTCCTCCGTCTCCTGCGACTAAGCAACATTTCAACAACCCACGCGACCTAAGAGTGCAGACGCGGACACGACGACAACAACTCGGGAGAGGCAACGAGTTTCGTCTCTTTCTTCGGCGAGTCAGTGGCGGTGGCGACAGGGTGCTTTCAGCAGCAGTGTGAAGCTTCACGTGGTGTGCCCTCATTCCCAACTAATTTAAAGGTTGTTGAGTGCGTTTCAGGTTTGATCCACAAATCGATTAACCCCGAATTAGTTAGTTGTTGTCCAGAAAGTTTAGATCTGCTAATTCGAATGATTTCTATTAATTGCATCTTGTTAGCAATTTCAGTTGAAAACTAAAGTCTTTTGGAGGTTAATATTTTGGATCTTATAGAGCTGTAACATTGTTGGAGGTGATTGTAGGTTTCAATTTTGATAGCTTCTCAAAAACAATCTTATATTTGATTGATTTATTTTAAGAACTAGGGATGTAGAAGAAGAAGAACTAGGATTTGTCGAAGATGGTAAAAGGTGAGGGGACATAGCATAAAACACATGATTCCTTTTACATACTCTTCTTG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MLVYGSKDQILTGYTDSDFQTDIDSRKSTLGSIFTLNEGAVVWGNIKQGCIVDSTMEAEYVAACEAAKVVVRACPLPSGEQLRRRRSSNDGSSASSTPSRDQPRFLHGLVYFSQFFAPQGLIPFSPSFSPSLVISFSVFQHFSSEFQAGQWLFSQFSGRYFDANRTSLLDPQTPSSSGIRQVDAEEKRGHDDNNSGEATSFVSFFGESVAVATGCFQQQCEASRGVPSFPTNLKVVECVSELCDIVSHRFGNLPFALATKLIQIIVVSLYSVGKITLLCTVVTLCIVMWLDTYLSNVALAQTSVDASTTVLSSTSGLFTLFIDATLCQDSLNMVKVVVFVNMLFSCVLSCSSYSDIELIDVKIKDLKKQPRFMISEVKKPYCNLLMPRGNRSSLQTRKLAKTISIDYMTEILSPRLYGTVCTQVEIELPVLDTLLTSVESSRLSSNTWVELYIESVYIVIFQTELCQGDTSFYVSEGLTGIVRGGRCSLASRHLPD Homology
BLAST of Lag0028372 vs. NCBI nr
Match: KAA0026067.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK22864.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 124.8 bits (312), Expect = 2.1e-24 Identity = 62/71 (87.32%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. NCBI nr
Match: KAA0046416.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 3.6e-24 Identity = 62/71 (87.32%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. NCBI nr
Match: TYK05759.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 3.6e-24 Identity = 62/71 (87.32%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. NCBI nr
Match: KAA0061170.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 3.6e-24 Identity = 61/71 (85.92%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. NCBI nr
Match: KAA0046366.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 123.2 bits (308), Expect = 6.1e-24 Identity = 61/71 (85.92%), Postives = 63/71 (88.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P10978 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.1e-11 Identity = 34/70 (48.57%), Postives = 46/70 (65.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CV72 (Secreted RxLR effector protein 161 OS=Plasmopara viticola OX=143451 GN=RXLR161 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 3.5e-06 Identity = 27/61 (44.26%), Postives = 39/61 (63.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SMW0 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold115G00510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.8 bits (312), Expect = 1.0e-24 Identity = 62/71 (87.32%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V1F5 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold753G00440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 1.7e-24 Identity = 61/71 (85.92%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C5V6 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G002480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 1.7e-24 Identity = 62/71 (87.32%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TWI0 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold149G001610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 1.7e-24 Identity = 62/71 (87.32%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C9Z1 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold118G00460 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 123.2 bits (308), Expect = 3.0e-24 Identity = 60/71 (84.51%), Postives = 64/71 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0028372 vs. TAIR 10
Match: AT4G32140.1 (EamA-like transporter family ) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 3.8e-08 Identity = 40/60 (66.67%), Postives = 47/60 (78.33%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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