Lag0027992 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0027992
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr8: 9513874 .. 9519781 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0027992
SyntenyLag0027992
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTCGCTGGCCGACGGTCGCCGACCATGGCTGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAAGGTGGAGGGAGAAGATGGTTGGAGGAAGAAGGGAGGGAAGAAAGGAGGGGAAAAAGAGGAGGGAAAATGAAAAGCTAAAAAATATACTTTTTTTATTATTTTATTTTTAAAATTTTAAAAATAAATTTTTAATAAAAAAAAATAGGTGTCATGTCAGCAAACCAAAACCTAAACCAAACGTGAAGGACCAAAAATGTATTTTTCCTATTATTTATAAATTTTAGTGTGTTGACACACTCAATTTATTCTTCTTAAAATCTTTTAATTTAAATTTTATTCCCATCCATGCTTTTCGTAGAAAATTTTGGTTTCCGCGTTGAACTTTTAATCAACCTCCACTAAAAATATATTATTATTTTTAAATTTTAATGTGTTGACACAGTCAATTTATTCTTCTTAAAATCTTTTAATTTAAATTTTATTCCAATCCATAATTTTCGTAGTATATTTTCTCTCTACACCTTAAAATCTTGCCAGTATAGTATAACCAGTCAAAAACACGTATCTTCAATAACGAAGTCTAAGGTTTGAGTTTTCTTATCCCCAAATGTTGTTAAACTAAAATTAAAAATAAAATAAAATAATTTAAGTCCCATTTGATAAGCATTTTATGCCATGTTTGATAACCATTTCGTTTTTTGTTTTTGGTTTTTCAAATTTTAGCTTATTAACACTCTTTTCACCCATACATTTCTTTGGGTTGTTATTTACCTCCTTCTCATGTTTTTAAAAACCAAGTCAATTTTTGGAAAAAAAAAAAAAAGTAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGCTTTTAGAATTTGACAAAGAACTCTAATGTCTCCTTAACAAAAATGAAAACCATGGTGGGGAAATTCAAAGAAAATAAGCATAATTTTGAAAAACTAAATGGTTATCAAACGGACCTTAGTTTTTTGTTTTTTAAAATTAAGCTTATAAACACTTCTTCCACCCATACATTTCTTTTGTTTACTATTTACATCCTTCCCATGATTCCAAAAACCAAGTAAAATTTTGAAAACAAAAGAAAAGTAGGTCCCCGTTTGATAACCATTTTGTTTTTTGTTTTTCGTTTTTGAAAATTATGCTTGTTTTCTCGCAAATTTCCTACAATGATTTTCATATTTGTTAAGGATCCATTTGATTTCATAGCCAAATTCCAATAACAAAAACAAGTTTTTGAAGGCTACGACCCCATTTGATAACCATTTCGTTTTTTATTTTTTGTTTTTTGAAAAATAAGCTTATAAATACTCTTTCCACCTATTCATTTCTTTGGTTTGAACACAGGGGGATGTGAGAGTAAAAACTTGATATTAATATCTCGTTTTTATACTTTCCTCCCACTAAAGTGTCTTAAAATTTTAGGGTCTTTTATTACTTAGGTAAATTCCGGCTAAATGAATCTATCTAAGTCTGTGCTTTTTATAACTCTTTATAAAGGTCTCTACTCTAATGTCTAGGTGAATTAAACCCTTTTAATTACCTAGTGATGTTTGCATGCTAATAAGACTGTGGTTAATTCAACTCAGGTTTTGGACTAGGCGCCGAGAGAGTTCCCTTGTAACTGAAGTCTTATATCCTACTTAACCATATTTTAAATCTACTAAAATACTAAGTAGGATATTCTAATCCTATTAGAAAAAATGATCTTAGGTCTATTAAATTTTAAACTGATTTAAATTTAACTCATATCCTAAGATCCTATGTTAGCATGCAACTCTTTGTTATAGGTTATGACGGTTTCTATTCATTAACTTTTATAACTATTATAACTTTTAATGAATTAGCCCTATAACATGTTTCTAATGGTGATGAAAGCATATGACATTCAAGATACAGGTTATATAAAGCACAATTTAGAAGCAACCTATGTCTTGGTGTGTATAACGCTTTATACTTACAATGTCTAGGTGATAAACTTTTAACCTTACATCACCCACACATGCTCATAAAACTCAGGTTAACTTAACTCAAGTACTGACTCGATGCACAGGTAGGAGGTGTTCCGTAAACCGTCAACTTAAATACCTCCAGCCTTAGACAACATATTGCCAGGTGAGTTCTCTTGTAACTTTAGCTTTACAAGATTACCTATTCTATGCTAATTGGTCGAGTTTGAGCTTCGTTAACCCTAAGTGAGCATGCAAATATCTTGTTATAGATTTTAACGTCTATCTCAGTTTATAACTATTTATAAATAACGATATAACTATGCTAAGGTGGTTTCATGCTGCATGTTTGTTCATTTTTGTTTATTAATATAACTTTTTATACTAATCGAGCTAAACAAATTTAAAACATACTACATGCATCTCTTGGGTTTTATGTCCTAAAACTCGTAGATAGTGAATGTTAACGAATTATACACTTGTATCAATAAAATGTTATTGAGGTTCATGCAAGACAATTTTATTGTCATTTAAGTCTAAAATTGCACAATATGACCCAAATCCAATAAACTAAAATCTAAGGTTGTTTACATGTAACTTGAACTAGTATGTGGGGACATACGGGGATCAGTGTTCAAGAAACAACCTAAAAGGTCTATAGTATAGGGATAAGGTTGGGTACCTTATCCTGATAACACTATGTGATGCGGCCCGCTTTGTATTCGATACAAACGTATTGATCAAATGTAACGCCCCAGGCCCAGGATTCGGAATCCTGATTCAGCACCTCACGGCCCCGGCATTCCCCTACATCCTCTGCGGCCTGGCGACGTTACCATACTCGTCTTAAACCGCTTCTAAGAGTGAAGACTGTCCCCACAAACCAACACGGGGTCCTTCTAGCATGCTTTGTCCTCACTCACATGCTTCCTAGGAAAATTTCCAGGAGGTCACCCAACATAGAACTACTCCAAGCCAAGCACGCTTAACTTCAAAGTTCCTATGATTGAGCCACCGAAAAGGAAGGTGCCCCTTGTTGGTATATGTAGTATCTATCAATTCTTTTAAGCTTATCTGGACCATGCTTTCATGTCCTTAGGATCCCTCTCATTCGAATGTAGGGGAATGCCGGGGCCGTGAGGTGCTGAATCCGGATTCTGAATCCTGGGCCTGGGGCGTTACAGATGGTATCAGAGCGGAACCTCTCCCAGTAGTATGTGGTTCGGGGACGAACCAAGGCGGAAGCTGGTGGGCATGTGACGCCCGAGGTTAGGAGGGGTACATGAATGAACCGAGATCACATCTGAATGAGAGGGATCCTGAGGACATGGAAACGGTCAAGATAAAGCTTAAAAAGAATTGATAGGTACTACCTATACCAACAAGGTGCACCTTCCTTTTCGGTGGCTCAATCATAGGAACTTTGAAGTTAAGCGTGCTTGGCTTGGGGAAGTTCTATGTTGGGTGACCTCCTAGGAATTTTCCTAGGAAGCATGTGAGTGAGGACAAAGCATGCTAGAAGGACCCCGTGTTGGTTTGTGGGGACAGTCTTCACTCTTAGAAGCGGTTTAAGACGAGTATGGTGACGTCGCCAGGCCACAGAGGATGTAGGGGAATGCCGGGGCCGTGAGGTGCCGAATCCGGATTCCGAATCTTGGGCCTGGGCGTTACAGTTTGTAACGCCCCGCATTTCCAGGTGCGAATAATTCTGTTAAATTTCTATTTAATTCGGAGTTGTAGTACCTGTTGGCTGTTTAAGGTTGATTATTATTTATTTTTTTGTGGTTGTTTGGAGTGGGTAATTTGTATTTGGGCCAAGAAATTCTTTTTCCTTCGTGAATTTAATTTTAAGAGTATGGTCTAAACCTTATAGAGTTCTAAGAGTCGATTTGGGCTTGAAGGGCCTTAATTGAGTATTTAAATGTGAGGGAAGGTTATATTTTTAATTCTAGTCTTAAGAAAAGAGGGAGCAAGGAAACCCTAGAAGTAACTCTCTTTTCCCTTTCTTTTTTTTCGTCAGCCGCCGCTCCCCAAGAGGAAAAAAAATTTCTCGTTTTTTTTCCTTCTCCTTGCGCAGCCGCCCAGCCTTCCGTGAAGCTCCAGCGTCGGCCACCTCCTCCAGTCGCAGGTCTTCTCCTCTCTTGCCCGTGTGTGCGCCGCTGTGAGAGCCTCCCCCTTCGCGATTTTCTTCAGCCGGCAGCGAGACCCATCGTCAATCTCTCTCCCTCTCTCGTTCTTCCTCACGCTGAAGCCGCAGCTCTCTCTCTCTCTAGTGTTCAGTCGCCAACAGCAGCAGACCCGTGGCCCTGTATTCGCGAGCATCGGCCAGCACCACAGCTTCGGTTTTTCTCTTTCAAACTCGCGTGTAAGGTCTCTCTCACGATTCTCTTTCAAGTTCCTCAAGCAGCGAGTTTAATCCTATGTTTTCTCTTGTTTTCGACTGGGCTAGTGAGTAGAAGCTGGAATCTTCGTTGTTCTGGTATTTAGGCGCGTTCGGGCTGATTTAAGGATCGTTTCGGCGTGCTTAGGCTCTTTCGGTAAGCTCTCAGCATTACCCATGCTTTATAAACCTCAAATTTAGATTTCCCACTCTTGTTCGGCCTTAGAATGGAGCGTTTGGTTTGATTTCTCGATTTTCCAATGCTGTGCAGTGCCGTTTTGGGTACGAAATCATTCTTGCCTTGTGACCCATCATCCGTGGAGCCTTAAACTTGAACACCCAGTACTTAGGGCCTCTAAGCAAGTGGTTTTAAACCTCTTCGCTTGCTGGACAACACGTGTTCGAGGTCTTTCGGACGCTGAACGGTAAATTCCAGCATCCCTAGATCCTTTCCTCAAGTTTATTAGGTGCTCTGAGTTGTTTTCTAACCCATGGTAATCGTTGCTTGTAGTTTGAGCTCTTTAGGCTCTTCCGGTTGTTTCCATTAGTCCTTTAGGATTGTTTAGGAGCGTTTGAGCTTCCGGTAAGTAGTTCTTACTTGCTGAAGTCTGTTTGACTGTGTGTTGCATGCTGAATGTTTTCTTGTCTTATAACTGTTCTCTTGTTCCTGTTCTTTG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mRNA sequence

ATGGTCGCTGGCCGACGGTCGCCGACCATGGCTGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAAGGTGGAGGGAGAAGATGGCCCAGGATTCGGAATCCTGATTCAGCACCTCACGGCCCCGGCATTCCCCTACATCCTCTGCGGCCTGGCGACGATCCCTCTCATTCGAATGTAGGGGAATGCCGGGGCCGTGAGGTGCTGAATCCGGATTCTGAATCCTGGGCCTGGGGCGTTACAGATGGTATCAGAGCGGAACCTCTCCCAGTAGTATGTGGTTCGGGGACGAACCAAGGCGGAAGCTGGTGGGCATGTGACGCCCGAGCCGCCCAGCCTTCCGTGAAGCTCCAGCGTCGGCCACCTCCTCCAGTCGCAGGTCTTCTCCTCTCTTGCCCGTGTGTGCGCCGCTGTGAGAGCCTCCCCCTTCGCGATTTTCTTCAGCCGGCAGCGAGACCCATCGTCAATCTCTCTCCCTCTCTCGTTCTTCCTCACGCTGAAGCCGCAGCTCTCTCTCTCTCTAGTGTTCAGTCGCCAACAGCAGCAGACCCGTGGCCCTGTATTCGCGAGCATCGGCCAGCACCACAGCTTCGGTTTTTCTCTTTCAAACTCGCGTTAGAAGCTGGAATCTTCGTTGTTCTGGTATTTAGGCGCGTTCGGGCTGATTTAAGGATCGTTTCGGCGTGCTTAGGCTCTTTCGTGCCGTTTTGGGTACGAAATCATTCTTGCCTTGTGACCCATCATCCGTGGAGCCTTAAACTTGAACACCCAGTACTTAGGGCCTCTAAGCAAGTGGTTTTAAACCTCTTCGCTTGCTGGACAACACGTGTTCGAGGTCTTTCGGACGCTGAACGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAACATGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGGCCAATACTTTGCTAAGTCATCGGTGCGCCTTGGGTATAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTTGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGAACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCCATGGGCTGCTTACCAGTACCTTAGTGTACTGACCCCTCCTCTCTCCCCCCACTACCAGACTTTGCAGGTTATGACGACTGCGCGGACCATGGTGATGCGGAGGATACCTACGAGGAGGAACCATAGCTTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTCGCTGGCCGACGGTCGCCGACCATGGCTGAAGGTGTTGGAGAAGAAGAAGGTGGAGGGAGAAGATGGCCCAGGATTCGGAATCCTGATTCAGCACCTCACGGCCCCGGCATTCCCCTACATCCTCTGCGGCCTGGCGACGATCCCTCTCATTCGAATGTAGGGGAATGCCGGGGCCGTGAGGTGCTGAATCCGGATTCTGAATCCTGGGCCTGGGGCGTTACAGATGGTATCAGAGCGGAACCTCTCCCAGTAGTATGTGGTTCGGGGACGAACCAAGGCGGAAGCTGGTGGGCATGTGACGCCCGAGCCGCCCAGCCTTCCGTGAAGCTCCAGCGTCGGCCACCTCCTCCAGTCGCAGGTCTTCTCCTCTCTTGCCCGTGTGTGCGCCGCTGTGAGAGCCTCCCCCTTCGCGATTTTCTTCAGCCGGCAGCGAGACCCATCGTCAATCTCTCTCCCTCTCTCGTTCTTCCTCACGCTGAAGCCGCAGCTCTCTCTCTCTCTAGTGTTCAGTCGCCAACAGCAGCAGACCCGTGGCCCTGTATTCGCGAGCATCGGCCAGCACCACAGCTTCGGTTTTTCTCTTTCAAACTCGCGTTAGAAGCTGGAATCTTCGTTGTTCTGGTATTTAGGCGCGTTCGGGCTGATTTAAGGATCGTTTCGGCGTGCTTAGGCTCTTTCGTGCCGTTTTGGGTACGAAATCATTCTTGCCTTGTGACCCATCATCCGTGGAGCCTTAAACTTGAACACCCAGTACTTAGGGCCTCTAAGCAAGTGGTTTTAAACCTCTTCGCTTGCTGGACAACACGTGTTCGAGGTCTTTCGGACGCTGAACGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAACATGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGGCCAATACTTTGCTAAGTCATCGGTGCGCCTTGGGTATAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTTGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGAACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCCATGGGCTGCTTACCAGTACCTTAGTGTACTGACCCCTCCTCTCTCCCCCCACTACCAGACTTTGCAGGTTATGACGACTGCGCGGACCATGGTGATGCGGAGGATACCTACGAGGAGGAACCATAGCTTGTAG

Protein sequence

MVAGRRSPTMAEGVGEEEGGGRRWPRIRNPDSAPHGPGIPLHPLRPGDDPSHSNVGECRGREVLNPDSESWAWGVTDGIRAEPLPVVCGSGTNQGGSWWACDARAAQPSVKLQRRPPPPVAGLLLSCPCVRRCESLPLRDFLQPAARPIVNLSPSLVLPHAEAAALSLSSVQSPTAADPWPCIREHRPAPQLRFFSFKLALEAGIFVVLVFRRVRADLRIVSACLGSFVPFWVRNHSCLVTHHPWSLKLEHPVLRASKQVVLNLFACWTTRVRGLSDAERVGVMSLETCVGRLGKGQYFAKSSVRLGYKWSRGDAQFEALGTNGQGSNAELRREHCGPGYKWSGNSATRRISLGEPWAAYQYLSVLTPPLSPHYQTLQVMTTARTMVMRRIPTRRNHSL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..61

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0027992.1Lag0027992.1mRNA