Lag0027028 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0027028
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr10: 44410543 .. 44417175 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0027028
SyntenyLag0027028
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGTTTTGGGAAAAGGGAACCGAACCGAACCCCACCGGTTCGGTTCGGTTCGGTCAGCATCAAACTTGGAAACCGAACCGAACCGTCGGTTCGATTCGATTCCTTACACCCCTAGGAAGAAGGTAGATAACAAAACAAAGAAACTTAGGGTATGTTTGGTTTAACTTTTCAAGTGTTTAATTTTGAAAATTTTCATTTTGAAAAAAATTCTAGTGTTTGACAACCACTAAAAATTACTTGTTAAAAAATGAGATTGAGAAATAAATTATTTTGAGAGAACACTTGAAAGAAATTTTTTTAAAAATAGTTTTTTTTTTTAATAATTTTAAAAAGAGTTTTTAAGTATATGATATAACTTGTATATAAAAACACTCATGAAGAGATGTAACCAAATATATGAATGTTTAAATTCTAAACAATTTTTATACAAAATGTTTAAAAGAAAATGCATTCTTGAAAAACACTTAAACTAAAATATATTCCAAACTAATTCTTCTAGGGGAGAAGTTGTAAGTTTAATTTTAAAAAACAAAAGAAAAAAAATCAAAGGGTTAGACTTAAATGGTTACATTTTTTGAAATTTGAGAACTAAATCATTACTTCAATAAAAACACACTAGCCAAATGTCCTTTCAACCCACTTGGAAAAATTGACAAAAGTTATGCATGCCTTTAGATTTTCAAGATATATTTTGAATATCTTTTATAGAAAAGAGAGAAAAAGATAATAATTCTATGGTTTAACCCATAAACTTTCAAATTTATCCTATTTTGGTTAACTTTTAAAACGTTTGTTTTAATCTTGAACTTCCAAATTTATTTCATTTTAGTTCCTAAATTTTTAAATTTTCTATTTTAGTCCCTAAATTTCACAAAATATCTATGTTGATCATTACTTCTATTTTAATTTTAGCAAATTAATAACATAACTTTGAATATGTGTATTAGCAGGTTAATATGAGCATAATTTCAAACCAAATTGAACTCAAAATAATAATAATAATAATAATTTCAAACCAAATAAATTAAAGATAAATATTAGACAAAAGGTAGTAACAAAACAAGAACCAAAATGGTTTTTTATTTATTTACTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAATTTAGAGACTGAAATAGACATTTTGAAAATTTAAAAGCTAAAATAGAATAACTTCAAATTTTAAAGATCAAAATTGACCTTTTGAAAGTTGATCACAATATGACAAAGAAGAAATTTCATATGAACTAAAAGTGAGATCTAAATCTAATTTTATTTAAGATAAATATAAAGATAAAGCATAGGGAAAAAGATATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAGCATAGGGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGGTGAAAATAAAGGTAGTATATGAGTATATACTCGTTATTTTCTCCCAAAAAAAGAAGGGTAATAAGGGAAAGTAAAGAGAGTAAAAAAAACGAAGGAATCAGGATGAGGTGAAAGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGAGGTGAAAGTAGTTATATAAGACAAGAGTGAGTTAAAAATAGAGGAGCCCACGTGTCAGGTGGTGGGCCCAGCGACACGTTAAGTACAGCTGGCAGAAGTACGGAAGTCACCAATCATAGCTGCCCAGTCACAGTGCCAGCTGGTGCCCTATTTTGCATGATGATGTGTCCCTTCTCTCAACCCCACCCACGTGCCTCTCCCCAGTTTTCATTTTTCCCTCTAATTTTTTCAACTTTTCAAACTGAGTTTGCTTACTTAAAAAATTAATACATATAATAATATGGCTAAAAATATACAAAATAGTTTTACTTAAGCTCCGTTTAATAATTATTTAGACCTCGTTTGATAACTACCTGGTTTTTAGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAAGCTTATAAATCTTATTTCCACGTACAAATTTCTTTGTTTTGCTAATACATTTCTTTCCTTGTTTTTAAAAACCAAGCAAATTTTGAAAACTAAGATCCCGTTTGATAACCATTTGGTTTTTTGTTTTTAAAAATTAAGCTTATACACACATACTTCTACCTATAAGTTTCCTGGTTTTAGTATCAATCTTCTACATTGTTTTCAAAAATCAAGTCCAATTTTGAAAAAAAAAAAATAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTAAAATTTGGCTAGGAATTCAAATGCAACTTTAACTAGGATGAAAGTCATGATAGGAAATCTAGGAGAAAACAAGCCTAATTTTTAAAAATCAAAAACCAAAAACCAAATGATTATCAAACGGGGCCTAAAAAAACTTGTTTTTGTTTTTAGAATTTGGCTAGGAGTTCAAATGTGTCATCGGCAAATATTAAAACCATGGTAGGGAAATTGGCAAAAAAACAAGCCTAATTTTCAAAAACCAAATGGTTATCAAATGGAGCCTTCGTTTTTTATTTTCATATTTGTTAAGGAAACATTTCTAGCTAAATTCCAAGCAAAAAAAAAAAAAAAATTGAAAACTACTTTTGTAATTAGTTTTCAAAACCGTTATAATTTACGGTGAGAGGAGGAAAAAAAGAAGAAGCATTTTTCAATGAGGGTACTTTTTAAATTTTTTTGAAAGTTCAATGGTACTTTTTTAAGTGAAATTTTAACGGTTTTCATCCAAAAAAATAACGGCAATGGTATTTTTGAAACATTTTTCAAAATTCAGGAGTATTTTTGAAACTTTTCAAAATTCAGGGACATTTTTTAAACAAACCCCATAGTTCAGGGTATTTTTTATAATTTAGCCTTCTTTCTTTCTTGAATTAAAATTTGCCACGGTATATATGTTTTTGTTTTTTTTTTTTGGGATTTTATTATTCACCACAGTGTTGGTTGTACTATTAAAATTTAAACCTACCCCAGTACAGTACAGAGTGGACTAAAAAAAAGTGAAGTACAAAGAAATTTTTAAAAATAAATTGGAAAAAGATATATATATATATATATATTTTACAATCCAACTCAATAATTTATTTTCTGGACTTCAAATCATAATAATTTATTTTCTTGAACTTTGTTGATTGACCCTAAGTTTAGGGTCTAATTTGATAAAATTGAAAATTTATGATAAAAATTGATACACTTTATCAAGTTGTTAAAAATAGTTTTTTAATCCTATTTTAAAGGTTATAAGTTTGAATTCCTACCTCATATTTGAACTCTAATCCTTAAAAAGTAGTTCAAATTTCAATTGGATAGTTTAGCTCCATTTGATAACCATTTGGTTTTTAGTTTTTTGTTTTTGAAAATTAAGCTTATACATACATATACTTCCACTTATAAGTTTCTTGGTTTTAGTATCAATCTTCTACCTTGTTTTCAAAAACCAAGTTCAATTTTAGAAAAAAAAAAAATTAATTTCAAATTTTTTTTTTGTTTTTAAAATTTGGCTATGAACTCAAATGTAACATTAACTAGGATGAAAACCTTGGTAGGAGATTTTAGGAAAAAACAAGCATAATTTTCAAAAACCAAAAAACAAAAAACTAAATGGTTATAAAACAAAACCTTAACTCTTAAGTTTATTTTATATAGTCTTTAAATTTTCAAAATATCTATAGTGATCCATGAATTTCAAAAGTTATCATTTTAGCCTATAAACCTTTTTATCATAGAAATCATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAAGAAAAAAAAAATCTAGTCCTTCTAGTTATTTAGTTATTCATTTTTTTTAACAACATTTGGGGATGGGGGATTGAACCTCCAACCACATGATGCAGGGTACATGTGAATTACTATTTGAACTATTATCACTTTTTGGCATCATCTATCATTTGTTCACTTCATACTTATTGTAGTTATGAGCTAATTTATATGATTTTTTTTCCTAAGTTCAACAATTGTGGAGTAGAGGATCGAACCATCACCCTATAAGTGGTAATTTATACTGTTATATGGCTTTATTGCGCATATACAAACTAGTAAACTAATATACAATATATTCAGAACCACGTTATCTAACTGTTTAAATAAAGTAACAATAAACTAACAATGATAATCAAAACGGTTATTATATATTTATGGGTTAAAAATAAACCCATTCAAGAACTTACCTAAAACAAACTTGAAGGTTTAGACCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGAATTGATGGTTTAGATTCTAAAACATACGTTTCCAATATTCAAGAATCAAAAGGGAATAATCTTAAAAGTTATGATTTTTTTTAGTTCAACAACATTCGGAAGTGGGAGAGATTTGGAACCTCTAATCTCTTGGTCGAGGACATATGTCAATTGTTGTTGAGCTATACTCACTTTGACCCTATAAAAATACATTCAGAACAGCTCTGCTCTCCACACTTTAATAAACATCTTAAGGAAGGGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAGAATCATCATTATATTAGGATACTATCTATGGATATATATAAAAAATGTTTGCCTCAACGAATTTAATGAAACATAAATCGTAAACCTCTCTTTTTCAAATTTATTTTGAATGCGGTTGGTAGAATAATATGCAATTGTACAACTCTAATACGTTAGCATTATTACCAACAATTTAATCTTATCCTTTATATATATATATATATCAATCACTATCACTCGTGAACATGCTAAATATATTAAAATACTTCCTTCTCAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATTAAAATACTTTGTCAAAAAAAAAATATATATATATATGTATTAAAATACAAATTGTGAGTTGTTGTGACATAAGACTGATCTACTAGATATAACTGCCATGTCATCGATTTTTAACAAAATTAGTAATTTGTCAATTCAAACATAACATAGTGGATAAAACAGAAGATCATTTCAAATATCCATAGTTTGATTCCATCAATCATCTCATAATTGTTAAATTAAAAAACATGTAAATACAAATACATTTTATTTAGAATTTTTTTTTTAAATCTCATTTTTTTTTTATATTCAATATATATTATGA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mRNA sequence

ATGGTTTTGGGAAAAGGGAACCGAACCGAACCCCACCGGTTCGGTTCGGTTCGGTCAGCATCAAACTTGGAAACCGAACCGAACCGTCGGTTCGATTCGATTCCTTACACCCCTAGGAAGAAGGTAGATAACAAAACAAAGAAACTTAGGGTGATTTTGGACCACCTCGATGCACAAGGAGTTGACGAGGACAATCGGGCAGAAATCAGACCGGAAGATAGACCCAAGAGGCGAAACCGGCAAGTGGGACGGGCCAAGACCAAAGGGGTTGGGCCCTACTCGGCCTCGGCCAAGGCTGAGGCCGAGCCTCATGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCTTGTCCGGCTCCACTTGGTCTCCACCGCCTCTGGTCGTCCCGGTTCAGCCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTTTTGGGAAAAGGGAACCGAACCGAACCCCACCGGTTCGGTTCGGTTCGGTCAGCATCAAACTTGGAAACCGAACCGAACCGTCGGTTCGATTCGATTCCTTACACCCCTAGGAAGAAGGTAGATAACAAAACAAAGAAACTTAGGGTGATTTTGGACCACCTCGATGCACAAGGAGTTGACGAGGACAATCGGGCAGAAATCAGACCGGAAGATAGACCCAAGAGGCGAAACCGGCAAGTGGGACGGGCCAAGACCAAAGGGGTTGGGCCCTACTCGGCCTCGGCCAAGGCTGAGGCCGAGCCTCATGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCTTGTCCGGCTCCACTTGGTCTCCACCGCCTCTGGTCGTCCCGGTTCAGCCTGA

Protein sequence

MVLGKGNRTEPHRFGSVRSASNLETEPNRRFDSIPYTPRKKVDNKTKKLRVILDHLDAQGVDEDNRAEIRPEDRPKRRNRQVGRAKTKGVGPYSASAKAEAEPHGPLARAELVRLHLVSTASGRPGSA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..43
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 59..107
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 14..28
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 59..79

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0027028.1Lag0027028.1mRNA