
Lag0021869 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCACTATGTGGGTCTGTCTCTGCTCTGAACTTGAGGTGGGAAAAAGGTATCCCGAAATCAACCTCGAGATGCTGTTCTCCATTAAGTTGTGAGAAGAGCAGTGCTTTAGCATTTTGGGGTAGTGAGTTTGTGGGCGATGGCTTGAAAGTATCTGGCAGACATGTTAATAGGAAACTATCTAAGGGAACTCTTCCACTAAAGGTTTGTCCTCGTTGAGATTCCAGACTATTTCGTTCCTCATGTAGTTGTTGAATTGAATTAGTTATTGTCATCTTTTCTTCATGAACAGGTAGTTTGCTTGGATTACCCTAGACCACCGATTGATGATACTGTTAATTTCATCGAAGCGGCATCCTTATCTGCTAGTTTTCGTACATCTGCACGTCCCAGTAAACCTTTGAAAATAGTGGTTGCTGGTGCAGGTAAGGAATTTCCTTGCCTAGCTTGACTGAACTTCTTTTTGGAATTTAGGTTGATCATGCTGATTATCAAATGTGTCATTTCTTTTCTTGAGATTGAGATTTGATGGTGTAATCATGTTCTTAAACTAGGATTGGCTGGCTTATCGACAGCAAAATATTTGGCTGATGCTGGCCACAAACCTGTTTTACTAGAAGCTCGAGATGTTTTAGGTGGGAAGGTATGCTTGTCGGAAGTAATATTGTTTGCTTACTAATTCTATTACAGATTATCTATTTTTCCAGAATTTGTTGCATAATTTATTTCCCTGAATTTTTTGTATAGAACTTGTAAATATGTATGCTATGCTGAATCTTTCAGTGTTTTATTTCTTATCCATCATATTTTAGCTTCTTAGTCAAATATGATGCTAGCTATAATTGTAAAATATTAATCTTTCTAAACGTGGTATTCTAATCCATTGTTTTTCCTGTTTGAGTCCCTTGTCTTCTTAATCATCTCAATGTCATATGCATTATCCCAATGTCATATACATTACTGACTTTACAGTTTTGTTGTTCTAGGAATTTGTATTCCGTTTAACAAAATAGTGAAAGGATAAACTGGGGTATCTTGGACCGGATCCCTTTCCTAGGACATTAGATGTGGCCCATTTGCCTCCTTTCGGACGGTTGTTTTTGTATGCCCGTTTTATGTTGGCTTATGTTTTCTGACCCTTCTTTATATATATTTTTCTTGAAGAAAGCTTGGTTTTTCCATTAAAAAAGTAGGGTTATTTGAGAGACCATAGAGCTCTTCCAGTACATGAAATACCCCAATCTAGTACCTTGACACACACACCCCCATTAGTATAATTAGTTGTAAAAGGTCATTCATTGCCTAAATTAACCTGTCATACCCTTTTCCTCTTCCTATATGGTAGACTTGGAATAGGAGGTCTATCATTATCTTGCCCTCTGTAGAACTGCCTTGTCCTCGAGGTGGAAGTCTTATAATAGAGTGGAAATATGATTACGAGTTCCCATGTAGTATCAAAGCAGAGAAGGGTCCATCTGTTGCACCAGAACTTCCAAGACAATAGGATTGAGTTGGGTTGTCCCTAGAATTCTCAATTGTAAGCTCCTTTGGGAAAGGAGTGATAGGATGAGCCTCTTTTTGAATGCATTTGGAGAGGATCCTTCCCCAAAAAATCCTAGCTCTTTTCTTTCTATGGGAGCTTGCGAGGAGTGCATACAGGGGATTGGCTACAAAAGAGACTTGCCTAACAGTTCATCTCTCCAAATTGGTGTTGTATTGTATCTGCAAAAACAGTGGGGAAAATCAAAACCACCTCTTTATATCCTGTACACTTGCGGCTGACTTTTGGATTCAAATGAGGGAGGCATCCGGCTGGGCTATGTATGACTCCTCCAAACAATATCAAAGTTTTTGGCAATCATCCTACTGGGACATTCCTTCAAAGCCGATAAAAGGACCCTTCTGGCAGTATATTTACTGGGCTTTCTTCTGGGTGCTATTGAGGAAAAGAGACAACAGCATTTTCAATGACAAATAAGTGGCTGCTATGGCTTGTAAATGCAAATTTTGCAATTTTATTTGAGAATATTACATCGTATATGAGGTGGGAGATTTGAACCTATGACCTCTTAGAAGAAGTAGAGATGCCTTAACCACTAAGGTAAGCCCATGTTGGCAAATAAAAACTTTGCAATTAATAAACCAACTTCTAATTTGAGTTTACATTAATTACCCATGGCCTGGTGCAGTTAGAATATATGAAACATCAGTAGTGTAATTAGGTAGAGTCAACATGCAAGCCACCAAACTGATGTGTTCCACCACCTGATATAGACCATAGAATCTTGTTAATATCTTAGCATTTCGGCATCTAAAAAGAGTTCCTTGGTAGTACGGTGGACGTTAAGATAAACTTGGCCTCCCACCTTAAATAGGATGCGAGCATTTCTTGTTTGTGTAGGCCACCATTTTCTTTTGGGCACGGTTCGAATGTTCTTTAAACTCACTTATCATAGCATTTCTATTGCAAGTGTCTGACTCACCTCTAGGCTCTAACATGCAATGTTTAAAAAGGCTTTTGTGGCTTAGGCCGAGGCTCACCTCAAGGTAATATTCTAACTTTTAACCTTAGAGACTTATGCCTTTTCTGGTCCATAAGAAGCTTACGCCTTTAAGAAAACACACTGAGGTTTAAAGTCTCTATGCCTCATATAGTGATTAGAAGAATAATATTAATTTGCCTCATTCTTAAAAAATATGAAGGTTTGAGTGGTAACAATTTGATTATACTACTTTTACTTCTTAGGCCTTAAAAACATTGAAGACAAAATTTGATAGAATTGGTCGATCTTATCAATGCTAATGGTTAAATTGTTACTCTAACAGCTAACTTCGCTCTTACACCTATCTCTTTCTCTAGCGAGTTGCTAAACCCTTCCTTGATCTAAGTTGGCTGACATTCTATTGCACTATGAACTCCTATGATCTTCTCATCCATTTACATATAATATTGATTTTTATTTTTTTTATTAGTTACCATTCCATAATAATCTCACCATTTTGATATAACAAATGATAGGAAACCGTATCATGTCGATGAACAATAAACTAAGGTTTATTCAAGAGAACCTAGCTCAAACCTAGCTCTCCTATGACATTAGCTACCCAAAATCTAAAATCTAATACCTTGGTTGTTCACATTACTTCCTAACCCCTCCCCTGTGTGGGTTTACTTATTAGTTACAAGGGTCCTGCAAGGTCATTCCATGCTCGAATTACAATTACCCCAGTCACACCTTTTTCCTCTCCTTCTATATAGACTTGAAGTTCATAGTGTCTATCATTTTGAGATGTAAGGGCACATTTCGAGATGCAAAGTGGAGGTCAAAAAGGTGGTTTCTGCAGGCCTATGAGGATGCTGTTGTTGGGAACCATGTTTATGCAATTTATTTAATATATATTTTGACAACCATTCTCTCTTTTCCTGCCCCTCTTTTTTCTCTCTTTTCTCAGACCCAAACAAGTTTGCTTTTCTTAAGCTACAAAAATGTTTATATTTTTATATTGTGACAAGATTTTATTCAAATTTATCATTGAGGCAATTCTACAGATTTTATTGTAAGAGCAACTCTTTAACTTTGTCAACTGTCGGTAACATTCTTGATTATTTTCATAGGTCTGAAGGAATCTTGATTTTTCCTATTAAATTTTGTTCACTCTTTCTTTGTAGGTAGCTGCGTGGAAAGATAATGATGGAGACTGGTATGAGACTGGCCTGCACATATTTTGTAAGTGTTTGATACTCAATGTTCCCAGTGCTTATATGACTAGTTGACGTTAGAAAATAGTTTTTTTTTCCTTTTAATTCCCGAACTATGAATGTATTTCAATTTGGTTTTGGAAACCTTTTCTCTAATCTGTCCCTGGTGTATATTATGGGTCCATAAGTATTTTAAATTTCATTGCTACCCCAGCCCTTAGGCTGTCTCCTTCTTTTTGAAATGAAATCTTTATTTCCTGTTTCTTAAAAAAAATCATTTTACATTTTATTTTTACCATCATCAGAAATGTTGCATGACGAAGCTTCCTAGTCTTCTTCAACCTTTAACCATTGTGTTCTATAATCTATAATGTACTCCACTTGCATGTAAATGATTATTTTACCATAATTTCAATTTCTATTAATCAAGCTGTCTTGTACCTGATAAAAAACTAATGTCAATTATACATCCAGCTATTTGCAGACCTTTAGATATGTTATATCTCATTTGCATGAGATGCTAATTTCTTATCCTTTCTGTTTCTATTCTTGCTGGAAAGTTGGGGCTTATCCCAATGTGCAGAACTTGTTTGGAGAACTTGGAATCAATGATCGATTGCAGTGGAAGGAACACTCAATGATATTTGCTATGCCAAATAAGCCTGGGGAGTTCAGTCGGTTTGATTTCCCTGAAGTACTTCCTTCACCCATAAATGGTAGGGCATGTAAAACCCACTAGTGACAAGTTTATTAAGACTGCATACTTTGTTGGAATCAGAATGTGACTGAAATAAGCTTTATTCTGTTGAGTGAACTAATCATGATTTGCAATTATGAAACATCTTATTACATGTACTTAGCCTAGCCTGGTTCATTCGGTTAGTTAATTAGTCTGTTGGAACTAATTTTTAGATTTGTTTGATCAGTTATCTCACAAAATTCTTGATAAACATATGCTGCACAGTATAATGGTGAATTCAGTTCATTTTGTGAAATTCTTGTTTGCATTACTTTATTTGCTAAATCATCATTTTCCCCCTTTGTCTGGTCTCTGGAAATATTTTATGTTACCATCAATCCAGTTTTCCTAAAACTTCGAGAACTACTGGCAGGGATATGGGCCATTTTAAGGAACAACGAGATGCTTACTTGGCCAGAGAAAATTAAATTTGCAATTGGGCTCCTGCCTGCAATGCTTGGTGGGCAATCTTATGTAGAGGCTCAAGATAATTTAACTGTGCAAGAGTGGATGAGAAGTCGGGTATGGTTAACATGCCATAATTTTTTATTGAAT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ATGTCACTATGTGGGTCTGTCTCTGCTCTGAACTTGAGGTGGGAAAAAGGTATCCCGAAATCAACCTCGAGATGCTGTTCTCCATTAAGTTGTGAGAAGAGCAGTGCTTTAGCATTTTGGGGTAGTGAGTTTGTGGGCGATGGCTTGAAAGTATCTGGCAGACATGTTAATAGGAAACTATCTAAGGGAACTCTTCCACTAAAGGTAGTTTGCTTGGATTACCCTAGACCACCGATTGATGATACTGTTAATTTCATCGAAGCGGCATCCTTATCTGCTAGTTTTCGTACATCTGCACGTCCCAGTAAACCTTTGAAAATAGTGGTTGCTGGTGCAGGATTGGCTGGCTTATCGACAGCAAAATATTTGGCTGATGCTGGCCACAAACCTGTTTTACTAGAAGCTCGAGATGTTTTAGGTGGGAAGGTAGCTGCGTGGAAAGATAATGATGGAGACTGGTATGAGACTGGCCTGCACATATTTTTTGGGGCTTATCCCAATGTGCAGAACTTGTTTGGAGAACTTGGAATCAATGATCGATTGCAGTGGAAGGAACACTCAATGATATTTGCTATGCCAAATAAGCCTGGGGAGTTCAGTCGGTTTGATTTCCCTGAAGTACTTCCTTCACCCATAAATGGGATATGGGCCATTTTAAGGAACAACGAGATGCTTACTTGGCCAGAGAAAATTAAATTTGCAATTGGGCTCCTGCCTGCAATGCTTGGTGGGCAATCTTATGTAGAGGCTCAAGATAATTTAACTGTGCAAGAGTGGATGAGAAGTCGGGGAGTACCTGATCGTGTAACAACTGAGGTGTTTATTGCTATGTCAAAGGCTCTAAATTTCATTAACCCCGATGAACTTTCTATGCAATGCATTTTGATTGCTTTGAATCGATTTCTTCAGGAGAAACATGGCTCTAAGATGGCTTTCTTAGATGGAAATCCACCTGAGAGACTATGTGAGCCAATTGTCGAGCATATTCAGTCATTGGGTGGTGAAGTACGACTTAATTCAAGGATACAAAAAATTGAGTTAAACAATGACGGAACAGTGAAGAGGTTCTCATTAAACGATGGGAATGTAATTGAAGGAGATGCATATGTATTTGCCACTCCTGTTGATATCCTGAAGCTTCTTTTGCCTAATGACTGGAAAGAGATCCCATACTTCAAAAAGATGGACAAGTTAGTTGGAGTTCCAGTCATCAATGTTCACATATGGTTTGACAGGAAACTGAAGAATACATATGATCACTTACTTTTTAGCAGGAGTCCGCTTCTTAGTGTTTATGCAGACATGTCAGTTACATGTAAGGAATATTACAACCCAAACCAGTCCATGTTGGAATTAGTCTTTGCGCCAGCAGAAGAGTGGATTTCCCGGAGTGACTCAGAAATTATTGATGCCACAATGTTGGAACTAGCTAAACTATTTCCTGATGAAATTTCTGCTGATCAGAGCAAAGCTAAGATTGTGAAGTACCACGTTGTTAAAACCCCAAGGTCTGTTTATAAGACTGTGCCCGACTGTGAACCCTGTCGCCCCTTACAAAGATCTCCTATTGAGGGATTTTATTTAGCTGGCGACTACACAAAACAGAAGTATTTAGCTTCTATGGAAGGTGCTGTTCTTTCAGGAAAGCTTTGTGCACAGGCGATTGTGAAGGATTATGAAATGCTAGTTGCTCGAAAGCAAAGACGGGTCGCCGAGGCTGGTGTTCGTTGA MSLCGSVSALNLRWEKGIPKSTSRCCSPLSCEKSSALAFWGSEFVGDGLKVSGRHVNRKLSKGTLPLKVVCLDYPRPPIDDTVNFIEAASLSASFRTSARPSKPLKIVVAGAGLAGLSTAKYLADAGHKPVLLEARDVLGGKVAAWKDNDGDWYETGLHIFFGAYPNVQNLFGELGINDRLQWKEHSMIFAMPNKPGEFSRFDFPEVLPSPINGIWAILRNNEMLTWPEKIKFAIGLLPAMLGGQSYVEAQDNLTVQEWMRSRGVPDRVTTEVFIAMSKALNFINPDELSMQCILIALNRFLQEKHGSKMAFLDGNPPERLCEPIVEHIQSLGGEVRLNSRIQKIELNNDGTVKRFSLNDGNVIEGDAYVFATPVDILKLLLPNDWKEIPYFKKMDKLVGVPVINVHIWFDRKLKNTYDHLLFSRSPLLSVYADMSVTCKEYYNPNQSMLELVFAPAEEWISRSDSEIIDATMLELAKLFPDEISADQSKAKIVKYHVVKTPRSVYKTVPDCEPCRPLQRSPIEGFYLAGDYTKQKYLASMEGAVLSGKLCAQAIVKDYEMLVARKQRRVAEAGVR Homology
BLAST of Lag0021869 vs. NCBI nr
Match: XP_023527611.1 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023527612.1 15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023527613.1 15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1137.9 bits (2942), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/576 (95.66%), Postives = 567/576 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. NCBI nr
Match: KAA0044540.1 (phytoene dehydrogenase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1135.6 bits (2936), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/576 (95.31%), Postives = 566/576 (98.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. NCBI nr
Match: XP_008454070.1 (PREDICTED: phytoene dehydrogenase, chloroplastic/chromoplastic isoform X1 [Cucumis melo] >TYK17043.1 phytoene dehydrogenase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.0e+00 Identity = 548/576 (95.14%), Postives = 565/576 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. NCBI nr
Match: XP_031740146.1 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic [Cucumis sativus] >XP_031740147.1 15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic [Cucumis sativus] >KGN53009.1 hypothetical protein Csa_014996 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1132.5 bits (2928), Expect = 0.0e+00 Identity = 548/576 (95.14%), Postives = 565/576 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. NCBI nr
Match: XP_022955514.1 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucurbita moschata] >XP_022955516.1 15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucurbita moschata] >XP_022955517.1 15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1131.3 bits (2925), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/576 (95.31%), Postives = 565/576 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P80093 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic OS=Capsicum annuum OX=4072 GN=PDS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 954.9 bits (2467), Expect = 4.1e-277 Identity = 465/581 (80.03%), Postives = 519/581 (89.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P28554 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=PDS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 953.0 bits (2462), Expect = 1.6e-276 Identity = 467/582 (80.24%), Postives = 515/582 (88.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P28553 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic OS=Glycine max OX=3847 GN=PDS1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 943.3 bits (2437), Expect = 1.2e-273 Identity = 461/575 (80.17%), Postives = 511/575 (88.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q07356 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 932.6 bits (2409), Expect = 2.2e-270 Identity = 454/578 (78.55%), Postives = 511/578 (88.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2XDA1 (15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=PDS1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 918.3 bits (2372), Expect = 4.3e-266 Identity = 438/545 (80.37%), Postives = 490/545 (89.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TMX7 (Phytoene dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold46G002880 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1135.6 bits (2936), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/576 (95.31%), Postives = 566/576 (98.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CYP6 (Phytoene dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold130G001910 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.0e+00 Identity = 548/576 (95.14%), Postives = 565/576 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BYZ6 (Phytoene dehydrogenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494596 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.0e+00 Identity = 548/576 (95.14%), Postives = 565/576 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KVZ4 (Phytoene dehydrogenase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G011080 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1132.5 bits (2928), Expect = 0.0e+00 Identity = 548/576 (95.14%), Postives = 565/576 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GTV7 (Phytoene dehydrogenase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457519 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1131.3 bits (2925), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/576 (95.31%), Postives = 565/576 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. TAIR 10
Match: AT4G14210.1 (phytoene desaturase 3 ) HSP 1 Score: 932.6 bits (2409), Expect = 1.6e-271 Identity = 454/578 (78.55%), Postives = 511/578 (88.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. TAIR 10
Match: AT4G14210.2 (phytoene desaturase 3 ) HSP 1 Score: 929.9 bits (2402), Expect = 1.0e-270 Identity = 452/578 (78.20%), Postives = 510/578 (88.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. TAIR 10
Match: AT3G04870.1 (zeta-carotene desaturase ) HSP 1 Score: 241.5 bits (615), Expect = 1.7e-63 Identity = 158/532 (29.70%), Postives = 266/532 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. TAIR 10
Match: AT3G04870.2 (zeta-carotene desaturase ) HSP 1 Score: 241.5 bits (615), Expect = 1.7e-63 Identity = 158/532 (29.70%), Postives = 266/532 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0021869 vs. TAIR 10
Match: AT1G65840.1 (polyamine oxidase 4 ) HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 3.0e-12 Identity = 99/471 (21.02%), Postives = 188/471 (39.92%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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