Lag0021764 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0021764
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr7: 11648646 .. 11652571 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0021764
SyntenyLag0021764
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTAATTTTGCTAGGATGATGACTGTTGATGGTCGATTTTGGCCAGAGGATCTCACCTGACCTTCACGTGCCACCAACGGTAAATTTGTAGTTGAGAGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAAACCTGCACACGGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCACACAGAACGGTAGGGCGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGGGAGAGTAGAGAGTTCGAGAGTAGAGTTTAGGGATAGAATTCGGGATCCCCTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTGTTCATCCTCCTCACCTTTTTAGGGTTTCGGAAGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGGCCGACCATGTGCTCGGCCTCGGCCATGGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGCCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCGGTTGCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACAATGACGTAAGCAAAATGACATATATCCTTTAATTGAAAACGTATGACATTTTTCATTTTTGCCTCTCCAAATGGGTCATCCACACAAAGGTTTCATTAAAAAATAAACAACTCAGGCTCTAGTACTAAAAAAAGCATAAACTCCACTGTTCAAAACGGTTAGAAAATCATTTATGTTATAAGCATTCTAAATTCAAAATGCAACAAACAAAAGTAATATCTTAGCGCATTGAAATTTGATACTATATTTTTAAACAACTAATTTTGTTGGGAATATAACTAAATTCTATTAAATACAAAATTTAACAGGCTGAGAACCTGAAAACGTGTAATGAAATCTTTAAAAAATTATATTTACTTAAATGAATTTATGATTTATCCAAATTGTATTAACTTCAAGGAATAGTCTCGGATGTAAATAACATTTGATGATGTTAGAAAAATAAGGAAGGATAGATAACAATACGACTTATTCATCAACCAAAAAAAAAAAAAATTATGAATTCTCAAGGTTTTATTGTGATATAGTCAATAGTGTTTCCCTCACGAATAACACAAACTTATAATTTTCCCTTTTCTTGAAAAGTCTTGATTTCTCGTATAAAAGTAGAAATTTTCCTATAGTTTGACATTTTGTTAATTATATATTTTCTTTTAATACGTAGATCACACCTATACATGAATGAATGCAACAATTCAATGTGTAACCATCTGAATCCATATGAATAGTCGCATCTCATCGACGTCAATCTTTACATGAATAGTTGCATCTCGTCGACATCAATTGCATCTATTGGACTCAACAGACACTTACAGTCGAAGAGTCGTGTCCCATCAGCAAAGGGTAAAATAGGAATTTTTTTAAAAAGTAAGGGCAAAAGAGGAAACAAAAGATTCTCCCCTCTTAGTCCCATTTATATATAGTATAGATTATTATTATTATATTATAACTATTATTATATTATTATATTTTATCCATCTTCGTATTCTCGTTGTGCTACTCAATTTCACAACAAATTAAAAAATATTCTTGGTCGAGGATAAAGTTTTCATTATTGAGGGATATTTCTAAAAAATAATAAATATAAAAATTCATAAAAATTTTAAATTAACCAATAAGTATTTTATTAATATTAGGTCTACATTAGTGATAATTTTTTTAATATTTTTTGTTTTTCTTTTGTCAATTTTTCTATAATATAATGAAAATGTGGATTCACCTCTCATGTTGAGGACATTTTTTATTAATATTGGTAGTTTTAAAACTTATTAGAGAAATATGGTTGTTTTGAAACTTTTTATTATATTGTGGTTTAGAATCTCGGGAGTTGTTCGTCTCTTGAAAAGACGACCGGGTGACATGACAATGAATTTAAAATTTGAAAAACACGTTAAACAACCGTTTAAAAAAAACATTTTTTAATGTAGGTCTTCTCTTCAAGAGATGACCTAGGTGAGTTTTTGCACAAGACAGTTCATTGTCATGGTGGAAATTGTGCAGTTTTTTAATATTTTTTTTCTTTTCCTACGGTTTCCTTCCCGTTTTTCAAGAAATCAAATAAGTAATTTCATTTTATAAAATTTCTTAAAGAAAATGAATTTTTATATTACAATTTTTATTTTCTTTCAAGCAATTGAAATTTAATTAAGTACTAATTATTTAAACACTTTATAAGTATAGTAAAATTAAATTTAACTATTATAATTTTTTGGAGTAGAATTAATTTTAATTGACAAGTACGTATATCTGTTTTGGATCAATATCATTTTATAATAATTAATACATAATTAAATTTCAATTGCTTTAAGAAAAGAAAATAAATTATAATATAATATTCAATTTGTTTAAAAAAATATAGACATATGCAATTACTCATTGGATTTTAACACTTATTTAAACTTCAATTTTTTTACAACTATTTAAATTTTAATTAATTCAAAAAATAGAATAAATTATAACATGATATTCAATTTATTTAAAAAATTAAAAAACAATCCAATTACTTATTTGATTTTAATACTTAATTAATTTTTGTTTCAAGTACAAGAAAAAGAATAAAATTTAATCTAAAAATTCAATTTGTTTAAAATATTTTTAAAAAATATTACTTATTTGATTTCTTAAAAACAATAATATAAAAAGAGAAAGGAAAAGCAGGCAAGGAAAAGGAAATGAAAAAAGGGGGGGAAATTTTCGCACATACAACCTTTCAAATGCTAGGCAACTAAATTTCCAATATGACAACACGAAAGTATGATAAATATCACGCATAGGTCGTCTCTTGAGAGACATCCTATGTCAACAAACTTTTTTTTTAACATCTGTCATTTAGCGCACTTTTTGTATTTCAAATTTTTTTGCCAAGTCAACAGGTCGTCTCTTCAAGAGATGACTTGCAAACGTTGATTTTAAACTACAATATTATATTTTAAAAAAAAACCATATTTCTCTAATAAGTTTTAAAAATACCAATGTTAATAAAAAAAAATGTCTCTCTTGTTGAACCCATAGACATATGGAAATGTCAACATGTCGATTTTTCTATGATATATTGTTCACACGTAACTTCGAAGATGGAGACACGTGGAATAAACTTTGATTTGTATTGATATTATCTGTGTGTGAGTGTACAATCTCTAATACATAATCCTTTGATTCTCTCTCTTGTGTGTGAATGTGTTTCACTCGAGAGCTGGTGTGCTTGTTCTCGAATTTGAAGTCGTCTCAAGGGCTTTGCAGCTTGTTCTTGAGATTGAAGTTGTATCAAGGGCTTCGTGAGCTTCGAGAAGTTTGTTGATCTTCAAGAAGTCTTTAAGAAACTTTAGTCTTCAAAGTCTTGAAGTTTTGTTCTTCAGACGGATTTGAGTTCTTTTGGATGGATTGAGGTAAGCTTCAGTCTTCAGGTTCGCAGGAGATTTTGAGCTTCAGTCTTTGGTTTTGCAGGAGGATTTGGATGATCTGAGCTTCGATCTTCAGTTCTGCGGTGAGATTTGAAGAGGATCTGAGCTTCGATCTTTGGTTTTGTAGTAGGATTTGAAGAGGATTTGAGCCTTGTTCTTCAGTTCTACAGCTGAATTTGACGAGGATCTGAGCTTCGTTCTTCAGTTCTTCGTCAGGATTTGAAGATGATCAGAGCCTTATTCTTCAGTTCTGCAACTGGATTTGATGAGGATCTGAACTTTGATCTTCAATTCTGCAGTAGGAGCTTCAATCTTCAGTTTCTTCTGAGAGCTTTCTCTTCTTCCTTTCCTTCTCCCCCCAAATGGAAGAGAACACCTCTATTTATAGAGTTCTCATTGGATGGGCTCTAG

mRNA sequence

ATGTTGAGAGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAAACCTGCACACGGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCACACAGAACGGTAGGGCGTGGAAAAGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGGCCGACCATGTGCTCGGCCTCGGCCATGGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGCCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCGGTTGCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACAATGACGTTCGCAGGAGATTTTGAGCTTCAGTCTTTGGTTTTGCAGGAGGATTTGGATGATCTGAGCTTCGATCTTCAGTTCTGCGTTCTTCGTCAGGATTTGAAGATGATCAGAGCCTTATTCTTCAGTTCTGCAACTGGATTTGATGAGGATCTGAACTTTGATCTTCAATTCTGCAGTAGGAGCTTCAATCTTCAGTTTCTTCTGAGAGCTTTCTCTTCTTCCTTTCCTTCTCCCCCCAAATGGAAGAGAACACCTCTATTTATAGAGTTCTCATTGGATGGGCTCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTGAGAGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAAACCTGCACACGGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCACACAGAACGGTAGGGCGTGGAAAAGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGGCCGACCATGTGCTCGGCCTCGGCCATGGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGCCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCGGTTGCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACAATGACGTTCGCAGGAGATTTTGAGCTTCAGTCTTTGGTTTTGCAGGAGGATTTGGATGATCTGAGCTTCGATCTTCAGTTCTGCGTTCTTCGTCAGGATTTGAAGATGATCAGAGCCTTATTCTTCAGTTCTGCAACTGGATTTGATGAGGATCTGAACTTTGATCTTCAATTCTGCAGTAGGAGCTTCAATCTTCAGTTTCTTCTGAGAGCTTTCTCTTCTTCCTTTCCTTCTCCCCCCAAATGGAAGAGAACACCTCTATTTATAGAGTTCTCATTGGATGGGCTCTAG

Protein sequence

MLRGEDVACKTVNLHTGVVLATPAPMLKSAHRTVGRGKVKPGETGASRGGGDQTRPNGLGPRERAEADHVLGLGHGPRPSRGSGLKPDPFGLGPSHLPVLPPWSIFQPDSSRLPRQLLVYRGGPKLPITMTFAGDFELQSLVLQEDLDDLSFDLQFCVLRQDLKMIRALFFSSATGFDEDLNFDLQFCSRSFNLQFLLRAFSSSFPSPPKWKRTPLFIEFSLDGL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 29..90

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0021764.1Lag0021764.1mRNA