Lag0019499 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0019499
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5: 42803975 .. 42809883 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0019499
SyntenyLag0019499
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTCGGAGATTGCTTCGTTAATCGTTGATATGCGCCGAAAGTTGCCAATTTCTTCTCTGTGTCGTATCAGCTTCTCGCAGCGTGAAGGGAACCAAGTGGCACACCTTTTAGCCCGTGTTGATGTGGGTGGTGGTTAATTTAATTTTTGGATGGAGTCCGTTTCGTCCCTGTGTTGTTTCTTTGGTTGTCGATGAAGCAAGCCCTTTGTAATGCTCTTCTCTTGTTTATGGAATGTAATGTTTTTTTGTTGGGGTGCTTTTGGTGCTTCTTTCAAATATGTTGGTATAAAAAGTGTTTCACTCCAAAATGTTTTTTTCAAAGTCCACCCAAATTCACTCTTATGCTTTGTTTAGTAAAAACACTTCTTTTTAAAATTACTATTACATACTCATTGAGTTCAAAATTATTTTTAAAATGGGGAAAATGTTCAATTAAAATTACATTTCATTTTCCTTTTCAAATAATTAAAAGTTATTTTAAAATGTATATAACTCTAAAATCACCCACTTAAAAAGAGTCATTTAAGGCCCATATGCTAGTCCATAAAACTTGTGAGTTCAGTCTCTTAGTGTTGGATTATTGCTTTTAATACTTCTAATATAGATAGTGTTAATCACGATAATAGGGGAGTCTATCCCACGGCTGATTTCTCATTAAGAGCTTTTGATCGTTTTTAATGAAAGTTTATTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCATTTAATTAGCATTTGTTCAAAAAACGAAGAAGTACACTCGAGTACTATCCTTTTTCTCTTTAATTAAATCTCAATACGTCCTTAATAAAAAAAATTAATTATAAAAATTCATCATTCAAACATAAACGTTATATATATATATATATATAATTTACAATATATATATAAATTAGTACAGACGTAACCATTATATTTATCTATATGCGTCATTTAAAAAAAAAACATTTATCATAGTATTTGCAAACCGCAACTACAACACAATTTCCAACTTTGTATTGCTTCTGCCAATTTGGGCTTGGGCTACCCACATGATTTTATTTGAGCAGATTTTTTTTTTCCTCCTCCTTCTCCATCAGTGCATAACATTTGGGGTGGGAAGATTCGAACTTTTGACCTTTTGGTCGATGATACATGTCAATTACTGTTGAGTTATGCTCATTTTGGTGATTTTATTTTAACCGTTACAAACATTTTCAATGTTATTAATATAAATTTTCTTAGTCCATACGGCCTCTTAATAAATTATCTTCTCAAGCCAACATAAGCATAATTCAACTGACATAAGACTTGTACTGATGACCAAAAGGTTTGTGGTTCGAATCCTCCCACCCCTACATGTTGTCAAAAACAATAACTTCTAATATATATATATATATATATATATATATATTATAATTTAATTAAAAATATCAGTTCATAAAATTTCAATTATCATCTTAAAAATTGATAGTTTGAATTTTTTCCTTCAATTACTAAATAAAAAGAACAATAATAAAATGTATTAAATCTCCATCGACATGCTGACACTTACATTGACATTTTCATACGTTCATGGGTTCGACATCGATATAAGAGGTAAATTGAAATTTCCACTAAACTGTAAAAGAATCAATGAAACATAAAGAGAATGGTAACGAAATGTAACTAATAGGGATACCATATTAATTTAAATATTTTTTGAAAATTTTGTTTTAAATATTTTTTTAAAAATATCTGTCAACATCGACATTTTCATAAAAATGAGATATAGACATTTTTGTTGACATCAACATTTTAATCTTTAAACATAACACGTGAGGGGAGGAAAAAAAAGCACATGATTTTTCTTTTTGAAAATTTAAAAAAAAAAGCACGTGATTTTGCAGTATATTAATTAATTAAAATAACAAAAACCAAGTTTGTTTAATCAGAGTTTATTTGAATGTGAATCCTCGTATCATTTGAGCTGTCGTTGAGTAACTTACCGACAATCAAACCAACCGTGCATTGCACTTTTTGTCGGTGGAAAATTTCAAATTTAACATCTTTTTAAAGTTTAGATTCACATTTTCGCCCCTCATATTTTTATTTTAATTTCAAATTCAATCATTATATTTTTTACAATTTTATTGCCGTTTGTATGATTTGATTAAAATTTACTAAGTAATGGAAATTCTATTCTTCTTAAAAAATAAATAATAATAAATAATAGAAATTCTCAAGTTACTTAGATTTTAAAAATTAAATTTATAAAATAGGATCTCATATTTTAGTCCAAATATAAGAGGTTTTGACAAATCTAACATTAAAAAAAAGAAAACATTAATCTAGATTAGTATTAAAATATTATTTTAATTGAAAAGGAGAAAGATGATTAAGAATAATGCTATTTTGGAGTATAATAAATAATGTTGGTTGGATTTTTTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATATGTGGGGGAGGGGGGTTCGAACCACATACCTTGTGGTTATCGGTACAACTTTATGTAATTGAGCTAAGTTATTGTTGGTGGATTTTTTTAGAATCCTTTCGTAGCATAATGAAATTCCAAAAATCCATAAAAAAAAGTAGAAACATAATTGTTTGATAAAGCTTTAATCAAAGAGAGAAAAAAAAATTTGTTGATGTCAAAATTTGGCCAAGGGACTCACCTGATCTTTACGTGCCATCAACGGTGAATTTGTAGAAGCTGGGGAAGACGTGACCTGCAAGACCAGCAAAAACCGCTGCACACCGGCGTGGTGTAGGCCACACCGCCTCCGATGCTTAAGTCAGAAAAATGGGAAAAGAGCGAAGAGTGTCGATAATTCCGTTCGGGTCCCCTTCTTCAGTGGCGAAGAGGGGTATAAATACATGTTCATGTTCCTAGGGTTTTTTAGGAGTTCGGAGGAGTTTCGGGACAAACCATGTGGATTCGGGGCGGCTAGAGGCTACAGGGTCCAAACGGGTCCCGACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCAAGGGTGGGCCGAGGCCGAGGGGCCCTACCCCTTCGGTCTTGACCCGTCCCGCTCGTCGGTTTCGCCTCTTGGGTCCATCTTCCAGTCTGATTTCTGTTCGATTGTCCTTGTCAGCTCCATGTGCATCTGGGTGGTCCAAAATTACCCATAACAAAAATAATAAATAAACTTTTCAAAGCATAAAAATTAAGGCTGAATAGGTCAAGTTTAACTTTTCTTTTAATTTTATATAATCAAACTTTAAACTTAAGAAAGGGTAAAATTAATACCTTCTTAGTATTTAGTAATGTGTGCATATATATGTGTATATGTGTAAGTTATTGTGGCTAATTTTGAGGATTTTAGTGGTTGGGTGAAATTATATTTATGGATATATTGAATATGAGTATTTTATAAGTTAAATTTTACATGCCTTATTAGTTATTCTTATTTATTTATTAAATTCAACAACATTTGGATCGGAGGTGGGGTATTTAAAATTTTGACCTCTTAGCTGAGACATATATCAATTACCGTTAAGTTATGTTCACCTTTATGATAATATGATATTTCCATATATAAATTAAGAACAATTGTACATGTATGTATTCACATAAAGACACATCCTCGAATAAAATAAATATTTACAGATTTATAATATTGATTTAGTATTGAAAATAGGATAGTGTTTTAAACATTTTTAAGATAATAATTGATGATGAAATTTAAAATATTTGAAACATGATTTCAAAATAGTGTTAAAAATTAATTTTCTTCAATACATTGTTTTTTATTATTTGTCAGTTGTATTTTCATCTTTAAAAATAATTAAATTATTACAAAAAAAGAATTAAGTAATGATTAATATAAGGAAATTTGGTAAATTAATATAGTTTGTAGAATGTGAGTCAAAGTTTATATTTGATTATTTTTTTTAAAAGTTTATATTTGATTATTTCTCCTTGTCCCAACCTCCCAAATTAAATTTAGTGGTCAAACATGTTGGTCAAGACAAAAGGAAGAAACACTTTTCACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTTTCTTTCTCCAAATTTCCACAATTTTTAAACTGAACCAATTAGTTTAAATTTCAAGTTGAGTTTAAATAATTGTCAAAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAGAGGTTGAGTTTAAATACCTGTGATTTTTTTTTTTTTGACAACTAAATACCTGTGATTATTGTTAACCAAATTGTTAGTAAAAATCTCTATTCACTCATCTGTTATGTAAAATAAAAGATAAGTTTGTTTATAATTGGAATTTTATTAATTATAAGTGCTATATAAATCCAAGCTTTTCAAAGTTATCCCCGGACTACACCAAACAAACTTTTTGAAATTCAGTTTATACGGTTCCATACTTAGGGTGTGTTTGGTTTAACTTTTCAAGTGTTTAATTTTCAAAAAAAAAATCATTTTTAAAAAAATTCTAGTGTTTGGCAACCCCTCAAAATAACTTATTAGACAATGAGATTGATAAATAAATGATTTTGAGAGAAACACTTGAAACCAACTTTTTTAAAAAAGAGTTTTAGTATACAGTAACTTGTGTATAAAAACACATGTGAGGAAATGCAACCAAACATATGGGTGTTTAAATTCTAAACATTTTTATACAAAATGTTTTTTAAAAAATGCATTCTTAAAAAACATTTAAATTAGAATGTATTCCAAACGACCCTTAGTAAAATTACGAGCCAAACATCTCTATAATAATTGATTCCTAATTGAAGAAAAAGTAAACAAAAATATATTTTTTCACTTATAATAATCATTATCAAGTTTTAGTACACTTCCTTCTCTCACATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTTCTCTCACATCTTTTGTAAACAATATATGAATTTTTCATAATATTAATTTGTTCCATCATTCTAAATGAAATTATTATAGTCTATACGATAATGATTTTAATTTATGAAATTTATTAAATCAAAAATAATTT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mRNA sequence

ATGTCGGAGATTGCTTCGTTAATCGTTGATATGCGCCGAAAGTTGCCAATTTCTTCTCTGTGTCGTATCAGCTTCTCGCAGCGTGAAGGGAACCAAGTGGCACACCTTTTAGCCCGTGTTGATGTGGGTGGTGAAGCTGGGGAAGACGTGACCTGCAAGACCAGCAAAAACCGCTGCACACCGGCGTGGTGTAGGCCACACCGCCTCCGATGCTTAAGTCAGAAAAATGGGAAAAGAGCGAAGAGTGTCGATAATTCCGTTCGGGTCCCCTTCTTCAGTGGCGAAGAGGGGTATAAATACATGTTCATGTTCCTAGGGTTTTTTAGGAGTTCGGAGGAGTTTCGGGACAAACCATGTGGATTCGGGGCGGCTAGAGGCTACAGGGTCCAAACGGGTCCCGACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCAAGGGTGGGCCGAGGCCGAGGGGCCCTACCCCTTCGGTCTTGACCCGTCCCGCTCGTCGGTTTCGCCTCTTGGGTCCATCTTCCAGTCTGATTTCTGTTCGATTGTCCTTGTCAGCTCCATGTGCATCTGGGTGGAGAAGATGTGGCCTGCAAGACGAAAAACCTGCACATACCACACCGACTCCGATGCTTAAGTCAGAAAACAACAGTAGGAGGGCTAGAGAGAGTTCGGAGGCGTTTCGGGACAAACCAGACGAAACCGGGACGGCCAGAGGCGGTAGGGACCAAACGGAGTCGGATGGGCTCGGCCCGCGTGAGCGGGCCGAGCAAGGGGTCGGGCTACGGTCTTGGCCCGTCCCCATTGTCGGTTACGCCTCTTGGGTCAATCTCCTAGCCCGATTTCTCCCCAGTTGTCCTCGTCAACTCATTGTACATCGCGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACATATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGGAGATTGCTTCGTTAATCGTTGATATGCGCCGAAAGTTGCCAATTTCTTCTCTGTGTCGTATCAGCTTCTCGCAGCGTGAAGGGAACCAAGTGGCACACCTTTTAGCCCGTGTTGATGTGGGTGGTGAAGCTGGGGAAGACGTGACCTGCAAGACCAGCAAAAACCGCTGCACACCGGCGTGGTGTAGGCCACACCGCCTCCGATGCTTAAGTCAGAAAAATGGGAAAAGAGCGAAGAGTGTCGATAATTCCGTTCGGGTCCCCTTCTTCAGTGGCGAAGAGGGGTATAAATACATGTTCATGTTCCTAGGGTTTTTTAGGAGTTCGGAGGAGTTTCGGGACAAACCATGTGGATTCGGGGCGGCTAGAGGCTACAGGGTCCAAACGGGTCCCGACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCAAGGGTGGGCCGAGGCCGAGGGGCCCTACCCCTTCGGTCTTGACCCGTCCCGCTCGTCGGTTTCGCCTCTTGGGTCCATCTTCCAGTCTGATTTCTGTTCGATTGTCCTTGTCAGCTCCATGTGCATCTGGGTGGAGAAGATGTGGCCTGCAAGACGAAAAACCTGCACATACCACACCGACTCCGATGCTTAAGTCAGAAAACAACAGTAGGAGGGCTAGAGAGAGTTCGGAGGCGTTTCGGGACAAACCAGACGAAACCGGGACGGCCAGAGGCGGTAGGGACCAAACGGAGTCGGATGGGCTCGGCCCGCGTGAGCGGGCCGAGCAAGGGGTCGGGCTACGGTCTTGGCCCGTCCCCATTGTCGGTTACGCCTCTTGGGTCAATCTCCTAGCCCGATTTCTCCCCAGTTGTCCTCGTCAACTCATTGTACATCGCGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACATATTGA

Protein sequence

MSEIASLIVDMRRKLPISSLCRISFSQREGNQVAHLLARVDVGGEAGEDVTCKTSKNRCTPAWCRPHRLRCLSQKNGKRAKSVDNSVRVPFFSGEEGYKYMFMFLGFFRSSEEFRDKPCGFGAARGYRVQTGPDGLGPHERAKGGPRPRGPTPSVLTRPARRFRLLGPSSSLISVRLSLSAPCASGWRRCGLQDEKPAHTTPTPMLKSENNSRRARESSEAFRDKPDETGTARGGRDQTESDGLGPRERAEQGVGLRSWPVPIVGYASWVNLLARFLPSCPRQLIVHRGGPKLPITY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 193..252
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 128..160
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 210..247

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0019499.1Lag0019499.1mRNA