Lag0018481 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0018481
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5: 28104681 .. 28112426 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0018481
SyntenyLag0018481
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCTTTCTACAGTGAGTATAGATCTAAGAAAACTTACTCTCGTTGACGACTTGATCGAATTCACCAACACCCTGGGGAGGAAGTCACGAACTTTTCTCCGAGATTTCTGCAGCAACACGATCAATGGAACACCACCGTTAGGAATACACCAGTATGTCTCGAAGGGATTTGTGAGGAGGTTTGTGGGAGCTTTTTCTCATAAGGGAAATCTTGGGAGGATTTTTTTTCACTCAGAGAGAACTCACACACTATCTAGAGAGCAATTGATCGATCAACGAAAAGCCAGAAACTGACTCCTATTACTTTCATAGGCGTGAACGGTTATGGAGGAGAAGCTCTTGTAAAACAAGCCACGTATCAACATCAATCAGTTGCCTTAACCGATTAAATTTTAAATTTATATAAAATTAAATTTTAATTTAATTAATAATTATAAAAATAATTAATTTATTAAATTAACAATTAAATAAATCATATTTAATTAATTTTTTTTATTTATATCATATTTAAATGAATATTCCTCACATAACCTATAGTTTTAATTCAATTAATTTAACTAAATCAAATTAAATTAAATTAAAAAAAATAATTAATTCTCCAACTAATTAATCTTTAAATTAAATATCACATATTTAATCTAACCCTATAATTGAATCATATTTACTTATATTTCTCTCATATAACCTATAGTTTTAATGTGCATCTAGCATTAATTTTAACCTATAGTTTTAATATGAATCCAATTCATATTAAATTTAATATTTGAACTCCTTCAAATATTTAATTCTCCCCTAAATTAATTTTGATCAATATTCAAAATATATTTATATTATAAAGTTTAATTAAAATATAAACTTTATATTATAATGTATCTCCATACATTATATAATTTCCCTTAGTAATTTTGAACATTTCAAATTACTTTAATTATCTCAATACCCTTTATAGGCTATCGGTGGGACCTAATGGATCTACAAATCAAAAACTCCAACGATATGAGATTAATTGGCTAAACTCATTAACCAAGATAATCAATATTTGTTAACTGTGGGTACACTCCACTATAGACCCACAGTTGCACTCTTCTCACTGCAAATATATTTTTGTGTCTACGGATATTGACCAATAGCAGCAAGTTAGTCCTTCACGAGTGTTCGTAACACCACCTGGGTCAATTACCATTTTACCCCTAGGTTACCTCTATATCCTTAAGTACCAATGCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTGAGGTCCAACCATCAAACAGAAACCCCTATCAGGCTAGTGAGACACTTAAGGGAGCACTCATCCACTTCCCCTAAAACCAGGAATGAACGAATTTCATCTTGTGTGATTATGTTCCCAGCTACTCACCCGATCTTGTCCCCAAAATGGTAGGCTTATTGAGTCGGTGAACAGACCACTCTCACCCATACAAATCAAAGAACAATCCCTGGTGAACAGGAGTCCATAACCCACTCAGGATTGAGACTAAGTTGTTTAAGTCATCCTAGTGAAATAAAAACTTAACTAGTCAACGGTGTTACAGCTAGCGGTTACTATTTCGTGGTTCGGTCATCGCAAACTCATTGTTGAGGATACCCCACTCGCATGTCCCCTACACGAACATGTTGGATCATTGGATTTGTATCAAATTCAAAGTGGGTCGCATCCAGAGTGTCACCAGAATAAGGTATCCAACCTTATCCCTATACTATAGACCCTTTAAGCTGTATCTTGAACAGTGATCCCCGCATGTCCCCACATACAGTTCAAGACTCTACAACAACCTAGGATGTTAATTTATTGGATTACGTTTATTTAGACAAGATAAACATAATATAAACAATAACACTTTATTGAAAAACACATCCATAACATGAATCGGTCAAACGTTACATTTACTATCTACTAGTTTTAGGGCATAAAACTCGACATATTTATACATATATAGTGTATTTATAACAAATAGATTTTTTCAATGAGAAAGGCTAAACCATTTTTCAGTGTATTTCTGGTTTATTTTTTAGTTATTTTTTAAAATAGAGTAGATTAATGTTTTTCTAATAAGAAAAAAGTATGGTGTTTTAAGATTAAAAAAAACAATAAAATATGCTATGTGAAAGAGTACAAAGTTTAAGGATAATTAAGGATAAAATATTAAAATTTAAATGATTAAAGACCAAATTGAGAATTACTAATACATCAAATATATTGAACTAAAATTAAAGACAAAATGAAAATATAAAATTTATATTCATATTTTGATATTTATTTAATTTAAGAAAACAAAAGTAATAAATGAAAAGAACATCAAAGAATACATAACTCAATGGTAATTGACATGTACCATCAACTATGAGACGAGAAATTTCTTCTGAAATTAAATTTTAAACGAGAGGATATTTACCTAACTTTTATCGAGAGATATTAGGAATGAATGTTATTAGGGTTGATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAATGTTGGAATTGAAATTCTAAGAAAAAAAATAAAGATACAAGATATTTATATTGTATGAAGCTTGCTTTGTAGAGTGAAACACTACGTCAAAATTGACAGGAATATGTAAAAATAACAACCAAACATCACTATAAATCATACATTTTATTTATAGTAATTTTGTGTTTTTTTTTTCTTTAGAGTCGAGCAGAATTTGGATATCAAAAATAAAAAATGTTGTCGGTAGATAATGCAACATATTGTTTGACGAAAGGAAAGATGTATTCCATGTTTTTAGAATTGTATCTCCTGTTTTCATTATTTTGAAAACAAAATTACAAAACAATAAAAATAATATTTTATTGTTTGTAAAAACAAGCCATTTTTTGAGTTATGTTCGAAATTTGTTTTGGAAAATAAGGGATTAACCAGAAAGATGGGTTGTATTTTAAAAAAAAAAAAAAATCAAATGAAAGAAGTGGGTTCAGAAACTATTTAGAAGAAGCATGCTCCATTTTTGTCGTTTATTGGAACGCGTATGTCAAAATTACGCAATCTTCATTGAATGTCTATCTTGAAAATGTGCAACCGGTCAAAATATTCAAATCCATTCAAATTTAACAGACGATTACAGCTGGGATGCGTAAGTTCAATTTATGCATTCCTTGGGAAAATGCAATTGTCAAGATTCGCTTGTGTCAAGCATAGTGACGGGTCATCGGCAGTGATGTGTCAAATTTGGATTAATTAGGTAGTTGAAAATGTTTAACCCACGCATTTCTCTCATTTTAAAACTACCATCAACATCAACAAAGGCACACAACTTATTTTTTTTCCAGGGAGTTTTGTGTGTTTTCTTCCCCTCCTTTCCGACATTAAGCTTCAGTTTCCCAGCGTCCCTTTTTGTCTTCTTTTTGTTTCTTTATTTTTCAGCTACGATTTTTTCCCTTCCCTCCGTGGCTTTCTCTCTGACGCTCATTGTCTTTCCTTTTTTCTTTCTTTATTCGACAGTAACGGCAGCGACTATTGCTTCATTTCATTAACAACTATTAACTCTTATTTAGATTCTGAGTTATGTATCTTTTATATTTAGTTTATGTTAATTAAAATTGAAAAATTTTAGATTTGGTACTATTTTATTTTTTGTAGCTAAATGATGTTTTTTTTTTTTTTGTACAGGAAACAAAAAGGGTGAGGAGAAAACAAAAAAATTCTATTTCAAGTTTGTTAAAAAAATTGAAATTCAAATAAGTTAGTTAAGTATTTCAAATTTGGTATTGATTTTTCCTCACTCGAAAACACGTTTTTCCTCCCTTTAGATTCATCACAAACCGGCTCCCACAAGTCTAAGGCCTAAGGATAACGGAGAAGACACTAGCGATCGTCCACAGCTCGATCGTGTTCATAGAAACCAAACGGAGTGACTCAATTTTGCCTCAAAAGGTTGGTTAACTCTACACTTTATTTTCAATTTGGTTTTCACATGCTTTTAATTAGTAAAATTAATGGAATTAAAGTGTTTGCAGTCCAAATCGCTTTCACATGATTGTTCTACACTTCTTCAAGTACATCTTATGTACCTCTCGTTGCTCGAAGATTTTGATGATGCGAGGACTTAAAGTTGGGGGGGGGGGGGGGGCAGGATGTCTTGTCTGACTCTACAAGAACCTATGTAATAAAGGTTCAGTTATCGACTCAAATGATTTGGGTGGCTCGCTAATACTACTGCAATTGTGGACATGGGATCAGTTCCCATTGTTGGCTCCTCGAAGACTTCAACGATATGAGAAAAACTTAGGAGACAAACCACTAACAATCCGATATGAATTTTAATAAATACAACTATACTCTTACATTTCAATTGTGTTACCTTAACTAATTATTGAACATATTATTGAAAATTAATATTAATTAGAAAAGGCCAATAAAAGAAGAAAGCTAAAGTCCTGTTTGGTTTGTGATTTTTTGGAGAAATATTTGGTTTGTGATTTGAAAATTGTTTTCGAAAACAAAGAATTCAGTCGAAAATGAAAACAAATTTCTTATTTCCATTATATCTGAAAACACGTTTTGTTCTAATTTAAACACTTTAAATTTACTTCAAATATTGAAAATTGTGTTTGGTTATGAATTTGAAAATGTAAGAAAAGATTAATATGTGTTTAGTAAAATTCATTTTTTTAAGAAAAAGTTAATTTAATAGGATTATTTCTTATTAATAATCTTGATGAATGAATATTTTACATACATACGCATATATATGCATGCAAATGATGTACAACTAAATGAAGCCTAATCACAAAAGTCCCTTTCCCCCTCATCTTCTCTCCCTCTCCTTTATCTCATCGTTGGCGCCGCCCTCTATCACGCCAACCATCGCCACCTTCATCTTCTCTCTCCCTCTCCTTCATCTTTTCTTCTCTCTCTCAACCCTCGAATCCCTTTCCCCTTCCATCCCTTTCACCTTCAAGTTTTTTTTTTTTTGTTCTTTCTTCTTGTGGTTCGACACGTTGACAGTCATTCCTTCCGTCTTCGTTCGTCTTCTT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mRNA sequence

ATGCTTTCTACAGTGAGTATAGATCTAAGAAAACTTACTCTCGTTGACGACTTGATCGAATTCACCAACACCCTGGGGAGGAAGTCACGAACTTTTCTCCGAGATTTCTGCAGCAACACGATCAATGGAACACCACCGTTAGGAATACACCAGTATGTCTCGAAGGGATTTGTGAGGAGCTACTCACCCGATCTTGTCCCCAAAATGCTAGCGGTTACTATTTCGTGGTTCGGTCATCGCAAACTCATTGTTGAGGATACCCCACTCGCATGTCCCCTACACGAACATGTTGGATCATTGGATTTGTATCAAATTCAAAGTGGGTCGCATCCAGAGTGTCACCAGAATAAGATTCATCACAAACCGGCTCCCACAAGTCTAAGGCCTAAGGATAACGGAGAAGACACTAGCGATCGTCCACAGCTCGATCGTGTTCATAGAAACCAAACGGATCATTCCTTCCGTCTTCGTTCGTCTTCTTTGGCAAACAAGGACAGCGACGATGGAAAATCTTCTAGCAGTTCGACGATGTCGAATGTGGGTGGTTCGGCAGTGTGGTTTGGATTAAGAAGAAAAAAGGGGGAATGGGCTTGGGTTTTGATGAAGAAGAAGAAAGAAGGTGAAAGGGAGGGAATAAGGAAGAGGAGGATGCGTCCATCGCCGACGAGAATAAGAAAGAGGCAGCGGCAACGGTGTGACCGACGCGAAGGGGAAGGGAGATTGAAGACTCCTTCAAGATCGGAAGACTTCAAGCTCCAAGAATCCATTAAAGCTTCAGACTCGAGATCAAGTGTTCCAGCCCTCGAGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTTTCTACAGTGAGTATAGATCTAAGAAAACTTACTCTCGTTGACGACTTGATCGAATTCACCAACACCCTGGGGAGGAAGTCACGAACTTTTCTCCGAGATTTCTGCAGCAACACGATCAATGGAACACCACCGTTAGGAATACACCAGTATGTCTCGAAGGGATTTGTGAGGAGCTACTCACCCGATCTTGTCCCCAAAATGCTAGCGGTTACTATTTCGTGGTTCGGTCATCGCAAACTCATTGTTGAGGATACCCCACTCGCATGTCCCCTACACGAACATGTTGGATCATTGGATTTGTATCAAATTCAAAGTGGGTCGCATCCAGAGTGTCACCAGAATAAGATTCATCACAAACCGGCTCCCACAAGTCTAAGGCCTAAGGATAACGGAGAAGACACTAGCGATCGTCCACAGCTCGATCGTGTTCATAGAAACCAAACGGATCATTCCTTCCGTCTTCGTTCGTCTTCTTTGGCAAACAAGGACAGCGACGATGGAAAATCTTCTAGCAGTTCGACGATGTCGAATGTGGGTGGTTCGGCAGTGTGGTTTGGATTAAGAAGAAAAAAGGGGGAATGGGCTTGGGTTTTGATGAAGAAGAAGAAAGAAGGTGAAAGGGAGGGAATAAGGAAGAGGAGGATGCGTCCATCGCCGACGAGAATAAGAAAGAGGCAGCGGCAACGGTGTGACCGACGCGAAGGGGAAGGGAGATTGAAGACTCCTTCAAGATCGGAAGACTTCAAGCTCCAAGAATCCATTAAAGCTTCAGACTCGAGATCAAGTGTTCCAGCCCTCGAGTGA

Protein sequence

MLSTVSIDLRKLTLVDDLIEFTNTLGRKSRTFLRDFCSNTINGTPPLGIHQYVSKGFVRSYSPDLVPKMLAVTISWFGHRKLIVEDTPLACPLHEHVGSLDLYQIQSGSHPECHQNKIHHKPAPTSLRPKDNGEDTSDRPQLDRVHRNQTDHSFRLRSSSLANKDSDDGKSSSSSTMSNVGGSAVWFGLRRKKGEWAWVLMKKKKEGEREGIRKRRMRPSPTRIRKRQRQRCDRREGEGRLKTPSRSEDFKLQESIKASDSRSSVPALE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 111..181
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 205..269
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 154..181
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 113..153

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0018481.1Lag0018481.1mRNA