Lag0017806 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0017806
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5: 9211927 .. 9219732 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0017806
SyntenyLag0017806
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCGCCAAATCTACTTGTGTAATGTAACTAACGCATTCTTAGAAACTCTTCCCCTACCGCATAGTGCAAAACAAGTTTGGGGGTCCAATGAGGATATTGTCCATTTTAAGTTTGGGGGGGGTGCATAACACATGTTTCTATATTCCATAGTTGTTGAGCGAAAAAAAAAAAAAAGAGAATGCTCCACTTACTTGAAGGCGTTAGTAACCTGGGGCATTCATGACACCCATCATTTGCCATTGCATGAAAGCGCTGAAAAGAAATGAGCATGCCTCGACAACCTGAAAGATGAGGCGCTCGTAGTTGGATGCTTTCATCACCAATGTTGGCAAGCCAGAACGAAGGCGCTACATCTAAAAGGATTCTCATATGAAAAAAAAATATGTTGCTGGCAACGTGAGCGCTATGAGTAAACATTCTTACAAAAGCGTTGGTGCATCCAAGTTTTGATTTAAAAGTAAGCTAGTAAAGAGGAAGAAGTGTAGGAAGGAGAAATGAGAGAAATCCATTTAAGTGAGAAAAATGCATTTTGAGGTAGTAAAAACAAAGTTGACTTTAGGGTTAGAAAGTTGGATGTTGGTATTTCGCACTGCTGAGGTAAATTTTTGTAGAGTGCGCTAAGGAATTGTAGTTAGGCATGAGGCATTGTGGCAATCTGAGAAGCAAAAAGTGTTGTTGTAGTATTGCTTGAGGACAAACAATAATTTAAGTTTGGGGGTTTGATAACTTGAAAATATCAGGTTATTAGGTGTCTAATTTAAGCTTATTGTGAGCCTCAAAAGAGTGAAAATACCCAAGTTTTAACTAATTTATATGCTAGATGTAGTAATATTGATTTATTTGTATTAAAGTGCTCATATTGATTATTATCTTTGAAATTCATACAAAACTCACTAATTCTAATTAATTGTTGCATCAGGAAAAGCTTGGCCAATTAGGCGCTAGAGCATGATGCGCTTGAAGCATGACACGCTGTAGCAGCTGAAGCATGGGAAGCTTCATGTTGTAGCAGTCTGGCCCATGGGATGCATGATGGTGCTACAACAAGTTTGGCTTCAAGCAACACCCTTTGGCTCCAAGCAACATACCCTTTGGCTCCAAGCAACACCATTTTGCTCCAAGCAACACCTCATTTGGCTCCAAGTAAAGAGAAGTTTATAAATAGGGGGAGATGAAAGGAGAAAAGATCATCCAGGGATCCAAGGATCCAAGTCTTTCTTAGAGTTTTATGTTTTATTGTATGTTGTAGTATGAACTAATTTAGAGTTTTATGTTTTATTGTATGTTGTAGCATGAACTAATTTCTTTTTATCAAGGCTTAGCCTAGGCGCCCATGATGCATTAAGATTATTTTTTGTATGCAATGCAATGAATCAATGATATTGATGCTTCTACTTAGATGTAAGAATTCTTTAATTACTAATATTCGTCTGATCAACCGATAGAGGTAATAGCATGATAAATCCCGAAAGGGTAATGAATGTGGAAATATCTAAGTAGATCAAGATAGTACATTACATGTAGTCTGGTTGTGTTAGGAATAACTCAGCCGCTTAGGATATTTCATGAATGTGTTTGGGTTGCTTTAGGGATAATTCAACCACTTGCAAGCATATAGAGAACTGATTAAACGCATGAATTAAGCAATAAGAATATTCATAGTTCATCGCATGTGTAATACCGGAAGGGAATCACATGTTTATTTCTCGCTTAGGCATCAATATCCTGTTGATTCATTGTTATGCGCTACATTAATATCTTAGCTGTCAATGTGGTTGCTGCGGCGAAAGTCTTGATAGCTCATCATCCATCGTATCTTTCTATCGCATTATTATTGCTTTTCTTTATCGCATGTTCAACTTGTCGCATCCATATTTTATTACCCCAGCACAACATCATTAGAATAGGATTTAATTTGAGATATTTTCTGTACTCGCCCTTTCCCTGTGGATTCGACCCTGAAATACTCTAGGTATTACTTGGTAGTGCAGAATGTATACTTGGATTAATGCACAACAACGATATATTCTTTAGTTAATTCAATATAAATTAGAAGTGATTAAATTTTCCTATCAGGACGACAGCGCTGCTAGAAACGGCGGCGCTGCGAGAAGGGGAAGCAGCACCGTCCATGCGAGAGGGAGAGATGAAGAGGGGCGTCGAAGAAGAACCCATGCTGCGACCCTTGCGCGAAGTGGAGGAAAACCTCCAGGGGCCGATGGCTTGCACGCGAACAACAAGGGCTGAAGGAGGGAGGCTGGCGGTGCAAGAAGAGAAGAACAAACGGGAAAGAAAGGGGGCTCACGAGAGAGAGGAAGATGCTGACGAGCACGAGGGAGAACGAGAAAGAGAGAGGCGGAGATGGGTCTTCAGGGGCTTGGCTGTGCAAGAAGAAGAAGCTGAAGGAGAGGGGGCTGGCGACTGGTGCTTCACGAAAAGAAGGAGGGAGAAAGAGATTTATTTTTTTTAGGGTTCTTCTTTTTTATTTTCCTTTTTTTAAATCATAATAAATGACTTAAGCCTCATATTTAAATTCTCACTTAAGGTCTCAAAAAAACCCAAATCAAGTCTTAATAAATCTATAAGGACCTAAGTCAATTTTTAATTTAAATACCAAAGGATAAAAGAAACTCTTGACTTCAAAAGAATTAACCCACTCCAAGCAACCACAAAAAATAAATAACTTAAAACAGCCAAACAGAAACTAGAACTCCGAATTAAATTATAATCTAACAGAGTTATTCGTACCTGAAAATACAGGGCGTTACAGCCTTGGGTCGTTAAATTAAATTTCTATAAATTAGGAAAAAGAGATTTTTAATTGAATATTTAATTTCCTACAGTTTGGAGGTTTAATATTCGATATTTATTTTAAATATCAAAAGACCCAAATCCCAAATCAATTGGGTTATTTTCTATTCCAAATCTTTCAAAAATTAAGTTTGGGATTTTAAATAAAATCCTATATAAAATCTAATTCGTAATAAAAATGGGATTTCATTCTTAAGGTGTATTTTATAAGAAGAAAGAAAAGAAAAGCCCTAGATTCCTCATCTCCCTCCATCTTTTCATCTCTCTCGTACGGCTGCCCCACTAATTTTAAACCACGTCGGAAACCACCAAGTCCCCTTCTCCCTTTCGTGAGCAGAGCTCAACGTTGAAGCTTCCCTCTGGCGAGACCCACGCAACTCGTTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTAACATTTGACTTGCTTCAATAAAGTATTATTTCTATATATTTGTTTTGCCTAAATATAACCACAAATCCAATAAACTAAGAACCCATGACTATATTATGTATACTTGAAGTTTATGTGTAACATAAGTATGGGTCAAGTTCAAGTAAATAGTCTAAATGATCTATAGTATATGGATAAGGTTGGGTACCTTAATCCTGGGGACACTATTGGCGTGGCTTGCTTTGTTCTTTTAAAGACAGACGATGTGATCCTAATCGTTCATGTATAAGACATGTGAGTGAGGGCGTCCTATGCAAAGAGTTTGCATAGAGATCGAACCAGTTGATAAGTCACTTTCACTTCACAACACTGTTTACTGTTGAAACTGAACATCTCATACATATAACCTAGGTAACTCAATCTTAATCCTGAGCTAACTATGAACTCCTGTTTATTTAGGATTATCTCTTGATTTGCATGGGTGAGAGTGGCCAAACATCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGATAAGACTAAATGGATAGCTGGGGACATAACTTTGCAAGATGGAATTCACTACTACCCGTTTTAGGGTTAGTAAAGGTTGTTCTCTTAAGTGCTGACTCTGAGTCTTGAATAAAGGGGCCCCGCCCTCTCATAACCTTGAGAGGGACTTGGTTTAGTGTTTAACCCTTGGGTTGTCCCATTAGTTTAAGTTTTAAATCAATTCAGACCTCAAACAACACGTATTCAAGGAGCTCTTGTGTTGTTCGATAAATTCCAACAAGCATCGCACCTCGTTCAGTGGTGTTTGTTAAGTTTGAGATGTTTTTAATCTTGTTAGATCTCTTGCTAGGCTCTACAAATCAATTTCCTATCTCTGGAAGTCATATGTTTGGAGCGTTGGCTCGATTACAGCTTGATTTAAGTAACATCCAGTAAGGGACAGATTTGTTTGGTGGAGTTAGCAAGTAATAAGTCTCCTTAAACCCTTTCAAACATGTTTAGAGAATCTATAGGTTAGTTCTAATTCTTTAGAAGTTATCCTTGTTGTTTAGGAGTTTATCTGGATCTTTAGAGTTGTTAAAGGAGTTCTTTAGGAGCGCTCGTAAAGCTATGTGTAAGTAGTTTCTTTCCGTTGAGTCCGTGTTGATTGCATGAGCATGTTGGTTGTTTACTCATTTTTCTAGTATTCTTTGTGATTGATATATAACTCCTTGTTTGTTTTAAACATGTTGTTCTGATTGGTTTCATTCGTTTTAAAGCATGATGATCTGTTGGTGTCTTAAGCATGTTGTGTTATCATTTCTGGGCTGTGTTGCATGTAAGTCATGGTTGCATAGTCTTTGTGCTCATTGAGAGGTAAGCTAGGTGTGTGTGCAGAGCGTGACACGAAAATCATGTGTTAAGATTGCGCTACATAATGCGAAAATCATGTTATTGGTGCAGAGCGTGATGCGCAAATTACGTGTGGGTTGTGAAAGAAGGGCGTGACACGTAAATCATGTGTGAGTGTGCGTTGTGCATGGCGCGTAATTCATGTGTTGGGTGTGAGTGCGTTACATGACGCGAAAATCATGTTTTGGTGAAGAGCGTGACATGTAAATCATGAGTTAAGTTGCGTTGCACGACGCGTAATTCATGTGTTTTGGTGCATGGCAATGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAAATAGTGAATGTAAACAAATTGTATACTTGTTTCAATAAAGTCATCTAACCCGATCATACACCGTCCATCGAATTAGACTCTAATTAATTAACC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mRNA sequence

ATGCGCCAAATCTACTTGTCTGAAGCATGGGAAGCTTCATGTTGTAGCAGTCTGGCCCATGGGATGCATGATGGTGCTACAACAAGTTTGGCTTCAAGCAACACCCTTTGGCTCCAAGCAACATACCCTTTGGCTCCAAGCAACACCATTTTGCTCCAAGCAACACCTCATTTGGCTCCAACTGTCAATGTGGTTGCTGCGGCGAAAGTCTTGATAGCTCATCATCCATCGACGACAGCGCTGCTAGAAACGGCGGCGCTGCGAGAAGGGGAAGCAGCACCGTCCATGCGAGAGGGAGAGATGAAGAGGGGCGTCGAAGAAGAACCCATGCTGCGACCCTTGCGCGAAGTGGAGGAAAACCTCCAGGGGCCGATGGCTTGCACGCGAACAACAAGGGCTGAAGGAGGGAGGCTGGCGGTGCAAGAAGAGAAGAACAAACGGGAAAGAAAGGGGGCTCACGAGAGAGAGGAAGATGCTGACGAGCACGAGGGAGAACGAGAAAGAGAGAGGCGGAGATGGGTCTTCAGGGGCTTGGCTGTGCAAGAAGAAGAAGCTGAAGGAGAGGGGGCTGGCGACTGGAGTTTATCTGGATCTTTAGAGTTGTTAAAGGAGTTCTTTAGGAGCGCTCGTAAAGCTATGTTCTTTGTGCTCATTGAGAGATGGTACTTGAGAGCATTGGCGAATGGCGAGGGTCGTGGCTTGGCTGGCTATGGGAGTGCAGCTGCAGTTCATGCTCTTTCCTTATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCGCCAAATCTACTTGTCTGAAGCATGGGAAGCTTCATGTTGTAGCAGTCTGGCCCATGGGATGCATGATGGTGCTACAACAAGTTTGGCTTCAAGCAACACCCTTTGGCTCCAAGCAACATACCCTTTGGCTCCAAGCAACACCATTTTGCTCCAAGCAACACCTCATTTGGCTCCAACTGTCAATGTGGTTGCTGCGGCGAAAGTCTTGATAGCTCATCATCCATCGACGACAGCGCTGCTAGAAACGGCGGCGCTGCGAGAAGGGGAAGCAGCACCGTCCATGCGAGAGGGAGAGATGAAGAGGGGCGTCGAAGAAGAACCCATGCTGCGACCCTTGCGCGAAGTGGAGGAAAACCTCCAGGGGCCGATGGCTTGCACGCGAACAACAAGGGCTGAAGGAGGGAGGCTGGCGGTGCAAGAAGAGAAGAACAAACGGGAAAGAAAGGGGGCTCACGAGAGAGAGGAAGATGCTGACGAGCACGAGGGAGAACGAGAAAGAGAGAGGCGGAGATGGGTCTTCAGGGGCTTGGCTGTGCAAGAAGAAGAAGCTGAAGGAGAGGGGGCTGGCGACTGGAGTTTATCTGGATCTTTAGAGTTGTTAAAGGAGTTCTTTAGGAGCGCTCGTAAAGCTATGTTCTTTGTGCTCATTGAGAGATGGTACTTGAGAGCATTGGCGAATGGCGAGGGTCGTGGCTTGGCTGGCTATGGGAGTGCAGCTGCAGTTCATGCTCTTTCCTTATGA

Protein sequence

MRQIYLSEAWEASCCSSLAHGMHDGATTSLASSNTLWLQATYPLAPSNTILLQATPHLAPTVNVVAAAKVLIAHHPSTTALLETAALREGEAAPSMREGEMKRGVEEEPMLRPLREVEENLQGPMACTRTTRAEGGRLAVQEEKNKRERKGAHEREEDADEHEGERERERRRWVFRGLAVQEEEAEGEGAGDWSLSGSLELLKEFFRSARKAMFFVLIERWYLRALANGEGRGLAGYGSAAAVHALSL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 152..172
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 131..167
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 136..167

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0017806.1Lag0017806.1mRNA