Lag0017758 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0017758
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr5: 8322724 .. 8329517 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0017758
SyntenyLag0017758
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTTTCAAAAGGGCATCCAAAAGCACTCAGATTACCTCCAGTATGGGCATCCTAGGATACACGAGCATCTCGAGATACCCGGGTATCTTAGATTACTGCAAAACAAACGTGGGAATTCAGATCCCCGATTCATGGGAATCTCGGATTCCCACGAAACAAACGACCCCTAATATCAATATTTTTTTTTTGAAAGCATACAGAAAAATTAAGTTAAAAATCGATATCTAAAAAAATTAGGTTAAAAATTATTTAATTTAGTACCTAAACTTTGATTTTTTTTACAACATGTGGGGTGGAGGATTTGAACGGAGACCTTTTGGTCTACAAGCTTGATGTCAGTTGAACTATGTTCATATTGGTACCTCAACTTTGATTTGTAACGATTTAGTTTGCAATTTTGCCCTTGAACATTAATAAGTAACAATTTAGTATATGTACTTTATAATTCGTAAGAATTTAATCGGTCACAAAAACTTCTTCAAAATTATATGTAGAGTTTTTATTATTTAATTATTTGACTTTTTTTTTTAGAAAATTTAATGATTATACTTAGTATTTTTAAATTGATTAATAATTTTTTTTTGACAACATGTGGAAAAGGGGGATTCGAACCACAAACCTTGTGGTTACCAATACAACTTGATGTCAGTTGAACTAAGCTCTTGTTGGCAATAATTATACTTAGTAGCGTATAAACATATTGGATCCCAAATTAACTTATTAATCTACGTAAGAAATTTCATTAAATCTTAACATTAATTTTTACGATAGGAACTATATTGTTACAAATTTTGAAAATACGTGGACTAAATTATTACTTACTAAAGTTCAAAGACTGTATTTGTTACAAAATTGAAAGTACATAGACTAAATCATTAAACTATTACTTTCACAGTCCAAAAATGTTTTTAACCTAAAAATTAAGGAAGTCCTAAAATTGATTTGAAACAAATAATAATAACAATAATTATTTCACTCTTTTAAACAATTTGAAAATTCTTATTATTAATATTTCTTTTAAAATAGTGGGTTTTTTTTTTTTTTAGTTCAACAATATTTGAAAGTGGGGGATTCGAACCTCTGACCTCTTGGTCGAGGGTACATGTCAATTACTGCTAAGTTATGCTTGCTTTGACAGTAGTGTGTGTGTTTCTTCAACGTTTTTTGTTTATCGTATTTCTTCAACGTTTTTTTGTTTATCATGTGATTAAAATATCTATCAATCCTCTATCAATTAACCAAAACATTGGTGAGTCGTTAAATGCTTCTTGCAGTTCAAAAGGATTGAGGATATTAAAAATAAATTAGAGATAAAGCAATGTAACATAGCTCGACCTAGACAACGTACATTACTGCTTAGATACATTTTATTCAAAGTTCCCTCAATTTTATATGCATCATAATTACCTGATCATGACGACTAATCATAAGTTTTGTAGAAAATATTTAATAAAAATCATTCAATTATCATTTCCTTATAAATATGAGGGTGTGTTTGGTTTAACTTTTCAAGTGTTTAATTTTGAAAAAAAAAAAAAATCATTTTGAAATAAATTTTAGTGTTTGGCAACCATTAAAAATGACTCATTAAATAATGAGATTGAGAATAATAAATCATTTTAAGAAAAACACTTGAAAGCAAAATTTCAAAAAAGAGTTTTTAAGTATATAATAACTTGTGTATAGAAACACTCATAAGGAATGTAACCAAACATATGAGTGTTTAAATTCTAAACAATTTTTATAGAAAATATTTAATAAAAAATGCATCCTTTAAAAACACTTAAACTAAAAGGTATACCAAACTACCTAAATCTCATGTGGGTTCTTTAGGTATGATTTGATTGTTCTTTACCTCGAAAACCCCTTTGAATTGTATCCTTGTTTGCTTTCAAAAGGCTTCTTAATTTGATTATTGTTGTTGTGGTCGATTCTGGACCACACCAGAATCCAAGGACTAAGCAGGACAATCCAATACCAGCTCAGGGAGACAACCAGGAAACGGGCCCTGGAGGAGAAACAAACCAGAGGGTTGGGCCAAGGCCGGAGGGATCGGGCCTTGGCCCAACCCATATGGTCGGCCTCGGCTCAAGGTCGAGGTCGAGGCCAACCACTCGGCCCACTTGCGTGGGCTAAGCCCTTACGACCCCGTTCGGTCCCTGCTGCCCCGGTCCGCCTCGATTCCACACGGTTCAATCCTAAATTGCCTCTGAACGTCAAGTAAACCCTAACTGAAGAGACAGGTATAAATGAGGCCTCCACACCCAAAAAAGGGGTTCGAAAATTTATCTACATAAATACTTTTAACTGTTGATCTAACTTAGGCATCGGAGTGCAGGTGGCCTACACCACACCGGTGTGCAGCGGTTCTTACTGGTCTTGCAGGTCATGTCTTTCCCAACTTCTACAAATTCACTATTGGTGTCACGTGAAGGTCAAGTGAGTTTTCTGTCCGGATTTTGGCATCAACAATTGTCATAATCGCTCCAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATATATATATATATTACATTGATGTTTAAGTTACACACTTCCAACAATTCCAAACGAAAAAAATATAGATACGAAAGTCCTTATTATCTTTTTCCCGAACAGGATGGAGACTATGCACAATTTTTTAAATCATTCAAGTGGAATTGTGCACGATAGAATTGGATGAAATTTCTTTATGGTGTGTTAGTTGTTGTTGGGTGGGCACACAGATTTGTTTTCTAAAACCCAACATTTAATTCCCAATTGCCAAAGTCAAATTAGAGCCACAGAAAGTCAACAAAGATGAGCCTTCAACTCAGCCAATTATAATGTCCCTAAAAAAAGCAAGGCAATTCAAAGTGTCCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATATAAACATTTGAAATTTAATGTTTTTAATACCCACAATCATTGACCATTTCTTTTTGGTAATTCTAATATTCTTAGATAAAATCATTATTCCCTGGGTGAGGATTCGAAACTCTGACCTCTTGATCGAAGGTACAATGTCAATTACTGTTAAGCTACACTCACTTTGGCTTCAACATTACGATGATTAGATTGTGAGTATTGTTTCCGTCGAATATTTTTGTTAATTAGTTTATAGATAAATTTTTAAATTTTATTTAAAGTAAATATTAATTTCACAACTTATTTTGTCTAGATTTCAATTTAATGGAATTGATAGTTGAATGTAGTTACTACTACCATTAAAAGTTTGAACTTTTCCAACCATGTTCATCATGCAATATTCTAAAAAAGAATATAGTTATTGATTGTGATATGATAATTTAAAAAATTAAAGTTTAGTTCTTATTTGATTGGCTTGTTAAATGTCTTGTTTAAGTCACTTCTGCAATCTATAAAGATGTCTTGGAATATATATTTGTTGTAAAAACCATCAAATAAAATTTTAGACATAATGGAAGGAAAGTCTTCTACAAGTTTTTATTCAAAGTACCACCGATTGACAATAAATTTTTATTCAACTTTAGTCAAGAATATATAAGGGAAAAATATATTTTTAGTCTCTCAAATTTGGATTAATTTTTATTTTAGTCTCTGAGTTCTCAAACTCGACAATTTAGTCTATGAGGTTTGGATTTCGTTTCATTTTAGTCTCTCAATCCATTTTTCCGTTAAATCCTAACGATTTTCTGACGTGACACCTATTTTTATTTAAAAAATTATTTTTTAATTTTTAAAATAAAAATATTATTAAATTTAAAAAAAAAAAAATTCTTCTTCTTCCTTCTTCTTGTCCAGCCACCACCCGTCAATGATCGTTTCTCGCCGGCCACCGACGCCGACGGACTTTTTTGTTGGCCTCTGAGTTTGAAAACTAACCCAAATCTTAAAGGTCAATATTTAATAATATAATTAACAAGTTGATATTTAGTCTTTGATATAAGATTAGTTTTATAGTTAAAAAAAAAATCATGTTCAATTGGGATGTGTTATAGGCAATTTTGGACCACCCCGATGTACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGGGAAGAAATCTGGGCTGGGAGATGGACCCAAGAGGTGAAACCGACAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCGACCCCCTCCTCGGCCTCTATGGTCGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTCCGACTCCGCTTGGTCCCTACTGCCTTTGGTCGCCCCGGTTCCGTCTGGTTTGTCCCGAAACGCCTTTGAATTCCTAAAAACCCTAGGAGCATGAGTAGGTATTTATACCCCTATTCGCTACTGAAGAAGGGGACCCGAACTCTCTACTCTCTTCTCTCACTCTCTAGCCCTCCTACTTCCATTTTCTGACTTAAACATCGGAGTCGGTGTGGCTAGCACCACACCGGTATGCAGGTTTTCCGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCGCTCTCAAACAAATTCATTGTCGATTATCACGTAGAGCAAAGATAATTTACCTAGCAAAACTTGATCATCAACAGAATGTAATAAAATACCCAACTTGTAAGTACTTTTCTTATCCAGATATAAAAATTGCAAAACTAGCTATAGATATATATATCTATATATCTATCTTTTTTAATCTTATATATATTTTAATTCTAAAAAAAATCTTATATATATTTCTTAAAGTAGATACGTTAATCATTTTAATTAGTTAATCAATAGGTAGGTTAATTAGTTTTTTTTTTTAAATATTTTTTTGAGAAAAGGTTAATTAGTAATTTCTTATTTTATTAGCCATCGATATTTAAATTAATCTTTGATTTAGGTTAATCTAGAACTATCCCATAAATTAAAATATATTTCTTTCAATTATTTATTTATTTTTGTGAAAACTGCAATTATTTAAGTTAATCAATAATTTATAAGTTTTTTTTTAAAAAAATATATGTTTAAATATTGAAAAGAAAAATTTCTCCAACATCAAGGCCCAAAAAATGTAAAAACTTT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mRNA sequence

ATGTTTCAAAAGGGCATCCAAAAGCACTCAGATTACCTCCAGTATGGGCATCCTAGGATACACGAGCATCTCGAGATACCCGGAATCCAAGGACTAAGCAGGACAATCCAATACCAGCTCAGGGAGACAACCAGGAAACGGGCCCTGGAGGAGAAACAAACCAGAGGGTTGGGCCAAGGCCGGAGGGATCGGGCCTTGGCCCAACCCATATGGTCGGCCTCGGCTCAAGGTCGAGGTCGAGGCCAACCACTCGGCCCACTTGCGTGGGCTAAGCCCTTACGACCCCGTTCGGTCCCTGCTGCCCCGGTCCGCCTCGATTCCACACGGTTCAATCCTAAATTGCCTCTGAACGTCAAGCATCGGAGTGCAGGTGGCCTACACCACACCGGTGTGCAGCGGTTCTTACTGGTCTTGCAGGTCATGTCTTTCCCAACTTCTACAAATTCACTATTGGTGTCACGTGAAGGTCAAGCAATTTTGGACCACCCCGATGTACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGGGAAGAAATCTGGGCTGGGAGATGGACCCAAGAGGTGAAACCGACAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCGACCCCCTCCTCGGCCTCTATGGTCGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTCCGACTCCGCTTGGTCCCTACTGCCTTTGGTCGCCCCGGTTCCGTCTGGTTGCAAACCTTCCAGGGCTTGGTTAATGCAAATGGGATCTGGGGTTTGCCTCCCAATAATCTGTTACGTAGTCCTGAATCCACTCACATCGATATCGAGGCGTTGGAATTGGACGGTTATGGGATCATGCCAGTTCTATCGTTCCAAATTGTCCAAGCACCAACACAAACGCATGATAATATATTATTTGCATATCCAGCAAAACTCAACCACATCGATCTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTTCAAAAGGGCATCCAAAAGCACTCAGATTACCTCCAGTATGGGCATCCTAGGATACACGAGCATCTCGAGATACCCGGAATCCAAGGACTAAGCAGGACAATCCAATACCAGCTCAGGGAGACAACCAGGAAACGGGCCCTGGAGGAGAAACAAACCAGAGGGTTGGGCCAAGGCCGGAGGGATCGGGCCTTGGCCCAACCCATATGGTCGGCCTCGGCTCAAGGTCGAGGTCGAGGCCAACCACTCGGCCCACTTGCGTGGGCTAAGCCCTTACGACCCCGTTCGGTCCCTGCTGCCCCGGTCCGCCTCGATTCCACACGGTTCAATCCTAAATTGCCTCTGAACGTCAAGCATCGGAGTGCAGGTGGCCTACACCACACCGGTGTGCAGCGGTTCTTACTGGTCTTGCAGGTCATGTCTTTCCCAACTTCTACAAATTCACTATTGGTGTCACGTGAAGGTCAAGCAATTTTGGACCACCCCGATGTACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGGGAAGAAATCTGGGCTGGGAGATGGACCCAAGAGGTGAAACCGACAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCGACCCCCTCCTCGGCCTCTATGGTCGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTCCGACTCCGCTTGGTCCCTACTGCCTTTGGTCGCCCCGGTTCCGTCTGGTTGCAAACCTTCCAGGGCTTGGTTAATGCAAATGGGATCTGGGGTTTGCCTCCCAATAATCTGTTACGTAGTCCTGAATCCACTCACATCGATATCGAGGCGTTGGAATTGGACGGTTATGGGATCATGCCAGTTCTATCGTTCCAAATTGTCCAAGCACCAACACAAACGCATGATAATATATTATTTGCATATCCAGCAAAACTCAACCACATCGATCTTTGA

Protein sequence

MFQKGIQKHSDYLQYGHPRIHEHLEIPGIQGLSRTIQYQLRETTRKRALEEKQTRGLGQGRRDRALAQPIWSASAQGRGRGQPLGPLAWAKPLRPRSVPAAPVRLDSTRFNPKLPLNVKHRSAGGLHHTGVQRFLLVLQVMSFPTSTNSLLVSREGQAILDHPDVQGADEDNREEIWAGRWTQEVKPTSGTGQDRRGRVFGPTPSSASMVGPLARAEPVRLRLVPTAFGRPGSVWLQTFQGLVNANGIWGLPPNNLLRSPESTHIDIEALELDGYGIMPVLSFQIVQAPTQTHDNILFAYPAKLNHIDL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 184..209

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0017758.1Lag0017758.1mRNA