
Lag0017703 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGATGCGCGAGCTGGTTACTGGAGGAGCTGCTTGTGCTGTTCCTGGTTCTTCTTCTTCTTCTAACCCTCTCGGTGCCCTTGCCAACGCTCTAGTTGGCTCCTCTTCCAAGACCCAGGTTCTTTCCCTCTACCTTCTGAATTTGAATTTGATATTTGTTACTAGAATTGTGTTTTCTGATACTTTGATATGTTAATTCATGAACTTGCTGTTGCCTAGTCTTGTGAAATCAGATTGAGCTTTGTCTAACTTGGTCATAGTTGCTGCTTTTGTTCTTATCTTCTTTTTGTTACCAATTTGGTTTTCCTTTATATGGGTTTGGTCTTGGGTGTGGCAAAGTAATTCGGTAATTCATCTTTATGTTTGAACTGATTCTGAGCAGGAAAGGCTACGGGAAATTCCTACATCGCAGCTCACAGGTCCTGAAAGGCCTTTTTACCCTGAGAGCCATGGGCAGCTTCCTGGGTCTGAGTTTGATCACCCACCGCTTCAACCCAATGAACAGGTTCGCTTTCCTTTTCCTTTTTTTTTTTGGTTATAATTTTAAATTCTTGTATGTTTTGCAGAATTTCCTTTCAGAATTCACATGGGGTTTTGAACTTATCTATTGTGTCTATTTTGCTTGATGTCAGGCGTCAAAATTTTTTAGTGGCTTCCACCAGGCTGCCGATCAGAGTGGTCTGGCCTCTGCATGGAATGAGGTACAGGGCGGTCCTCCTCCTGCCCACTTGAGAGAAATGCAACCAAGTCTTGCTGAATTCGATCGTATTTATGATCAAATGCCTGTTTCTCAACCGATATTGGATGGTACTTCTGAGTTTCTGCTTTATTCTTTAAAATTCTGGATGGTTGGCATAGTTTGCAGTTCGATTGCCTTTTGTGTTGCTGCCGAACCATTTTCATTTAATTACAAGGACTAAAATTCAATTCAATGACATTCATCTTTTGTTTAGTCTGGGTTCCCAATTCAGGACCTGAACTCAATTCCTTTAAGTGAACTAATGGAGCTTCAAGTTGCAGTTTAATGCATTTCAGGGAAGTTTTGGTTTGAGACATGGAGTTCCAGGCTTTTGACCTGAACTTCCTAATCATAGTCTTGAAACTCCAATTCCTGCAAATTATTGCCGGAGTCTACCAGAGTTTGGAATTCCTGAAAATTTGGAATTTCATTTTGAATTAGATAAAATTTTAAATTGGAGGCTAAAGCCTAATTAAAATTTATGTCAGCGGGTTGGTCTTCCTGTGGAAACCTAAAGTATGTTATGAAATAAGCAGAATGTTCAACCTTGACTGATTTCGTAGAGTGGAAGATTCATTTTAGTTCATCACAAAGTTATAAACATTCAATATTGACTACGTACCATCTGTTAGTGTTAGAGCTTGATTTATATTATTTTCAGTCTGACTAATTAGTTTATATTTTGACTTCACCTTTACTGTAAACCAGGGCCACCGCAAAGAGTGCTGTCAAGCTTTTTGCACTCATTTGTAGAGAGTAGCCGTGGTGGAGTTCCTTTTCATCCTACCCCTCTGCCTTTGTTGGGACTATCTGAAGGTGATAAACAATGTATACGGGATCGTAGTAGCATAATGGCTCGACATTTTTTTGCAGACAAGAGCGAAGACTTCATTAACGCGCAGGTTTGGAGATTCTCTGTTTAGTACCCATTCATAAGAAAGCATGTAGTTAACATTTTTATACCAAATTTCTAGACATTATCCAAGCTCTAGTTTAAGTGCAATGGGATTTCACCATCTTCAGGTCATGTCTCATGTTTGGCTTTCATTTTTTTCCCCCATGTTGTTTTTCTCCCTGTTTTCATTTCGTTTTATTTTTCTTACAGATATATTGTTTTGGGTTAAGAAACAATACTTCCATTTGTCTTGATAGAACAAAAAACAAATCTTGAAAATTTTTATTTCTTCAAACATTTATGATTTTTCAGATAAGAGATAATTCATTAATGCCGAAAGAAGTACATGAAAAGGGGAGTCATTGGCTCTAGACACCAAATGTATTAAAAAAGTGATCTTCTAACAGTGTTCATAAAAAAGAACAATAGTTGCAATTCAAGTGGTAAATCATAAAGGTAAGTTATTGGAGTTTCTTTGTTTTCATTCCCTCCAGGTGAATGCACTTTTATCTTCCTTAGACATTGACAACAGTAAACAGGTTAAGGGGCCTCAACCTGGTAGGTTTCACGAGTTGGAGGATTATTGGAACGAATCTCAAGCTCTCCAGAGACCTGGTGGTCATATTGCTGATGGATGGGCTTCTGAATATAGCCTAAACAGGGAAAAATTTGCCAATCATGAGGCTTGGGCTCAATCCTTTGAACAACAATATGGTGGCAATGGTTGGGCCTCTGAGTTTGAGCAGGTAAGGAGCTGCAGCTTGTCCTTCAAGTTGCACCTATAATGCTGATCTCTATCTGATCTATCCATATTACATGATCTGTGACTAATGATTGGCTTTCTAATGATCATTTTGTATTTCATGCTTTGAGTTAGAGTGATTAATTCACAATCATTTTTTCAATGATAATCATCAAACTGGCATTCGGTTGGCATCACATCATGAACTTAAAATCCTTGGTGGTTATTAACTTAGAATTAAGAACTTTATGTTGGATTGGGAGCTGTGAAGTTTAATTGGCTCTTGCTTTAGACTTGGTCATACAGAGTTATTTTAGCATGTTAGAAAATCTGGACGTACAGAGTTATTTAAGCCATGCCTATTTCATTTTAAGGTTTAGACTATGATAAAGCTGCTTAGTAGTAGTTTTGGACAGTTTATTTCCTGGTTGATCACCATCAACTACACTCTGGCCTATGTGTTTGGGTCCTTGTCTTACTTTCAACACCCTAGGGTAAATATGTATGTACTTATATGTCCTTCACTCTTGGTTAGTATAATAATTGATTCTGTATGCACAATGCCTAATTTGACTCTCAGTCAACTATAATAACTTATATTTGACTCCACGGTTTGTGGATTGAAACTCTTTTTTTTTTTGATAAGAAACTCTTCATATATTTCCACAGGAGAAGTTTCAGTTAGCATCGGCAGAAAGAATGGCAGGTGGTAATATGATGAATTTATCTGCAATGGAGCAGACTCGCAAACTTGCCAATACATTAGCTGAAAATAACGACCCTAAATTTCAGGTTGATATTTTGTATTATGATATTAGTATTTTATTCATCTCTCTCTCTCTCTCCTTTTTTTTTTTTGAGTTCAATGATTGTAGGGGTGAGGGATCAAACCATCGACCTTTAGAATGGTAATTGATGCCTTAGCCACCAACCTATTCTCGGATTGACAATATTTCATTATGATATTATCTGAAACATAACTAGTGTTTTCCCATTCATGTCTGATGAGAGTGCAACACATAAGTAACAAACAGTTGGTTTGATTAATTAGGCTTGGCAACGTTGTAAAATTATTTTTAACAAAAAAAGTGTCCTATTATGGTATAACAGAAAAAAGGGTTCTATTATGGTATAATATCGTACCAACTTTTTTTCCAAATAAAACCAAAGGTCAAACTTATGGCTTTCCACTGGAGTATTTACATTCTTGTGTACTGTATGTTAAAATCAGACTAGCACCCTAAATATCTTTGTTTGTTAGGTGGTTGTAGATTTTTAGCATATGCTTGTTGACGGATAGATGACTGGTTTTCACTATGCTGCGTCTTCTTTGTTTTTAACATGGTTCTTACATTTTTAATAATTCCTATTTAGTCTTTAGTTTTGAGGAAAATATCAGCCATCTAATAACATTTTTTCTTCTGGTTTTGTTTCTTCATGGGCATCTTTACTTCCTTGCATTAGGTGGCCTCAGTGTTGCCTTCTCCTTCTCCTGACCTTTCTTCCTTGATCTCTTTAGGTTTTTGTTGTCCTCTAACATATAGGTAGACGATTGATGTGGAGATCTGTTTGTTGCCCCTAGGAGAAGAGAGGTTAGGGTTTGGACCCCCTATCCTTCTAGGAGTTTTTCTTGCCATTCCCATTTTCATTTTGTCTTTCCCTCCTGCCTCGTTAGCTGGTCCAAAGGCTTTAGTTTTTGCCTCTCTAGAAGGTTAAAATTCCTAAGAAGGTGAAGTATTTGGTGTGGCAAGTTTTACTCAATATTTTGGATTATGCTCGAGATACTCTTCCTTAGTTTTGTACCCACAATGGTGCATTCTTTGTCGGAGGCATGAGGAAGACTTGAATCCCTATGGAAGTGCTAGTTTACAAACTACCTTTGGGGTTGTGGGAGGAGTTTGTTCGGTATTAGCGAGGTACGTAATAGAAATGAGCAGTCTTTGTTGGAGGAGATGCTCTTGCATCCTCCCTTAAGGGAGTAAAGCAAAGTGGTGTGGTAGGCTAGCTTCTTTGCTAATAGGATGTTGGCTTGACCAATATTTTAAAAGGCTTATGGTAGCCTCAAGGTGTTTTCTCATGGAGAAGCGAGAGGCATAAGCCTTGAGGCGGTATGAGGCGTAAACCTCATTTTAAATTAAAAAAATATATTTAAATCATAAAACATCAAACTTTATCTATTCTTAACCTTATAATATTCCTTAGAAATCTAAAACATGCTAAAAAATCAATAATGACAAAGAAAAAATCCTAGTAGTCTATTGATGTTAATCAATGCATCAACTTTCTTGTGTTAATAATAATCTAAAGCTTATCCACAATATAAAAAAAACCTCAATAGTCCATTGAAAAGAAAATAAAAGTGAAGTAAGAAAACATAATAAAACTCACCTTGTTGTGAAGAGATAAAAATGAAAAGAAAACAAAATTAAAGCATGGAAAAATAATAAAACTCACCTTATGTTGCGTTGCTTTCGCCACCTTATAATTCTTTTCTTTGGCTAGTGCAGCCACTCACGCTATCTTAAAATAACCACCGCTTGGACTTCTAAAACCATTTCGACTCCTAAGGCATTTGCCTTTTCATTTTGGGGCGAACTTTCAATTTTCTTTGATCTT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BLAST of Lag0017703 vs. NCBI nr
Match: XP_022940955.1 (peroxisome biogenesis protein 5 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1384.8 bits (3583), Expect = 0.0e+00 Identity = 684/728 (93.96%), Postives = 703/728 (96.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. NCBI nr
Match: XP_023005312.1 (peroxisome biogenesis protein 5 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1383.6 bits (3580), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/728 (93.82%), Postives = 702/728 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. NCBI nr
Match: KAG6596803.1 (Peroxisome biogenesis protein 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1383.2 bits (3579), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/728 (93.82%), Postives = 702/728 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. NCBI nr
Match: XP_023539736.1 (peroxisome biogenesis protein 5-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1380.5 bits (3572), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/728 (93.54%), Postives = 701/728 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. NCBI nr
Match: XP_023539737.1 (peroxisome biogenesis protein 5-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1379.0 bits (3568), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/728 (93.41%), Postives = 701/728 (96.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMA3 (Peroxisome biogenesis protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 968.8 bits (2503), Expect = 4.1e-281 Identity = 494/734 (67.30%), Postives = 588/734 (80.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54MD1 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=pex5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 253.4 bits (646), Expect = 8.9e-66 Identity = 190/641 (29.64%), Postives = 300/641 (46.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZMQ9 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Gallus gallus OX=9031 GN=PEX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 241.9 bits (616), Expect = 2.7e-62 Identity = 167/500 (33.40%), Postives = 249/500 (49.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P50542 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PEX5 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 239.2 bits (609), Expect = 1.7e-61 Identity = 173/535 (32.34%), Postives = 268/535 (50.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O70525 (Peroxisomal targeting signal 1 receptor OS=Cavia porcellus OX=10141 GN=PEX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 235.7 bits (600), Expect = 1.9e-60 Identity = 175/536 (32.65%), Postives = 267/536 (49.81%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FS68 (Peroxin-5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446384 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1384.8 bits (3583), Expect = 0.0e+00 Identity = 684/728 (93.96%), Postives = 703/728 (96.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KSS7 (Peroxin-5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498348 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1383.6 bits (3580), Expect = 0.0e+00 Identity = 683/728 (93.82%), Postives = 702/728 (96.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DGX3 (Peroxin-5 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020388 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1354.3 bits (3504), Expect = 0.0e+00 Identity = 668/728 (91.76%), Postives = 696/728 (95.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L1F9 (Peroxin-5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500246 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1354.3 bits (3504), Expect = 0.0e+00 Identity = 668/729 (91.63%), Postives = 696/729 (95.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BKZ0 (Peroxin-5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490975 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1354.0 bits (3503), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/728 (92.17%), Postives = 696/728 (95.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. TAIR 10
Match: AT5G56290.1 (peroxin 5 ) HSP 1 Score: 968.8 bits (2503), Expect = 2.9e-282 Identity = 494/734 (67.30%), Postives = 588/734 (80.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. TAIR 10
Match: AT3G11540.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 7.6e-12 Identity = 63/241 (26.14%), Postives = 104/241 (43.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. TAIR 10
Match: AT3G04240.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 3.5e-09 Identity = 52/220 (23.64%), Postives = 101/220 (45.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. TAIR 10
Match: AT2G32450.1 (Calcium-binding tetratricopeptide family protein ) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 4.3e-07 Identity = 66/279 (23.66%), Postives = 115/279 (41.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0017703 vs. TAIR 10
Match: AT1G05150.1 (Calcium-binding tetratricopeptide family protein ) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 1.3e-06 Identity = 55/232 (23.71%), Postives = 99/232 (42.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
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