Lag0015677 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0015677
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr12: 19876177 .. 19880973 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0015677
SyntenyLag0015677
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGAGAGGATGGGCGCCCTTGTTCAAGACCCAGAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTGCTTACCCCAATAGGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTTTTGCCCCTGAAATGGTAGGATTATTGAGTCAGCGAACTGGCCACTCTACCCATACAGATCTAAGGACAATCCCTCCTGAAAAGGAGTTCATAATTGACTCAGGATTGAGATTGAGTTACCGAGGTCATCCTATTGAAATAGAAACCTAAACTAGTCAACGGTGTTACATCTAGTGGTTTCTATTTTGCGGTCCAGTCTTATGCAAACTCATTGCACAAGATACCCCCACTCGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAAGTGGGTCGTATCACATAGTGTTACCAGGATAAGGTACCCATCCTTATCCCTGTACTATAGACCATTTAGGTTGTTACTTGAACATTGATCCATGTATGTCCCCACATACTAGTCCAAGTTTCATCTAAACAACCTTGGATCTTAGTTTATTGGATTTGGGTCAAATTGTGCAATTTCAGTAACAATAACTCTTTATTGTTGACACAAGTGAACAATTTGTCACCATTCACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAATCCAACAACTCCCACTTGAACTAAAACTCTAGTTTAGTGGGATGTACAATAATCTATCATGGCAATGAGTGTATCGATACATGTAAAATACATAAAACGTATATATACAATGTACAAATACAATAAACTAGGGCATCCACTATACCCATTACAATTCTCCCACTTGCCCTAGATTACATCTTTGTACTTATCTCGTAGATCTAGACCATCTAGATGACACTACAACAAATATCACTTACGATAGCATTAAAAAACGCTATCGTAGGCTTTCCATAGCGTTTTTTGAAACGCTATCGTAGCCGATGTTATTGAAAGTCTCTGACTTTTCATAGCGTTTTTTCAATGCTATAAAAAAGGCTATAAAAATTCTATTTCAATTGCGTAATTTTAATGTTATGGAAATTTTTCATAGCGTTAGCAAAAAACGCTATGATTGCCCTTTAATAGCATTTTCTATAGCTGTAAAAAAAGTTATAAAAAGTATATCATAGCATTTTTAGACACGCTGTTATAGCCGATGTTATTGAAAGTCTTTGACTTTTTATAGCGTTTTTTCTATTTTTTCAATGCTATAGAAAAAGCTATAAAAAAATCAAAATTTTATTGCACATCTTTAATGTTATAAAAACTTTTCATAACGCTAGCAAAAAATGCTATGATTGCTCTTTAATAGCATCTTTTTATAATAGTTAAAAATGTTGTCAAAACATAATCATTTTTTATCTCGTCATTGTGATAGGCAATGTTATGGATAGTAGGTAACTTTTAATAGCATTAATACATACACGCATACATTTGTACCATTTTTGAGTAATATGTAACAATTTCTATAACATTTTATATGAGTACCAAATATTTTCAAATGTTATTGTAAAATAAACTCATTTATATAATCATACAATGTATTTAAATGCACTTACATCAAAATAAATTTTCAAGAATAGACATAGTAACAAAATTTACCTATAATAAATGACATTACCAAATTTATCCCTGTTATTCGTTGAAACACTTCTAAAAATTTCGACAGCATAACAACATATTTATAGTTAACCCAAGATTTTCAACCACCTACTTAAGAGAACACATAACTCCAGAGAATTCCAAACAGAATTACGAGTCAAATCTCATAACAAATTTCATTTAAATAACTCAAATAAACTTATAAGTCTAACACAATGCTAACCACAAGAGTAAGATATGTCCCTCAAATTAAATAACACCCAACTGAATAAAACGACTAAGTCTTTCTAACAACCACTATTTAAGCACAAGACAACAATGAAAAGACTTAGAGAGCTATTATTGTTCCTCAGACCTCTTCCTCAGCATCACCCGATTCGTAGTAATCCTCATCACCTGCAAAATTTGATGGTAGGTCAGTACAAGCCATGACACTAAGTAACTGGCTCACACCTGAAGAGCCATCAAAGAACATACAACAAACTAAGCAACATCATGTTTTTCAAACACAACTAAACATGTTTTTTTATATACATGATTGGCAACCAACATAAAACTCTTGAAATGATGCCCAACGAAGATTATATTTCAAAGTATATATTATCTAAAATAACTATTAACTTTACTTCTTTTAAGAAAAGCTACCATGTCATAAACTAAACTACCACTAAAAACACAATAAATCGCAAAGAAAGTCACAAGCTAACTCTTGTAGTCTTCCTCATTTTCCATAAAACAATAAAGCAAAACCCTTGTTGTCTTTTCCAACAAAATTTCACTAATTCTACAAGTGTATAATATGCATTGCAAAATATTGTAACAAAATCACAAGTGTAACACTTCTAAACTTCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATCTTGGTGTCTCCTAATCTCTTCACCCTCCCCTAAACCAAGCAAACTGAAAATTGACTAAAAGGTTGCATTATAAAAGGAAATACACAATTTGCTTCTACTTTCATATTAAGCTCAAATTCTTATAAACATGCATGTCCATAGGACCAAAGAAAACAAAACTTGATAAATTCCTAAGAACATGAACAAACTTAAAAACAAAACTTGATAATTCGCTAATGAAGAAAAACAATAACTCAAGAAAAACATAATTTAAGCTAGAATCTCAAACTATTAAACCAAAATCTCAAAACTAACAAACTTTAGTCAAAATTATAAAGTATGATCACACTCAAAACTAAAAAACCTAGACCGAAATTATAATTAAGCTAGAATTTCAGAGTAGGTCATTTTCATTGCCTAAACACATGCATCCATTTATGCTTGCCATCAAAATATGTGAAAATTGTAAAATTCCAAGATTTCAACAAAATATGTCAATTACCTTTGAAGATAAGCCTTCTAGTTTGTTGGCCCCTTAGATTTTGCACCTATTGTTGATGTGGTAAGCCTTTTGAGCTCCTTGATCGTTGGATTTATCGTGAAAAATGGTTATGCTACTGATGTGATTATGCAGGTTGTTGCTGGAGGGCTTATGAAATTTGTTTTGTTGAGAAACTGGAGGTAATGGGTGGTTCTATTGTGGGTTTTTTGATCTTTGTTGCATAGCATATAAGTTTGCTTGTGGTCTATATGAATGTGTTGAAAGTGGTGGGTTTCCTTGTGAAGTAGATGGCAACTATGGTTGGTTGGAGGGTTGCATATTTTAAGAATATAAAAGCTTAATAAACACCATTGTCAAGACAAAAGAAAATAACTCCATGACGAGCCTAGAAGAATATTAAGAAGCTAGACTTGATGGATGAAACATGGTAGTATCCCTTTGTAGAAAGAAGCAACTTTGAAGCATATTAACAACAAAGAAGGTGAATAAAGTATATTAAGCATAGGAGGCCACCCATGTTGGTCTTATTACCTATGGAGCTTGTGATAGACATATAAGTAAGATCCCATAAAGCCAAATAACCGACCAAGAATATTAAGCTAAAAAAAAAAAAACAAAAAACTAACAAGTTAACAACAAAGAAAAAAAACTACATCAAAACTTCAAGGTAAAATGATGTTGGCTTACAGAATAGTAGGGAAGTCTGTCGAACAGAAACCAACCCAGCTAATGCTGAAAATATCCTATTATATATTGATTCAAAAGTTAGAAAACGAGCACAAACTCAACTGCAAGTGTAAGATTTGGTTGCACCAATTATCTCCCATGGAAGTCACAAGTTATTACACTTATATGAAATTTGGGATTACAAAACTATTTAACAGGAGTTTCCACATAAGGATAAGAAGTTCAAGAGGAAGATGGAAAATCTATGGCAAATGAAAAATACAGCACTTGGGTGAATATTGATGGCCTACTAACCTCATCACTACAAGAAAAATTGCATTACCTGACACTTGAGATTTTATATTAGTTGACATTTTCTAAAAAAAATGTCAAGAATTTGCATTTTTAACCAAAAAAATGTCAAGAAAAATGTAAAAACACGGAGTTTGACGGAGTTTTCCGGATTTTGTTGCACGCCACAAAATACTTGACACTTTTAAAATGTCAAGAACTATAATAATTTACTTGACATTTAAAAAATATCAAGTTTTATCACGGTTTACTTGCTACATTTTAAATGTCAAGTATTACTTACCTAAGTGATAAAATCGTTTATTTAGAAAAAATCGAAAACCCTAATAACCCTCTCCCTTTACCAGATACCTTCTTCGCCGTTGTTCTTCTTCCAGCTGTGAGCATCAGTCCAGTCGTTTCCGTTTTTCTCTTCTTCTTCGACCGCCAACAACGCTCCTCAACGCCGGCACCGACGATGACCTCCTCCGGTGACACGCGAGATCCACGGCGGCGGCAGGGCGTGCGTTAATGCTCCGGCGGCGTCCTCTGTAGCAGTGGCGGATTGGGTTTGTTTTCTCAGTCTTTAATTTCGCTGACCTCTCCCTTTATTTCCCTCTATCACTCGTGGTTTCTCTCCTTTTTCTCCGGCGATAGCAACACGGAAGCAGCCATTCACGGCCAGTCTGCGAGCAGCATCGTTTTTGGTCATCTTCTTCAAGTTTCCAGTAGTTTGGACCAGTTCAGTGGTGTGGGTGTTTGTTGCTTGTGCGATTTTTTACGAGGTAGCAGCCATGTACAGTTTTCGGCACGTTTTGAGCAATGGGTCTTCGATTCGCGGAGGTTTTAG

mRNA sequence

ATGAGAGGATGGGCGCCCTTGTTCAAGACCCAGAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTGCTTACCCCAATAGGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTTTTGCCCCTGAAATGGTAGGATTATTGAGTCAGCGAACTGGCCACTCTACCCATACAGATCTAAGGACAATCCCTCCTGAAAAGGAGTTCATAATTGACTCAGGATTGAGATTGAGTTACCGAGTCTTATGCAAACTCATTGCACAAGATACCCCCACTCGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAAGTGGGTCGTATCACATAGTGTTACCAGGATAAGACCTCTTCCTCAGCATCACCCGATTCGTAGTAATCCTCATCACCTGCAAAATTTGATGGTAGATTTTGCACCTATTGTTGATGTGGTAAGCCTTTTGAGCTCCTTGATCGTTGGATTTATCGTGAAAAATGGTTATGCTACTGATGTGATTATGCAGGTTGTTGCTGGAGGGCTTATGAAATTTGTTTTGTTGAGAAACTGGAGAATAGTAGGGAAGTCTGTCGAACAGAAACCAACCCAGCTAATGCTGAAAATATCCTATTATATATTGATTCAAAAGTTAGAAAACGAGCACAAACTCAACTGCAAGTATACCTTCTTCGCCGTTGTTCTTCTTCCAGCTGTGAGCATCAGTCCAGTCGTTTCCGTTTTTCTCTTCTTCTTCGACCGCCAACAACGCTCCTCAACGCCGGCACCGACGATGACCTCCTCCGGTGACACGCGAGATCCACGGCGGCGGCAGGGCTCTTTAATTTCGCTGACCTCTCCCTTTATTTCCCTCTATCACTCGTGGTTTCTCTCCTTTTTCTCCGGCGATAGCAACACGGAAGCAGCCATTCACGGCCAGTCTGCGAGCAGCATCGTTTTTGGTCATCTTCTTCAAGTTTCCAGTAGTTTGGACCAGTTCAGTGGTGTGGGTGTTTGTTGCTTGTGCGATTTTTTACGAGGTAGCAGCCATGTACAGTTTTCGGCACGTTTTGAGCAATGGGTCTTCGATTCGCGGAGGTTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGAGGATGGGCGCCCTTGTTCAAGACCCAGAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTGCTTACCCCAATAGGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTTTTGCCCCTGAAATGGTAGGATTATTGAGTCAGCGAACTGGCCACTCTACCCATACAGATCTAAGGACAATCCCTCCTGAAAAGGAGTTCATAATTGACTCAGGATTGAGATTGAGTTACCGAGTCTTATGCAAACTCATTGCACAAGATACCCCCACTCGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAAGTGGGTCGTATCACATAGTGTTACCAGGATAAGACCTCTTCCTCAGCATCACCCGATTCGTAGTAATCCTCATCACCTGCAAAATTTGATGGTAGATTTTGCACCTATTGTTGATGTGGTAAGCCTTTTGAGCTCCTTGATCGTTGGATTTATCGTGAAAAATGGTTATGCTACTGATGTGATTATGCAGGTTGTTGCTGGAGGGCTTATGAAATTTGTTTTGTTGAGAAACTGGAGAATAGTAGGGAAGTCTGTCGAACAGAAACCAACCCAGCTAATGCTGAAAATATCCTATTATATATTGATTCAAAAGTTAGAAAACGAGCACAAACTCAACTGCAAGTATACCTTCTTCGCCGTTGTTCTTCTTCCAGCTGTGAGCATCAGTCCAGTCGTTTCCGTTTTTCTCTTCTTCTTCGACCGCCAACAACGCTCCTCAACGCCGGCACCGACGATGACCTCCTCCGGTGACACGCGAGATCCACGGCGGCGGCAGGGCTCTTTAATTTCGCTGACCTCTCCCTTTATTTCCCTCTATCACTCGTGGTTTCTCTCCTTTTTCTCCGGCGATAGCAACACGGAAGCAGCCATTCACGGCCAGTCTGCGAGCAGCATCGTTTTTGGTCATCTTCTTCAAGTTTCCAGTAGTTTGGACCAGTTCAGTGGTGTGGGTGTTTGTTGCTTGTGCGATTTTTTACGAGGTAGCAGCCATGTACAGTTTTCGGCACGTTTTGAGCAATGGGTCTTCGATTCGCGGAGGTTTTAG

Protein sequence

MRGWAPLFKTQNQPLREHTSAYPNRGRSEFHLVLLCSQPPFGFAPEMVGLLSQRTGHSTHTDLRTIPPEKEFIIDSGLRLSYRVLCKLIAQDTPTRMSPTWMLWIIASVSNTKWVVSHSVTRIRPLPQHHPIRSNPHHLQNLMVDFAPIVDVVSLLSSLIVGFIVKNGYATDVIMQVVAGGLMKFVLLRNWRIVGKSVEQKPTQLMLKISYYILIQKLENEHKLNCKYTFFAVVLLPAVSISPVVSVFLFFFDRQQRSSTPAPTMTSSGDTRDPRRRQGSLISLTSPFISLYHSWFLSFFSGDSNTEAAIHGQSASSIVFGHLLQVSSSLDQFSGVGVCCLCDFLRGSSHVQFSARFEQWVFDSRRF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 258..277

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0015677.1Lag0015677.1mRNA