Lag0015479 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0015479
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr12: 13922503 .. 13926235 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0015479
SyntenyLag0015479
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGACGACTCAGAGCAGGCAAAAGAGTTATGCAGACACCAGACGTAGAGAGTTAGAGTTTGTTGTTGGAGACTTTGTGTTTCTGAAGGTTGCACCATGGATAAACCACTCAGTCTAAGCTAAGAAGACATTGAATATTATCCATCAAGTCCACGCATAAACCACCCCAAAAAGAGCTATGGATTCACAAGCTTCACTATATCCATCAACTCCAAGCATGGACCACCCAAAAATGGTTATGGATTCTCACAAGCTTCACTATATGCATCAAGTCCACACATGGACCACCCAAAAAAAGCTATGGATTTATGCTCGTGAGAGGCATCATGGCTTGAGTCCCATACATGTTGAGGACTCTAGAATTACTCTCCTTGTTTGTCCTTTAGTGAGAGGATCTGTCAAGTTCCTTTCGAACCTCACATATTCCAAGAAGATAACTCCATCTTTCAGTAATTGTTTAACGCCTCAATGTGTCAGGCGTATGAACTCAGATTTCATAGTATAACAAGCAATGCAAGTCTGTTTTGTTGATTTCCATGAGATATGTCCTCCACCAAAGGTAAAAGCGAAGCTTACCTCATCATTATTTTTTACCCAATTTGCATTACAATATCCTTCAAGGACAGTAGAAAATTTGTTAAAATGCAAACAGTAATCCATAGTACCTCTAAGACACCTTAATAAGCGAAGTAGAGCAGTCCAATGTTATTTACCAGGGCTATGTGTAAATCTACTCAGTCTATTAACAACATAATTAAGTTTTTCAGTTGAACTCAAAATAATAATAATAAATATATAAATAAATTTTTCTTAGTTGTTTCCAATTTGGGGCATTTTTAAAGCATTTTGCAGGGGTATATCTTCTTATTGAGAGGGCTGATTTTTCAATCGACGCATCTGCTGGAGGGGGTTGAATTTTACATGTTTCCCCCTAATAAATGTATCGATTCTTGTGTTCGTCCCGTGTGTTTTTTCTAGAAAACAGTTCTTGAGTACTAAGAAGATGTCACATCTAGATTTTCAAATTAAGTTGGTTTCTTGGATTTTTTGAATTTCAAGCTTCCTAGAATTTCTCTAACTTTTTTAGGTAGGTTGGTTTTTTGGATTTTTTGAATTTCAAGCTTCCTAGAATTTCTCTAACTTTTTTAGGTAGGTTGGGTTTTTGGATTTTTTGAATTTCAAGCTTCCTAGAATTTCTCTAACTTTTTTAGGTAGGTTGGGTTTTTGGATTTTTTGAATTTCAAGCTTCCTAGAATTTCTCTAACTTTTTTAGGTAGGTTGGGTCCTTTGATTTTTTGAATTTCAATATTCCTAGTTTTTAGGGGTATTTTCTCTCTCATAAACTATGATTTAAATTTTAAACGTTAGGAACCTTGGACAGTTTGTTGGTGGCATTTTTGTCTTCTACAAATAGGGATTTATTAATCATAAAATCAATTAGCCATCTATTTAATTTATAAACTTTTGTAGCTATTTTTCAAGCCACCTATTTATTTTTAGACATTTTTCTTGTTGTCCCTTTTATATATTTTTATATATAATTCCAGTCATGTTATCAAAAGAAAAAGCTGGCCTTGTTGGTGTAAACATCTTAAGCCATCCTTGGATCGGGTTTGAGATCATGTAATTTTTTTAAATTTTATTCTTTTTCTCACTCTTTTAAAAAACTTTTATTTCTCATAAATTTAAATTGTAGGCTATATTTTGTTTAAAAAAATTACTTACAAATGTGAAATAATAACAAATTTGGTCCATAAATTTAGGATATGTTTGACTTCACTTTTCAAGTTTTTAATTTTATAAAAAAAAACATTTTAAAAAAAATTCTAGTGTTTGATATCCACTAAAAATTGAAAGTTCAAGAATCTCATTAGATACAAATGTAAAAATTTCAAAATTAAACTTGTAATATAACCAAACAAATAAATAATATTACAATATTTGTTTTAATTTCTCCTTTAAATATTATTTTTATATCAAAATAAACAGAAATGGATAAAAATATTTTAAAATTTTGTTGTTTTCTTAAAATTAATCTTATGATATAAAATGTATAGAGAAGAATTGCAATGAATAAAATTAGTAGTTTAGTTTCATTTATGAAAATTTTAGAATTGAAATTTTGGAATTATTTACTTGTAAATTACTTTTACGAAATTTCAAATGAAACCCCTCTGAATAAAATTTCTGGATTTGTCACTGTTTGGAAGAAAACAAACATAATTTTCAAAAATCAAATATAAAAAACCAAATGGTTATCAAATGATTTTAATTATAATGCAATTTCTTCTCTCCTTCACTCACCCTTAAAGTTGGAATGATGTACTTGTGTGTATGTGTGTATATATTTTTAGTTCAACAATTGTAGTGTAAGAATCGAACTATTGATTTTTATTATGGTAATTGATATCTTATTCGATGAACTATATTCTGATTGACTGAATGACTTACATATATATTTAAATAGAATAGGGCAATTTTTATACCTAGCTACATGAGTTTGAGGGTTTGGTTTTTGCAATTTAAAAGTTTTGAAGTACAATTATATAACAAACACTAAAGTTTAGAATTGATTTTTGCAATTCATACAAAAGAAAGAAAAAAAAATAGAACTTAGGATTATAATACCTAAAATGATATATTGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAATGATATCTTGATTTCTCTTCTAACCAGGAAAGGAAAAAAAATCACATATTCATTTGAAATCTTTTTTTGGTTTACCCATGGTAGAGGTGAAGGATGCAACCATCAATCTTCGAGATGATAATTGATATCTTATTCAATGAACGGTGCTTGAATTGATTATATATTTAATTGAATAATAAAGTAAACCACTTCAAATCACATTGAAATAAAGAAATTTAAAATCTTTTAGGGAAAAATACACTTTTAGTCCCTGAGGTTTGAGTTAGGTTTCATTTTGGTCCCTGAGTTTTCAAACTCAACAATTTAGTCCCTCAGGTTTGGTTTTAGTTTCATTTTGGTCCCTCCATCCATTTTTCCGTTAAAAACTAACTGGTGGATGACGTGGCTTTATTTTTTTTATTAAAAAATTAATTTTTAATTTTTAAGAATAAAAATATAATAAAACAATATTAAGATAATAAAAATATATTAATTTTTTTTTATTCTTTCTCTCTTTCCTCTTCTTCTTCTTTCATCTTCTCCACCTTCACCTTCAGCTTCAACTTCATCTTCACCTTCACAGCTTGTCGTTGCCGGCGTTGGAGCCTCGTCGGAGCTGCCGCCGTCGTTACAATTTTTCTTTATTTTTCTCTTTTTTCTTCTTCTTTTCTCTCTTCCCATTTTTCTTTCTTCCCTCTTCCTTCCTTCCTCCTCCCTTCCCTCTTCTTTCACTGTTAAAAAAAAAAAAAGTACAGGAAGGGGAAACCCCTCAAATCCGGTTGGAACGAAGGGTGGCAGATCTGGGCATTGGTCACAAACGACGATTACGACTCGATCGAAGGTCGCGACTGCTTGACAGATCTAGGTGTTGGTCACGAACGACGATTCCGACACGGTTTCAATCGAACGGCTATAGATATCGATCAGAAACTGCTTCAGACGCTACTCTTCAGATCTCGGGTTCGCGAACGGTGGCTTCGGCAGAGCTTCAGGTGAACTGCTTCAGAACTTGTCGTCGGACAGCTTTAGAACTCGACTCCGGCACAGCTTCAGACGAATTGCTCAAGAGCTAG

mRNA sequence

ATGAAGACGACTCAGAGCAGGCAAAAGAGTTATGCAGACACCAGACGTAGAGAGTTAGAGTTTGTTGTTGGAGACTTTGTGTTTCTGAAGGAAGGGGAAACCCCTCAAATCCGGTTGGAACGAAGGGTGGCAGATCTGGGCATTGGTCACAAACGACGATTACGACTCGATCGAAGGTCGCGACTGCTTGACAGATCTAGGTGTTGGTCACGAACGACGATTCCGACACGGTTTCAATCGAACGGCTATAGATATCGATCAGAAACTGCTTCAGACGCTACTCTTCAGATCTCGGGTTCGCGAACGGTGGCTTCGGCAGAGCTTCAGGTGAACTGCTTCAGAACTTGTCGTCGGACAGCTTTAGAACTCGACTCCGGCACAGCTTCAGACGAATTGCTCAAGAGCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAAGACGACTCAGAGCAGGCAAAAGAGTTATGCAGACACCAGACGTAGAGAGTTAGAGTTTGTTGTTGGAGACTTTGTGTTTCTGAAGGAAGGGGAAACCCCTCAAATCCGGTTGGAACGAAGGGTGGCAGATCTGGGCATTGGTCACAAACGACGATTACGACTCGATCGAAGGTCGCGACTGCTTGACAGATCTAGGTGTTGGTCACGAACGACGATTCCGACACGGTTTCAATCGAACGGCTATAGATATCGATCAGAAACTGCTTCAGACGCTACTCTTCAGATCTCGGGTTCGCGAACGGTGGCTTCGGCAGAGCTTCAGGTGAACTGCTTCAGAACTTGTCGTCGGACAGCTTTAGAACTCGACTCCGGCACAGCTTCAGACGAATTGCTCAAGAGCTAG

Protein sequence

MKTTQSRQKSYADTRRRELEFVVGDFVFLKEGETPQIRLERRVADLGIGHKRRLRLDRRSRLLDRSRCWSRTTIPTRFQSNGYRYRSETASDATLQISGSRTVASAELQVNCFRTCRRTALELDSGTASDELLKS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lag0015479 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0015479 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0015479.1Lag0015479.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0015074 DNA integration
molecular_function GO:0003676 nucleic acid binding
molecular_function GO:0008270 zinc ion binding