Lag0015392 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0015392
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr12: 12078196 .. 12081407 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0015392
SyntenyLag0015392
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGTGGAGAAATTGAAAGGATTTTCGAGTGTTTGTGTAGAGAGGTGGTTCTTGGTGCGTTTTTTGCCATGCCTTTTAATTTTGCTTTGCAGCTGAAACGTAAACAATCCACACTGGATTTGGATATATAGAGGAGAGAGAAAGGAGAAAGAGAGACCGAGAAAGGTAGTTTGGTTTTGTATCCAATTCCAACTTCTCTGTCTCTTGATGGACAAATTATTTAAATGCAACTAGCAGTTTTACGAGAAATTTTTAGGTGTTCTCGTACGATGAGACTCGTAGTTTTGCATTGTTGGATGTAAAGACAGAGAAATAGTTAAAGTATCTTGATTTTGCATCTAACGGTTGTTAAGTAATAAATAAATTTGAATATTTACATCCAACCTTAAAAATGGAGTAGAATTTCACCGGAAACAATTAATAATTTTTCTAGTTTTACACGGTTTCAAATCTCATACTTGATAAGAAGTATAGATAACTTAATGCTAAATTGTACTGATGTGTTAACACTTGAATCTTTATCCATTAGAGTGTTTTTTTTAAGAGCACGATTTAATAAATCTATTTTGGTTAAATTACAAGTTTGGTCCCTCAATTTTTTGGGTTGTGTCAATTTGTTCTCTGAACTTTAAAAAGTGTTAAATAAGTTTTCGAACTTTAAATTTATTTTCTCAGTAGGTTCCTGAACTTTAAAAAGTATCAAATCCATCCAACTTTCAATTTTGTATCTAATAAGTCATTGATCACCTATTTGACATTATTTGAAATTCACAGGCCTACTCGATAGTCCAAATAGACACAAAATTCAATTACATATCTAATAGATTTCTTAATTTTTAAGAATTTTGAATGTGTCAGAGACTTATTAAACACGAAATTAAAATTTGATGGTTCTATTAGACATTTCTAAAGTTAAGTGAACTATTAAACACAACATTGAGAGTACAATGACCTATTAGACATTTTTTTTTAAATTTTGAGACCTAATTGATACAACTCTTAGGACTAAATTGTAACAAAACCATTTATTTTTATCCAATTTTGTTTATGATTTAATTTTTATTTTATTTGGTAGTTTAACAAAATGTGAGAGGGAGGATTTTCCACCCCTCTGAACATTAATGTTTCATCATACATTTTGGGATGAGATTTGTTTATGATGTAATAAACCTATGTAATTTGTTTTATGGATGGTAGATTTTTAGAGCCTGATTTTATTATATCCTTGTAAATGATAATTTTTTTTTTGTTTATTCAATATTTAATTGTTTAAAATATTTTAATTAATTGTAATTAATTGATCAATTAAGGAATATGTTATATTAAATAATCTAAATTAAAATTAAAAATAAAGAAAAAAGACCAAATAATTGATTGATATTATTATTTTAATATTTTATATATAATTATAGCAAAGTATATTTTGTAATTCCCAAATGTTTGATTTTTTTTTTTTCAATTTAGACTATTATTTTAAGATTTTCAATTTAATTCTTTTTGTTAAAAAATTTTCCAATTTAGTCTCTCGTAGTTCTTTTCCGTGAGTTTTAGTCTCTCACAATTGGTGAATGTTAAAGTTGATCAATAATGAACTTACCCTGACATAATACTTGGTGAATTGATGGAAATTTAAAGGAGACACATGTTATCTAAGAGGAACAAAACTTGAAATTTCTATCAATTTCTTAGAAGTTTGGAGGAGAAACTGTATAAGCTTTCTTTTTTTAAATGAATATATTTTTCCTCTAAATTTTTGTTAATTTACCAAGTATTGGTTATGTCAGGATGAATCAACCAATTTCAACATTCATCGGCAATAAGAAACTAAATTGAAAAATGTTAAAACTTAAGGGACTAAATTAAAAAAAATTCAAATAATATAGATTAAATTGAAAAAAGAATCAAATCGTTATAAACTAAAACATATATTTAGCCTATAACTAATAAGCAAAACATGTAAAACAAACACACCACTTTTTTTTAGTTCAACAACATTTGAGGGTGGATGGATTCAAACCTCCAACCTCTTGGTTTATACTATAGTTACATGTCAACTACTGTTGAGTTATGCTCACTCTGACTAAAACAAACAACATAATATACACAACTAGACATTAATTATCAAGGTATATCTAAACATAGATTTTTATTATTTCAGACATTTGAATTTAAGTATTTAATTCCAGTGTTTAATATTCAAATTCATAGAACAATATCATCGTTCTGAAGAGACCCTAAGAAATATGTAAACACATCAACGACTGAGTTGTAAATTAACATTTTTGAAAAAATTATACGTGCCAAATTGGATTAATCAATTTCGACTTGTGGCAAGTACAAGTGAATAACATACTTATAAAATCTAGGTTATAAGTAGTTGTGCTTCAAAAGAGTTTGACACTAATGGTGGTCCACTAGTAGTTCCAAGCTTTGAATAAAGAGGTTGGGTAAAGAAGTCTAACATGAATGAAAAAGTTGAGAGAAAATGAATCATTTGTACTATCAATTATTTCCCATACACTTGAAATGATCTACACATATCTCAGTCGGTCAATACATTGCTAATCTATCATTTTAAATATTTAATTTAAGAAAGTCCTCCCTCTGTTTGAATTAAAATGATCTAAATAAGAAAAATAAATAGGATTGATGGCCCTTATAATTTCTCCAACCAAAATGCGCAAGGATTAAGTTAAAAAATTTTATAAAGAAGATACAATTTATTTTCTAACTTTTTAAAGGTTTTTCAATATTACTAAAAATTAAAATGAAGCCAATTAGAAAAAAAAATAGCTTATATAATCTTATCCTTTTTCATATACATATATACTTTATAATTTGAGATAAATTAGGAAAAACCATTAGTCCCCTTCTTTCTTCAATCTCAACTCTTTTTTATTTTAAATATAAAGATTCTTTTTGAGGTTCAACAATTGTTATAGGTAATTTTGGACAACCCCATGCACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGGACAGAAATCGGACTGGAAGATGGATCCGGGCGGGGAAACGGGCCAGTGGATCAGGTCAAGACCGAAGGGGTCGGGCCTTGGCCCGACCCCATGCTCGACCTTGGCCAAAGGCCGGGGCCGAGTCCCACTGACTCTGTTCGATCCATACCTCCTCTGGCCGCCCCGGTTTCACCTGGTTCATCCCAAAACGCCTCTGAATTCCTGGAAACCCTAGGAGGATGA

mRNA sequence

ATGGGTGGAGAAATTGAAAGGATTTTCGAGTGTTTGTGTAGAGAGGTGGTTCTTGGTGCGTTTTTTGCCATGCCTTTTAATTTTGCTTTGCAGCTGAAACGTAATTTTGGACAACCCCATGCACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGGACAGAAATCGGACTGGAAGATGGATCCGGGCGGGGAAACGGGCCAGTGGATCAGGTCAAGACCGAAGGGGTCGGGCCTTGGCCCGACCCCATGCTCGACCTTGGCCAAAGGCCGGGGCCGAGTCCCACTGACTCTGTTCGATCCATACCTCCTCTGGCCGCCCCGGTTTCACCTGGTTCATCCCAAAACGCCTCTGAATTCCTGGAAACCCTAGGAGGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGTGGAGAAATTGAAAGGATTTTCGAGTGTTTGTGTAGAGAGGTGGTTCTTGGTGCGTTTTTTGCCATGCCTTTTAATTTTGCTTTGCAGCTGAAACGTAATTTTGGACAACCCCATGCACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGGACAGAAATCGGACTGGAAGATGGATCCGGGCGGGGAAACGGGCCAGTGGATCAGGTCAAGACCGAAGGGGTCGGGCCTTGGCCCGACCCCATGCTCGACCTTGGCCAAAGGCCGGGGCCGAGTCCCACTGACTCTGTTCGATCCATACCTCCTCTGGCCGCCCCGGTTTCACCTGGTTCATCCCAAAACGCCTCTGAATTCCTGGAAACCCTAGGAGGATGA

Protein sequence

MGGEIERIFECLCREVVLGAFFAMPFNFALQLKRNFGQPHAQGADEDNRTEIGLEDGSGRGNGPVDQVKTEGVGPWPDPMLDLGQRPGPSPTDSVRSIPPLAAPVSPGSSQNASEFLETLGG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 104..122
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 38..122

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0015392.1Lag0015392.1mRNA