
Lag0015089 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCTGTGACTCTCTTAATACTCGTGATACACACTTTTTTTCCAATTTCGTATGAAGGTGCCCAGCTTTATTGGAAAAATCCGTTGAACCAGTTGAAGGTACTTGTCCAATCCCTCTTTCCTTTGATAGGTATTCTTAAGGTAATTTGAATTATAAATGAACGGGAAGTTTCGATACTTGGTAGTTGGAAAACATTCACTTTTTAATGTTCTAAGTAATTTGAGTGCAAAGACAACTTCCTTATGCCCTTAATGTTAAAATGCACCTATAAATTATTTTCTTTGTCCATACGAGAATTTGAGCTTGGCAATAATACATAGATGAATGTCTTTTAGGAAAGGCAAAAAGTTTGTTAAGTGACTAAAAAGTTTTAGCAGAAATGTAACATTTATTGCCTTCACAGAATTATTTAGATAGGTTGAAGTTGAACAACATAACAGTCAGAATCACATTGCTGAAATGATGAAACGGTAGATTATCATATTTTATTATCTTATCAATGATACATTTCGTTTATAGTGCACTTCATCTTATGATTATGGTTATATATTTTTATTGTACCTTGGTTAAAGGTAGTTTTTAATTCTTTAGAATGAGCAAGTCAACATTCTAATAATTGGAATCTCTTGCTTATGAATTGTCAATATCCCATCGGGTTTTGGTGGCTATGATGTTGTGCTTTTAACAAAATTAATTCTAAAGCTTTCCCGTTTTCCAGGTCATTTGCATAATTATTTTGGCTGCTGATTTTCTCATTTATGCTCTATATTTGTCACCGGTGGCCTTTGATTATCTTCCATTCAGAGTTGCACCATATATAAGAGTTGTCTTTTTCATCATGAATATCAGGTATTTCTTGACAGGACTCTGATTTTGCTTGTCATTTTTATGTGCATCACATCTTATGTACTTAAAGATATCGTAGCGTCTAATTCAAATACTCTTGTATCAGCAAGTAACTTAATTTCAAGGAATGAATTTAAATATACTTCTTTTGGCAAATGATTGTTTCGAGATAGCCCTTTTAGTGGGTTAAAATGGACCAGTTAGTTCATATTAATTGCCAGCAGGTAATTATCCATTGTGTAAATAAGCATTTAATGGTGTTGGATGTGTTGCGGAGATTGAGAGAAGGGAGCTTTCTACATTTCATTTAAAGATAAAATTTCTGTGTAATATCAATTTTTGTCGTTGTTGGGTCTCCTGAATCCTGATATCTAAAATGACCATCATAATACTCTCTTATTCTACTGATTGAAGAAAGAAGGCTTGAGATTATTTATTTATGGGAAAGGTTATGTTTTGATTGGGCCCTAATATTTTATCTTCATTAAATGCTGATGAAAATTCAAATGCAGTACCTATTCTGATATGGAATTACCTCTTCCATTAATATCTGATTCTTGTTCCTTATTGGTTGGAGGCAATCCTGTTTATGATTTAGTTATTTACTTTTAAACAACTCCAACAAATTTAATCATTTCATTTGGTTCTTAGGCATCTACGGGAGAGCATCATCATCCTGGCTGGAATGCTTGGAACATACTTGAATGTCTTGGTTTGTAGATAACTTTGGCATAATAAATATTCTGTTTCTGTAGAATTTATAATATACCTACATGACATCTTATACTTACCTTTTACTTGAAAAGTTGAAGAACTGTGAGTCTAAAATTATATTATCTTAATTATTATACCAACTCTTACTACTTTATTGCTACTTTTCTTGCAGGCTCTAGGGCTTTTGTTTCTTCTGTTTTCCAGCTGGTTGGCATATGTTATTTTTGAGGATACACAGCAGGGGAAAATAATATTTACTTCTTTTGGAGCCACATTATATCAAATGTTTATTTTGTTCACAACATCCAATAATCCAGATGTTTGGATACCTGCCTACAAGTAAGTGGGTAATATAGAATGATTAAAACACTGTTCATAGCTTTTATTGATATATTTATCTACTAGTTTGACCAGTATTCTTTTCTTCTTCATTCCCTTTGAAATGTATTGATAAGCTCTTTTCAGGATTGTAAATTTTGGAAATGGTTGTTGTCCTTCTGCTATATAATCCAAGAAACAAGTTTAGGAAACTGTTTCATGAGGTAGCAAGCAGACACTGGAATAAGAGATTTGTGGAGGGATATACCAGTTTTCTGTTGAGTTCTTGCTTAGAGGGAAAATTAATCCCCCTTTTCAATCACTATCCCGTTCCTGCATTTTGTACTGGTTGGGAGTAGAATGATGATGAAACATATACTATTAAAGCATGTTTTGGTCCAGAGAGTCCATGAAGACTTGAGATCTGGGTTTTCATTCATAAATTTTGTGATATTCAAAATGGTCTCTAATCACATTCAATTTGATCCCTCACGGACACTTTAGTTTGGCTAGCGTGTCCGTGTCTGATGTTGGACACTTAGACACTCCGACACTTGTTGAACACGTATCGGACACTTGTTAGTAGAACTGATATGTGGCAAACACTAGTTATACAAAGTCAATATAGGTTCATATCAAACACTTGTTAAGTATACTAAATAGATACAATATTAAATTACAAAAATAATACATTTTAAGAGTGAAATACATTAAACTCATTTTCTTAAGCATACAAATGCATTAAGTTATTGATTTTGAATCTCCTTCCTGTATAAAAATGATATATATTTTAAAAAATGTATATTTTATTTAACGTGTCTGTGTCGTGTCCCTATCTTAGATTTTTAAAAAATGGCGTGTCATTGTGTCCGTGTCGTGTCATGTCGTATCTATGTCTTGTGTCCGTTTCCGTTCTTCTTAGATCCCTACATTGCACAAGACAAGACCATAAATTTACCATATCAGTTTTAGAGATAGAATTACTTTTGAGAGAGAAACATAATGATTTCATTGATAAATGAAATGATCGGGATAAAACCCCGAACCATTAGCAAATTACAAAAAGGACCTCCAATTAAGAGTCAAAGAAGCAAGACTATAATCCTTAAAAGGAGGTAAACATTTACACCAGTAAAGAGCATTAAAAATAAATAAATCCAGAAAGTTTTCACAGGATGATTGAGTATCGTTGAAAATCCTTTCATTTCTAGAAAGATTTCTAGAGATAGAATTATTTGATTTTGATAGAATTCATGACCTTGAGATGTTAAGTGATATTCTGGAGGTTACATGATTCATTAATGAATTATGTGCAGTATGAAGAATCATTGTTATTAATGTCCATCAAATGTAAAAGAACTATATTGATGACATCATTGAAGTTATTAATTGAAGAAATGTATATTAGAAAAGACGTTTCTCCAACATTCTAAAGTAAGCATTACATTGACTTATATTGTCTTTTACAGGGCATCTCGTTGGTATTGCCTCTTTTTTGTTCTTTATGTGCTGTTGGGAGTTTACTTCGTCACAAACTTGATTCTTGCTGTTGTATACGATAGCTTTAAAAGTCAGGTAAATGCTATTTCATCATGCACCGCCAGTGCAAATGGTTGTCTATGGCTTCAATAGGCTTTAGTATTCATTTTTATCTGCCCGTTTATTGCTTCATCCATAGGTTTTTTTCCCTCTACAGATACTTGCTTCATCCATAGTTCATCAACTATTGATTTGCTTTATTATTTTTTTATAAGGATCCAAAAGCTCACGTTCTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTCCTTCCCATTTTAATTTTTTGATTCAGCTTGCTAAACAAATTTCTGAGATGGACCGCTTGAGGAAAAGTATATTGGCCAAAGCTTTTAGTCTTATGGATACTAATGTAAGTATGATGGCCACTTACCATCTATCTCGCATCTTCAAATCCTTAACTGGGTGGCTTATAGATCCTATTTAATTTTGATGAAAGAATCTTGTTATACTTTTACATAGGGGGCAAGTATATGTCTTGTTCCTTGTTTGTGAACTAGAAATTTGTTCTAATCTAGGAAGTTTTCTCTTCATAAAATTTTCTATTAAACATGAAAAGGATCATTTTAAGATAAGAGAAAGACATTGTTTTTAATAATCTGGATTGATATTCATCGGGCTTGTAACTACACAACTGATAGTGTTAGTTGTATACTATCAGTACACAACTGATAGTATTAGTTTTGAGCAAGTGAACATAGATATTATCATTCATAGTTATAGAGAAATGAATAGTTTTTCGTATGCTTTTTCATTGGGTATCAATGTGTAAAAGCCCATTGGCATCTTATAATAAAATTGAAGTCAGGTGAGGAAACTTAGCAGATAATTTTATGGAAGGTAGAGCTATATGGAGAAAATTTCCGTTGTTGGAAGAAAATAGTAAGATGTCCCTTTTAGGATATGTAAATGGGTTTCTGCTGAGCTTCAGTGAAGGGCATGACTGTAGTTAGAGTTATGTTTTTAAGTAGCGGCCCACTAAATTCATTTTTTAGTTTAGTTGGGTAAACTCTAAGGTTTGAGAGAATCAGAATAATCTATTCCATTCACATAAAAGATATATATATACAAGTGTACAAGGTTAACCCTAAGTAGGAGAATGTAAAAAGACAATAAAGGACAACTCTATATAATTACACTTATTATACTAATATAATAACTCTAACACTCCCCCTCAAGTTGGAGCATATATATTCGTCATGCCCAACTTGTTAGAGAGATAATCTATTTGAGCTCCATTTAGTGCGTTTGTGAAGGTATCTCCTAATTGCTCTCCAGTCTTCACATATCCTGTTGACACCAAACCTTCTTGTATCTTTTCACGTACAAAGTGACAGTCAACCTCAATGTGTTTAGTCCGTTCATGAAATACCGGATTAGATGCAATATGAAGAGCTGCCTCATTATCACACCACAATTTTGTCGGTGTTGTGATATCAAATCCCAATTCAACAAGAAGTTGACATATCCAAACTAATTCACATACAGACTGTGCCATTGCTCTATATTCTAATTCAGCACTTGAACGCGACACCACATTTTGTTTCTTACTTTTCCAAGAAACCAAATTAC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AVTLLILVIHTFFPISYEGAQLYWKNPLNQLKVICIIILAADFLIYALYLSPVAFDYLPFRVAPYIRVVFFIMNIRHLRESIIILAGMLGTYLNVLALGLLFLLFSSWLAYVIFEDTQQGKIIFTSFGATLYQMFILFTTSNNPDVWIPAYKASRWYCLFFVLYVLLGVYFVTNLILAVVYDSFKSQLAKQISEMDRLRKSILAKAFSLMDTNNVGFINKEQCLILLEELNRYRTLPKISKDDYELIFDELDDSHDFKINMNEFADLCNAIALKFQKEDIPSWFEGYPSIYHSDFSKKLKVFVRSPKFGYAVSFILILNLVAVVIETTLDIENNVGQKAWQELEFVFGWIYVVEMGLKIYAFGFMNYWRDGQNQFDFIVTWIIVIGETITFVAPSGLTFLSNGEWIRYLLIARMLRLIRLLMHVQQYRAFLATFLTLIPSLMPYLGTIFCVLCLYCTLGVQVFGGIVNAGNVNLPKTDLDDDDYLLFNFNDYPNGMVTLFNLLVMGNWQVWMQSYKELTGSIWTLVYFISFYLITVLLLLNLVVAFVLEAFFAELDIESSENGEEQDQDGDSRKDRRRFVGTKTRSRKVDILLHHMLSAELDNKDSD Homology
BLAST of Lag0015089 vs. NCBI nr
Match: XP_022968991.1 (two pore calcium channel protein 1A-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1119.4 bits (2894), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/607 (94.23%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. NCBI nr
Match: XP_008455316.1 (PREDICTED: two pore calcium channel protein 1B isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1119.0 bits (2893), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/607 (94.23%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. NCBI nr
Match: KAG6572364.1 (Two pore calcium channel protein 1A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1117.4 bits (2889), Expect = 0.0e+00 Identity = 571/607 (94.07%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. NCBI nr
Match: XP_022952442.1 (two pore calcium channel protein 1A-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 571/607 (94.07%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. NCBI nr
Match: XP_031744917.1 (two pore calcium channel protein 1A [Cucumis sativus] >KGN43617.1 hypothetical protein Csa_020586 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1110.5 bits (2871), Expect = 0.0e+00 Identity = 568/607 (93.57%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75VR0 (Two pore calcium channel protein 1B OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=TPC1B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 863.6 bits (2230), Expect = 1.3e-249 Identity = 434/606 (71.62%), Postives = 513/606 (84.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94KI8 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TPC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 862.4 bits (2227), Expect = 3.0e-249 Identity = 420/604 (69.54%), Postives = 522/604 (86.42%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75VR1 (Two pore calcium channel protein 1A OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=TPC1A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 861.7 bits (2225), Expect = 5.0e-249 Identity = 431/600 (71.83%), Postives = 511/600 (85.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5QM84 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TPC1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 796.2 bits (2055), Expect = 2.6e-229 Identity = 400/605 (66.12%), Postives = 488/605 (80.66%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6YLX9 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Triticum aestivum OX=4565 GN=TPC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 763.5 bits (1970), Expect = 1.9e-219 Identity = 383/605 (63.31%), Postives = 483/605 (79.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HWG3 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468128 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1119.4 bits (2894), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/607 (94.23%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1V7 (two pore calcium channel protein 1B isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495512 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1119.0 bits (2893), Expect = 0.0e+00 Identity = 572/607 (94.23%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GKF4 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455128 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 571/607 (94.07%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K5Q7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G048010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1110.5 bits (2871), Expect = 0.0e+00 Identity = 568/607 (93.57%), Postives = 587/607 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ERC4 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437105 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1107.8 bits (2864), Expect = 0.0e+00 Identity = 569/607 (93.74%), Postives = 588/607 (96.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015089 vs. TAIR 10
Match: AT4G03560.1 (two-pore channel 1 ) HSP 1 Score: 862.4 bits (2227), Expect = 2.1e-250 Identity = 420/604 (69.54%), Postives = 522/604 (86.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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