Lag0014969 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0014969
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr12: 6377718 .. 6382982 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0014969
SyntenyLag0014969
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTAGGTGATATGTTGGGTTGGGCCTAATTATACTTTCGAGGCTTCAACTTGCTTTGGATTGGTTTCTAAAGAAATGGAGAAAAAAAATCAATTTTAATTTTGATTTAACAAAAGTGTTAGCAATTTATATATATAAATGTGTGTGTATTGACAACATGTGGGAGACCTCTTGGTCATTAGTACTACTGTTATAGGTAATTTTGGACCACTCCGATATGCAAGGAGTTGACGAGGACAACGCGATACCAGTCCAAGGAGAGAACCAGAAAACGAAACCCGAAGGAAGAACAGGCCAAAGGGTCTGGCCAAAGTCGAAGGGATCGGGCTTTTGACCCGACCCCCTGCTCAGTCGAGGTCGAGCTTTTCCGCCTCCGTTCAGTCCCTAGTGTCTCCGACTGCCTCGGTTTCACTCGGTTCAGCCCGAATCGCCTCGGAATTCCTAAAAACTCCAGGAGCATGAACAGGTATTTAAACCCCTCTTCATCACTGAAGAGAGGATCTCGAACTCTATTCTCTACTCTCTTCTCTTGCTCTCCTCTTTCCGCTTTCTGACTTAAGTATTGGAGGCAATGTGGCAAACACCACACTGGTGTTCAGGTTTTCTGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCTCTCAAACAAATTTACCGTTGGTGGCACGTGAAGGTCAGGTGAGTTCCTCCCGACCAGATTTTGCCATCAACAAGTACAAGTTTTATTCTATTGAAATATGTTCATGTTGGCTTGTAATTTATATTTTTTCTCATATGATTTCGTTCGAGAAATCATTGAACAAATATTTTCACGTATGTCCAATGAATCATAACAGAAATAGTTTGTGGTCAATCGATAGACTTTAGACAGACACAATATTAGAGTTGGTTTTTTTCTTCTCCTTTTTAATTGAAATTTGTAAGTGTAAGTAGAGTAGTTTAATGGTTAATTTTATGCATGGATCGGATTTAGTGTTCGTTTGGAATACATTCTAATTTAAATATTTTCAAGAATACATTTTTGTAAAAAACATTTTGTATAAAAATTGTTTATAATTTAAACACTCATATGTTTGGTTGCATTTTCTACAAGTGTTTTTACACACAAGTTATTGTATACTTAAAAAGATTTTTTTTTTTTGATGTTGGTTTAAAGTGTTTCTCTCAAAATGGTTTATTTATCAATCTCATTTTCTAATAAGTCATTTTTAGTGGTTGCCAAACATTAAAAAAAATTTCAAAATGATTTTTTTTTTCAAAATTAAACACTTGAAAAGTTAAATCAAACACTCAACTAATTTTGTGAGAAACTTGTTAAAATTAGTGAAATTTGAATAGAGGGTAAAAATTGCAACAATTTGCCTTAAATTGATGAAATTGAAAATTTATGGTACAAGTTGATATGTTCGCCAACTTTAAGGTTAAAATTTGATTTTTTTCCTTAAATGTTTGGGTATAGTTTCTATTTAATTTCTAAGTTTGGGTTTTATTTTTAATTGTCCAATGATGGGAGACCAAAAAGGTAATTTGGTCGCATATGTTTTATTACCTTATATTCGAATCTTGAGTTTTCTCTCTATCCAACTCTTCGTAATTCAGTATTTATATTTATAATGACACATAGGGGTTATTATTAGTCAATTTCATCCTTCAACAACAATTAGAAACTAAACTAATATAATAATAATAATTTAACAATTGGTTATAAATATTAAAAAATATATATCAAACATTATGGACTAAAATATATATTAAACCTTTTATAGTTTCAGATATTGGGGTGTTTTAAAGCTTTAATTGAGTTCAATAAATGTGGGTGGAGATCCAACGTTTAATTTTGAAGAAATTAATATCTAAGGCTCCTTTGGTATCTGTTATAGGTAATTTTGGACCACCCCAATGTACAAGGGGTTGACGAGGACAACCCAACGTGAGCTCAGAAATAATATCGAAAAATGGACTCTGGAAGCGAAACAGGCCAAAAGGTCGGGCCAAGGTCGGATGGACCAGGCCTTGGCCCGACCCATATGGTCGGCCTCGGCCCAAGGTCGAGGTCGAGAATAATGGTCGACCTCGGTCGAGTCCGTCTGCCTCCGTTCGATCCCTGCTGCCTCTGGCCGCCTCGGTTCCACCTGGTTCATCCCAAAACGCCTCCGAATTCCTAAAAACTCTAGAGCAACAACATGTATTTAAATCCTTCTTCATCATTGAAGAAAGTATCCCAAACTCTATTCTCGACTTCTCCTCTTGCTCTCTAGCTCTTCCATCAGTTTTTTTGACTTAAGCATCAGAGGCGGTGTGGCAAGCACCACACTGGTGTGCAGGTTTACTATTTTGCAGGTCACGTCTTTCCCCCTCATACAAATTTACCAGTTTTTATTGTTTTAAAAATGTATTTAATAAGTAGCTAAATTATTTTTTTTTCCCTCATTCGTTGACGGGTCCCTCTCACTCGAGGACAGATCCATAATTTTTATTTAGTGGCTTAACTTAAAATTCATTAAAAGTAATTTACAAATAACTCATTCATAACATTTATGATGATTCGGTTGATTTTCTTTTATAATATCTTTTTGTTAGATTTGAAATAAAATATACAACTAAAACATAAAATAAAAATAATGTTATTTTTTTTAACATATTATAAATTTATATAGTAAAATTTAGAAAATTTACAATAAGGGATTGACTAAAATGAGAAATTAAGATCTAATTAACACAATGGAGGAAATTTATTTATTTTATTTTTATTATTTCAAAATTGAGGTCGTTGATTGAAAAATAAAATAGGACAAAAATGCGAAAGAAAAGAGGCAGAGGTAGGTTTGAATCCTGACATGAGGGAGGTGGGGTTAATTATATGTAGTTCTATATCGGTGTGTAATGATCTTATTTTTTACTTTTCTCTTTTTAATTTGTCAAGATTTTAAAGGAGTAGGTAGGAAGATCCCTACAAATCGAAATGCAGCCAAGTATGGTTCATTACATCCGCCACTGCTCTCACTCGGTTGTTTATGAGACTCTTATTTTTTCTTCAAATTTATCTAAACCTTGTGCAATTGACTTAATCCTTCTCATCAAATGTATACTTAAACATAAATCAATTAATTAAAACCTTAAGGGCCGTTTGATAACCATTTCGTTTTCCGTTTTCTGTTTCTGTTTTTCATTTTTAAAAAACTCATTTTTTTTATGATGCTTATTTTTCTCCTCTTTTACCTATCTCTCTCCAACAAATTCCTTTTTTTCTATTTTTTTCCTCTCTCTAAAACGTTTTTCTCTCTATAAAATTTATTTTTCTCTCTCAAAACTTTTTTTTCTATAACTTATCTATTTCTAAAAATTTATCAATAATTTTTCTCTCATTAATAAATATATTCTAATTTCTCTTTTGAAAAAAAAAATTCTCCAAAATTTTCTATCTCTACAACTTTTCTTTATTTTTCTAATTTATCGTTATTTCTTTAGCTTATTTTTTACTATTAACCTTACTATCTCTCTAAATTTTCTCTGTTTATTTAATTTTTTTATATAAAATTTATTGCTTTTACTCTAACTTTTTTTTTCTATTTTTCTCTAATTAAAATCTTTTCTCGAGTCTAACTAATATTCTCTCTCTAAGCATTTTCTTTCACCTCTCTAAATTTTATGTTTAATTTTTCTCTCGTCTTTAAAAAAAAACTTTTCTCTCGAAAACATTTATATTTTTGTCTCTAAATTTTTGTTTTTCAACGTCTCTACACATTTTTCTCTCTCTAAAACATCTTTTCATCTTTCTAATTTTAAAAAAACTGAAAACCAAAAACAGTTATCAAACAAGGTTGGTTTTCTGTTTTTTAAAAACAGAAAACAAAAAATAGTTATCAAACATATATGGTTTTTGTTTTTTTAAAAAAAAAAAAACCAAAAACCAAAAACAGAAAAAACCAAAAACCAAAAACTAAAATGGTTATGAAACGGAGCCTTAATTATACCCTTGTCTGAAAAATTAAAAGTTCTAATTCTCGCGAAACCATATTGTTTGAACTACAAAATAAGGAAACTAATTATGATGCATTTATGGGATGATTTAAAAACAAAACTTTCATTTATAAAAAATCAAACCAAAAAGAAAAGAAAAGAAGAAATTGAAAGTGAAAACAGATAATGAATTGGTAGAAACTTTGAGCTATATGTGTTTCAGACCAATATAAATAGAATAATATAGGTAATTATTATGTATGCTATTTTTGTTGATGGTCAGATTTTGCTCAGGAATCGATCCCTCGCTCCACGTGACAGACAGCAGTGAATTTGTAGATGAGCGGGAGAAACGTGACCTGCAAAACAGACAAACGCTATACACCGGTGTGGTGTTGACCACACAAGCTCCGATGCTTAAGTTAGCTTTGATCTGGAAGCATGCAGAATGTACTTTTTGGGTGAAGTTTTCGGCGTACCTGAGTATGTGCATCGTCTCCTCCTTTATAAGCTCCCGTTAGGGTTTGCACAGCTGCCAGCCTCCTGGCAATCTTGGGCCTTTGGCCCTGGTCGGCCTCGGCTGTGGGCCGAGGCTGACCTCCTCCTCGGCCTCTCCCTTGGGCCGAGGCCGAGGGGAGTTGTTGTGGGTCGGAGGGAGTCTGACCCTCCGCTTTGTCGGTTCAATCTCTTCTGGTTACGGGCCAGGCCAGTTTGGGCCTTATTCTGCATAAAACTCGATTGGACAATTTTCCCTATAACATTAAGCCCCCACTCTCCATTGGAGTTATTGGGCCTTTACTAATTTTCAATGGTGAGTAGTAATATTTTGGGAATTCCATCTGCAACAAAAAATGCATAAATACAGTGGGAAATAAAAGATACATAAATAGAATGAGAAAACATTTTTCCTGCCCTCCGTTATCAACAAGGACCAACCATTTGGGAGTTGTGGGCACAACTATCATGTTTGAGCCATTGCCATTAATTCCAAAAAGGAAACTTTATAGTTGGCTGGTAACTAAGTTCAGGACTAGGGCATTAGAATCCT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mRNA sequence

ATGGAGTTGACGAGGACAACGCGATACCAGTCCAAGGAGAGAACCAGAAAACGAAACCCGAAGGAAGAACAGGCCAAAGGGTCTGGCCAAAGTCGAAGGGATCGGGCTTTTGACCCGACCCCCTGCTCAGTCGAGGTCGAGCTTTTCCGCCTCCGTTCAGTCCCTAGTGTCTCCGACTGCCTCGGTTTCACTCGGTTCAGCCCGAATCGCCTCGGAATTCCTAAAAACTCCAGGAGCATGAACAGTATTGGAGGCAATGTGGCAAACACCACACTGGTGTTCAGGTTTTCTGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCTCTCAAACAAATTTACCGTTGGTGGCACGTGAAGGTCAGGTAATTTTGGACCACCCCAATGTACAAGGGGTTGACGAGGACAACCCAACGCCAAAAGGTCGGGCCAAGGTCGGATGGACCAGGCCTTGGCCCGACCCATATGGTCGGCCTCGGCCCAAGGTCGAGGTCGAGAATAATGGTCGACCTCGGTCGAGTCCGTCTGCCTCCGTTCGATCCCTGCTGCCTCTGGCCGCCTCGGTTCCACCTGGTTCATCCCAAAACGCCTCCGAATTCCTAAAAACTCTAGAGCAACAACATGTATTTAAATCCTTCTTCATCATTGAAGAAAGAATCGATCCCTCGCTCCACGTGACAGACAGCAGTGAATTTGTAGATGAGCGGGAGAAACGTGACCTGCAAAACAGACAAACGCTATACACCGGTGTGGTGTTGACCACACAAGCTCCGATGCTTAAGTTAGCTTTGATCTGGAAGCATGCAGAATGGTTTGCACAGCTGCCAGCCTCCTGGCAATCTTGGGCCTTTGGCCCTGGTCGGCCTCGGCTGTGGGCCGAGGCTGACCTCCTCCTCGGCCTCTCCCTTGGGCCGAGGCCGAGGGGAGTTGTTGTGGGTCGGAGGGAGTCTGACCCTCCGCTTTGTCGGTTCAATCTCTTCTGTCGCAGCTGGCGCGCTCGGCCTCGGCCATTGGCCGAGGCCGAGCAGGCTAGGCCTGCCGTGGCAGGCCTAGCTCGGCGCGTGACCGAGGTGTTCCATCCTCGGTCATGTCACGCCAGGCTTCTGCCTGGCCTGGCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGTTGACGAGGACAACGCGATACCAGTCCAAGGAGAGAACCAGAAAACGAAACCCGAAGGAAGAACAGGCCAAAGGGTCTGGCCAAAGTCGAAGGGATCGGGCTTTTGACCCGACCCCCTGCTCAGTCGAGGTCGAGCTTTTCCGCCTCCGTTCAGTCCCTAGTGTCTCCGACTGCCTCGGTTTCACTCGGTTCAGCCCGAATCGCCTCGGAATTCCTAAAAACTCCAGGAGCATGAACAGTATTGGAGGCAATGTGGCAAACACCACACTGGTGTTCAGGTTTTCTGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCTCTCAAACAAATTTACCGTTGGTGGCACGTGAAGGTCAGGTAATTTTGGACCACCCCAATGTACAAGGGGTTGACGAGGACAACCCAACGCCAAAAGGTCGGGCCAAGGTCGGATGGACCAGGCCTTGGCCCGACCCATATGGTCGGCCTCGGCCCAAGGTCGAGGTCGAGAATAATGGTCGACCTCGGTCGAGTCCGTCTGCCTCCGTTCGATCCCTGCTGCCTCTGGCCGCCTCGGTTCCACCTGGTTCATCCCAAAACGCCTCCGAATTCCTAAAAACTCTAGAGCAACAACATGTATTTAAATCCTTCTTCATCATTGAAGAAAGAATCGATCCCTCGCTCCACGTGACAGACAGCAGTGAATTTGTAGATGAGCGGGAGAAACGTGACCTGCAAAACAGACAAACGCTATACACCGGTGTGGTGTTGACCACACAAGCTCCGATGCTTAAGTTAGCTTTGATCTGGAAGCATGCAGAATGGTTTGCACAGCTGCCAGCCTCCTGGCAATCTTGGGCCTTTGGCCCTGGTCGGCCTCGGCTGTGGGCCGAGGCTGACCTCCTCCTCGGCCTCTCCCTTGGGCCGAGGCCGAGGGGAGTTGTTGTGGGTCGGAGGGAGTCTGACCCTCCGCTTTGTCGGTTCAATCTCTTCTGTCGCAGCTGGCGCGCTCGGCCTCGGCCATTGGCCGAGGCCGAGCAGGCTAGGCCTGCCGTGGCAGGCCTAGCTCGGCGCGTGACCGAGGTGTTCCATCCTCGGTCATGTCACGCCAGGCTTCTGCCTGGCCTGGCGTGA

Protein sequence

MELTRTTRYQSKERTRKRNPKEEQAKGSGQSRRDRAFDPTPCSVEVELFRLRSVPSVSDCLGFTRFSPNRLGIPKNSRSMNSIGGNVANTTLVFRFSVLQATSSPSQTNLPLVAREGQVILDHPNVQGVDEDNPTPKGRAKVGWTRPWPDPYGRPRPKVEVENNGRPRSSPSASVRSLLPLAASVPPGSSQNASEFLKTLEQQHVFKSFFIIEERIDPSLHVTDSSEFVDEREKRDLQNRQTLYTGVVLTTQAPMLKLALIWKHAEWFAQLPASWQSWAFGPGRPRLWAEADLLLGLSLGPRPRGVVVGRRESDPPLCRFNLFCRSWRARPRPLAEAEQARPAVAGLARRVTEVFHPRSCHARLLPGLA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..38
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..33
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 125..174

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0014969.1Lag0014969.1mRNA