Lag0014688 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0014688
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr12: 3551207 .. 3557147 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0014688
SyntenyLag0014688
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCATTTGCTCTGTTCCATCTCTAAGCACGCTATTAGCTATCAGGTAAAAAAGGCTCAATAATTCATTTGTCTTTGTACTCTTCCATTTTGCTTCTATTTCTTGGTTGTGTTTACCTATGTTACTCTCTTTACTATATTATACATCTTCCTTTACTATCCATTCCACTTTAGTTCCCCAAAACAATATGCGCTGTCTTTTCTTGTATGGTCAGTGCCCAACTCATGATGTGTGGCTTCTGAAAGAGTCATTACAGATATTACCAATTAATTCATCCACTAGAGTTCTTACTTAACAATTTCTGACAAATAAAGTATGCAAGTTTTCACATGATCGAAACTTTCTCTAGGCTGAGGAACAGAACTGGCATATTCAAGCCCGTATCGATGTCCTCAGAAAGGAGTGCAAGACGCCTCGGGCATGGCAGATGCTGTTGAGAAGGTGCAACTTTTATTTTCTTACCTTTTCCCACCTCTTCCAAATGGATAAATAATTTGAAAATGGTAGATAAAATACAAAATGGCTGACGAAGAGGAAACTTTCATTGTTGGTTAGACTTTTCAATAGCCCAATTGGTAATTTGGTATTTTGAACTAAGCCTAAGAAATGGTAAGTCTGTGAAAGAAATGGTTGTTTTCTGATGAATTAAACAATCTGGAAGAGAAAATAAAACTCAGGATCTAGTTTCTAACCTGTAAATGTTCACGTAAGAAACAGATGCAGTGCTTATGCAACTGATGGCGTCGACGGGACCTGCGATATGTAACTCATGCTTCACCAACTCACTGTTGCCATCTGATTTGTTTTTATCATGTTAAATGCATCTGAGATTGGTCAATAACGACATCGGTATGTAATTTAGTAGATTATATTTTGGTAGCTTTATGTTAATTTCTCAGCTTAGCTCAAGCTTTGTAATTCATATCAACAACTTTAGATGTTTCAATTGTAGTGATGTTTCCTCTGTCAATTCAACCACTCTGTCTTGTATCAAAGAAATCTTCATGGCTGAGTTGGAACACTATGTGGCCCTTGTTTTTCCTTTTAGATATCTGTGGCATTGATTTGTGAGTATAGCGAAATTATGTTTAGGTATATGATCAGTCAGAATACTCATGAGCAACGTTTCACAAGGACAACCTAACCAAAAATTTTATTGATGCAAATATTTCGCTGAAGATTTGAATATCTTCTCATAATTTCATTTGTCAATATAAATCTTTTTAAGAAAGGAATGGATTGGTTTTTTTTTTTGGGTGGGTGATTTATTTATTTATTATTATTTTTTTTCTGAGTACATCAACATTTGGGGTGGAGGATTCGAACCTCTAATCTCATGGTCGAGGTGCATGTCAATTACCGCTGAGCTAAGCTCGCTTCGGCTTGGGTGGGTGAATTATTTCCACGAAATTGCATTGGTCAATCAAGTTAAGTGATTGGCATTTGAATTCCTCTTAATTGACAAATACCATTGTTTTTATCCAATTTTCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCAAAATTAATTTACAAAATTATATGAAAGAGGAGTGCACTTGTCTTAGCTATTTCCATGCAATTTTATTAACCATTTTGTTCATAAACTCGAAGTACACGTCTCCATTTCTAATGGAGCAATAGACTATCAAATATTATCAAATAACCAACAACAAATCCAAGAGATATGCTGATAAATTGTGTCATAACTTCATCTTTATTTTTGCTTTCAATTGGATTATATTGATAAACTGATTTTGGATATTACCTTCAAAACACGAATGGAGCTCCGCAAAGATAAGGATTACTTCAAAAGAAGAAATTGGGAAGGTTTGTGAAAGGTTATTATAAGATAGGTTCAACACACTCAATGTGGATATTTGAGAAAAGACAGGAGGTATTTGACTAGAAGGATGATTCTATACCAGGTATAAAGACTCTAATGAATGAAGTTGACTCGTTCATATGGAATTTAACCTATTGAATTGTTGCTCCAAAGGTTTAAAGTAATCCTCAATTTAAATTTAAACGAACCGAATTTAGAAATTTCAGATCCAATCCAAGATGATATTATTCCAGGTAATTGATGTACATCACACCACTACTAAATTTGTAAAGTTGAATCGAGACAATTCTCTCAAACACTAGTAGTCGCCTAAATTTAATGTCTATAGTTGTTTGAGACTTCCCATAGAATTTGGGATAGCTACATAAGAAGTGTCATTGATCGAATTTAGAATTCTATCATTGATTTTATTATTTGAAATGATGATGCATATAAAGCATCCATGACCACAAATAGCAAGCTGTGATGAATATTTTATTTTAGGGTAAAATACACTTTTGGTCCCTGAAGTTTGGAGTTTATGTCTATTTGGTCTATAAAGTTTCAAAATGAACACTTTGGTCCTTGAGGTTTGCAAAATAATTCTAAATGGTCCATGATTTAACTTAAGTTAACGGAAAAATGACTAGACCATTATCTTTTGAGATGGTTGACACACATGCAATTTTTTTTTTTTAATTACATGCCACATGAGCTTGAAAAAGAAAAACTGAACTAAAAGTTAATCTCCAAATCTCTCTTCCTCTCCAACTCTGGCAAAGAACGAAGAATAGGTGCCACAACCATCGTCGTCCATTGCAACCCACATGGTAGAGATTGTGTTTTTCGTGAATTTTATTGTGATGCTATGGCAGTTGGGTTGAAATTTGCATGTGTGTCAACCATCTCAAAGGATAACGATCTAGTCATTTTTCCGTACTTAAGTTAAATCAGGGACCATTTAGAATAATTTGCAAACCTCAGAGGCAAAGTGTTTATTTTGAAACTCTAGGGACCAAATAGACATCAACCTCAAACTTCAGGGACCAAAAGTGCATTTTGCCCTTTATTTTATTTAATTTTTTTGCAAAGGAAAAATTTTATTATTTGAGAGGGAAGGAAATAAAGAAATAAATAAATACAATTTAATGTTATTTTATTTAAAATTAATAAAAAAACAGTGCAACGTCCATCATCCCTGAGTAATTAACAGAAAATTGGACGGTAGATGGACTAAAATGTCGAATTTTCCAAAATGAAATCTAATCAAATATTAAAAGTGTATTTTTTTCGCTTAAAAAGAAAGTGTATTTTTTTCTGATTAATTTTAAAAATCCATAAAACACGTGCAGACACGAGATGATTGTGACCAGTTACAAATGAAATCGTTCGTTTTCAAACTTTTCAAAATCTGATTTAAAAAGTACCGTTGTCAGGCAGACGTTCTCATTTCATTTCTCTCCTCGTCGCTTCGTTTTACTCTCTGTTTTCTCTGAGAGAACTCCACCGCCGAAGAATCTGACGACGATGACCCATGTGGGATTGCAGATGAATGCGTGCTAAATTACAATCGATCGATGTCGATTGTCCGCCAGACGGTTGCTTGTCATTCTCCGGCCGCGGAGATCGGTTGTCCGCCGCAGTACTCGTCCGGCACGATTGGATTGCCCAAAGGATTGAGCGCCGCAGGTATTCTCCGCACGATGTCTCGTGCCTATCTATTGGATTATTTTCGTTCCATTGTGATAATGTATCTAAATTCGCTATCGTGATTCGTACAGAAATACAGCGATAAACACGATGGTTCTTCCATCTCTAATCTGAAGGCGACTCGGCCAGGTTACAGATTGGCGGCTGGGTCAGAGAGTGTTGATCGGTATGAACTATTCAGTTGATTTTAAGTCTCTGAGTGGTTTGCTGTTAGGATTTAAGTCTCGTGCCTATCTACTGGATTATTTTCGTTCCATTGTGATAATGTACCAAAATTCGCTATCGTGATTCGTACAGAATTACAGCGATAAACACGATGGTTCTTCCATTTCTAATCTGAAGGCGACTTGGCCAGGTTACAAATTGGCGGGCTGGGGTCAGAGAGGTGTTGAATCGGTATGAACTTTCAGTTGATTTAAGTCTCTGAGTGGTTTTGCTGTTAGGATTTTAAGTCTCGTTCCTATCTACTGGATTATTTTCGTTCCATTGTGATAATGTACCAAAATTTGCTATCGTAATTCGTACAGAAGAAATACAGCGATAAACACGATGGTTCTTCCATCTCTATTCTGAAGGCGACTCGGCCAGGTTACAGATTGGCGGGCTGGGGTCAGAGAGGTGTTGAATGGTATGAACTTTTCAGTTGATTTTAAGTCTCTGAGTGGTTTTGCTGTTAGTATTTAGGAAGTTGCTTTCACAAGTAAAGATGGTTAAGATAGTCTTTACAATCCAAGTCTTCGATCCTTGTATATTCTTTCATTTCTCCTAATGAAAGCTATTTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAATCCAGTCGAAGATTGCAAGATAAGAGAGGGGAAGCTCATAGAAATTTACCAAACTTCGTTACCTGCCTTTATATGAAGTTCCTATATGAAGGCTAAAATTTTCAAATTGACAGTAGTGTTGCTTTTGCCGTAATTCTTGAGAAGAGTGGGAAGAAGGAATTAGAATTTGGGCTGGAAGTGATTGCAAAATGACAAGATATGCCACTAATGTTGCTGTTCGGGAAATTCAGTCTCTATTTTTATTGGCAGTGATTGCTTTCTAAGTTTAACATTATTCTTCTCATCTTTCATATTCGAAGACCCTTTGTTCGAATAGTTATGGAGTGCAGGAACCACAAATTTTCACAATTTTTTTTCAAAAACTATTGTTTGTTATGGGATCACTAAAAGGATTTGAACATTTAAAAGATTTATAATAAATACACAATAATATGCTAGTGTATGTATTCATTTTTTTAATGAAATGGAAACACTGTTTTTTGGTATTAGATAGGGACTAGTATAAAAGCTGATACTTGAAAAGTTTGACACCTAGCTAACCTAACCGTGCTTTTCCACAGATGAAAGAGTAAGTTCCAATAGGCAACTATCACAAAATAGATTCAGAAACTTTGTGATACCACTAGGCCAAAAAGAACGACCATATTAATAAGATCCCAATTGATCGGTTTGTTTTTCTATAGTTTGTATTTTTAGGATGTTGATGATCTGTTTATTTGTAAAATTTGCAGCTTGATAGATGAATCGGTTTGTAGGAAACACTCAGCTGTTAGTGTTGTGAACTTTGGTGAGCTCTCTAAGGTACTTCCATTCTCTCGGACATTTGTTTTTTTTTTAATTTTATTTTAATATATAAAAAATAAATTGCAAAAACTATGTCTAAACCATAGGGAGTGTTACAATTACATTCTCAAACTTTCAATTCGATTAACTACCCCTGCAATTACAACAACTTTGTGAGTTTATGAGGATGGTTGATCAAATCGAAATTTCTAGGGTGTGATTGTAATAATTTTTATGGTTTGAAAGTGATTTATTTTCCATTGTACTAATAGATTAAATGCTATTTGAATTCACTCTTGCATAGGAAAACTTACCTGTCTCGCTTAAATTTGACTTTAGTTTAACTAATCATGTAAATTTTAAAATTTTGTTTTATTTAGAAGTTTTTAAGTCTCTGAGTGGTTTCGCTGTTAGTATTTAGGAAGTTTCTTTCACAAGTAAAGATGGTTAAGATAGTCTTTACAATCCAAGTCTTCGATCCTTGTATATTCTTTCATTTCTCCTAATGAAACCTATTTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGGAATCCAGTCGAAGATTGCAAGATAAAGAGGGGAAGCTCATAGAAATTTACCAAACTTCATTACCTGCCTTTATATGAAGTTCTTATATTGAAGGCTAAAATTTTCAAATTGACAGTGGTGTTGCTTTTGCCGTAATTCTAGAGAAGAGTGGGAAGAAGGAATTAGAATTTGGGCTGGAAGTGATTGCAAAATGACAAGATATGCCACTATTGTTGCTGTTCAGTCTCTATTTTTATTGGCAGTGATTGCTTTCTAA

mRNA sequence

ATGCATTTGCTCTGTTCCATCTCTAAGCACGCTATTAGCTATCAGGCTGAGGAACAGAACTGGCATATTCAAGCCCGTATCGATGTCCTCAGAAAGGAGTGCAAGACGCCTCGGGCATGGCAGATGCTGTTGAGAAGATGCAGTGCTTATGCAACTGATGGCGTCGACGGGACCTGCGATATGTTTAAAGTAATCCTCAATTTAAATTTAAACGAACCGAATTTAGAAATTTCAGATCCAATCCAAGATGATATTATTCCAGAGAACTCCACCGCCGAAGAATCTGACGACGATGACCCATGTGGGATTGCAGATGAATGCGTGCTAAATTACAATCGATCGATGTCGATTGTCCGCCAGACGGTTGCTTGTCATTCTCCGGCCGCGGAGATCGGTTGTCCGCCGCAGTACTCGTCCGGCACGATTGGATTGCCCAAAGGATTGAGCGCCGCAGGTTACAGATTGGCGGCTGGGTCAGAGAGTGTTGATCGCGATAAACACGATGGTTCTTCCATTTCTAATCTGAAGGCGACTTGGCCAGGTTACAAATTGGCGGGCTGGGGTCAGAGAGGTGTTGAATCGAAGAAATACAGCGATAAACACGATGGTTCTTCCATCTCTATTCTGAAGGCGACTCGGCCAGGTTACAGATTGGCGGGCTGGGGTCAGAGAGGTGTTGAATGCTTGATAGATGAATCGGTTTGTAGGAAACACTCAGCTGTTAGTGTTGTGAACTTTGGTGAGCTCTCTAAGTGGTGTTGCTTTTGCCGTAATTCTAGAGAAGAGTGGGAAGAAGGAATTAGAATTTGGGCTGGAAGTGATTGCAAAATGACAAGATATGCCACTATTGTTGCTGTTCAGTCTCTATTTTTATTGGCAGTGATTGCTTTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCATTTGCTCTGTTCCATCTCTAAGCACGCTATTAGCTATCAGGCTGAGGAACAGAACTGGCATATTCAAGCCCGTATCGATGTCCTCAGAAAGGAGTGCAAGACGCCTCGGGCATGGCAGATGCTGTTGAGAAGATGCAGTGCTTATGCAACTGATGGCGTCGACGGGACCTGCGATATGTTTAAAGTAATCCTCAATTTAAATTTAAACGAACCGAATTTAGAAATTTCAGATCCAATCCAAGATGATATTATTCCAGAGAACTCCACCGCCGAAGAATCTGACGACGATGACCCATGTGGGATTGCAGATGAATGCGTGCTAAATTACAATCGATCGATGTCGATTGTCCGCCAGACGGTTGCTTGTCATTCTCCGGCCGCGGAGATCGGTTGTCCGCCGCAGTACTCGTCCGGCACGATTGGATTGCCCAAAGGATTGAGCGCCGCAGGTTACAGATTGGCGGCTGGGTCAGAGAGTGTTGATCGCGATAAACACGATGGTTCTTCCATTTCTAATCTGAAGGCGACTTGGCCAGGTTACAAATTGGCGGGCTGGGGTCAGAGAGGTGTTGAATCGAAGAAATACAGCGATAAACACGATGGTTCTTCCATCTCTATTCTGAAGGCGACTCGGCCAGGTTACAGATTGGCGGGCTGGGGTCAGAGAGGTGTTGAATGCTTGATAGATGAATCGGTTTGTAGGAAACACTCAGCTGTTAGTGTTGTGAACTTTGGTGAGCTCTCTAAGTGGTGTTGCTTTTGCCGTAATTCTAGAGAAGAGTGGGAAGAAGGAATTAGAATTTGGGCTGGAAGTGATTGCAAAATGACAAGATATGCCACTATTGTTGCTGTTCAGTCTCTATTTTTATTGGCAGTGATTGCTTTCTAA

Protein sequence

MHLLCSISKHAISYQAEEQNWHIQARIDVLRKECKTPRAWQMLLRRCSAYATDGVDGTCDMFKVILNLNLNEPNLEISDPIQDDIIPENSTAEESDDDDPCGIADECVLNYNRSMSIVRQTVACHSPAAEIGCPPQYSSGTIGLPKGLSAAGYRLAAGSESVDRDKHDGSSISNLKATWPGYKLAGWGQRGVESKKYSDKHDGSSISILKATRPGYRLAGWGQRGVECLIDESVCRKHSAVSVVNFGELSKWCCFCRNSREEWEEGIRIWAGSDCKMTRYATIVAVQSLFLLAVIAF
Homology
[Close]
BLAST of Lag0014688 vs. NCBI nr
Match: XP_022136388.1 (uncharacterized protein LOC111008110 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 9.4e-04
Identity = 29/49 (59.18%), Postives = 34/49 (69.39%), Query Frame = 0 

Query: 16  AEEQNWHIQARIDVLRKECK----TPRAWQMLLRRCSAYATDGVDGTCD 61
           AEEQN H+QARID+LRK  +    T  A + L  RC AYATDGV+ TCD
Sbjct: 132 AEEQNQHVQARIDLLRKGVQDVSGTADAVEKLWNRCRAYATDGVNETCD 180

[Close]
BLAST of Lag0014688 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C7G2 (uncharacterized protein LOC111008110 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008110 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 4.5e-04
Identity = 29/49 (59.18%), Postives = 34/49 (69.39%), Query Frame = 0 

Query: 16  AEEQNWHIQARIDVLRKECK----TPRAWQMLLRRCSAYATDGVDGTCD 61
           AEEQN H+QARID+LRK  +    T  A + L  RC AYATDGV+ TCD
Sbjct: 132 AEEQNQHVQARIDLLRKGVQDVSGTADAVEKLWNRCRAYATDGVNETCD 180

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lag0014688 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022136388.19.4e-0459.18uncharacterized protein LOC111008110 [Momordica charantia][more]
BLAST of Lag0014688 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0014688 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1C7G24.5e-0459.18uncharacterized protein LOC111008110 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008... [more]
BLAST of Lag0014688 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0014688.1Lag0014688.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0000775 chromosome, centromeric region