Lag0011968 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0011968
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1: 35647691 .. 35653871 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0011968
SyntenyLag0011968
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAGAGGGGAAGACGTGACCTGCAAGACAGTAAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCATGTAGAATGGAGGGGCGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAAAGTACAGAGTTCGAGAGTAGAGTTTAGGGATAGAATTCGGGATCCCCTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACGTGCTCATCCTCCTAGCCTTTTTAGGGTTTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGGGTCGGCCTCGGCCCATTGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTCCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGCCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACAGTATGTATGCACGTATATGCATAAAAGTTTAACAAGGTGGGAGATTCGAACATCTAACCTCTTGATTGAAGATATATGCCAATTACGTGAATGATGTTGCCTTTGACTTACTCATTATAAATTCTAGGGCTAAAGGTATGTTTTAGTCTTTAATGTTTGACCTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAATTAGTTTCTATTATTTAAAAAGTTCAATTTACTCCGTATTCTTTAACATTTTTTTAAGGGCCGGTTGCAAGGATAGCAATATGGGCCAAAATAATTGCAAATCTAGCAACCCACAAAAAAAATTGCAAAAATGGCAAAATCTAATAGTTTGTGTGTTGCATTTACTAAAATACCCCTCCAGATTTTCTTTCACTGATAGAAAGTTTTTCTATCACTGATAGATTCTATCAGTGATAGAAAGATTTTCTATCAGTGATAGAAATTTTCTTTCACTGATAGATTCTATCATATGATAGAAAATTTTTCTACTACTGATAGATTCTATCGGCGATAGATATTTTTCTATCACTTGTTCGGTGTTCTATCAGTGTTTGGTTGTTGTTATTTGATTTTCTATCAGTGTTTGGTTTTTGCTTTTCAGTGTTTGATTTCTATAATCGTTCGTTTTTGCTTTATTTTTCAATGTTCGATTTCACCATGTATCACCATCGTTGATAGAAACAAAAGATCTTCTATCACTGATAGAAAAGTATCAGTGGTAGAAAGATTTTCTATAACTCACGAAAAGTTTTTCTATCAGTGTCAGTGATAGAGATAGAAAGTTTTTCTATCACTCATAGAAAGATTTTCTATGAATGATAGAATTTTTTTATATCACTCAAAAAATTTCTATAAGTGATAGAAGATTTCTATCACTGATAGGTTCTATCAGGGATTGAAAGATTTTCTATCAAGAGTTTTCTATCATTGATAGAATATCTTTCTATCACTGATAGAATAGTAAAAATTTCTATCAGTGATAGAAATCTTTTATCACTGATAGAAAGTTTTTCTATCACTTATAGATTATATCGGTGATAGAAAGATTTCTATCGGAGATAGAAAGATTTTTATGGGTGATCAGGGATTGAAAGATTTTTTATCAAAAGTTTTTCTATGATTTTCTATAAAAAGTTTTTTTTATCACTGATAGAACCTATCAGTGATAGAAATCTTTTATCACGGATAGAAAAAGTTTCTATTAGTGATAGAAATCTTCTATTCTATCAGTGATAGAAACTTTCTATCACTGATAGAAAATTTTTCTACCACTGATAGAATCTATCAGTCATAGAAATGTTAGTGATAGAAACTTTTTATCGCCGATAGAAAATTTTTCTACCACTGATAGAATCTATCAGTAATAAAAAGACTTTCTATCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGACGAGGAAGAAGAAGATGGGCACACAGGGGCAATTTAGGAATATAAAAAATTAATTCAAAAATTTTGCCATATTTGCAAATATTTTTAAAAATTGCTATATTTGTAATTATTTACCTTCATGTTGCCACCCATTACAATTATCCTTTTTTTAACTATATTCTTTTTTTTAAAAGTGGTTGATGATCATAAGATTAAATGAGATGATACTTAGTGAGGTAGCAAAAACATTACTAGAGAAAAATTAGGTCACCTATGAGAGAAAAACTAAATTTTAATTTCTACACCAATTTCTTACAAATTGGATGGAGAAATTAGAAAATTTTCTCTCTTGGGTAGGTTTGATTTCTCTTGTATAAATATATATGCCAACTCACTAAGGATCATGCTCTATAAGTTTATCATCAAATTATTTTTAACATTAATCAATGAAAAAGGTATAATTGAAAATGATAAACTTATGTTTAAGTTTAATCAATGAAAAAAGGTATAATTGAAAATGATAAACTTATGTTTAAGTTTAATCAATGAAAAAAGGTATAATTGAAAAAAAAAATTAAGGAGCTAGAAACTTTCCAAATGAATATAAAAACTATATTGAAAAAAAACATTCAAATCTTAAAGACTAAAACATATATTTTACCTAAGTTTTAGTAGTGAGAAGATATGTTATATTTTGCTTTTGTCCTTGTTGCTTAGAGAATAGAGATTACAATAATCCTTGGTTGTGAATTCCTGCTCTCGAGGTGAAGATTTGGGTCTCAATAGCTCTCTCGATGTACACTTTTTTTTTTAGTATATCAACATTTGGAGGTGGGGGGATCGAACCTCTGACCTCATAGTTGAGGGTACATGTCAATTAACGCTGAGCTAAACTCGATTTGGGTCTCAATAGCTCTCTCGATGTACACTTGTGTGCAAAATCTGTTCATTCTTTTTAGGGTATTCAATTTCCATTAACATGCAGATATTTTCATATATCTATTAGTTGAACACCCAAAGTAAGAGATGAGTCTAAAATTCTATTATATCATGGAAATCATGTTGAAATATAATCAAATTATCAAAAAGAAAACCACACATGTGGAGAAATATTAATAATAAGAAATTTTAACCCTATTTAAAAAGTGAACTTTTTATTTGTTAATTTAAATATTTTTATGGATTTTTCGACATCAATATTTTATCATTATTTTCATCAACATTATGGTCATTTAAAGGCTTGATTTTATCATAAAAATGGTCCACAAGTTCGAAAATAATTGTGAGGAGCTTTCTTTTGAAAAGACAAGAACATGGTTTGGAGGAAGCAAAATTACTCGAATGGGTATAATATCTACACTCCAATTTTTAAAGGGGACTTGAGATTAACTATATCTAATGATTGGATTGTTGTTGGGATCATAAAAATGCTCTAGAATCTTATTTCTTTTTAGAGATGATTTTTGTAGGGTTGATTGGATTGAGGCCTATGCCCTTCAAAATTTAGATTTGGCAAACAAATCCGCTCGATATTTCTCTACATCTCATGTGATCTAAATGTAACACATCATGTTTAGACCTGCTTTCGAGGGTAAAGATTGTCTCTATAGGTCAATACATATTCTTGAGTGCTTTCTAGATCATGCCACTCACCATCATGTATGTGAATTGGGTCAATAAAGAATGTTGAAATAACATGTGTCTAATTTGTAGTGATAGTTTTCAAAAGTAGTTCAAGATATGACATGACACATATCGGTCACAAAGGATGTAATTTTGAATCTTAGGTGTAAGACATGTAATATATCTAAGTATTCCAAGTTGGGCCTTATTTGGTCTTGATAGAAGAACCTTTTTGTGTATCAAGTAGAAGCATTTTTTTTTTTTCTTTTTCACCTTTTCCATTTGATTTATACCCATACATAATGTGTATGATTGAATCATTTCTTGTTCCTTCAAGGTCAATTGATGTGACAAAATTCTATTCTCTCCACTTTTCATTATAATTTTGAAGGAACTTGTGCAACTTATATTGACCACTAACTCCAAAAAATAGTTAGACCTAGATGAATTGGAAAAAAAAAAGTAAGAGTAAATATAAGAATGTATTTGGTTGGGTGATCTACAAACGAAATATTTAATGAAAAATGTGTGTTATTGTATTTCTTTCTTTTCAAATTTGTGTTGGATAATTCATACATCATAGTTTGAATAGCTTAATTATTGTTAGTTTCTATGATTTTTCAGGATATTTTCATATACGTATCTATACATTTCGTAGGATATAGTAATTGATATAAAATAAAATTTTCAAGAGATGCACCAAAAAGTTCAGATAAATGTGGTCGAACCATCACCAATCGAGCAATTACATAAGCGAATTGAAGCCTAAAATTTGAGGCGATAGTGTTGAGGTGCCTATAGATGCACTCAAGTGAGAAAACCCAATGGGTTAGTGTTGAGATGTTGTCTAGAGCACCACACAACTCTAGCAATAGATAAATTCAATGTCCTTGCATTTTGTCATAGTGTCTCGACCCTGGATTGAAGTGTCTGAACATTGCATAATGTCTTAACATTATTTTTAGCATTTCAATGCTCTTATTGTTGGATTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTGAATGTAAACAAATTGTATACTTGTTTCAATAAAGTGTTATTGAGTTTCTACAATAAAGTGTTATTGTTAAATATTGCACAATTTGACCCAAATTTAATAAACTATGATCCAAGGTTGTTTACATGTGACTTAAACTAGTATGTAGGGACATACGAGGATCGGTGTTCAAGTAACAACCTAAAAGGTCTATAGTACAGGGATAAGGCTAGGTACCTTATCCTAGTAACACTATGTGATACGACCCGCTTTGTATTCGATACAGACACATTGATCCAAGGTGTCCATGTAGGAAACATGCGAGCGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACCTGACCACAAAATAGTAAACCACTAGATGTAACACCGTTAACTAGTTAGGTTACTGTTTCAATAAGATGACCTAGGTAACTTGAGGGAAGAGATTG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mRNA sequence

ATGAGAGGGGAAGACGTGACCTGCAAGACAGTAAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCATGTAGAATGGAGGGGCGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAAAGGTTTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGGGTCGGCCTCGGCCCATTGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTCCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGCCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACATGTCTTGACTCTGATGACGAGCGCCTCGACGCAGATGAGGCTCCAGGGGCAGAATGGTCATTTTACGCTCCGGTTACGCTCGTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGAGGGGAAGACGTGACCTGCAAGACAGTAAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCATGTAGAATGGAGGGGCGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAAAGGTTTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCGCGAGCGGGCCGAGGGTCGGCCTCGGCCCATTGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTCCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGCCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACATGTCTTGACTCTGATGACGAGCGCCTCGACGCAGATGAGGCTCCAGGGGCAGAATGGTCATTTTACGCTCCGGTTACGCTCGTTTAA

Protein sequence

MRGEDVTCKTVNLHTGVVLATPAPMLKSACRMEGRGKVRARGERFRRRFRSNQAKPGHPEAVGTRRDRTGSARASGPRVGLGPLAEAEQGVGPKTRPLRSWPVSLAGFAPLVHLSARFLPGCPRQLLVYRGGPKLPITCLDSDDERLDADEAPGAEWSFYAPVTLV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 50..67
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 50..93

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0011968.1Lag0011968.1mRNA