Lag0011903 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0011903
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1: 34713746 .. 34720020 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0011903
SyntenyLag0011903
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCAGACTTGTCGGAATTCTCACCCCGATACTAACCCAACTGACGGAAGGGAGAACGGACCTCCCACGCGCCCTCACGCGCCGACCCGTGGCGGCGACTGCAGAAATCTCTGTCGGCGCGTGAAGCTCATGCACAGCTACTTCCGGTGAACGACGACGGCGATTCGACTCCCCTGACGGCGATGCTTCTCTTTAGGTGGGTGGTGTCGACAAACGGTCCCTCTAATGTGGTGACCATAATTTCAAACCCTAACCCCACTTGGATGAGAAGAAACCCTAACAGCCAAAGGAAAATTCTAAGACCCTAAAGTGGCTCTGATACCATGTTATCAAAATATCAAACACGAGAGAATTCCATATCCATTCTATACACTAGAGCCAATTATATATAGGCATACATAGAAGCCCTAAACCAATAATGGTAAAATTACAATAAGGGACGAAGACTAATAAGCTACTATATTTGCCTATATACTATAACAATCCACACATTGCATTTTCAGGCATTTTTGTATCCTATTCTTTTGTTGTATGATTTTACCAATGAGTTCTAGTTTACTTTCTAGATCTAGGCTTAGTGAGGGTTTTTTCCAGTCAAATTCCATGGGTCCATGGGAAGATGGGAGAAAGTAGATCTCTGTTATAGATCAGGAAATACCAAGCACTTCTCTTGTTTTTTCACTTCTAGAAATTCGTGTGGCCTTCTGTTTTCGTGATCAAGGAATCAAACACTAACCATCTTCAGTTTATTGAAATATTATTCCCATTGTTTGAATTGCTTGAACTATTTAGGTTTTGCTATTCTATGTTGACTCAGCTTGGACATAGAAAAATTACAGTGTATCTACCAAAACCAGAGCTCTCAAGTAAACACATATTAGGATGAGTGGTTATGTTATATACTGAGTTTGTTTTGGTGATAAAGTAGTTCAAACTAAATGATCCATGTGAATTTAATTATAATATTTAAATAGAATTGTTTCTAGTTTGAACCTTTTGCACCCAAAGGATATGAGCAACTTTCACTATGTGTGGGCTTGGTCTACTCCTAATTTTCTCTAAGTTATTGCATAACAATATCAATAAATTTTAGAACATTTTTTTTTGTCAATCTTCAGCTTTTACAATATAGATCAAGGAATCTATTAACAATTATGTATCTTTTACTTGGTAATGTACAATAGATTACTGCACAAACACATTTCACCTTTGTTATTTCTCTTGGTTGCCTCATTCTTCAGCTGAAGAGATCTTGCTTTCTTAGTTTTTCTTGTCCTAGTCCATTAATTTATCTAAAGATTGACATAGCAATGATTATTTACTCGCATCCTTCTGCTGAATTTACAAATCTCTAGTTGACAGTGGTTGATGTAATGATATTGTTAAAGAGTTGGTATTCAGTATTTCTTTTCTCTTCATAACCATTATACAATGCCACAAATTTTGTTCAATTTTATTCTCCTCACCACTTTTTATTTGAAATTAAAACATGTGTTTGCTACTTCTTTCAGCGCATCTCTAGGATGGTTTACACATGAGCCAGAGTGGTACGATGTAAAAACACGTGGGTGTGAAAATGGTATTTCTTCGGTTGATTCGGTAAGATGATAGCCATGGTTGGGTATTAACAAAGTGATTTTCTTGTATCCGCTTTTTTTAGCAGAATATCCATTTCTTCAAGAATTTAATAGATTATAATTTAGGTGAGGTGTAAAATTTTCCACTACTGTACAAGAAGAAGAAATAAGTTGTTCAATGCTAGAGTGGTTGAAATTTTGGTTTGACGACTATAATGTTACATTTTGATTGACAATGCTAATTTGCATTGGAAGTTGATTGACAATGTAAGTTTATTTAGGGAGTTGGCAGTAAACTTTAATCTCTTGGAATCTATATTCTTGATTGAATTTTCTTTCTTGTTTGGAAGTTGCATGTACAAGAATTTTTGTTATTTTTGGTGCTTTATGGGGATTTAAGTTTTTATTCTTTTGCTCTTGATGGGAGTTTTCATGATTTTCATAATGTATTAGTTTTCATATCAATTTTGTTTGAGTTCCTCAACTTTCAATACTTCTATGTTGGGTTTGTATGGAATTGGCTTTTGTCATCCAAAATTTGTGGTCAATTGTGCCTTTTGTTTGGTGTTAATAATGATGCTTTTGGGTCATCAAAATAGGTATTTTACTCTGTAATTCTATTGTTTTCTTAAACACTATAAAAATCTAATGGAAAACTAGTTCTTTTATGATTAATTCTTTGACTTTGGTGAGCTTGTTCTCCGTAATATGACGATGTTGAAATATTGATACCAAAACAAGTTGTTTTGGGCCCGTTTGGTAACGTTTTCGTTTCTCGTTTTTTTGTTTCTAATTTTATTAAGAAATCTAAGCATTTAATAACTATGTATGTTTCTTGTTTCTCATTTTTTAGAAACACTCCCAAAATTTGTATAGAACTTTTGGGAACAACTAAAACTAGTTTCTCATTTTTTGTTCTTGTTTCCAATTTTTTTCAAACATAAATAAGAATATAGGTTTATTATTATTGATATTTTTCTTTATTAAAAATGAAGAAACAGAAACAAGAAACGAGAACGTTACCAAACGGGCCCTTTATGATTAATTCTTTGAGTTCTATCTTTTAGATAGGTTTGTGTAGTGTTCTTAGTGATCGGCCTTTCTTCATAACTGAGTTTGACTTGACTTTTCATTGGTAAAATGTGACGGGGGAGTTAATTGGTTTACTAGGAAATGTTCTTGTCTTTTATTATCAAACTTGCTTTGTTTTGTGTTATTATATATGGACCTTGAGAGAATGAGATTATTTAATGGCTAGACAACACTTTCCTTTAATTTTCTGAAAGAAGTTATAAGAATTGCGATGCCAGTCATTTCTTTTGAATATGTAAATCTGAGAACACAATCCCTATTGTTAGTTTAACAATGTTGTAATTTGGTGTTTGATATTATTTTGCTGACTTTCTTGCACACAGGGAAGGAAGCTGGAATGGTTAATTACTTCTCATTTCAATTTGGAACAAAAGAAACGCTATTATCTCAGAAATGGATGTCAGGTAAGGCAATCAGGTTTATATAGCTTCTTTGCTTCCCAAGCTAGAGGGGTGTGTGTTTTAGGCTATAATACGATCAAGGTCTAATAAAGTCGTGACTAATAAAGTTTGTTTGATTCCCTTAGAGAAAACTCTGCTCCCACAAGTATACTCAACGAGTAACCTTCAGAGAATACTGGTGTTGCTTTGTGGTGGTGTTTCGTGATTATCACAACAAGGAAAAGTCTTGTTCATTTTGCTGGAATTTTCTGCAAATCTTGGAGAAAAAGGCGAAACTCGATCAAGGCTTCTACGATAGTAAGTATCCATTGATCCCTTGATCACTAGGTTTGCATCTAGATTAGATCTAGATTTAAATTCGTAATTAACATGCTTATAGTGCATTTTACAGTAGGTTTAATAAGTTTTTGCTGCTGGAAATATTTGTCGTCGTATTGGTATTCCAATCGACGTTTAACTTTGAGTAAGGTCTCTGATACGTTTCCGCTGCCTAGGGTTTTTTTAATCCCTACACTAAGTCCTTGTTATTTTTTAATATTCGTGAGGTTTGGACCAGCTTGTATGCACCTCAACTATGTGATGTATGAATTCCTTTTTATTTCTTGATTCAATTCTTGTATTTGGTTTCTAAACTTTTGTGCTTGTTTTATTTTAGTTGGTTGACTTTCAAATGTGCTAATCTAGTCATTATTGCTAAATTTTTACTAGTCATTTGATGTGAATGTAAATTTATTTGGAAATCCAACACCTAACCCTCCAAATATAACTTGAAAAAATTGTCCACGTAGACATGTATTGATAAGATGAAAGAACAAAAAAAAAAAAGTGTGATTGATTTCTAAAATCTACTGGTAAATTGTCACGTCATGTAAAATAGTATATTTCACCATTGAAGAGAGATCAAAATTTATTTTTGAATATTTTACCTTGTTTGTAATATTATGTTGAGTTGAATACCGAAAGGATTGAACAAGATATGGTTCTCATAAATACAATATAGATAAAAGAACCTAAAAATAGGTCCTTGTTTTTTATCCTAGAAATAGGGTAAAAATCTATAGGATTAATGGGTTGTATGTTCACTAATTTAAGTTAAATTAGCCATAGAAATATAGTTTAATTGGTTAAGCAACTAAAAACATGTTTATACAGCTGAATAGGTGTTGAACCTGATTTGTTGTGTGAGTTGTTTGAGTAGAAATTGTGATTGCATTTTATGCTGCATTTCCTTCCAGAGTAGAAGCATATTTAAAGTCCCTTCTTCTATCTACTATTTTAATCATCTTTAATTCAAAACCATCTCATTCCAAGCTCTTTGTCAACTTGTTACCTTTGTCTCAAACTTTGTTCTCAATTCTTGCTTATTGAATTATGTTACAACCGTTCTCTTAGGTTCGATACTTGAAATTCTTCCACTTTATACTACTTGAGTAAGATAACGTGTACTTGTGTTTGCCAATGCAACAATAATATTTTTAATTTTTCTACTGAGGTTAGTAAGTTAGACATAGAAGGGACACAACGATCGAAGGGGCCCAATGTTTTATCTCAAAAGAAAAGAGCTTGTGGATAATGAGTCTAAGCAACAAAAACTCTCTAATTATATTCGATGTATCGACAACGACCGTAGGAGTCATGAAAATTCTGTGTTGGAATGTCAGATAATTTGGGAGTCCTTGGGCATTCCATGATGTTTGCATGAATTATCTTGCATTAATTCATCATTATTATTTTTATTATTTTATTATTATTATTTTTTATTTAAAATAAAGTGTACAACTTCTTCTTTAATAAATTTAAAAGCATCGTTTAAATTATGTTGGATGTTAGGAATATTCAAATATGAATCGAAAATTGATCCGATCGACCAAAATCGACCAAACCAATATCGGTCGGTTGGTTTGCCTTTTGGTTCAGTCAGAATCAATTT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mRNA sequence

ATGCAGACTTGTCGGAATTCTCACCCCGATACTAACCCAACTGACGGAAGGGAGAACGGACCTCCCACGCGCCCTCACGCGCCGACCCGTGGCGGCGACTGCAGAAATCTCTGTCGGCGCGTGAAGCTCATGCACAGCTACTTCCGCGCATCTCTAGGATGGTTTACACATGAGCCAGAGTGGTACGATGTAAAAACACGTGGGTGTGAAAATGGTATTTCTTCGGTTGATTCGGGAAGGAAGCTGGAATGGTTAATTACTTCTCATTTCAATTTGGAACAAAAGAAACGCTATTATCTCAGAAATGGATGTCAGAGAAAACTCTGCTCCCACAAGTATACTCAACGAGTAACCTTCAGAGAATACTGGTGTTGCTTTGTGGTGGTGTTTCGTGATTATCACAACAAGGAAAAGTCTTGTTCATTTTGCTGGAATTTTCTGCAAATCTTGGAGAAAAAGGCGAAACTCGATCAAGGCTTCTACGATATGGGTGTTCGCGGGTCCGCAGAAAGCAGCGACAGAAGATCTGGGCGTTCGCGAGTTCTCTCTCTAAGTCTCTCAGAACCGTCATCAGTGTTGAGTCGAGAGGACCTCCGTTTCAGATCTGAAACAAATAACTTCCTTGGTCTGCCGCGCGGGGATTCGGTTGGTTGTAAGCATCTGGGTAAGAGTAAATCGACGACGACAGCGACCGGATTAGCAGTGGTGGTGGCAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCAGACTTGTCGGAATTCTCACCCCGATACTAACCCAACTGACGGAAGGGAGAACGGACCTCCCACGCGCCCTCACGCGCCGACCCGTGGCGGCGACTGCAGAAATCTCTGTCGGCGCGTGAAGCTCATGCACAGCTACTTCCGCGCATCTCTAGGATGGTTTACACATGAGCCAGAGTGGTACGATGTAAAAACACGTGGGTGTGAAAATGGTATTTCTTCGGTTGATTCGGGAAGGAAGCTGGAATGGTTAATTACTTCTCATTTCAATTTGGAACAAAAGAAACGCTATTATCTCAGAAATGGATGTCAGAGAAAACTCTGCTCCCACAAGTATACTCAACGAGTAACCTTCAGAGAATACTGGTGTTGCTTTGTGGTGGTGTTTCGTGATTATCACAACAAGGAAAAGTCTTGTTCATTTTGCTGGAATTTTCTGCAAATCTTGGAGAAAAAGGCGAAACTCGATCAAGGCTTCTACGATATGGGTGTTCGCGGGTCCGCAGAAAGCAGCGACAGAAGATCTGGGCGTTCGCGAGTTCTCTCTCTAAGTCTCTCAGAACCGTCATCAGTGTTGAGTCGAGAGGACCTCCGTTTCAGATCTGAAACAAATAACTTCCTTGGTCTGCCGCGCGGGGATTCGGTTGGTTGTAAGCATCTGGGTAAGAGTAAATCGACGACGACAGCGACCGGATTAGCAGTGGTGGTGGCAGATTAG

Protein sequence

MQTCRNSHPDTNPTDGRENGPPTRPHAPTRGGDCRNLCRRVKLMHSYFRASLGWFTHEPEWYDVKTRGCENGISSVDSGRKLEWLITSHFNLEQKKRYYLRNGCQRKLCSHKYTQRVTFREYWCCFVVVFRDYHNKEKSCSFCWNFLQILEKKAKLDQGFYDMGVRGSAESSDRRSGRSRVLSLSLSEPSSVLSREDLRFRSETNNFLGLPRGDSVGCKHLGKSKSTTTATGLAVVVAD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..31
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..18

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0011903.1Lag0011903.1mRNA