Lag0011427 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0011427
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr1: 24508101 .. 24515268 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0011427
SyntenyLag0011427
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTATGGTAATTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTCCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGTGAGAGGTTTGGAGTCGCCACCAATCATCTTGGGGTGTGATTGGTCACCCATTTTAAAAAAAGTGGTCTTTGAAAACCAAAAATTAGGTTCGGGGATCAGTTGTGTGTAGGGAAGGTGTTAGCACCCTACAACACCCGTTTGAAAACATTTTATTTTATTACTCAAATTCATTAAACAAAAGGTCCGTGTCGAAAATAAACAAAAAAAATGAAAATTGAAAATTAATTGTCTCACTAATTTCACCTTATCTTTAAATAAAGTAAGGATTTAATTTTGTGAGTGGGGTTAACCCATGACTTTATTATCATGTAAAAATTTCCTAATTAAAGAAAATCTTTCACCTCAAGAATTTGAAAATTATTTCAACTCCGTCATAGGCTATACATGAGCTAATTTGTCTCTCAACTATTACCTCACATTTCAAAAATAAAATATGAAGTAATAATCATGAGTGGTATGACACCATTCAATGGAAAAATATTTTTTCATTTTTAAATCAAATTCAATTAGAAATTCATTTGGAATTACCAAAGTAAAACTATTTTGAAGTTCATTTGGAAAATCCAATTTAGAATCAAATCGAAGTTGATTTGAAAGTTTTCTAATTTAAGATCCAATTGAAATTTTGATTGCCAAAATAATTGACTAGTCAAACTTTAGGCTAATTTCCAGGCAGGGTGTTCCCTTTCGGTCAGCTTAAATACCCGTTCTTAGACAAAATTAGCATTAAAGTTTTCATAATCAATCTATTTTAACCATTCAAAATATTAAACAATGTTTTTGAAATTTGATTTAACCTTTCCAAAATCGAAATTGATTTCCAATTTAGTTTAAAATTGAAATTGATTTTCAATCTAAGACCAAAAGACATTGACTGGAAACTTTAATTTAGAACCAAATTGACATTTACTGAAAAATTCCAAATCACTTTGAAACTCCATGAATTCAAGATTAAAACCAATTGAGGGTGAAAATTCAAATAAAATTCCAATTGAAATTCATTTGGGCAATTCCAAATTAAAATTCATTTGTAAATGTCAAAATGAAATCAAATTAAAAACAAACAAAAGTTGAAATCCCAAATTAAATCCAATTAAAAATTTATTATAAAATCCCAAATTAATTATTGAAACCAATGGAAGGAAAGTTTAAAATCGTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGAAAATCAAATTGAAAATCTTAGTTCAAATGTCATTTGTTTGAAATTCATTTGAGCATTTCAAAACCCTTTGAAATTCATTTGAACCATTCAAATTAAAGTAAAATTCAAAACATTAAAATTTCCATTTTAAAGAAAATTGAATTTTCTAATTACAAACTAGTGAACATTTATTAGGAAAATACAAATTCAAACTCAAATTAGAAATTTTATGTTAGAATCCAACTAAAATTAATAAGAAAGACAATTAAAGTTGAAAATGTCATATTAAAATCAAATTGAAATTGGTAATAACAATTCAATTTAAAGCCAATTAAAATTAGTTTGGAAACTCCCAAATAAACTCTAATTGAAATTAGATAAAAAAAACTTTCAACTAATATCCAATTAAAGTTCTTTAGAAGTCTAAAATAAATCAATTTAAATTTCTAATTAGAAAATGAAATAAAATAAATTGCAATTGATTTGGGAAACTCAAATTCATAGCCAAAATGAAAAATGGAAAAATTTGGATACATAAAAAAATAATAATAATAATAAAAGAATTTAAACATGTGGGACCCACCTTATTCACTTTACTCTTTCTTCTTCCCCAACTTCCTTCCTTCTCTTTTTCTTTTTTCTCTTCCACTTTCCCTCACTTAGGAGCCTTGTTGGAAAAAAAAAAAAGCGGCGGCACGGTGGCGGCGGTGACAGTGGTGGCGGCAACGGCGGTACGACAGTGAGTGGCGGCGTTGGTACGGTGGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGCAGTGAGTGGCGGCGGCGGTACGGTGGTGACGGTAGCTTTGGTTTTTGGAAAATCCTTCTCCAAACTCTATTTTCCCTCTCAAACTCACTTTCTCTCTCTAAGCTCTCTCACTATTCTTCTCTTTTTTCTTGTGTCCTTGTTGTTCTTTCCTTTCCTCCATCCTCCATGAGCTCTCATTATATAGTAGAGCTTGGAGGAAGGGGTTGAGAAAAAGGGGGAAAGAATGAGAGGTTGGGAGAAAGAGGGGGAGTGAGTTGAGAAAGATGGGGAAAGAATGAGAGGTTGGGAGAAGGAAGGGGGGAGAGTTGAGAAAGATGGGGAAAGAATGAGAGGTTGGGAGAAAGAAGGGGAGTGAGTTGAGAAAGAGGGGAGTGAGTTGAGAAAGATGGGGAAAGAATGGGAGGTTGGGAGAAAGAAGGGGAGTGAGTTGAGAAAGATGGGGAAAGAATGGGAGGTTGGGAGAAGGAAGGGGAATGGAGAAGAAAAAGGGAGAGGGAGAAAGAATAGGAGAGGTTGGGAGAATGAGGGGGATGGAGAACGTGGAAAGAGGAGTGAAGGAAAAAAAATGAATAAAATAAAATAATAAAATAAATAAAAATAAAATAAATAAACAAAAATAAAATAAAATAAAATAAACAAAATAAATTAATTAATTAAATAAAACAAAAAAAAAGAAAAGAAAATAAAATAAATAAGATGAAAATGAAAATAAATCATGAAAACTAAAAAACAAATTTTGATAATATGCAAGGAGAGAGATTCGAACCAAAGACCTTGTGATTGTTAATACGACTTTATACCACTTGAGCTATGCTCTTGTTGACATATCAAAAACAAATTGACTTCCAAATATTGAAAAACTTCAAACATTATTACTAAAATCAAGCCGGACCAAATACGGTGTCTACAGTAATTATGCATGATTTTAATTTCATGAGTAATTTAGTATAATTGTTATATTAAATGTATGAAATTGGAAAAACATGGTGCATGACATTAATTAATTTAATATAATTGTTATATTTAATTAATGTAGCATGCATGCTTAGGTTTATTTTCATGAGTATTAATATAATTAGTTATATTATGGATGGAAATAAATGTCAATGCTTGTTTTCATGTATGATTTAATATAAAATGTTATATTAATTAAATGAAAATGGAATAGCATTGAGGATGACAATAATTAGATTAATATAAATGTTATATTATATTAATGTCAAATTTCATGTAATTTAATTTCGTGGATGATTAATTATTATAATCGATATTAATTAAATGAAATTGAAATTGCATGAAGCATGACACCACCTTAGATATATATAATCGTTAATCATAGTCTAATATTAGCATGCAATGTCACTAGGTAATTAATCATAGTCTAATATTAGCATGCAATGTCACTAGGTAATTAAAAGGGTTTAATTCCCGTAAACATTAGAGTAAATACCTAATTATAAGAGTTATAATAGGCATAGACTTAGATAGATTGACTTAGTCGGGTTTATCGAAGTTTAAAAAAACCCTAAAATACAGTAGGACATTTCAGTGGGAGGAAAAATATAAAAACAAGATTTTCATATCGAGTTTTTACTCTCACGTCCCCCTGTGTTCACACCGTGAGATCCATGCTCGGCTTCGTATCGCCCTAGGCGCGGCCTCCCTTCGGGAAGTGTTTGCATGGGTCAATAACAAGGTGAATGGGGAGAATGTCTATAGTAAGTAGGAGCAGGATACGTCAACGTATCCTACGGTTTCCACCCCTAGGTCGCACCGTGAGATTCTTATGATCCGTCTGTGTGTCGTCTTGAAGCGACCATCCCTTCGAAGGGCCTGATCATAGGTTTCGGAACACTGCAAACTCCCGAAATGGATAGGGTCACTTAGGTTAATTACCAACAGTTGTCTTTCCTTTTGGTATGTTGTTGGTCCGTACCTCTAGGATCTAAAAGTGGGAGGATTACACTTACGGGGATGAGTTAAATGTGTTAACTAATCCTTGACCGAACAACGATAACTAAATGCTAACGGAATATGAGTTATTCTGGTGTTAGAATTTGGTTGAGATTGTCTCAATTCAGAGGAGGAGTAGCTGACCACCCTTCGGTGGCTGTTGTTCTAAACCTCTGAAGTATCATTGCAAAAACTAAATCAATAGTTTTATAGGGTTTCTTTGATTGCTTGTTTGTTTTTGCAGAATTTGATTGGATTATTTGTAATGGGTTTAGTGCAAAACAAGTAATTTGTTGTTTCAGTGATAATTTCTATGTGCATTGTCTTACGCCAATTGATAACGGTTTTAGATACAACTAGCTTAAACTACAAACTTGTGGTAAATGATTTTAGATTAGTCTTGATTGAGGAATGTCCTCAGGCTCAAATGTCTAGTTCATCTTGAATTGTTCATGATGAGTATTACATTAACTGCCTAGCCAATACCAATTACAATAAATATGATTTATTGGTCATTGAAACGTGCATAGTGGAAAATGAGGGTACGACCTGAATTTTTAATTCAGGTGCCACTTATCACGTTTGCTTTTCCTTTTAAGGAATAAGCTCATGGCAACAGTTGCAATTAGGTGAGATGACTCTCAGATTCTGATCTGGAGAGTATGTTTCGGCTTTGGCAGAGGGAACATTAAGTTATTTTATCCAGTGGGAGAAAATACCCATTATTGGATAATGTGTATGAATTTCCCGAAGTTTAACAGAAATTTGATTTCTGTATCGCATATGCTGGAACAATGTTACTCTATATCTTTCTCTGCTAACACAGTTTTATTTGAAGAAAGGGAGTTGACATTAGTTCAGCATTATTGAAAATAACTTGTGTGTTTTAAGACTAATCGAGAGTAAAGCAACTCATGAGCACTGAGTTGTTTAAGATTTCTTATACTCATAGAAATAAAGGCAAAGGATATCTCCTAAAGGAAATACATTTCTTTGGTTCTTAAGGTGTTAGGCTATTTTTTA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mRNA sequence

ATGTATGGTAATTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTCCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGTGAGAGGTTTGGAGTCGCCACCAATCATCTTGGGGAGCCTTGTTGGAAAAAAAAAAAAGCGGCGGCACGGTGGCGGCGGTGACAGTGGTGGCGGCAACGGCGGTACGACAGTGAGTGGCGGCGTTGGTACGGTGGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGCAGTGAGTGGCGGCGGCGGTACGGTGGTGACGATCCATGCTCGGCTTCGTATCGCCCTAGGCGCGGCCTCCCTTCGGGAAGTGTTTGCATGGGTCAATAACAAGGTGAATGGGGAGAATGTCTATAAATTTGATTGGATTATTTGTAATGGGTTTAGTGCAAAACAAATCTTTTACTGGAGAAGAGCTACAAGAGCCAAAGAGCCCTTGGAGCTTGTACATTTGGATCCTTGTGGTCTAGCTAGCGTCGAGACGCCAGCCCTTGAGTGTCTCGACGCTGGCATTCCATATCAGAATAGGTGCGAAATCGTCGCAGCGTCGAGACGCTACGACCTTAGCGTCTCGACGCTATGGCAGAAACAGAGAGGATTAAGGCTGAAACAAGGGGAGAGATTCAGAAATCAACCCATCGTTCGTGGGGATCATGACGGGGACGTCGGTCTCGGCCTACATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTATGGTAATTGTCGCAACGTCATCGCGACGCGGAGCGGCCGACGTCCTTCCCTAAGGGTCTCTTTCGAGGTGAGAGGTTTGGAGTCGCCACCAATCATCTTGGGGAGCCTTGTTGGAAAAAAAAAAAAGCGGCGGCACGGTGGCGGCGGTGACAGTGGTGGCGGCAACGGCGGTACGACAGTGAGTGGCGGCGTTGGTACGGTGGTGAGTGGCGGCGTCGGTACGGCAGTGAGTGGCGGCGGCGGTACGGTGGTGACGATCCATGCTCGGCTTCGTATCGCCCTAGGCGCGGCCTCCCTTCGGGAAGTGTTTGCATGGGTCAATAACAAGGTGAATGGGGAGAATGTCTATAAATTTGATTGGATTATTTGTAATGGGTTTAGTGCAAAACAAATCTTTTACTGGAGAAGAGCTACAAGAGCCAAAGAGCCCTTGGAGCTTGTACATTTGGATCCTTGTGGTCTAGCTAGCGTCGAGACGCCAGCCCTTGAGTGTCTCGACGCTGGCATTCCATATCAGAATAGGTGCGAAATCGTCGCAGCGTCGAGACGCTACGACCTTAGCGTCTCGACGCTATGGCAGAAACAGAGAGGATTAAGGCTGAAACAAGGGGAGAGATTCAGAAATCAACCCATCGTTCGTGGGGATCATGACGGGGACGTCGGTCTCGGCCTACATTGA

Protein sequence

MYGNCRNVIATRSGRRPSLRVSFEVRGLESPPIILGSLVGKKKKRRHGGGGDSGGGNGGTTVSGGVGTVVSGGVGTAVSGGGGTVVTIHARLRIALGAASLREVFAWVNNKVNGENVYKFDWIICNGFSAKQIFYWRRATRAKEPLELVHLDPCGLASVETPALECLDAGIPYQNRCEIVAASRRYDLSVSTLWQKQRGLRLKQGERFRNQPIVRGDHDGDVGLGLH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 40..62

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0011427.1Lag0011427.1mRNA