Lag0007977 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0007977
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr9: 9224367 .. 9230529 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0007977
SyntenyLag0007977
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTGGCCACTTCTCTGTAAGATCAGCTACACTGAAGGCATTGGAGATGTAGGTGTCAGGAGGTGAGTTACCAAATACAAGCATTTGGACCAACCATCTTCATTAATCTGCAAGGGCTGATATCTTTTGCTTCAAATTGTTGAAAGTATCCCACACTATCAAAGGTATTCCATAACTGCATTGCCTTAAACTCCCTCCATTGTCTCAAGTTAGCACCCTCTACATATTTCTAACTTAGTTTTGTCAAGTTTTCACAACTTAATGTATTTAATTAATTCTATCCATATAGTCATTTGCCTTTATGCTTACATCAGCAGAAGTAGGTAGTTGTACAAGAACTGCTGTCAGCTTGGGAACCTTTTGTGTACACAACCTCAAATGGGAATTAATTAGTTGATTTGTTTTTCATATTGCTGAGTGAAAATCCAGCCTGTAGAAGTGCTAAGTCTCACTGACTTCACCCATCAAAACTAAACACATAAAAGATCTCCAAGAGTTCTATTTGTAACCTGCCTCTGGTCATCCATTGTGGGTCTCAATGTCAAGTGCTGTTTAATTTCAAACTTGTTCCAAATTTCTTCTACAGTGATTTCTAGAGACAAGAAATTTCAAATTCCATAGCTCTTGCTTTAGGAATTCCATATAGCTCTACCGCTTCCTTAAAAAGAAAAGGTTGTAAGCATAGCAGCATCATTGGTTTTTCAGCACAGCAAGATATAAAGTGCGGCAATTTGTAGAACATGCCAACAACAAAGGTTCAGTTGTCTCCCTTCGGAATTTTAGGCAATCTGAGAATGAAGTTGATGGGGGTATTTTTTGACAAGAAACCACAACTTCATTGATAAAAAATGAAACAATACAAGGGACACCCACAAAAGGCGCTAAACTAGAACAAAACGAGTCTCCAATCTAATCTAATCTGACAAAATAAGACCTAAAAGATAATTACAAAAATCCTTAACCACCAAATCCCAAAGAAAACATGACCGGGTTCTCAAGAAAAAGTAACAAGGGATAAATGTAGGAAACTATTTTTAAGGATATTATTAGGATAATAGAAGGGCATGTGTCATTAGTAAGAGTTGGTTAGGAAAATGTGGTTATAAATAAGGTGAAATTAGAGAGTTTGGGATAGGCAACATTTCAGGACTCAGGAGTAGATATTTTGGGAGAGTCGATGCCCTCTTTAACTGCTTGGGTATAATACAATTTCAGTGTTATTTTCTTGCTTCTATTCTCAAGGATTGGGTTCCTACTTCCTATCCAGAGTCCATGGTTAGATCTTCAATATATATTCTGGAACAGGTAGTTGAGAGTAAAACCCCTTTTTCTACACATTACCCTTCGCCATGAAGTAGATTCAACAATGTTGTAAAAATGTTTGACATCCTTCTTCCCATTGGGATAAAAAGAGCCGGCTTTCCAGTTGATCATGTCTTGTCCCTCCCAAAATGCTCTCGGAGTCCTTTGGGGTTACCAACCTAATTGAATGTACTCATGGTGAAGTTATAGATATGCAAAGTTTGGCATCTTTGAAATTTGAATAGATTTTAATCTGTAAAAGAATATCCCAGGGTAGGCCCCAAGTATTAATCTGTAATAGAGATATTGGTTACTGGTTATGGGAGAGGTATTAACACTACATAATTCAAAAAGTTAATTCTAATTCCAATCCTCAAATATCTTAAAACTAATGCATCCTAGGCATGAGAAATCAACCCACCTACTTTTACATTGTCCTTTCTCTTACAAGTGGTGGTGTTTGATCCTTCAAGGCTTTGACATCCCTCAATGCTACCTAAATGGTGTGGAACTAGCAATGAAGCATCTACATGTGGCTACCCCTAAGGGGAAAGCTAAAATTCCTTCATCGGACATGATTAAAGCTTTAGATATGGGAGCTATGGATGAAGAGAAAAGAACAAGAACCTTCCAGGCTTCCAAGATTTCTCTCGAGAGGATAGCACTTTTTTTAATGTTACACCAATGTTAAACTTGGTTTCTCTTTCACTCTCTCTTTAAGCAATTTCGAAATTAATCTTCTTTATCTATCTTTGCCAACTCGATTGGTCTTTTGTAATCCTAATGAGGTAGTTTTGTTCTCCTCATTTGTTCTTGAGTAATTGAATCTATTATTTCGTCTATATATATTTATAATAATAATTATTATAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAGATTTGCGGCCACTATACACAACCATGACAATAACAGCGATGCATCAATTCTTTTGATTTTCGATATATACAAATTGATGGATTGTAGACTATAAATCTCTATGATTTTTCTTTTTATAAGTTGAGATGTGTAACTGAGAAGAAACCAGAACACTCCATAAAATTCTTAAGATTAGAGTTCCAAACAGCGCAGATGAAGAGCACTGACCCCATCCTATTCCACTATCGTTTCATAAGACCATTTTCTGGGGGGAGGGGGGGGGGGGTGGAGGAAAGATATCTTATGAATTATATGGACGAATGATCATAAACTCGTCTTCTTCATCAACAATCCCACATAAAATGGCCCGAAAAACACCACATCTCTAATAATTTTGAATTGCATAAGCAACTTCAAATGATGACAATGTCTCATCGGAACATCAGCAGCATGAAAATAGTAGTTCAATTTACAGCCAAAGATTACTCAGCAACCAAATAAACCGAAATAAAGCTCCTAGGCTCGACAGTTGAGGGCAAAAGAAAGTAAGATCATAGAATGATTAAATAAGTGCAGGTACCTCATCTTCGATATCCTTGATTTTCTGCATAACAGTCGCCATTGTTGCTGTTCAGAGAGAGATTAGTGTGGATTAACGTCGAACAAGAATTCTTCCGTGTTTCAGAGGATTCTGTTGGTGCCGCACAGCAACTGCGCGGAGAGAGTGCAGATGTTTATAGACAGAGATGTCTAATTCCGTAGATGGGCCTGTAATTGGGCCTTCCTTAAGCGAAGGGCCTTTTCATCCGCTTTAACCCTTAACCCTAGGGAAATTTCACTTCATGTCTATATTTAAGTGGCAGTTTTGAAAAATAGCCCAAACTGATTACATAAACTTCATCTAAGACCAATCTAGATTTTAGGATGTGAATGCACGAAGGGGCAATGGGGCACGTGCCCCTCTCAACTTAAAATAATATACATTATTAGGGGTGAAAGAAACCGAACCGAACCGGACCGGTTCGGTTCGGTCTGGTTCGGTTTTCAACTTAAATTCTAACCGACCCGAACCGAACCGATTAGGTTCGGTTCGGTCCACACGCTTTTCCTTGCACGAAGTTTCGAACCGATATATATTTTCAATTTTTCATTTAGGGTTTCTTTCTTCCTCATTCAAACGCTTTTCTTCCACCGCCGCCCCCGATGTTCGTCCGTCGCCTCTCCCAGTCTCCTCTCGTGCTCGTGTTTACCGCCACCGCCGGTGCTTTTCGTGCTTGCTGCCGAGTTTAGGTTGCCGTCGGGTAAGTTCTTAATCGTTTTTCTTCTTTGTTTTTTAGTTTTCTTCTTTGTTTTTCTGGGTTTCTAGCGGTGATTCACTGGTGAGTTCGATCGGGTTCCTTTTGTTTTTCGATTGATTTCTCTTTTTGTGTCTTTGGTTTTGTTTATTGCATTCCTCTGCACCTTGTTTGTGTTTCGATATAACTACAAGGCAGTCCGTACAGGTTTTCTCATCTGTTCTTTGTTTGTGTTTCGCTTTTACTCACCTTTTTCGATTTCATCTTTATCTTCTTCGAATTTCTTTATTAAAAGCACGATTATATTCGGATTAAAGCCCTTGAGTTAAATGAGTTTGATCTATTAAAGCCCTTGAGTTTCAAAAAGTCTGTTCGTTGTTGCTAGTAGCCGAAATTCCCTGCCATATGCGAAGATGGCAAGGTTAGTTACATTTGATTCGAATCGCTCTGTTTTAGCATCTGTTCTGATTCAGGGCTTTCTCTTTCCTCATATTTCAAACTCTTGATTTCGATTTGTGGGGTGGGGGGGGTTTGTAGCAAAATCCTAAAACGAAACAATTATGAGTAAACAAATCTAATTTTGAAAGACAAGAAACAACAGAAACATCATCCAACAAATCTCGTAAACATTCCCTTGAATAAAATTCCCCAAGGACTCTCCTCTGTATTTGAAGGGTGGGTGTTAGATAGATGAGATGGGAGTATGATGAAAGGCCTTTATCTGTGTGTAAGTTTGGGGCAGATAGAGTAAAGTTAGTAGAAATTAAGAACAAAACAATTTTAGCAACTGGAAGTGGACTTAAAGTGTTTGGCCTTTTCACTTTTCATTTAATTTCTAAGTCGTACAAATCCCCCATCCCTTCCCTCTTTTATTAACCTCATTCTACACGTTATGTTTTCTGCCTTTTCCTTCCTTCTTTCATTTTCTTGTGTTTTTGGAGCAATTGGAGAGAAGAAAGTAATGATAATAATGTTGCTGATCAATTTCCTTGTGTTGGTGCTGCAGATTATCATATGTCGATGTCTGGTGGCGCGATTGAAGAGAAGAAGATGGAGTCTGTTTTCTCGGCTTGTAATGACATTTTGCTGCAAGAGATCAATGGCTTTTGCAGTGAAGATAGATTATTATTATAATGCTAGCAATCCTGCAAATGCATTGCACCACAAAAGGAAGTCCATTGTTGTCGCTGGTGATGATGATCTTGATCACAACAAGCTCAACAACGACCCCAATAAGAGAATTTGTGCTTCAAACAATGTAAGTAAATTTATCGAACCATCAACTTAAAATTTTAAATTCATTAGTTTTTCAAGTGTTAAAGATAACGAGTCCGATCTTCATGCATATTCTTGTGATAGTATGTTATTGTCCACTCTAAACTAATTTTAGTACTCAAAGTTCCATATAATTGAAATATTACCACGTGGAACATTATTTGTTTTTCCAATGTTAATATACATGATATAAGATTAGGATGACATCTAGGTTTAGGTAGGTTTTAAGATTTGTAAATTTCTAGTTTGGGATAAACAAATATGTATACTAATCCTAAGTTTGTGTTTTGGGTTTAGAAAGTGTCATTTTGATATTATGATATGATTATGTTTTGTCTATTTAACTTGCTAGAGGAAGGGAAGGACATGAGAAAAAGTAGTGTAAGACAATGAGGAAAGGAAGGCCACGAGAAAAAGTAGTGAAGACAGTAGTCTTCGAGAGAATTCAACCCTCTCGAATTGGTTGAAATCTAACCGAAACCCAAAAAAGAGTGATGAATTTGACCAAACTATAGAGCTCCATTGATTGGTTTGGAAAGTATATATATTTTTTCTAGAGCATAAAACTAAAAAATAAAGATCAATTAGTTTGGATAAATTTTGTTAGTTTTAGTCAGTTTGATTCACCTAGTTTAGCTCCATTGGGTTGCTGCATTTCTCTTGGTTATTGGGTGATTAACAATTGTGTCCAGTTAGATTTTCATTAACTGTTGGGGCTTGGTAATGATTAATGGAATTTAAGGATGTTGAGTTAGTTTTGTATTTTGATGTCATGTGGTATTTGGATATTTGCAGGCAACAATGGAATATGGAGAGGCTGATGAAGTCATTTTCTCTGTTATTGGTCCTCGAAGCATTCACCTTTCTGGTTATTTTCTAAGAAGTTGTCGACACAATAATAATGTAAATGATGATAAGATGTATCCATTAATTTGTGTGGCAGGGAGATAACTGTCTTTACCTCTGTAAATAATTGTGTGTATTTGTATAGTAGCTTTTTTCGTTGTGGTACTTGCCAGTAGTTTCCAGGAAGTAAAGTAGATGAAGATTAGAAATTATAAAATTACTGTATTGGGTATTCAAAGCAAATGAAAGAGGCATAGCTTTGTAATCATGTTGGGTGTTCAAAGCAAATGAAAGAGTCATATTTAAAAATGGGAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCGTGGGTCACCCGACCCGACCAAGTTCGGGTCACGCTGAACCGGGTCGGGTCGGGTCGGGTCAATGTGTCCGTACAACCGACCCCCAGACAAACCGACCCAAAAATTTTACACCCCTAATATATATAATTTGTCATTTTAAGTTGAAAGTTTAGCTTTGACTTAGTGTTTTCGTATTTGTCTGCCTGAAGGTGTGCCCCTTCTGCCCGGTCAGTCTTGA

mRNA sequence

ATGTGGCCACTTCTCTGTAAGATCAGCTACACTGAAGGCATTGGAGATGTAGGTGTCAGGAGCACAGCAAGATATAAAGTGCGGCAATTTGTAGAACATGCCAACAACAAAGGTTCAGTTGTCTCCCTTCGGAATTTTAGGCAATCTGAGAATGAAGTTGATGGGGGACTCAGGAGTAGATATTTTGGGAGAGTCGATGCCCTCTTTAACTGCTTGGGTATAATACAATTTCAGTGTTATTTTCTTGCTTCTATTCTCAAGGATTGGGTTCCTACTTCCTATCCAGAGTCCATGGTTAGATCTTCAATATATATTCTGGAACAGTCGCCATTGTTGCTGTTCAGAGAGAGATTAGTGTGGATTAACGTCGAACAAGAATTCTTCCGTGTTTCAGAGGATTCTGTTGGTGCCGCACAGCAACTGCGCGGAGAGAGTGCAGATGTTTATAGACAGAGATGGTTTCTTTCTTCCTCATTCAAACGCTTTTCTTCCACCGCCGCCCCCGATGTTCGTCCGTCGCCTCTCCCAGTCTCCTCTCGTGCTCGTGTTTACCGCCACCGCCGGTGCTTTTCGTGCTTGCTGCCGAGTTTAGGTTGCCGTCGGATTATCATATGTCGATGTCTGGTGGCGCGATTGAAGAGAAGAAGATGGAGTCTGTTTTCTCGGCTTGTAATGACATTTTGCTGCAAGAGATCAATGGCTTTTGCAGTGAAGATAGATTATTATTATAATGCTAGCAATCCTGCAAATGCATTGCACCACAAAAGGAAGTCCATTGTTGTCGCTGGTGATGATGATCTTGATCACAACAAGCTCAACAACGACCCCAATAAGAGAATTTGTGCTTCAAACAATGCAACAATGGAATATGGAGAGGCTGATGAAGTCATTTTCTCTGTTATTGGTCCTCGAAGCATTCACCTTTCTGGTGTGCCCCTTCTGCCCGGTCAGTCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTGGCCACTTCTCTGTAAGATCAGCTACACTGAAGGCATTGGAGATGTAGGTGTCAGGAGCACAGCAAGATATAAAGTGCGGCAATTTGTAGAACATGCCAACAACAAAGGTTCAGTTGTCTCCCTTCGGAATTTTAGGCAATCTGAGAATGAAGTTGATGGGGGACTCAGGAGTAGATATTTTGGGAGAGTCGATGCCCTCTTTAACTGCTTGGGTATAATACAATTTCAGTGTTATTTTCTTGCTTCTATTCTCAAGGATTGGGTTCCTACTTCCTATCCAGAGTCCATGGTTAGATCTTCAATATATATTCTGGAACAGTCGCCATTGTTGCTGTTCAGAGAGAGATTAGTGTGGATTAACGTCGAACAAGAATTCTTCCGTGTTTCAGAGGATTCTGTTGGTGCCGCACAGCAACTGCGCGGAGAGAGTGCAGATGTTTATAGACAGAGATGGTTTCTTTCTTCCTCATTCAAACGCTTTTCTTCCACCGCCGCCCCCGATGTTCGTCCGTCGCCTCTCCCAGTCTCCTCTCGTGCTCGTGTTTACCGCCACCGCCGGTGCTTTTCGTGCTTGCTGCCGAGTTTAGGTTGCCGTCGGATTATCATATGTCGATGTCTGGTGGCGCGATTGAAGAGAAGAAGATGGAGTCTGTTTTCTCGGCTTGTAATGACATTTTGCTGCAAGAGATCAATGGCTTTTGCAGTGAAGATAGATTATTATTATAATGCTAGCAATCCTGCAAATGCATTGCACCACAAAAGGAAGTCCATTGTTGTCGCTGGTGATGATGATCTTGATCACAACAAGCTCAACAACGACCCCAATAAGAGAATTTGTGCTTCAAACAATGCAACAATGGAATATGGAGAGGCTGATGAAGTCATTTTCTCTGTTATTGGTCCTCGAAGCATTCACCTTTCTGGTGTGCCCCTTCTGCCCGGTCAGTCTTGA

Protein sequence

MWPLLCKISYTEGIGDVGVRSTARYKVRQFVEHANNKGSVVSLRNFRQSENEVDGGLRSRYFGRVDALFNCLGIIQFQCYFLASILKDWVPTSYPESMVRSSIYILEQSPLLLFRERLVWINVEQEFFRVSEDSVGAAQQLRGESADVYRQRWFLSSSFKRFSSTAAPDVRPSPLPVSSRARVYRHRRCFSCLLPSLGCRRIIICRCLVARLKRRRWSLFSRLVMTFCCKRSMAFAVKIDYYYNASNPANALHHKRKSIVVAGDDDLDHNKLNNDPNKRICASNNATMEYGEADEVIFSVIGPRSIHLSGVPLLPGQS
Homology
[Close]
BLAST of Lag0007977 vs. NCBI nr
Match: KAG7024298.1 (Transcription factor bHLH84 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 9.1e-05
Identity = 32/54 (59.26%), Postives = 37/54 (68.52%), Query Frame = 0 

Query: 232 SMAFAVKIDYYYNASNPANALHHKRKSIVVAGDDDLDHNKLNNDPNKRICASNN 286
           +M    +I   +NA+N A A HHKRKSIVVA DDD  HNKLNN P K+I  SNN
Sbjct: 110 NMDVQTQIGNDHNATNSAKAFHHKRKSIVVADDDDHHHNKLNN-PTKKIRTSNN 162

[Close]
BLAST of Lag0007977 vs. NCBI nr
Match: KAG6591418.1 (Transcription factor basic helix-loop-helix 85, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 5.9e-04
Identity = 31/54 (57.41%), Postives = 36/54 (66.67%), Query Frame = 0 

Query: 232 SMAFAVKIDYYYNASNPANALHHKRKSIVVAGDDDLDHNKLNNDPNKRICASNN 286
           +M    +I   +NA+N A A HHKRKSIVVA DD   HNKLNN P K+I  SNN
Sbjct: 110 NMDVQTQIGNDHNATNSAKAFHHKRKSIVVADDDHHHHNKLNN-PTKKIRTSNN 162

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lag0007977 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7024298.19.1e-0559.26Transcription factor bHLH84 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
KAG6591418.15.9e-0457.41Transcription factor basic helix-loop-helix 85, partial [Cucurbita argyrosperma ... [more]
BLAST of Lag0007977 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0007977 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0007977 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0007977.1Lag0007977.1mRNA