
Lag0007937 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAACTTTTGGAAAGTGGGTTGAAGGTTAAGGAGTACTCGATGTTTTGCAGGAACTTCAGTGACACTCGATGTTTTGGCTTTGGTATTCAAGAGCACATTGATCTTGGAATCAAGTAAGCCTTTATACTTCTGAATATCCTTTAAGTTATGTTCCAAATTTTGTATGAAACTTACTGTTTAGTCTTCAATCTATTTGGAGATCTATAATCTGTTTTGCTTAGGTGATTTAGTTTTGTATTGCATATGAGTGTAGTTAACTTGAAATGAAACATTCATTTGCATGACGTTTTTAGCACTGACTCTCTTTGAATGGGGATGGATGTTGCTAAATTATCACCACCTGTGGCTACTAGCACTTGAAATTCTAGGTATTTGATTTTAGCAACCAATGATGTATTTTCTTTTTCTTTCTTTCTTATAACCTCTCTCTGTTTAACCTTTTCCTCTCCCTTGGGTGGATTCCAAATTAACCTTGTTTCCATTTTCAAACAATAAATCAGTTTTCTAACCTTGTTTGATTGACGGGTATTTAACATTTCCTTTATGTATTTCCAAAATATATTTAGGTGATATCATTGAATTAATGGAATCATTAATTGTCCTGAAACATTCATAACCATTATAACTATAGCTAATTATTTTTAGGGAAAAATACACTTTTAGTCCCTGAGGTTTGGGTTAAGTGACAGTTTGGTCCCTGAGTTTTCAAACTCAACAAAAATACCCCTGAGGTTTGAGATAAGTAGCATTTTGGTCCCTGCCGTCTATTTTTCTGTTAAATACTAACGGTTGCTGACGTGGCACTATTATTTTAATAAAAAAAAATTATTTTTTAAATAAAAACATATTAAAATAATAAAATATTTATTATTTTATTTAAATTCTTTCTCTCTCTCTTCCTTTCTTCTCCCCCATCTTCTTTCAACCTTCTTATCTCCTTCTTCTTCTTCAGCTCCGGTGGCCGGCCGCCACCGGCTGCCGGTGAGCGGCGGCGGCGGCGGTCGGAATTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTCCCCTTTTCTTCTCTCCTTTCTTTCTCTCTTTCCTTCAATTTTTTTTTTTAATAAAAAGAAGGGAGAGGGAGGAGGAGCCCTCCTCCCTCTCCGGCGTCGGCGACGGGAGGAGGGAGGGCCCCTCCTCCCTCTCCCTTCTTTTTATTAAAAAAAAAATTAAAGGAAAGAGAGAAAGAAAGGAGAGAAGAAAAGGGGAGAAAGAAAGAAAAAAAAAAAATTCCGGCAGCCAGCGGCGGCTGGCGGCGGCCGGCCACTGGAGCTGAAGAAGAAGAAGGAGATAAGAAGGTTGAAAGAAGATGGGGGAGAAGAAAGGAAGAGAGAGAGAGAATTTAAATAAAATAATAATATTTTATTATTTTAATATGTTTTTATTTAAAAAAATATAAAAAATAATATTTTTTTATTAAAATAATAGTGCCACGTCAGCAACCGTTAGTATTTAACAGAAAAATAGACGGCAGGGACCAAAGTGCTACTTATCTCAAACCTCAGGGGTATTTTTGTTGAGTTTGAAAACTCAGGGACCAAACTGTCACTTAACCCAAACCTCAGGGATTAAAAGTATATTTTCCCTTATTTTTACCACCATAGCTTTCTTTCCGCTGCTAATTTCAATTGCAATGAGTGTTTACTTTATCATGCTCTCTTTCCCACCTATTGAATGTATTTGTGTATATATATGTATGTATGTAAATTTTAAAATCATTTTTAACTCTTTGTTGCTTTTGTGAGTGTAATTTAAATGATGTTCTTGCTCATTTTCTACTCTATTTTCCTTTTCATTGCTAGTTCACTTGAAGATGTGCAAAATATAGTGTGTGAAACATTGCTTTGGTGTATTTCAAAGTTTTTTTTTAATCCCTTCTTGAAGTACTTTTTCTTACGAGAAACATAAAAGGTGTTAGTTCTTGAACATATGGAGATAAACAGAGATGAATACCCTTTTGTGAAGTGAGATTTGATTCAATATCAAAAGGTTATTTTTGTATTCAATGTGAGTGATGCCAAAGCATACCACTGCTAGCATCTAAAATATATTTTGCAATACTTTTGCAGCTTCTTGGTGTGTGCAAGTTTGAAAGGGTTTTTCAATTATTTTATATTTGTTACAATTGGCAAACTTTTTATGGCAATTTCATCTTTCAAGGCTTAGAATTTGGGGCTTTTTTGTAAAGGTCCTTGTAAATTTAGTGTGGGGCCAATTTCTTTCTTTTTGGAGGAAGTTTGTAACTTTGAACATAGTTGAAAGTTTAATTTTACTTTACTTTGTGAAGTGGTATGTGGAGATGTTTGAGTTACTTGATCATAAACCTTTGATCCAATGAAAAGTTATTTTGGGCTATTTTAATTCTATGTTTGGATTGGGTGGAGTCTAGTTTCATGATGCTTATGTCAATTATATTACCTTTTGATGGTTGTGTTAGTTTTTGATCAAATATATTTTGAATGAAATCCTAATTAAGGGTGATAGGATGGAAAGCATGTCTTCTTGAAAGAAGACTTAGAGGGTTTTGCTTAGTTTGGGGAGGGATTGTTGTGATTTTTTATTACAAATATATTCTTTCAACATTTCCCTTCTTTATGTGTCCTAGTTTTTGGAAAATTGTGTGATGTCATGTTGTATTATGTCATATCTTGTTGTTATTGTTTTTCCTTTGGTCATGTAAACATTCTTCTTTGTCAACCGCGGTTTATTTTATCATCAAGATGATATGCATACATGTTTATGACTCCATAAGTGTCATCCCCAAGTCATGGAAGGAATTTGGTGACTTTGCATGAAATTGAGGCTACTAGGCTAGTTCATGAAATATTTTGAACTTTGTGCAGTGATGCTGAGGAGGAAGTTTTATCCCACTGCCACAAAGTATTGGCTTCAGGCTACAATAAGTAGTTGCTTTGGAATGAATTTCTGTTGATGTCTCTTAAAAAACTAATAAAACAAAGATGGATGATTAGTGGTAATCCGTAAATGTATCCAGAACATGCTTCCTCATGTCTAGCCTACCAGAATCGGTTGTTCTCTTGATTAAGTTTCATATTTTTAGGTTTGTTCTACTTGGAAACTAGTTATTTTTCCATAAATTGCTAAGATGATGCTCAAGGGTTGTAAAAGAAAGTATTATTTGCTATCAATGCTTATATGTGTTTAATCATATGTACTCAATATTAGATGATTTGAGTTGTCAAATTTGTTAATGCTAAAATTGCACTGTTATTGGTGCTATTGGTTTTAAGTTCAACATGCTCCTACTTTTGTTCTTACTTCTTGCTACTATTGCGAATTCTTGGCTACTACTGTTGGGGCTTTGTTAATGATGCTAAGACAATTGTTGGTTGTTTATTAAGTGTTGGTTAAAAAGTTCACTAGACACTAAAAAGCTAATTAAAGTGTTGGTTGTTTATAAAAATTGTTGGTTGTTTATTAAGTGTTGGTTAAAAAGTTCACTTGACACTAAAAAGCTAATTAAAGTGTTGGTTGTTTATTAAGTGTTGGCTAAAAAGTTCGTTTGACTCGCTTAGTTTGAGGATATTTGGAGTCTTGTTATGAACCTGAAATGTCGTGAGGTTGTAGTTGGGTAGTTTTTTATATAGAAGTGTGTTTATCTTGTTTAACAGGTTTAAAAAAATTTGGGTTAGTCTTATGTATGTTGTTATGCTGTTGAAATTTTTGGAGTATCCGATTAGAATTAAGATAATTAACCAAAACCTTTCCTAATTACATTTTGAATAGCTATTTTGATCCCTTGTTAGTCTCTTTCTATTTAGTTCTATGTGAAGTAGTTACATGTGTTGTCATTTTTCGTTTCTCTTAGTTAGTTTTGGTTTAATGGTTTGGGATTCTAGCTTAAATTATGCTTTTCTTGAGTTATTACTTTTTTTCATTAGCGAATTATCATGTTTTGTTTTTCAAGATTGTTCATGTTCTTAGGAATTTATCAAGTTTTGTTTTCTTTTGTCCTATATGGACATGCACGTTTATAAGATTTTGAGTTTAATATGAAAGTAGAAGCATATTGTGTATTTCCTTTTATAATGCAACCTTTTAGTCAATTTTCATTTTGCTTGGTTTAGGGGAGGGGTGAAGAGTTTAGGAGATACCTTGTGACTTCGTTGTGATCTCTTACTTATAGTTGGGTAAAATTTGGTCAAAAAATAACTTCCAAGATTTTTTTTTTGGGATGGGGGGGGAGTTTAGAAGTGTTACACTTGTGATTTTGTTACGATATTTTGCAATGCATATTATACACTTGTAGAATAAGTGAAATTTTGTTGAAAAAGACTCCAAGGGTTTTGCTTTATTGTTTTATGGAAAATGAGGAAGACTACAAGTGTATGTTGTGTTGGATAAGTGTATGTTGTTTGATGGTTCTTTAGGTGTGAGTCATTTAGTGCCATGGTTTGTACTGACCTACCATCAAATTTTGTAGGTGATGAGGATTACTGCGAACCGGGTGATGCTGAGGAAGAGGTCTGAGGAACAATAATAGCTCTCTAAGTCTAAATTTCATTGTTGTCTTGTGCTTAAATAGTGGTTGTTAGAAAGACTTAGTTGTTTTATTTAGTTGGGTGTTATTTAATTCGAGGGACATATCTTACTCTTGTGGTTAGCATTGTGTTAGACTTGTAAGTTTATTTGAGTTATTTAAATGAAATTTGTTATGAGATTTTACTCGTAATTCTATTTGGAATTCTCTGAAGTTATGTGTTCTCTTAAGTAGGTGGTTGAAATTTTTGGGTGAGCTATTGTTACGTTGTTATGCTGTCGAAATTTTAGAAGTGTTTCAACTAGTAATAGGGATAAATTTGGTAATGTCATTTATAATAGGTAAATTTTGGTACTATGTCTATTCTTGAAAATTTATTTCGATGCAAGTGCATTTAAATACATTGTATGTTTATATAAATGAGTTTATTTTACAATAACATTTGAAAATATTTGGTACTCATATAAAATGT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ATGCAACTTTTGGAAAGTGGGTTGAAGGTTAAGGAGTACTCGATGTTTTGCAGGAACTTCAGTGACACTCGATGTTTTGGCTTTGGTATTCAAGAGCACATTGATCTTGGAATCAACTCCGGTGGCCGGCCGCCACCGGCTGCCGTGATGCTGAGGAGGAAGTTTTATCCCACTGCCACAAAGTGTGAGTCATTTAGTGCCATGGTTTGTACTGACCTACCATCAAATTTTGTAGGTGATGAGGATTACTGCGAACCGGGTGATGCTGAGGAAGAGTGTTTGGCAATTCCAGTGTCTACAGTTGCTTCTGAGTCTACATTAAGTACTGGTGGAAGAGTGATAGATCCTTTTCGCTCCACATTGGCTCTATCCACAGTTGAGGCACTTATTTGTGCACAAAATTTGTTACGTTCTAATGCTATCAATATTGATCTTCAATCACATTTGGAAGAAATTTCTCGCTTTGAAGAAGCTGGTGTTACGGACACTCGTGAAGGACTAACTAGTCGATATTGGTCTAAATCCGTGGACACAGAAAATATGTCTGCAGTGAGAATAGTGCAACTGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTAACACTATGTGATACGGCCCGCTTTGTATTCGATATAGACGTATTGATCCAAGGCGTCCATGTAGGAGACATGCGAGCGGGGATATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACTGGACCACGAAATAGTAAACCACTAGATGTCTTGAACAAAGGGATCCCGCCCTCTCATTGGCCCGAGAGGGACTTTCTGTTTACTGGTTGGACCATAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTAGTACTTAAGGAGCCAGAGGAGGTGTTCTTGAAGAATTCAGAGTCGTCAGACGACGATTCTCCAAAACCTGCCACACCTTCTCATCCTAACATAACACCCTTATTCACCCTTTTACATACATCTCCAAGCCCATCTTCACCTTCCGCACCTACCCAATTATCCACTGTTGACACTAATTCTTCTCCTCAAGAGATTTTGCATGTTTCACCTTCTAGTATTGCAGATTTACTAGCAGATGAGCAATCTCATGAGCATTCAGTATTCCAAAATGTTCACATTCCTGCAAGCACTGTCAATAATCATCTGATGCAAACACGAGCTAAGTTAGGACCTTTCAAGCCAAAGGCGTTTGTCTCCACCATGACCACTTCAGTTCCAACAGATCCTTCTTCATATTTTGTTGCATCGAAGTATCAAGAATGGAGATCCGCTATGTGTGAGAAATTTAATGCCCTTCAGGAACAAGTTGCTAAAGGATTTCATCAGGTCGAAGGGTTTGACTTTAGTAAAACCTTCAATCCAGTTGTTAAAAAGCCCACAATCAGAGTTATCCTCGCTCTTGCTGCTCATTATCAATGGTCTTTAACTCAATTGGATGTAAAGAATGGTTTTCTACACGACCACTTAAAGAAGAAGTTTATGTCTCAACCACCTGGCTTTCTTGACAAATCCAGTCCACATCATGTTTTTCGCCTTCATAAAAGTCTATATGGTCGAAAGCAAGCTCCTCGAGCTTGGTTCGATCGCTTTACATCATATCTATTCACCTTGGGATTTACTGCTTCTTCTGCGATTCATTCTTATTTGTACGCTCGGTTGGATCTTCTTTGA MQLLESGLKVKEYSMFCRNFSDTRCFGFGIQEHIDLGINSGGRPPPAAVMLRRKFYPTATKCESFSAMVCTDLPSNFVGDEDYCEPGDAEEECLAIPVSTVASESTLSTGGRVIDPFRSTLALSTVEALICAQNLLRSNAINIDLQSHLEEISRFEEAGVTDTREGLTSRYWSKSVDTENMSAVRIVQLDKAGYLILVTLCDTARFVFDIDVLIQGVHVGDMRAGISYAMSLHKTGPRNSKPLDVLNKGIPPSHWPERDFLFTGWTINRLFIRGALVLKEPEEVFLKNSESSDDDSPKPATPSHPNITPLFTLLHTSPSPSSPSAPTQLSTVDTNSSPQEILHVSPSSIADLLADEQSHEHSVFQNVHIPASTVNNHLMQTRAKLGPFKPKAFVSTMTTSVPTDPSSYFVASKYQEWRSAMCEKFNALQEQVAKGFHQVEGFDFSKTFNPVVKKPTIRVILALAAHYQWSLTQLDVKNGFLHDHLKKKFMSQPPGFLDKSSPHHVFRLHKSLYGRKQAPRAWFDRFTSYLFTLGFTASSAIHSYLYARLDLL Homology
BLAST of Lag0007937 vs. NCBI nr
Match: KAA0056830.1 (putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ99954.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 1.2e-44 Identity = 110/205 (53.66%), Postives = 144/205 (70.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. NCBI nr
Match: XP_022158189.1 (uncharacterized protein LOC111024722 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 188.3 bits (477), Expect = 1.7e-43 Identity = 126/294 (42.86%), Postives = 163/294 (55.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. NCBI nr
Match: KAA0066360.1 (putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00923.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 186.4 bits (472), Expect = 6.5e-43 Identity = 116/230 (50.43%), Postives = 147/230 (63.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. NCBI nr
Match: CCH50966.1 (T4.5 [Malus x robusta]) HSP 1 Score: 172.2 bits (435), Expect = 1.3e-38 Identity = 121/335 (36.12%), Postives = 161/335 (48.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. NCBI nr
Match: KAA0054997.1 (putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 4.8e-38 Identity = 99/227 (43.61%), Postives = 134/227 (59.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94HW2 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 5.6e-29 Identity = 92/291 (31.62%), Postives = 134/291 (46.05%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZT94 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE2 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 129.0 bits (323), Expect = 1.6e-28 Identity = 101/300 (33.67%), Postives = 140/300 (46.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P10978 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 1.1e-19 Identity = 50/100 (50.00%), Postives = 66/100 (66.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P04146 (Copia protein OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=GIP PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 73.2 bits (178), Expect = 1.1e-11 Identity = 43/109 (39.45%), Postives = 61/109 (55.96%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P42795 (60S ribosomal protein L11-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPL11A PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.4e-11 Identity = 33/38 (86.84%), Postives = 34/38 (89.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9FUJ5 (Uncharacterized protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS18717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 1.8e-46 Identity = 140/386 (36.27%), Postives = 187/386 (48.45%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BLP0 (Putative mitochondrial protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold701G00890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 5.8e-45 Identity = 110/205 (53.66%), Postives = 144/205 (70.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9IR41 (Reverse transcriptase Ty1/copia-type domain-containing protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS54880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 5.8e-45 Identity = 130/289 (44.98%), Postives = 164/289 (56.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9J6E3 (Uncharacterized protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS60664 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 5.8e-45 Identity = 130/338 (38.46%), Postives = 174/338 (51.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2N9IV19 (Uncharacterized protein OS=Fagus sylvatica OX=28930 GN=FSB_LOCUS57128 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 5.8e-45 Identity = 130/338 (38.46%), Postives = 174/338 (51.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. TAIR 10
Match: AT4G23160.1 (cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 ) HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 2.2e-20 Identity = 52/118 (44.07%), Postives = 75/118 (63.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. TAIR 10
Match: AT2G42740.1 (ribosomal protein large subunit 16A ) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 1.7e-12 Identity = 33/38 (86.84%), Postives = 34/38 (89.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. TAIR 10
Match: AT3G58700.1 (Ribosomal L5P family protein ) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 1.7e-12 Identity = 33/38 (86.84%), Postives = 34/38 (89.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. TAIR 10
Match: AT4G18730.1 (ribosomal protein L16B ) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 1.7e-12 Identity = 33/38 (86.84%), Postives = 34/38 (89.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0007937 vs. TAIR 10
Match: AT5G45775.1 (Ribosomal L5P family protein ) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 1.7e-12 Identity = 33/38 (86.84%), Postives = 34/38 (89.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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