Lag0007875 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0007875
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr9: 6933183 .. 6940650 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0007875
SyntenyLag0007875
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAGGCTACCGGCCGTTGGAGATATGAAGAAGAAGAAGGAAAAGGATGAAGAAGAAGAAGAGTAAGAGAGAGAAGGAGAAATAATTAAAAAAAAATAAAAAATAAAAATATTTTAATATTTTTAATTTAAAATTTTTTAATTTTTTTTATTAAAATAATAGTGTCACGTCAGCAACCTTGAGGATTTAACAGAAAAATGGACGACAAGGACCAAAGTGCTCCTTATCTCAAACCTTAGGGGTATTTTTGTTGAGTTTGAAAACTCACGGACCAAAGTGTAACTTAACCCAAAACCTCAGGGACCAAAAACCTATTTTTCCCAATTAATTAAATATGTGATATTTAATTAATATTGGGAAAAATTAATTATTGAATTAATTGGTTGGCTCGAATTAATTCAATTAAATAGGGTTTAATTGAATTGATTAGTTGAAAACTATATAGTAAAATTAATTTAGTTAAATTATGATTTGATTAAATTAATTTTGCATAATATATGGTTTTAACATTAATTATTATTTAATAATAATTAAATCTCATAAGTTGGGATGGCGCCATATGGGGAGTTAGAGATCGTGGATCTCTCCCCCTCCCATTGGTGAAAATACGTACTGCAGAGGGGTTTTGCAGTAGTAGGTTCATGTATCTCTCTCTTTTCGGTGTAATACAGAGGTTTTTTTTTCTAATCTCTCTCAATTTCTCTCAAAGAAATCACAACAATCTTGGCTGTAAATTATTCCTAATTTAAGATTGAATTCCCACAAACTCAACCTCAAGATCTAGAAATATAGTGGGTGATCTCTATTGGTGGTGTTTGTTGGGAATTCGTGACGAATAATTCGTTGAGGAGCATAGTGCTGTGAAGAATGGTCTTCAACAAGCAAGTCCTAAAATTCTAAATAGTTTAGAATGTGTTATTGGTTGATTCTCAAAGAGTTGATTAAGTTGATACTAAAATATTGCTGATATGCATTAATCCAAGCGTAAATTAAACATAACCAAGTAGTACCTAGAGTATCCTAGGGTCGAATCCACAGGGAAGGAATAATAAGACTTTCAATAAACTAGCTAATGAACACTCCGACGCATGGTACTAGATGCAAATTTAAATAAGTGAAAGCTGCGATATTGAAGGATACTGTAAAACAAGCTATGCGACAGGAGTAAGTAAAAAGTAATCAGATGATGAAACTATCAAGGCTTTTGCTGCGGCAACCACATGCGTTACCAACTTATTTAGCATCGCACATTCTGTTTGAATTCCAATTAATGCTTAAGTGAGAAATAAACATGTGATTTTCTTCCGGTACTACACATGTGTTTGGCGTAGAACCAACAACGTTCTGTTCAATTGGTTCATGCGTTGGTGTTGTTCTCTAATGACTGCAAGTGATTGTGTTATTCCTAAAACAATCGAAACACATTCATGAAATATCTCTTGCGGTAGTATTAATCCTAACACAACCTAGACTACATGCAATGCGCTAACTTGCTCTACTTAGACATTTCCACATGCGTTACCTGTCAGGGATTTATCATGCTGCTTCCGCATCCAGCTGGCCAGGTGGGAGTTAGTAATGAAAATATTATCACATCTAAGCAGAAAGCATTAATGTTTCATTCATTCAAAATGTGACGCATACATGATAACGTTGTTACCACATGGGTGCCTAAGCTAAGCCTTGATAAAAGTAATTTAGCTCATGCTATAAGGAAAGACATAACACAATACATCATATCACAAGGTGACTGCGCTGAGACAATATATCCTCTTCTCTCTTCTCCTATATCTCTCTTTGTTCTCTTCTCCTTGTCCTGTTCGCCTTTTCTTCACTGGCAGCTGGGCACTTTTTATAGGCTGAGGATACTAATTTCTCCAAGAAATTGACTTGCGTGCCCCAACTTTCTCTAGCCAGCTTGCAAATTAGTCACATGCCAGGGCAACCATCTTTCCAGCTATCATCGTACGAATTATACTTTGGGATCTGCTCCTGCGCTAAAGATAACTTGGGCAAGGAAATATCTATAGAATTCATTCGTTAGCGGGTAAAAATACATAATTTCCTACCGCATTTAAGAATACTTATTTAAGGATTAGCTATCACAATTCTCTGCTACCATGCACTCAATCAACGCAACTTTTATCTTTTCGAGCCTTATTTAGTTTAAATTTAAGGGATAAATTGTTGGGTTTTATACCCTAAAACTCGTAGATAGTGAATGTAAACAAATTGTATACTTGTTTTCAATAAAGTGTTATTGAGTTTCTACAATAAAGTGTTAAATATTGCACAATTTGACCCAAATCCAATAAACTAAGATCCAAAGTTGTTTGTATGTAACTTGAACTTGTATGTGGGGGCATACGGGGATCGATGTTCAAGTAACAACCTAAAAGGTCTATAGTACAAGGATAAGGTTGGGTACCTTATCCTAGTAACACTATGAGATACGACCCACTTTGTATTTGATACAGACGTATTGATCTAAAGCGCCCATGTAGTAGACTTGCAAGCGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACTGGACCATGAAATTGTAAACCACTAGATATAACACCGTTAACTAGTTAGGTTACTGTTTCAATAGGATGACCTAGGTAACTCAGTCTTAATCCTGAGTGTGTCATGAACTCCTTCTCATGAGGGATTGTCCTTTGATTAGCATGGGTGAGAGTGACCAATACGCCGACTCAATATGCCTACCTTTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGAGGTGGGGACATGACAACAGAAGATCCAAGGTTGTTTAAATGAGTGTTCACTCATTCCCACTTCTAGGAGAAGTAGATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTGACTCTGGGACTTGAACTATTAGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGAAACAAATTAATCGATCTAAATAAAGCGTTATTTGAGTAATTCAGTAATTTGGTTATTGAACAATCGAGTTTGCATTAATAAACCATAAATCCAATAAACTAAGATCCAAGGTTGTTTAAATGAAACTTGGACTAGTATGCGGGGACATATGGAGATCGGTGTCCAAGTAACAACCTAAAAGGTCTATAGTATAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTACGTGATACGACCCACCTTGTATTCGATACATATGCAATGATCCAAAGCATCCATGTAGGAGACATGCGGGTGGGGGAATCCTATGCAGTGAGTTTGCATAAGACCGGACTGCGAAATAGTAACCACTAGATGTAACGCTGTTAACTAGTTTAGGTTTCTACTTCAATATGATGACCTAGGTACTCAATCTCAATCCTGAGTCTGTTATGAACCCCTTTCAGAAGGGACTGTCCTTAGATTTGTATGGGTGCGAGTGGCCAGTTCGCCGACTCAATAATCCTACCATTTCAAGGGCAAGACCGAATGGGGGCTGGGAACATAACAATATAAGATGGAATTCACTCCTTCCCCTATTGGGGTAAGTAGATGTGTGTTCCCTTAAGTGCTGATTTCGGGGCTTGAACAAAGGCGCGCTGTCCTCTCCTGGCCCGAGAGGAACTCATGTTTAGTGGTTGGACCCTAAACAACTTGTTTATTAGAGGGATCAGTGGTGCTGAAGGATCCAGAGGTAACCTAGGGGTAAAACGATAATTTGACCCAACTGGAGTTACAAACACACATGAAGGATTGACTTATTGCATTGGTCGATATCCGTGGAAACAAAATATTCTACAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGGTCTTTAGTGGAGTGACCCATAGTTTACGAATGTTGACTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCTAATTAGTCTCGTATCGTTGGAGCTTTTGATCTGTAGGCCCATTAGGTCCCATTGGTAGCTCGTAAAGAGACTTGAGGCAATCAAGTATAAATTGTAAATTGAAAGTGTTCCGTTTATTTAGGGGAATCATATAATGTATTGATTCATTATAATATAAAGTTTATGAAACTTTATAATATAATTTTTTTAATTAATTTCAAAAATTAATTATTGAGAGAAAACATTTGAAAGAGTTGAAATAAATTTTAGTATGAATTAGATTCATATTAATTTTAATTTTAATAAAATTCCTAAGATTAAATATATGATATTTAATTGGATAATTAATTAATTATGGAATTAATTAACTATTTATTAAAATTAGATATTGTTCAGATAATAGATTTGAACTTATTAATAGACATTTTCCTATTAGGAAAAGGTCTTGGCCTTTATCTATATATAGGACCCCTGGGGTGAGGTGAAAGGCATCCCATTCATTCTCCTACTCTAAGAGAATTCCCCTGAAGACTCCCTCTAGACTCCAACCAGTCTCCTGCCTCTAGAAGTCTCAGAGTCATACCGGTGTAGCCATGTGGTGGTGTTCGTAGTAGTTTGTGATTATTTCACAAGTAATTGGTGAATTTAATATGAGTCGTCAACGAGAGTAAGTAATTTGTTACTTTATAAATTAGATTTAAATCTAATATTTTTGTATGCTTAGCCTTAATATAAATTTAGAATAGTTCTAAGATTATTGCCAATGTATTGGTATTTTAGATTAAACAAAATTAATTACGAATCGGTCCCAATCACGCTTCTGCTTTACGAAATTACAAAATTCCAATCCTTCATGAACAAAGGGATCCCGCCCTTCCACCGGCCCGAGAGGGACTTTCTGTTTAATGGTTGGATCATAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCGTTGGTACTTAAGGAGACAGATGTAACGCAAGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGTGATTACGAACACTCGTGAAGGACTGACTTACCGGAATAGGTCTATAACCGTGGACAAAAAAATGTTCTACAGTGAAAAGAGTTCATTTGTGGGTCTTTAGTGGAATGACCCATAGTTAATGAATATTGGTTAACGTGATTAATGAGTTTAATCAATTAACCTCATATCATTGGAGTTTCTGATCTG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mRNA sequence

ATGAGGCTACCGGCCGTTGGAGATATGAAGAAGAAGAAGGAAAAGGATGAAGAAGAAGAAGACATGGGTGAGAGTGACCAATACGCCGACTCAATATGCCTACCTTTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGAGGTGGGGACATGACAACAGAAGATCCAAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTACGTGATACGACCCACCTTGTATTCGATACATATGCAATGATCCAAAGCATCCATGTAGGAGACATGCGGGTGGGGGAATCCTATGCAGTACTCAATCTCAATCCTGAGTCTGTTATGAACCCCTTTCAGAAGGGACTGTCCTTAGATTTGTATGGGTGCGAGTGGCCAGTTCGCCGACTCAATAATCCTACCATTTCAAGGGCAAGACCGAATGGGGGCTGGGAACATAACAATATAAGATGGAATTCACTCCTTCCCCTATTGGGATTAAACAAAATTAATTACGAATCGGTCCCAATCACGCTTCTGCTTTACGAAATTACAAAATTCCAATCCTTCATGAACAAAGGGATCCCGCCCTTCCACCGGCCCGAGAGGGACTTTCTGTTTAATGGTTGGATCATAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCGTTGGTACTTAAGGAGACAGATGTAACGCAAGGGACACAAACCTTTGACTCCTTGGCACTTGTATTCGGGCTCGTCATGGTCCATAATGGAGGTTCAGAGCCAAAACGCGACCTAAACGAGCAAAACCAGAGCAAAACGAGTCTTAGAGCCATTTTCCTGAGAGCTCAGCGTCGAGACCCTCCAAAAAAGCATCTCAATGCTATGTCTACAGCAAATCCAAGTCAAAAACTCGGGAGGACAACTTCTCAACGCCACATCTTGACGCTACGACAAATTCAGACCAGCATCTCGATGTTGTGCATAGTGTCTCGACGCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGGCTACCGGCCGTTGGAGATATGAAGAAGAAGAAGGAAAAGGATGAAGAAGAAGAAGACATGGGTGAGAGTGACCAATACGCCGACTCAATATGCCTACCTTTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGAGGTGGGGACATGACAACAGAAGATCCAAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTACGTGATACGACCCACCTTGTATTCGATACATATGCAATGATCCAAAGCATCCATGTAGGAGACATGCGGGTGGGGGAATCCTATGCAGTACTCAATCTCAATCCTGAGTCTGTTATGAACCCCTTTCAGAAGGGACTGTCCTTAGATTTGTATGGGTGCGAGTGGCCAGTTCGCCGACTCAATAATCCTACCATTTCAAGGGCAAGACCGAATGGGGGCTGGGAACATAACAATATAAGATGGAATTCACTCCTTCCCCTATTGGGATTAAACAAAATTAATTACGAATCGGTCCCAATCACGCTTCTGCTTTACGAAATTACAAAATTCCAATCCTTCATGAACAAAGGGATCCCGCCCTTCCACCGGCCCGAGAGGGACTTTCTGTTTAATGGTTGGATCATAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCGTTGGTACTTAAGGAGACAGATGTAACGCAAGGGACACAAACCTTTGACTCCTTGGCACTTGTATTCGGGCTCGTCATGGTCCATAATGGAGGTTCAGAGCCAAAACGCGACCTAAACGAGCAAAACCAGAGCAAAACGAGTCTTAGAGCCATTTTCCTGAGAGCTCAGCGTCGAGACCCTCCAAAAAAGCATCTCAATGCTATGTCTACAGCAAATCCAAGTCAAAAACTCGGGAGGACAACTTCTCAACGCCACATCTTGACGCTACGACAAATTCAGACCAGCATCTCGATGTTGTGCATAGTGTCTCGACGCTAG

Protein sequence

MRLPAVGDMKKKKEKDEEEEDMGESDQYADSICLPFWGQDRVGGGDMTTEDPRDKAGYLILVTLRDTTHLVFDTYAMIQSIHVGDMRVGESYAVLNLNPESVMNPFQKGLSLDLYGCEWPVRRLNNPTISRARPNGGWEHNNIRWNSLLPLLGLNKINYESVPITLLLYEITKFQSFMNKGIPPFHRPERDFLFNGWIINRLFIRGALVLKETDVTQGTQTFDSLALVFGLVMVHNGGSEPKRDLNEQNQSKTSLRAIFLRAQRRDPPKKHLNAMSTANPSQKLGRTTSQRHILTLRQIQTSISMLCIVSRR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..18
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..26

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0007875.1Lag0007875.1mRNA