Lag0005832 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview


Name	Lag0005832
Type	gene
Organism	Luffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
Description	Unknown protein
Location	chr6: 31503185 .. 31507884 (-)
RNA-Seq Expression	Lag0005832
Synteny	Lag0005832

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGCCCTACCCTTTCTATGGCACGAGAGGGACTTCTATTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGATGAAGAGGTAGCCCAGAGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGGGTACGAACACACATGAAGGGCTGACTTGCTATTGATGGTCGATATCCATGGACACAAAAATATATCTACAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGTTCTATAGTGGAGTGAACCACAGTTAACGAACATTGATTAACTTGGTTAATGAGTTTAGTCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTCTATAAGGGTGTTGAGGTAAATTTCTAAGGGAGAATTGAATATTCGAAGGAGTTCGAATATTAAGTTAAAATATGAATTTGATTCATATTAAAAACTATAGGTTATAATGCACGTATGGTGTATATTAATTCTATAGTTTATTTGAGAGAAATATAATTAAATATATGATATTTAATTGTAATATTAACTAGTTGGTGAATTAATTAATATTTATGTTTTAATTAAATTTTGATTTAATTAAGTTATATTAAAACTATAGGTTAAGTGGAATATTTGTATAAATTTGTTTTATACAAATAAAATTAAATTAAATTATAAGTTGATTGAATTAAAATATTAATTAATATTTATTCTTAGATATTAATTAATTACTATTTTTCCCATTAGTTAGGTTAACTGATGGGAACGTGTCTAACTTTTCCTGTGGGTTGCGTGTATGATGAAGTGATTATTAAGGGCAATTGGCCTTTTTATCTGTAACTTAATCGCTTCAGTTGATCGATTATCCAGTAGCTCTCTCTCACGCAATCTCTCTTGCTCTCTCTGATAGTGCTTTGTGTTTTCTCTCTAGCAATACGGAGACTAAAATTATCTCAAAACCTTAGAAGTTTTGGTTCCCACAAACCGCTCAACTCCAATCCCTAGGAGAATACTGGTGTTTCTTCATGGTTGTGTTTGTGGGTAGAATTTCCAGCAAGGAAAAGAGAGTTTTGTTGCTGTTTTTTCTGCAATCCACAGGAGAAAAGGCGATTCAAGTCAATAATTTCCATAACGGTATAGTATTCTTGATCTTGGATCATTAGGATCCGCCACACTAGATTATATCTAGAAGTTTTTCCTATATTTTGCAACATGTTTTATATGGTTTGCAGTAGTTTTTAAATATGATTTTACTGCTGTAATTTATTTTCCCAACGTATTGGTATTTTAATCCAAATTAAAAACTGAGTTAAGGTTCTGATCGTTTCCGCAGCGCAAGGGCTTTTATCCCTTCAAGAAGTAATCTAGGCCTAATTATTTCTAATTTCCTAATCAATCCACTAGACTTAAGACAATTGGGTGATTGTTTGATTTGATAGTCTAATTGAATTAATTAACTAACCAATTAGTGTCTTTCGATGGACGTTGTATGATCGCGTTAGATGGCTTAGGTGGGCTTTGAGTCTTTTCTAGGTTCATATTAGACCAATTGGTAAATTGAGCAATTCAAACTAGCCTTTAATAGGTAGAGATTCAATGATCAGAGTAAATCATTAAACCCCAATAATCACTCCAATTGGTGTCGCCTAATTCAATTAATGACCTCGTCTTTTTATGATTTCTTGCAATTTAATATCTTGCTTGTTTGAATTCTTATATTTTAAATTCCTTGCACGTCCATTTATCCAATATTCCAATCCCCCCATTTACTGCTTTCACAACTCAAAATAAATAGGAATTAAATAAGCAACTGCCACTCCCTGTGATTAACCCCGGCCACTACTACTGCAAGTAGTTTAGTGTTCGTGGAACTATAAATTTTATTTGGCAAACTGGGAGCCTCGATAACTCTCGTCCCGTCAAATTGGCGTCATTGTCGGAGAGTGAAATCGGTTAATTATTTTATTTTTATCTTGAGTTTTTAATTTTTAGTTTGACTTTTATTTTATGGCTAAGAGAATAAGTGTAGACAGCGAGGTAATCAAGTTAAAATCTGAATTGTCTGAGCTTAAGGCTCTCATTAATCAGTTGGCTGCAGAGCTCGAATACATATCAAGGATTTCCAGCAATGCAAAGCCAACAAATGCCAAACTACTATTTCCAGAACAATTGAAGCCTAAATATGCAGCATGGATCTTGTTCAGGTTAGGGGTGTACAAAAAACCCGACATCCCAAACAACTCGGACTACCCAACCCAAACCGTAAGGGTTGGGTTGGGTTGGAATTTTTTCGGTTTGGGTTGGGTTGAATTTTTAAAAAACCAAAAATTCGGTTCGGTTCACGGGGTTTGAGGAAATTTTGCTCGGTTCAACACGAACCGAACCAAACCGAAAGATATATATTATATATGCCGCCGTATTTTACAATTAATTGGTATGCCATAATGGTTGTAGTTCTCCTTTTAGTGCAGTCTGTCTCAAGTTCGAGCTTTATTAATGCCAAATTGCTGTTTTTTTTATGTATATTATTTGTTATGTTTTTAAAACTTCTTTTTTTATTTAATATAAATAATTTATACTTTTATGTCTTGAAATTTACATTATAGTATTGTGGATAAGCATAAATACTTTTTTAAAAAAGAAGAATTTTAAATAATTAAAAAAAAGACAACCCGGCAACCCAACCCAACCCAACCCAAAAATAGAAGGGTTGGGTTGGGTTGGGTTGCCATATTCATTCAGTTCATTCGGGTCGACAATCCGACCATTTTCGGGTTGGTCCAAAAAATTCCCTCAACCCAACCCAACCCAACCCGTGTACACCCCTAGTTTAGGTATTTTAGAATTTTTGGTTAAAAATTTATCTGATGGCATTCGAGTTTTGCAAGAAGGCCAACTCAAATTCCAAGAGAGACCATAGCTGAGATGCAACAATTGAGAGTCCAAGTTTTTCAATTGGCTGACACCGTCAGAAAATTGGTGGCCAAAATTGACAAACTTCCTGTTCAACCTCAGATCCCTAGAAGAGAAGAAATATGATCGACCACGATGAGGAGTGGGACAATCCTGAGTCCTAGTCCACAATTTCCTTCTCCGCCTGTATTTGAAAAGAATAGAGAGGCGAGGAAGCCTGAAGAGAAGACAAGCAATCTCAACTTTTCAAAGAAGCGAGGGGTACGTTTTGATCCTCCTACTAATTTTAATTCTTATGTTCCTAAAGCTCCTTTATCTAGCAGGTTAGTGCAACAGCCTGAACCTCCCAAAGAAAAGGAAGAAAAGGACACACTTGACCCATTCACGAAGGTGGAGGTCAGCAACGAGCTTTTGGACACCGTAAGGAAAATTCATATGGTAGGAAAATTTCTAAAGAAATGGTGCTCCAGGAAAGGTAAGCCTGAGGTATGTCAACATATTTCTGCTATTTTGAAGAAATTACCTAATGAGTGTTTAGATCATGGTATCTTTACTTTGCCATGCATTTAGGGGTTTAGAAATTGAGCATGCCATGTTAGATTTAGGAATCCTCTATAAATGTCATGTCCCATGCACTCGCTAATAAGCTGAATTTTTCCCATGTTAAGAAAACAAGTAATTTAATCCAGTTAAGGTAGATGAGCTTATATTTCCTGCAAACTTCTTTATAATTCACATGCATGAAAATGGTTCACCTAATACCACTTCAGTTATTTTGGGTCGTCCATTCATGAAAACGACCAAGGTTAAAATTAATTTAGGCAAGGGAATCATCTCTGTTGAATTTAATGGAAAAAGAAGTTGTTTTATGTCTGACATTTTAGGTCACCTTAACCCTTCTCTGACCTGTTCAAATATTTCCCATACGATACAGGTAAACAGGTAAAAGGCCTCTAGATCCAGGAGAATTAATGTTCTGGAGCGGGAAAATTTAGATCCCGGATGAGTTCATGAAGGACTCCATCGATTTCAAGACGTTACACAAGACGCTTTTTGGGAGGCAACCCAAAATTTTAAGTTTTCTTTTCCTTTTCCTTATATATTTTTCTTAGTGTATTCCTTCTTTCTTCATTTTTTTAGAGTTGTAAATTTATTGAAAGAAAGAAAGAATATCTAAATTTTAAAAAAAAATGAAATTGGGGGTCAAACCCGAGAGCTGGCGTCGAGACGCCATGCTCTCGGCGTCGAGACACCGAGACAAAATCTGGGGTAAAAACCCCAGTTTTCGATCAGTTTGGTAAAAGACCCATTCAAGCCCTAAAATTTACTCTCTACTCTTTTCACTTTTCACTCAAACACCCACATATACCAACCAAATTTCTTCATCTTTTGACAAATCTTACACGATTTCAAGCTTCATTTACCAAAATTCCAGATTTCTATCATTGATTTCGTGAGTTTTGTTGCTTTTGAGCGATTTCTTGAAGATTTGGGCGATTTTTTATTGTTCAAGCGTGGGTAATGCGATTTTCTCTTCTTTGTCTTTTCTTTACTTGATTTTTCAATGTTTAGATGCATTTGGTTAAGATTAGAAGTTGAATAAGCTTGATTTGAGCATGATTGTTACATTCTCTGGCTGAAAATCGTTGAGAAGAACTTGTTGTGGCTGATTTTTCCTATTCCTTGTGTAAATTTTATGTTATTTTTGTTGGGATTTTTCTGTTTGGCAGGTTATATTTTGTTCATAAGGAGGAAGGGCTTTTAAGTGTTGGAGTTTTTGGATCCATTGATCTTGAATCCCTAGTTTTCTTAGCTTCCAACCAGTTTTAG

mRNA sequence

ATGGGCCCTACCCTTTCTATGGCACGAGAGGGACTTCTATTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGATGAAGAGGTAGCCCAGAGAATTTCCAGCAAGGAAAAGAGAGTTTTGTTGCTGTTTTTTCTGCAATCCACAGGAGAAAAGGCGATTCAAGTCAATAATTTCCATAACGACAGCGAGGTAATCAAGTTAAAATCTGAATTGTCTGAGCTTAAGGCTCTCATTAATCAGTTGGCTGCAGAGCTCGAATACATATCAAGGATTTCCAGCAATGCAAAGCCAACAAATGCCAAACTACTATTTCCAGAACAATTGAAGCCTAAATATGCAGCATGGATCTTGTTCAGGTTAGTGCAACAGCCTGAACCTCCCAAAGAAAAGGAAGAAAAGGACACACTTGACCCATTCACGAAGGTGGAGGTCAGCAACGAGCTTTTGGACACCGTAAGGAAAATTCATATGGTAGGAAAATTTCTAAAGAAATGGTGCTCCAGGAAAGGTAAGCCTGAGATTTCTATCATTGATTTCGTGAGTTTTGTTGCTTTTGAGCGATTTCTTGAAGATTTGGGCGATTTTTTATTGTTCAAGCGTGGGTTATATTTTGTTCATAAGGAGGAAGGGCTTTTAAGTGTTGGAGTTTTTGGATCCATTGATCTTGAATCCCTAGTTTTCTTAGCTTCCAACCAGTTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGCCCTACCCTTTCTATGGCACGAGAGGGACTTCTATTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGATGAAGAGGTAGCCCAGAGAATTTCCAGCAAGGAAAAGAGAGTTTTGTTGCTGTTTTTTCTGCAATCCACAGGAGAAAAGGCGATTCAAGTCAATAATTTCCATAACGACAGCGAGGTAATCAAGTTAAAATCTGAATTGTCTGAGCTTAAGGCTCTCATTAATCAGTTGGCTGCAGAGCTCGAATACATATCAAGGATTTCCAGCAATGCAAAGCCAACAAATGCCAAACTACTATTTCCAGAACAATTGAAGCCTAAATATGCAGCATGGATCTTGTTCAGGTTAGTGCAACAGCCTGAACCTCCCAAAGAAAAGGAAGAAAAGGACACACTTGACCCATTCACGAAGGTGGAGGTCAGCAACGAGCTTTTGGACACCGTAAGGAAAATTCATATGGTAGGAAAATTTCTAAAGAAATGGTGCTCCAGGAAAGGTAAGCCTGAGATTTCTATCATTGATTTCGTGAGTTTTGTTGCTTTTGAGCGATTTCTTGAAGATTTGGGCGATTTTTTATTGTTCAAGCGTGGGTTATATTTTGTTCATAAGGAGGAAGGGCTTTTAAGTGTTGGAGTTTTTGGATCCATTGATCTTGAATCCCTAGTTTTCTTAGCTTCCAACCAGTTTTAG

Protein sequence

MGPTLSMAREGLLFVGWTSNRLFIRGALVLKDEEVAQRISSKEKRVLLLFFLQSTGEKAIQVNNFHNDSEVIKLKSELSELKALINQLAAELEYISRISSNAKPTNAKLLFPEQLKPKYAAWILFRLVQQPEPPKEKEEKDTLDPFTKVEVSNELLDTVRKIHMVGKFLKKWCSRKGKPEISIIDFVSFVAFERFLEDLGDFLLFKRGLYFVHKEEGLLSVGVFGSIDLESLVFLASNQF

Homology

[Close]

BLAST of Lag0005832 vs. NCBI nr
Match: XP_024042859.1 (uncharacterized protein LOC112099672 [Citrus clementina])

HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 9.9e-04
Identity = 44/122 (36.07%), Postives = 66/122 (54.10%), Query Frame = 0


Query: 61  QVNNFHNDSEVI-KLKSELSE-LKALINQLAAELE--YISRISSNAKPTNAKLLFPEQLK 120
           +VN   NDS VI +   +L E  K +   +  ELE   +   S +A+PT AK L P  + 
Sbjct: 24  EVNPKQNDSAVILRSGKDLQESSKKVTKHVEDELEKNELMPKSQDAQPTKAKPL-PMVIP 83

Query: 121 PKYAAWILFRLVQQPEPPKEKEEKDTLDPFTKVEVSNELLDTVRKIHMVGKFLKKWCSRK 179
           P + +W         +  KE++EKD L+ F KV+V+  LLD +++I    KFLK+ C+ K
Sbjct: 84  PYFPSWF-------AKSKKEEQEKDILETFRKVDVNIPLLDAIKQIPRYAKFLKELCTSK 137

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lag0005832 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_024042859.1	9.9e-04	36.07	uncharacterized protein LOC112099672 [Citrus clementina]	[more]

BLAST of Lag0005832 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lag0005832 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lag0005832 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 71..91

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lag0005832.1	Lag0005832.1	mRNA