Lag0005080 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGCAACTGCTTGCAAACTACCCTTGTGTGGAATTCATCATCTCTCTTCCATTCTAATGGAAGCTCAAGCTGGAAAATCAATGGATTTGGTAAAGCTTCCTCAATCTTTGAAGTCCAGCTCATTTCGTCTTCGATGGGGCGGTTCTTCGAAGCTAGAGTTGAAATCCAGATCGAGCATCCGAGTATTAGCTTCCAGCTCGAACTCTGTGTATGAATCTTCTGCGTCGTCGAAAATTGAGAAAGATGACGATGGAGGTCTTGTTTGTCCTCCTGGCTATCGGCCCACGCCTGCTAATCGCGAGCTGCGGACTCCTCACAGCGGGTAATATATTGTCTAAACTCTGCATTCAAGAAGGTTCACATCTAGCATAGATGCCTTAGTTCCCAATTTTTTACCAATGCTCACTTGGGCTTTCACAAACGGGCTAAATGTATCTGTGAACCCCCCCCTGTTTTGTATCTATGTACACTGTTATCCTAGTTCATCTTCAATTTAAACACTCAATTATCACCAAAAACAATCAGGTTCCATCTCATGAACAGTTTGTTTATCCTTTGTTTTGGCTGTAAAGAAATATCTTTTTAAGTTTGAAAGATTCCACTATTGACTCTGGTAGTTATGGGGTGTCCTTTAGTAGGTCAACATTTTCAGGTGGTTGAGTAGGAGACTCATAGGTGAGGTAGTGGATTATTTTTCAGAAAATTGCCTAATTGCGACAACTTACCAAAACTTGTTACTTGACCAGGCAAAAGTTTGTCCAAGAGAGTGAGTGTAGAGCAAGAAAAATCAGAAATCAGAAATCAGATTTATATTGGCAGACATGCTAGATTGACTATTTTGAAGAGGACTAGATAGAATTTGAGCATCGTTCTACTTTAGCACCACCTTCATGGACTTGAATTCCGTCACAGGACAATTAATAGGGTAAATTTTTGTAAACACGTTACTGTCATGGGTTAGTCTTGATACATAAAACATTTTTAAGTTGAGGGATATAACCAAGGATATGGTAGGATATGGTAGTGAGAAACTCTAGAGAATATGACATTAATGGTCTGTCATGTCACTCTTCGTATCCAGGGTTAAAGGTGATCTTAACACTTGTTTCAGGCTTCAGCTCGTGATATGGTAGTGAGAAACTCTAGAGAATATGGTTTTGTCCAAAAGGATGTATTGTTCAAGTTTATTTCCTCGGACGACAGACTTGCTATTGTTTTCTGCAGAAGGGAGTTAGCTCCTTCCAATTCTACTTGAGGCCCCATTGTAGTGTGTTACTGTAGGGGGAGAATGATAGTTGTCTTTACTATTTCTTGAATTGTAGGTTGAGCAGGTGATGATGTAGATGGTTCAGAGGACCCCAAGCCTGTTTAGGCTGTTTTTTGTTTGGCATGGCCTCAACTTCTTAATTGGTTTTGATACCAGCTTGGTTTTTAGCACAAAACAGTAAAATCACAAATGTTGTAATCTTGGAAAACTAAGCACACAGACAACAGCTGAGAGGAAACTCATGTATTTAAGGAGGGAATAAACCATATTAGCTTCCAATCAAATGAGTGAACGAACCAGAAAACTAAACCAAGAATGTTCAACCAATAACCAATAACCAACGCACAACAAGTACATAAAGTACTTTTGGCTAAATGGATTTGGAGGTTCTTGCATAAACAAGATGCCCTTTGGCGAAAGACTATTGTGGCCAAATACTATAATAGAAATAATTTCTGTTGGTGGCCTAAATCCATTTTGAGGTGATCGTCTAGGTCACTTTGGAGATTTATTTGTTGCACCAATGACATTGTTGGTAATCATATATAGAGAAAGCTTGGCAATGGGTTGTACACTTTTTTCTGGCATGATTCTTGGCTTGCTGGTGGTTATCTTATTTCAACTTATCCAAGGCTCTATTGATTATCTAGCTGACCAATGGATGCAGTTGCACAAGCCTGGAACTCAATTCATGAATTTTGGGGTTTGAGTCTTTGACAGAATCTAAACGACTAGGAGTTATGGAATGGACTAGTCTTTTGCACCTCCTTTTCATTGGTTACTTTGAGGAATGTTAACGATTCATGTTATTGACCACTTGACCCCTCTCACTCCTTTACCATTCATTCTTTGATGGAAGGTTTAGTCCAATCAAAACATCCAACTAAAAACAATCTATATGCGGTGATTTGGAATGATAACTTTTTTTTTAGAAGAGAAACGAATTTCATTGATGAATGAAATGTGGAGAAAAACTCCAATCACCAATAGGTGAATTACATGAAAGCTTTCCAATTGGAAATAAAAAAAGATAAACTATAATCAGAGAAAGGATGTTGACATGTACACCATTATAAAGCATGAAAGAGAATTAGATCCATGAATTTATCAGAGGAAGAGAAAGAATCCCTGAAAATTTGTGAATTTCATTTGCCCCATAAAAACCAAAAGAAGACCATGTTCAGAGAAAGCCACAAGATCTTCTTTTCTCCATGAAAGGGATGACCCACAAAAATGAGAGTAAGAACATCGTTAATGCAATTTGGAAAAACGGTGGACCATCCAAAAGCATCAAGAATCTTTGACTAATATCTGGATGCGAAGGAACAAAACAAATAGGTGTCCAAAATGTTCTGAACTAGCGGCACCATTATGCACCATGATGGGACAAATGAAAATGAGGCATCCGTCGTTGAAGTTGATCACTGTATTAATAGCACCATGACTAAGCTCCCATAGAAAAATATTGATCTTCTTTGGATAGAATCGGTCCAAATTACCTTATAGAGGTCATTCTCCATAACCGGATAGTCTACAAGATCCTTCATAAGAGATTTAATAGAAAAAATATTGGACGATTCCAACGACCATAACCAGGAATCATTACGGTTCTGTAAGCTGATGGAGGAAAGAATAAGAGATAATTCCACCCATTTTCCGTCTCTAAATCATTTAAATTATGCCGTAGACTCAGGTCCCATGCTGTTTGAGAAGCAATCCATGTCTCACCAACCAAACTCCTCGGACGATCAGTTAAACGATAAAGACGAGGAAAATTTGCAGCCAGAATACCACAACTTAACCAGAATCATGCCAGAAAGATGTAGCACCCAAACTTCTTTTAACACGAGAATATACCAGGTCAATAGTAGAAGAAATAATCGCCACAGAGATTTGTGTGAACTTCTCTGAATAATGCTAGGCCAAAGACTACTCAAATTAGAGTTATAATACTTAGCTACAATCAGTTTATGCCATAGAATGTTTTCCTCGTGTAAAAATCTCCATATCCCTTTTGCTAGAAGAGCTAGATTGCGATTCTGGAAATTACCAATACCAATACCCCCAACAAATGTGGAAGTTGTGTTGTTGCCCAATTAATATTGTGCATACCACCCTTACCTCTAGATCCTTCCCAAAAGAAATCACGAAGTAGCTTATCAAAGATCTTGCAACCTTTCTTGGCAATTTGAATAAGGATAAATAATATATTGACATACTAGACAAAACTGCTTGAGAAAGTGTATGCGACCACCTTTTGAAATATATGAATATTTCCAACTATGAAGCTTATGTTGGATTCTTTCAATCACTAGCTGCCAAAAAGTATAGTTTTTGCATTGCCTCCCAAAGGTAACCAAGGTAAGTGGAGGCCAAATCCTTGTTTATAGCCAAACGTTGTTGTCAACCATTCCAATTCCAATCCTCCAAATGAATTCCCAGAACCTCACTCTTGGAATAATTAATATTCAATCTAGAAGCTAGTTAAAAATTTTAATATCTTTTCAAAAAAAATAAATTTAATAATATCGAACATGTTAACCAAAGCATCCTTATGAAAGAGGGAGAATAATAATGTATCATTAGCGAATTGTAAATGATTCACATGAAGTTGTGAATTTCCAATCGGATGAGAAATAATTCGACCCATATTAGCACTATGAGATGATAAGCGACTTAAGCAATCAGACACCAAGATGAAAAGGAAAGGTGAAAGGGGATCCCCTTGACAAATGCCTCGAGAGGGAATAATCTTGCCTCGTGGTCTACCATTGATAATAATAGAGTAGTTAACACTAGAAAGGCAACCATAAATCCATTTCTCCATACCGTACCAAAACCCTTGGCCTGAAGAATTGCATCCAGAAAATCCCAATCGACTTTATCAAAAGCCTTTTCAAGATCTAATTTAATCGCCACACCTTTCTTACGAGATAATTTCCAATCATCAATAAGCTCATTTGCTATAAGAGAATCATCTAGAATTTGTCTGTTAGCCACAAAGGCCATTTGATTTTCCGCAATAGTGGATGGCAATACCATTTTCAATCGGTTGGACAAAACTCGAGCTATAATCTTGTATGCACAAGGAATTAAACTAATAGGGCGAAAGTCTGAGACTGATTTAGAGTCTAATTTCTTTGGATAAGGCAAATATAAGTTTCATTTAGTGAGACATTGATAATACATGTATTATAGAAACCTCCACCATAGTCATGAGATCGCGTTTGATGGTATTCCATGAGAATTTGAAGAATTCAGCTGTAAAGCCATCTGGACCTGGAGATTTACTCGAGCCTAGCAATTTTACCGCTTGGTAAACCTCATCTTCTAAAAAACCGCCTCCAAACCCATCGATTGCGATTCATTAATTGGACACCAATCAACATTAGTTGGTAAAATCTAGTGCCACGATCCTTGGTAAACAATGTTTGATAAAAACCAAGGAACACCGCTTCTATATCATTATTTGTAAAGAGGCTATTTCCTTCTCTAGACAAAATTTCTGAAATGAAATTCTTTCTTTTATGTGCAGCCATGATTCTATGGAAAAATTTTGTATTTTCATCCCCTTCTTTTAACCAGTTCAACTTACAACGTTGGTGCCAATAAATGTGATCTTGAGCTGATAAATCCTCAATTTGTTCTCGCAATAATCTTCTAGAAGATATTTGTTCCATGGATAAAGGGACTCTGTCTTCTGCATCATCCAACAATTTCAAC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ATGGAAGCAACTGCTTGCAAACTACCCTTGTGTGGAATTCATCATCTCTCTTCCATTCTAATGGAAGCTCAAGCTGGAAAATCAATGGATTTGGTAAAGCTTCCTCAATCTTTGAAGTCCAGCTCATTTCGTCTTCGATGGGGCGGTTCTTCGAAGCTAGAGTTGAAATCCAGATCGAGCATCCGAGTATTAGCTTCCAGCTCGAACTCTGTGTATGAATCTTCTGCGTCGTCGAAAATTGAGAAAGATGACGATGGAGGTCTTGTTTGTCCTCCTGGCTATCGGCCCACGCCTGCTAATCGCGAGCTGCGGACTCCTCACAGCGGGTATCACTTTGATGGGAGTACTCGGAAATTCTTTGAAGGTTGGTACTTCAAGGTATCAATTCCACAGAAGAGGCAGAGTTTCTGCTTCATGTACTCCATTGAGAGCCCTGCATTTCCAAAGAAATTAACAACACCTGAAATCGCACAACATGGACCTAGATTTACAGGTGTTGGAGCACAGATTCTTGGTGCTTATGACAAATACATATGCCAATACTCTGAAGAGTCTCAAAACTTTTGGGGAAGTAGGCATGAACTGAGTCTGGGCAACAGTTTTGCAACTAAAGGAGGGTTTAAGCCTCCAAACAAGGAAGTTCATCCGGAGGAGTTCAATAGAAAGGTAGTGGAAGGTTTTCAAGTCACTCCACTTTGGCATCAAGGATTTATTCGTGATGATGGCAGGACAAACTATTTGGAAACTGTAAAAACTGCTCGGTGGGAATACAGTACCCGCCCAGTTTATGGATGGGGAAATGTTGGATCTAAGCAGAAGTCAACAGCGGGCTGGCTTGCAGCCTTTCCAGTATTTGAACCTCATTGGCAAATATGCATGGCAGGCGGGTTATCAACAGGTTGGATTGAGTGGGAGGATGAAAGGTTCGAGTTTGTAGATGCCCCTTCATACTCTGAAAAGAATTGGGGCGGAGGATTTCCCAGAAAATGGTTTTGGGTTCAGTGCAATGTTTTTGAAGGTGCTCGTGGAGAAGTTGCTCTTACTGTTGGTGGAGGGTTGAGACAACTTCCTGGATTGACGGAAACCTTTGAAAATGCTGCATTGGTTGGAGTCCATCATGATGGAATTTTTTATGAATTTGTGCCATGGAATGGAACTGTTAACTGGGAAATAAGTCCTTGGGGCTATTGGTATGTTGCTGCTGAAAATGAAACGCACAAGGTTGAAGTAGAAGCCAAAACAGACGAGCCTGGTTCACCCTTACGTGCTCCCACGTCAGAACGTGGCCTTGACACAGCTTGCAAAGATACTTGTTTTGGTATCTTGAAACTGATAATATGGGAACGAAGATTTGATGGCAGCAAGGGCAAGATTGTATTGGATGTCACAAGTAACATGGCAGCATTGGAAGTTGGAGGAGGACCTTGGTTTAACACATGGAAGGGAGAGACTACGACGCCAGAGATCCTCAAGCGTGCCCTTACAACACCTATTGATGTGGATCAAGCTTTTAACTTGCTTCCACTATTCAAACCTCCTGGCTTGTAG MEATACKLPLCGIHHLSSILMEAQAGKSMDLVKLPQSLKSSSFRLRWGGSSKLELKSRSSIRVLASSSNSVYESSASSKIEKDDDGGLVCPPGYRPTPANRELRTPHSGYHFDGSTRKFFEGWYFKVSIPQKRQSFCFMYSIESPAFPKKLTTPEIAQHGPRFTGVGAQILGAYDKYICQYSEESQNFWGSRHELSLGNSFATKGGFKPPNKEVHPEEFNRKVVEGFQVTPLWHQGFIRDDGRTNYLETVKTARWEYSTRPVYGWGNVGSKQKSTAGWLAAFPVFEPHWQICMAGGLSTGWIEWEDERFEFVDAPSYSEKNWGGGFPRKWFWVQCNVFEGARGEVALTVGGGLRQLPGLTETFENAALVGVHHDGIFYEFVPWNGTVNWEISPWGYWYVAAENETHKVEVEAKTDEPGSPLRAPTSERGLDTACKDTCFGILKLIIWERRFDGSKGKIVLDVTSNMAALEVGGGPWFNTWKGETTTPEILKRALTTPIDVDQAFNLLPLFKPPGL Homology
BLAST of Lag0005080 vs. NCBI nr
Match: XP_023538605.1 (tocopherol cyclase, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1036.6 bits (2679), Expect = 7.4e-299 Identity = 480/515 (93.20%), Postives = 499/515 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. NCBI nr
Match: KAG6585392.1 (Tocopherol cyclase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7020309.1 Tocopherol cyclase, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1034.6 bits (2674), Expect = 2.8e-298 Identity = 479/515 (93.01%), Postives = 497/515 (96.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. NCBI nr
Match: XP_022951773.1 (tocopherol cyclase, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1034.2 bits (2673), Expect = 3.7e-298 Identity = 479/515 (93.01%), Postives = 497/515 (96.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. NCBI nr
Match: XP_023002310.1 (tocopherol cyclase, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1024.6 bits (2648), Expect = 2.9e-295 Identity = 475/515 (92.23%), Postives = 493/515 (95.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. NCBI nr
Match: XP_008445022.1 (PREDICTED: tocopherol cyclase, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1023.5 bits (2645), Expect = 6.5e-295 Identity = 484/517 (93.62%), Postives = 497/517 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94FY7 (Tocopherol cyclase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VTE1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 727.2 bits (1876), Expect = 1.3e-208 Identity = 325/447 (72.71%), Postives = 375/447 (83.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6K7V6 (Probable tocopherol cyclase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=VTE1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 660.6 bits (1703), Expect = 1.4e-188 Identity = 292/427 (68.38%), Postives = 347/427 (81.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94FY8 (Tocopherol cyclase, chloroplastic OS=Zea mays OX=4577 GN=SXD1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 648.7 bits (1672), Expect = 5.7e-185 Identity = 288/445 (64.72%), Postives = 351/445 (78.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GIN5 (tocopherol cyclase, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1034.2 bits (2673), Expect = 1.8e-298 Identity = 479/515 (93.01%), Postives = 497/515 (96.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KNK8 (tocopherol cyclase, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496186 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1024.6 bits (2648), Expect = 1.4e-295 Identity = 475/515 (92.23%), Postives = 493/515 (95.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BBQ0 (tocopherol cyclase, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488188 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1023.5 bits (2645), Expect = 3.1e-295 Identity = 484/517 (93.62%), Postives = 497/517 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LLK5 (Tocopherol cyclase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G374670 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1014.6 bits (2622), Expect = 1.5e-292 Identity = 481/517 (93.04%), Postives = 495/517 (95.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VA31 (Tocopherol cyclase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold82G003600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1010.0 bits (2610), Expect = 3.6e-291 Identity = 482/526 (91.63%), Postives = 495/526 (94.11%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0005080 vs. TAIR 10
Match: AT4G32770.1 (tocopherol cyclase, chloroplast / vitamin E deficient 1 (VTE1) / sucrose export defective 1 (SXD1) ) HSP 1 Score: 727.2 bits (1876), Expect = 8.9e-210 Identity = 325/447 (72.71%), Postives = 375/447 (83.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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