Lag0004715 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0004715
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6: 6323959 .. 6328922 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0004715
SyntenyLag0004715
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGCGAAGATGGGTTTACATACCTATTCCTGCCCTAGGGTTTTTAGACGTTCAAAGGCGATTTGGGCTGAACCAAGTGGAACAGGGACGACCAAAGGCACCAGGGACCGAGCGAAGGGGGTGGACCCGACCCACCAAAGCGAGCCAAGGCATACCAGGCCAAGGTATTAGGCTTTGGCCCAATTCCTTTTGGCATACCTCTCCTCTGGGGTCTACTTCCTCGTCGTGTCCTTGGATTGGTGTTGCATTGTCCTCGTCGGCTCCTTACATCTTAGAGTGGTTCAGAATTACCTATTACAATTATAATTTAAACACTTTTTAAATATTGTTTTTTCTTAATATATTTTCAATGAAAATGGTTTTAATTGGAATCTTTTACCCTTGTTTGGTTAATTTTTTTTAAGTGGTTTAAATAATAAGTTTGTTTAGTTGTATTAGTTATAGAAGTTATTGTTTGAATAGAAAATTATTATCAAGTGACTTTTTTTTAATCACTTCTTGAGTGATCAATTTTAAAGTGATGTTAAGAAAATTAAAAAAAAAATAATTTTTTATTTGTTATCCAGTAGATTTGATAATGACTATCTTATTATCTTGTTTTATAGTATTGTTAAATTAATGGTAGTCGTGTTTTAGAATGTTGCAACTGGTGATAAGATATTATACACGCTGATTGTCATTTAAAAAAAATAATCTTCATTTGAAGTTGTCAATATTTAAACGCTTAATAGCCAGACTAAAGTATTATATTGGAATATAAAAAGGTCAATTTCATAAAAACTATTGCACTTAGACTAATTTTAAGGTACAATTGCTTGGTGTTATAACATTTGATTGTCCAACAACTTCGAATTAACATCTCAAATGGTTAAACTTAATGAAATTTAAATTTGAGTAGTCCACCAAAATTCTTATACTTATTCTATATGGTCCGTCCAATGATCATTAAGTCAACTAATTATGATTTGTTTATTATTACAACTCTCATTCAAATTCTTTTAGTTCAAATAACATGTGGAAATGAGAGGATTCGAACATTTGACCTCTTAATCGAATATATATGTATTTAACTAATTGATAATTTTTCCGATTTAAAAAACTCCAATTCAATTTTGAGAGGCTAGTCAACCCAATTTACAATGTGTTTATCCTTTTTTTAACAAGTGTGACGTATTTTTTTTATTTTATTTTTTTGGTTTATGACATAATTATAAAAAGAAAAAGTAACAGGAAAAATATATTTAAAAAATTTTATAATCACGATCCAAAGTAGTTTCTCAACCACTCAACAAAGCCAAGTGCTTTTCAAAAAAAAAGAAAAACAAAGCCAAGTGGGAACCGCGTTGATAAAAATCAGACTTCGGACTTGGAAGCAGTCAAAGCAAATCGTTGACTGCAATATTGGACTTGCGTGCTGACGTGGCGCAACAAGCGGAGGCAAATATATATATATATATATATTTTCCCACAGTAAAAACGAGGAGGAAAGGTAAAAGTAAAAGTTAGAGAAGAAACCGGGATTAGGGAAGCGGAAACCGGCTAGGCCGGTTGAAATCACGGGTTAAAAACACGACCACGTGGCTAGTTGGAGCCCACAATTCTTTTAATCACACGTAAATCCGCCTATTCCATTATTCCCCACTGTGTCTGCCTGGAGACACCTGCTGCCAATATAAATCAAACCGGCTCAGCATTTTACCATAATACCCCTCCTCCATTTTCTTTTAAACATTATTGGTTAAATACATCATTTTTAAGACTCATGTAAAATGTTTTAATATTTTTTCCATTTAAAATGTTTTTTTTTCACCTGGTTATTTTTGTTTGTATAATAGACCATTCGATCAATTAAGCAACTTTTTGAAAGTTAAATATTAAAAAATGCTCACTTAATTCATTTCTTGAACCAAGAAAGAAATACATTTACATGACATTTCAACCAAATCACTTTGTATAAGAGAAGTCATTTCATGTCAAATATTGACTTATTTGTGAGGTCATATGACAGGGGTGAAGTATATGATTCTTACTTTATGAGGGGAGATGTTATATTGATCGTCTTCTAGTTCAACAATGTGGAGTTGAAAATTCAAACACTGACATTTAGGACAATTATATAATATCGTGACCAATTGTGTTATGTTCAAGTTTGCGTGTATATTTATTCAATGGAAGTATGAGATAATTTCAAGTCAATCAATAAAATATATCAATGTCAGGTTTTAGCTTTATCAACGAATTTTAACAATTTGTTTAAAGACTTCATAGCAATAGAACATATGGTGCTCAATATTTGCTAAAATAATCACAACATTTGAAACATATGGTACGCTGTCTCCATCATTATTATTTCAATAATTTTCAATTAAATTTTCACTGATTAAAATTATTATTGAATTGTTGAACATAATACAATATTAGAAGAATATAATCTACGTTTGTTGATGTCAAAATTTGGTCAAGGGACTCACCTGACCTTCACGTGACATCAACGGTGAATTTGTAGAAACTGGGGAAGACATGACCTGCAAGACCAGCAAAAAGTGCTGCACACCGGCATGGTATAGGCCACACCACCTCTGATGCTTAAGTCAGCACACGGGAGGAGAGCAGGAAAGTAAGAGAAGAGAGTCGATAATTCAGTTCGGGTCCCTTTCTTCAATGGCAAAGAGGGGTATAAATACCTGCTCATGCTCCTAGGGTTTTTTTAGGAGTTCGGAGGCGTTTCGGGACAAACCAGGCGGATCCGAGGCAGCTAGAGGCTACAGGGACCAAACGAGGCCCGACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCGAGCAGGTCTTGGCCCGTCCCACTAGCCGGTTTCGCCTCTTGGGTCCATCTTCCAATCTGATTTCTGTTCGGTTGTCCTTATCAGCTCCTTGTGCATCGGGGTGGTCCAAAATTAGCTATAACAACGTTCATATTTTATTTCTATTTTCTATACACAAATATTAGTACCCACTAGTTAAAAATTGGTCAGACGAAAAAAAATATATATACTTTTTTGTATTTTAAAAAAACGTTTGAAATAAAATTTGACTCAGATTTTTATTCAACAAAACTGGTAAAATTATATTGTGTATAATTGCGTAAATAAAATGGAAATTTGTTGTAAAGGACAGATTGGTCAATTCGACTCATTTATTACAGATCTGCTAACCGACAAACCAGATGGTCGGCAAGGCAACTGTCGGCCTGTGAACAAAGAGAGACACAGTGGAGAAAATTTTCGTCGTTTTTTTTTTTTTTTGGAACAAAAATTTTGTACATATTTTTTAAATAATATTTTTTGTACATTTCTTAAGGGTAACCCAACTTTTTAAATAATTAAAAGAAGGACGTTTCATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGTCCCGCTCTGACAGATATTTGTTAATTTAATTTTAGCATCGATTGCTTCACTTTTTTTTTTTTTCCAAAAAATATTCCATCTTTACGTGTTTTTTTGTTATTAAATTTAAATTCCATGTTTTTGTTTGGTAATGTATACGGTAGAAATTCAAATATTTAATGTTTTTGAAGCATCTATTTTAGTCTCTCAACTTAAAAAATATTACTATTTTAAATTTTTTGTACGGAACTATTTTCACTCCTAAACCATAGATAGATAAACGTTTTAGTTATTGTATTATGATTATTATTTTTTTCTCTTAAATCATTTACTAGATTCATATTTCAACCGATTCATGTGTCTTTAATATATGTTCAAGTCCGCCATCAATATTCAATACATATTTAAATTTTAAAATCAAAACTAATTGACGACAAATTGTCAACTTGAATATAATTTAATTAGTTAAGACATATACTCTTGACGACAAATTCTCATATGTTTTTTTTGTAACACTTAAGATGGAGGAATTCGACCCATAGACCTTTTGGTCAGTAATAAAGTTTTATGTCGATTTAGTTATGCTCATGTTGGCTACTCACATATGTTATAGAACTTTTTTTTAGCAAGAGAAATTACGTGGTTAGGAATCTATGTTGAATACTTAAATTGTTGCTTTGTTATATATAAAAAAAATCGAGTATAGCTCAATAAATGAGACACTTATAATCGTTCTTAAAAGTAGATAGTTCAATTTCTTACTCGGAATGATTGAACTCAAGAAAAATTAAAGTTTTAATTTAATAACCATTTGGTTTTTTTTTTTTTTAATTGAGTTTAATAAAGTTTACGAATAAAAATAGAATATATGTGAAAAATATTCTATTCTATTCTATTTTTTTATTGTTGTTTTTGTTTTTTCAACTGTGTTTTGCCATCGGGAAGTAAAAAGCATAAATCCTCTTTTCCTCTCTCTTTCTCTCTCCGTTCCGAGAAATCTGCTTACCTATTTTAAACATTTTTTAAAAAAAAATAAAAAAGAAAAGTATTTTGATTTTCTTGTGGGGATGAAGATGAATGATGATTAATGGAACGAAAATGTGCCGATCATAGGGAGCCTCTGATTCTGTTTGTTTCCTGAGAAAATTCGTGATTAATACTATTTTATGAAGCCTCCTTGGTTGGTTCTGTTTTTTCTGGTACGTTTTTTCTGTTCCAAATCTAGTTTTCTTCACTCTCCACCCCCTGATTTCCCCATTCGATTCTCGATTCTTTGCCTTTTCCAATTTTCGAATTCGTTCCATTCATTTTCGCCAAGATTTGAGGCTCATCGTCCTTCGTTTTCCTGCGTTTTGGTTCGTGTAATTGAGATTTGGATTTGATTTTCTACTTGTTCGTTATTATGAATGCTTTTGTGCGATGGTTGTTGTTTTGGCTAAGATCTCCGCCGAGGAAGTCGTTTTCGAAATTCTTGTATGTAGATGTTCCTTTTTTCCGATTCTGAGACTTTTACTGTTCGGCGATACGTATCTATCTCTGTTGATACCGTCTTTCGACCTTCAATTCGAGCTCTGA

mRNA sequence

ATGGCGAAGATGGGTTTACATACCTATTCCTGCCCTAGGGTTTTTAGACGTTCAAAGGCGATTTGGGCTGAACCAAGTGGAACAGGGACGACCAAAGGCACCAGGGACCGAGCGAAGGGGGTGGACCCGACCCACCAAAGCGAGCCAAGGCATACCAGGCCAAGGAGTTCGGAGGCGTTTCGGGACAAACCAGGCGGATCCGAGGCAGCTAGAGGCTACAGGGACCAAACGAGGCCCGACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCGAGCAGGTCTTGGCCCGTCCCACTAGCCGGTTTCGCCTCTTGGGTCCATCTTCCAATCTGATTTCTGTTCGGTTGTCCTTATCAGCTCCTTGTGCATCGGGGTGTTTTCTTCACTCTCCACCCCCTGATTTCCCCATTCGATTCTCGATTCTTTGCCTTTTCCAATTTTCGAATTCGTTCCATTCATTTTCGCCAAGATTTGAGGCTCATCGTCCTTCGTTTTCCTGCGTTTTGATCTCCGCCGAGGAAGTCGTTTTCGAAATTCTTGTATGTAGATGTTCCTTTTTTCCGATTCTGAGACTTTTACTGTTCGGCGATACGTATCTATCTCTGTTGATACCGTCTTTCGACCTTCAATTCGAGCTCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGAAGATGGGTTTACATACCTATTCCTGCCCTAGGGTTTTTAGACGTTCAAAGGCGATTTGGGCTGAACCAAGTGGAACAGGGACGACCAAAGGCACCAGGGACCGAGCGAAGGGGGTGGACCCGACCCACCAAAGCGAGCCAAGGCATACCAGGCCAAGGAGTTCGGAGGCGTTTCGGGACAAACCAGGCGGATCCGAGGCAGCTAGAGGCTACAGGGACCAAACGAGGCCCGACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCGAGCAGGTCTTGGCCCGTCCCACTAGCCGGTTTCGCCTCTTGGGTCCATCTTCCAATCTGATTTCTGTTCGGTTGTCCTTATCAGCTCCTTGTGCATCGGGGTGTTTTCTTCACTCTCCACCCCCTGATTTCCCCATTCGATTCTCGATTCTTTGCCTTTTCCAATTTTCGAATTCGTTCCATTCATTTTCGCCAAGATTTGAGGCTCATCGTCCTTCGTTTTCCTGCGTTTTGATCTCCGCCGAGGAAGTCGTTTTCGAAATTCTTGTATGTAGATGTTCCTTTTTTCCGATTCTGAGACTTTTACTGTTCGGCGATACGTATCTATCTCTGTTGATACCGTCTTTCGACCTTCAATTCGAGCTCTGA

Protein sequence

MAKMGLHTYSCPRVFRRSKAIWAEPSGTGTTKGTRDRAKGVDPTHQSEPRHTRPRSSEAFRDKPGGSEAARGYRDQTRPDGLGPHERAEQVLARPTSRFRLLGPSSNLISVRLSLSAPCASGCFLHSPPPDFPIRFSILCLFQFSNSFHSFSPRFEAHRPSFSCVLISAEEVVFEILVCRCSFFPILRLLLFGDTYLSLLIPSFDLQFEL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 20..88
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 35..88

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0004715.1Lag0004715.1mRNA