Lag0004078 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0004078
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr6: 911319 .. 914685 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0004078
SyntenyLag0004078
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCATGTCCTCATCCCTTACAAGTGGTATCAGAGCCATGCCCCAGGCGTAGCCGTGTCGGGTGGAATCCTCGAGTGTCGAACAAAGAAGTTGTGAGCCTTGAAGTAGTTATGAGGAGATCCGTGGTTGAGCTCTGGATAGGTGAGTATATTTCGGAGAAGAGGAGTCGTCCTAGATAAGATAAGGGAGGACAAGTATCTCCATTGGTATTAGGCCTTTTGGGGTGATCCAAAACAAAGTCATGACTGCTTATGCCCAAAGTGAAAAATATTATACCATTGTGGAGATATGTGTGTGTTCAATAGTCCCTTACAATGCCTTTATTGATCTTCCCAAAAAATCACCAATTTTTTTTTGGCAATAAATCAAATTTTGTTTTATAAACTTAAAAGAATAATACGAAGATTTTGCAAAAAAAAAAATAATAATAAAGAGATATTTTTCAAAAACAAAATGCCTTGGATTCTTCATTATATGGACAAGAGAAGGTCTCTTAAAAGATGAAGAAAAAAAAAACTCAGAGAAGACTCCAAATAAGGAAAGAGAAATCTAAAAATCTATCAAATTGATACGACGTTAGAGATGTTGTATTAGCTTACCCATACCTTTATAAGTATAATATATTCACTAATTTAATTATCATTACAAATTAAAAAAAAAATTAAAACAATATCAATTTTCAGTTATAGTTATTCATTTGAGCCTATTATAAATTGACTATGAATCTAGTAGAAAGCGTAAATAATCCTAAATACAATCCAAGATCGATCACAATCTGAAATTTTCCGCTAAGAAAAATAAATTAAATTGACAATCTATTATTGAAGGAATAATTAAAAGACATTGGAAAAAAAAATCTTTAAAAAAAAGTCTTTTGAATTAAATTTGAATTTAAAAATCAAGAAGCCTATTCCTAGAAAGAAATAGATTTTGGAAATTAAAGTTTGTCATCGAGTTTTAGAAATAAATATTTATCACCACAAAAAGATGTTTGATAATAATAAAAAAAAAAAAGCTAATTGGTTAAAAAAAATTATGTTCAAGTGGGCTCATAACTATATATATGATAATTAAAATTGACCTAGATGCTAATTGAGATTAGCTAGGATTAATTTACACAATGTGATTTAAATACGTCGTTACAATAAATCATGAACATTTTATTGATTGTGTTCTAGACTTCTAGCTACTTTTTGTCATATTGATAGTTTTTTTTTCTAAATTTATGATTTCTATATAGTATTGGAGTCTTGTGGTTATCCTACATTTTACTTGATAGGAAATCGAGAATGAAATATAATAGTTGTAAAGTACAACATTGAACATTGGATGTGTAAGGAGTAAGGACTAAGGGAGGGCCAAATTTCAATTAAATGAAAGTACCAAATTACCCACCACAGGTCCCCTCGGGGCCCTATTGGTCTTCTAAGGATAAGGAAATCCATTTCCCCTTCCTCCTCCAATAATAATAGTAATAAATATGTGATATTATAATTTTTGTCCATCGCTAATAATAGAGTTGTATCTAATAAGTTCGTAAACTTTCACCAGTTTCAAAGGGACTCACCATTGTACTTCTAGAGGAAGGTCTAACATAGCGTTTGGCCACAACTTTTGTGACTGTTCAGCACAATATGGTACGGTATGCCACCAGCGTAAATGAGGCACACAAAAGACACTGGTGTGATCTTTATTTAATGCCAACTTGGAAGTGAGATTCGCTAAGTTAGGTAGCAACCGCCTATTGTAGAATCGTTGATTCTCAACAAAATAAAAAAAAAAATTGAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGTTGTGTCTAATGAGTTTCTAAAAGTTTAATGATTTGTCGTGCAAGTTGAAAGTCTAGAAATCGTTCATACACTTCTTAAGAATTAAGAACTTATTGGATACAACTCTTTATTTATATATTTATTTATTTATTTATTTTCTTTTTTTTAACTATTAGATTAGCTCTAGAAGTTTAGGAGACCAAACTTGTAATTTAATCTATACTCTCCTGGTTTAAGACGGCTATATTTTAAGACAACTATATAATGTGTTAACCAATTGAGATGTGCTTAAAGAATTATGTTAAAAATTTCTTATTAGATTTGCACCATTAAAAATTGTTTTATACCTACACTTTACATTATTATGTATAAACTTTTCCATAAACTTTAACTTTATCAAATTGAACACCCTAAACATCAATAAAAGTTACAACTTTTCCTGCTATTCAATTTTTGTTAAATTCACCCACTAATTTTAAAACAAAAAAAAAGGTAAAAATCTCTCAAAACTCATAGATTTTCATAAAAATTAAATCTCTCACAAAATTAACTTCTATTAACGCATAAAATGGACTATAGACCCAATCTTCCAAAACTTACAAATTTTAACAGTCTTTATTTATCTTAAATCTCACCAATTTCATACGGTTAAAAACACACGTATTTGACAATTTATTCTTTCCCAAAAAAAAAAAAAAACAGACCAGATCCGTTGTTAGAGATCTGACATGTCCTTTCCTTAATTTACTCGTAGATGTGATACAGACACTAAAATTTAGGACAGTTTAACTAACAATTACATATGTTGTCTTTGAAATTGCTTCACATGCATTAACTATTTCTCAAAATTAAATTTAACCATTCATTCAAATTCATTAATTATTCCAAAATTCTCGTTCATGCACCCTAAATGCTTTTAAAGATATATTTTTCTAATCTTCCTAATCAAAACAATAGACCATTTCTTTCTTTCTTTCTTTATATATATTGTTGATGCCAAAATCCGGACAGAAGACTCACCCGACCTTCACGTGACACCAACAGTGAATTTGTAGGAACTGGGGAAGACGTGACCTGCAAAACCAGCAAAAACCGCTGCACACCGGCGTGGTGTAGGCCACACCGCCTCCGATGCCTAAGTCAGAAAACTGAGGAGAAGCTTCAGATAGTCAAGGGGAGAGTCAAGAATCGAGTTTTCGAACCCTTCTTCCGTGGTGAAGAGGGGGTTTTATACCTGTTTGTCCTCCTAGGGTTTTTCAGGAATTCGGTGGCGTTTCGGGGCGAACCAGGCGAAACCGGGGCGATTCGGGGCATTAGGGACCGAAGAGAGGTGACCGAGCTCGGCCCGTGCAAACGGGCCGAATGTTCGGCCTCGGCCTTTTGCCGAGGCCGACCATATGCTCGGCCTCGGCAAAAGGCCGAGGCCGACCATATGGGTCGGGCCATTTTGGCCCGACCCTTTGGTCCGGTCTTCCTCTGGGTCGGTCTCTTGATCCTACCTCTGCCCGATTGTCCTCGTCAGCTCCTCGTCCATCTGTGTGGTCCAAAATCACCTGTAACATTAAGCCCCCACTCTTGA

mRNA sequence

ATGTCATGTCCTCATCCCTTACAAGTGGTATCAGAGCCATGCCCCAGGCGTAGCCGTGTCGGGTGGAATCCTCGAGTGTCGAACAAAGAAGTTGTGAGCCTTGAAGTAGTTATGAGGAGATCCGTGGTTGAGCTCTGGATAGGAACTGGGGAAGACGTGACCTGCAAAACCAGCAAAAACCGCTGCACACCGGCGTGGTGTAGGCCACACCGCCTCCGATGCCTAAGTCAGAAAACTGAGGAGAAGCTTCAGATAGTCAAGGGGAGAGTCAAGAATCGAGTTTTCGAACCCTTCTTCCGTGGTGAAGAGGGGGTTTTATACCTGTTTGTCCTCCTAGGGTTTTTCAGGAATTCGGTGGCGTTTCGGGGCGAACCAGGCGAAACCGGGGCGATTCGGGGCATTAGGGACCGAAGAGAGGTGACCGAGCTCGGCCCGTGCAAACGGGCCGAATGTTCGGCCTCGGCCTTTTGCCGAGGCCGACCATATGCTCGGCCTCGGCAAAAGGCCGAGGCCGACCATATGGGTCGGGCCATTTTGGCCCGACCCTTTGGTCCGGTCTTCCTCTGGGTCGGTCTCTTGATCCTACCTCTGCCCGATTGTCCTCGTCAGCTCCTCGTCCATCTGTGTGGTCCAAAATCACCTGTAACATTAAGCCCCCACTCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCATGTCCTCATCCCTTACAAGTGGTATCAGAGCCATGCCCCAGGCGTAGCCGTGTCGGGTGGAATCCTCGAGTGTCGAACAAAGAAGTTGTGAGCCTTGAAGTAGTTATGAGGAGATCCGTGGTTGAGCTCTGGATAGGAACTGGGGAAGACGTGACCTGCAAAACCAGCAAAAACCGCTGCACACCGGCGTGGTGTAGGCCACACCGCCTCCGATGCCTAAGTCAGAAAACTGAGGAGAAGCTTCAGATAGTCAAGGGGAGAGTCAAGAATCGAGTTTTCGAACCCTTCTTCCGTGGTGAAGAGGGGGTTTTATACCTGTTTGTCCTCCTAGGGTTTTTCAGGAATTCGGTGGCGTTTCGGGGCGAACCAGGCGAAACCGGGGCGATTCGGGGCATTAGGGACCGAAGAGAGGTGACCGAGCTCGGCCCGTGCAAACGGGCCGAATGTTCGGCCTCGGCCTTTTGCCGAGGCCGACCATATGCTCGGCCTCGGCAAAAGGCCGAGGCCGACCATATGGGTCGGGCCATTTTGGCCCGACCCTTTGGTCCGGTCTTCCTCTGGGTCGGTCTCTTGATCCTACCTCTGCCCGATTGTCCTCGTCAGCTCCTCGTCCATCTGTGTGGTCCAAAATCACCTGTAACATTAAGCCCCCACTCTTGA

Protein sequence

MSCPHPLQVVSEPCPRRSRVGWNPRVSNKEVVSLEVVMRRSVVELWIGTGEDVTCKTSKNRCTPAWCRPHRLRCLSQKTEEKLQIVKGRVKNRVFEPFFRGEEGVLYLFVLLGFFRNSVAFRGEPGETGAIRGIRDRREVTELGPCKRAECSASAFCRGRPYARPRQKAEADHMGRAILARPFGPVFLWVGLLILPLPDCPRQLLVHLCGPKSPVTLSPHS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Lag0004078 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0004078 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0004078 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Lag0004078 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0004078.1Lag0004078.1mRNA