Lag0001968 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0001968
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 37735841 .. 37743937 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0001968
SyntenyLag0001968
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAGACCAGGAAACGACCCAGAGGAAGACCAAACCAATGGCCCGACCCGTACGGTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGTCCGTTTGCCTCCGCTCGGTCCCTACCGCCGCTAGCCGCCCTGGTTTTGCTTGGTTCGTCCCAAAACGCCTCCAGATTCCTAAAAACCCTAGGAGCACGAGCAGGTATATATACCCCTCTTCACCACTAAAGAAGGGTTTCGAAAACTATATTCTCGACTTCTCCCTTTACTCTCTAGCTTCTCAGTTTTCTGACTTAGGCATCGGAGGCGGTGTGGCCTACACCACACCGGTGTGCAATAGTTCTTGCTGGTCTTGCAAGTCACGTCTTCCCCAGCTTCTACAAATTCACTGTTGGTGTCACGTGAAGGTCAGGTGAGTCCTCTGTCCGGATTTTGACATTAACAATATATATAAAATGATTAAGGGTAAAATTTTACTAAAAAATAATCTTGATTAAATTATATATTTGGGTCTCTAAACGTTATGTTTAATAAGTTTAAAAAAAATAGTCTAACAAGCTCTTAAGCATTTTTTGTTTTAGTTTCACAAATGTGAGATGATGATTATCAAATATCTTAACCTCAAAGGAAACCGAAGAAGTAAGTGATATGCTTTAACCAATAAGCTAATGCTACTCGTGGCAATTTCTAAGTTATTAATGTTTTGTTTAATAGATTTTTAAAATATAAAAGGTGTATAAAAGTATTTTAAATCTTCAATTTTGTATTTAATAATTCTCTAAATTTGACTTATATTTGATATAAAATGGAATGTTGGAGTACTTATTTGATACTTTTTTAAAGTTTTGATACTTATTAGATGTAAAATTAAAAATTTAGGACTTACCCGATTCAAACTCATACGTTGTGAAAAAAAAAATAGACCAAACCCATATATCAATTTTAATTGGGATCGATGATGAGCTTTAATATACATGGGTGTGCAAATTGATTAATTTTTTAAAAAAATCAATAATATGAAGTTGGAAAATTCGAACACATGACCTTTTGATTATAAATACATTCTTTACGTTGGTTGAACTATGTTCTTTTTGACCATATGTATGTATAGTCTCAAGTTTTGCACAAGAAATTATCATTGTTTCATGTATAAAATCTTGAAGACATTGGTTTGAAGGGTCCCTTTTTTTTGGACAATTTATTTCAAATAACCTAGCAAGTAGAAATCAAATTTAAAACAATGATGGAACTATGGTCCCTGTCCTGTTTCTCACAATAATGAGTGGTCCTCCAACATTTCTAGGGACAATGACACATTATAAATTTTTTTTACAACACATGAGGAATTTGAAGTTCTAATCTAACAATGACACATTATAACTACAAGAAATAATATGTCCGCCAACAAGAGGGAAAATTATTAGGTGTTCTGGGTGCAATGAGACCCAATTTTTAAAACCGTCGGATGTAAATCTTCAAATTTGTCTGCCCCCTAATAATCGTGGGATACAAAATCAAGGTACTTTTACCATTTTTCTATCTTACATCCGATGGTGCAAAACTATCGGCATCATTGCACCCGGAGCACCTAAAAATTTCTCCAACAAGAGAGGGAATTGATCCCTCTCTTGTTTCTCACCGTGATGTGTGGTCCTCCCACGTTTCTAGTAACAACGACACATTATAACTTGTTTTTTTTTATTACAACATGACAAAGGGTGGGGATTTAAACCTTTGTCCTTGTTGAGGATCCCACATCGAAAAGATTGGTGGAGACCACTCCACTCATTGCCAATTGGTTTTGAGATGGAAGCCCATATAATATAATATGGTATCAGAGCCCATTAAACCCAAACGGGTATTCGGTCCAATAAAAAGAAATGGATCCGATCCAAGAATGGTGAACCCAAAGAGGCACCATCTTGAGGGGGCATGTTGAGGATCCCACATCGGAAAGATTGGTGGAGACCTCACAATATATAACCTACAAGGGTCACTCCACTCATTGCCAATTGGTTTTGAGATGGAAGCCCATATAATATAATATGGTTTCAGAGCCCATAAAACCCAAACGGGTATTCGGTCCAATAAAAAGAAATTGGGATCCGATCCAAGAATGGTGAACCCAAGGAGGCACCATCTTGAGGGGGCATGTTGAGGATCCCACATCGAAAAGATGAGAGGTAATATTATGGTCCCTCTCTTGTTTGTCACAATGATGTGTGGTCATTCCACGTTTTTTTAGTGACAATGACATATTATAACCTTTTTTTGACAACACGTATGGTGAGAGATTTAAATCTCTTGATCCGACAACGACACATTATAATTACAAGAATAATAAGAGAACTGCCAACAAGAACATAACTTAACTGACATAAAGTGTGTGACTAAGAAGGTCGGAGATTCCTAGATGGGACAAAGATAAATTCTAACTGTGACTAAAATACTTTGGAAAATTTTGAAACCAACTACAGGTTACAAGAATTTTCTTTTGTTAATTTACTTTGGTACCTTTACTTTCTAAGTTTATTTTATTTTAGTTCTTAAATTTTCTAATATCCTTTCGTTTCTTAATTTTTCAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAGTGCTGGTCATTATTGTTATTTTTTCAACTTAATTTTTGGCTTGATAGGAACCTAGTTGTTGATATATATATATATATATATATATTATATATATATAAAGGAAAAACGAGAGTGATAAGGTGTATGTTTGGTTTAACTTTTCAAGTGTTTAATTTTGAAAAAAAAAATCGTTTTGAAATAAATATTCTAGTGTTTGACAACCACTAAAAATGACTTATTAAAAAATGAGATTGAGAAATAAATCATTTTGAAATAAACACTTGAAAACAATTTTTTTAAAAAGGGTTTTTAAGTATATGATAACTTGGGTATAACAACACTTATAAGGAAATGTAACCAAATATACAAGTGTTTAAATTCTAAGCAATTTTTATACAAAATGCTTTTAAAAAATGCATTATTGAAAAACACTTAAACTAAAAAGGTATTTCAAACAAGTCCCGAGTTGATAGTCGAATAATAACAACAATGACAAAATGATTAATTTTCTTAACATTGAATGACTAAATTTGAATACGCTTAAAGTTATAAGACCAAAAATAAGATTTTGATTCTGTTTCAAATCCTGGTAATTATTAACCTCGATATTTAACAATTTTGGATAACTCAATTTAATTTAAAAATGAGGACAAAATCAGTTTATTCCCTTTAACTTCTAGGTGTATCAATTTTTATACTTAGATTCAAATTTATCAATTTGCAACCTCTTTTTGAACAATATCAATTTGCAACCTAAGCTCAAATACGAGTTGTACCATTTACTATAAATTTCAATAAGTTTTCATTCGAAGAATCGTTAAAATATATAACATGTTAGATTAAATGAATTCAAGTTTTTCATATCTTGATCGAGAATATATATACCTTAATCATTTAAATTGGGGAAAAATACACTTTTGGTCTTTGAGGTTTGGATTAGATTTCATTTTGGTCTTTGAGGTTTGGATTAGATTTCATTTTGGTCCCTGGGTTTTCAAACTCAACATTTTTATTCCTGAGGTCTAGATTTCGTTACAATCTTAGTCCCCTAGTTAATTTTTCTGTTAAATACTAACAGAATGTTGACATGACATTAGTTTTATTTAATTTCTTAAAATAAAATAATATAATATTAAATACTTTTTTATTTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTCCATCTTCTTTGATCTTCTTCGTTGGATTCTTCTTTTTCAAACCCTCGTCGGAAACGCCACTGCAAATCTCGTCCTCCTCCATTCAACGTCCAACCGCAGATCTCTCCATCTCCTTTCAGCATCTTCGACGGCATTCGCGATTTCAGCAGCGGTAGATCGTGGGTTTCGAGCAGCCGACGAGTTTTTCCCTTCTTTACGATTTCAACCAACGGTAGATCGCGGTAGATCGTGGATCATGGGTTTCGTTCTCCCTTTTTTTTTCTTCTTTCTTGCTACTGGAACATAGCTGAAGAAGAGATTGGATGTGAGAGAGAACGAAAGGAAGAGAGAACCCACGATCTTCCGCAGAAATCATTGAAACCCACGATGTTGAACGGAGATCGTTGCTCGAAACCCACGATCTACCGTTGAAATCATCGAAACCCACGATCTACGTTACTCAAAATCCATGATCTGCAGCTGGACGTTGAACGGAGGAGGACGAGATCTACAGTGGCGTTTCCAGCGAGGCGGGCGCGACTCCAGCGAGGGTCTGAAGAAGAAGAGTCCAGCGAAGAAGATCAAAGAAGATGGAAGAAAAAGAAAAAAATAAAAAATAAAAAATAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGTATTTAATATTATATTGTTTTATTTTAATTAGTTAATAAAAAAATATTTTTTAATTAAAAACTAATGTCATAAATTAACTGAGGGACTAGGATTGTAACGAAATCCAAACCTCAAGGGTACAAATGTTGAGTTTGAAAACTTAGGGACCAAAATGAAACCCAATCCAAACCTCAGGGACCAAAAGTGTATTTTTTCCTTTAAGTTATACTTAAGTTAGCAATAAAAATTAGGTTAAATTATAAAAAATACCCTTGAACTATGGGGTTTGTTTCAAAAAATGTCTCTAAACTTTAAAAAATGTTTCAAAAATACCATTTTCATTAATTTTTAGATGGAAACCGTTAAAGTTTCAGTTTCATTAATACCCTTGAACTTTAAAAAAAAAAAAATTAAAAAATACTCTTATTGGAAAATGTTCTTTTTTTTTTCCTTCTCTCACCGTAAATTCTTTGGGGTAATTTCTCGAATAATGTACTTAAAAAAAATGACAAATCTAATGTTGTTTTCAAAATAAAAATCTTAATAATGTACTTAAAATTACAAATTACAAAGTTGTGGTGAAGTTTGAAACTATTGACAAAACTAGGGCAGTTAGAAATCGTGTACCTGGTACACGATTATTGTGGGATAGAATCGTGT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mRNA sequence

ATGAGACCAGGAAACGACCCAGAGGAAGACCAAACCAATGGCCCGACCCGTACGGTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGTCCGTTTGCCTCCGCTCGGTCCCTACCGCCGCTAGCCGCCCTGGTTTTGCTTGGTTCGTCCCAAAACGCCTCCAGATTCCTAAAAACCCTAGGAGCACGAGCAGGCATCGGAGGCGGTGTGGCCTACACCACACCGGTGTGCAATAGTTCTTGCTGGTCTTGCAAGTCACGTCTTCCCCAGCTTCTACAAATTCACTGTTGGTGTCACGTGAAGGTCAGATCTCTCCATCTCCTTTCAGCATCTTCGACGGCATTCGCGATTTCAGCAGCGGTAGATCGTGGGTTTCGAGCAGCCGACGAGTTTTTCCCTTCTTTACGATTTCAACCAACGCTGGACGTTGAACGGAGGAGGACGAGATCTACAGTGGCGTTTCCAGCGAGGCGGGCGCGACTCCAGCGAGGGTACACGAGTTCGCTGGCGCAACGTCAGCGACACATCAGCGCCAAATCATCGCCAACCTATCGCCAACCTGGTCATGTATGCCTCGTCAGCGTGCCAATAAGGAAGTCGCGTACCAGGGTTTTTAGGCAATCGGAGGCGATTTGGGTTGAACCAAGCGAAATCAGGGCGGCCAGTGGCAGCAGAGACCGAATAGAGGCGAAAGAACTCGGGCCACGCAAGTGGGCCGAGTGGTTAGCCTTGGCCCAAGGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGACCAGGAAACGACCCAGAGGAAGACCAAACCAATGGCCCGACCCGTACGGTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGTCCGTTTGCCTCCGCTCGGTCCCTACCGCCGCTAGCCGCCCTGGTTTTGCTTGGTTCGTCCCAAAACGCCTCCAGATTCCTAAAAACCCTAGGAGCACGAGCAGGCATCGGAGGCGGTGTGGCCTACACCACACCGGTGTGCAATAGTTCTTGCTGGTCTTGCAAGTCACGTCTTCCCCAGCTTCTACAAATTCACTGTTGGTGTCACGTGAAGGTCAGATCTCTCCATCTCCTTTCAGCATCTTCGACGGCATTCGCGATTTCAGCAGCGGTAGATCGTGGGTTTCGAGCAGCCGACGAGTTTTTCCCTTCTTTACGATTTCAACCAACGCTGGACGTTGAACGGAGGAGGACGAGATCTACAGTGGCGTTTCCAGCGAGGCGGGCGCGACTCCAGCGAGGGTACACGAGTTCGCTGGCGCAACGTCAGCGACACATCAGCGCCAAATCATCGCCAACCTATCGCCAACCTGGTCATGTATGCCTCGTCAGCGTGCCAATAAGGAAGTCGCGTACCAGGGTTTTTAGGCAATCGGAGGCGATTTGGGTTGAACCAAGCGAAATCAGGGCGGCCAGTGGCAGCAGAGACCGAATAGAGGCGAAAGAACTCGGGCCACGCAAGTGGGCCGAGTGGTTAGCCTTGGCCCAAGGCTAA

Protein sequence

MRPGNDPEEDQTNGPTRTVGLGLGPSPFASARSLPPLAALVLLGSSQNASRFLKTLGARAGIGGGVAYTTPVCNSSCWSCKSRLPQLLQIHCWCHVKVRSLHLLSASSTAFAISAAVDRGFRAADEFFPSLRFQPTLDVERRRTRSTVAFPARRARLQRGYTSSLAQRQRHISAKSSPTYRQPGHVCLVSVPIRKSRTRVFRQSEAIWVEPSEIRAASGSRDRIEAKELGPRKWAEWLALAQG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..22

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0001968.1Lag0001968.1mRNA