
Lag0001962 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGACGGAAGAAGATCGAGGTGAAGCGAATCGAAGATAGGTGTAATCGCCATGTGACTTTCTGCAAGAGAAGATCTGGATTGATCAAGAAGGCTCGAGAGCTCTCTGTTCTGTGCGATGTTGAGGTCGGACTCGTCGTCTTCACCAACCGCGGCCGCCTCTATGAGTTTTGCAGCGGAAACAGGTAAGCGTTTGATCCTTAGCTTCTTCGTTGTTTTTCTTCTTTTCTTCGATTATTTCAATCTCCGGTTGTCTGTTTGTTCATATCGATTAGGATAGTGCAAGCTGAATGTCTATTGAACGAACTGGAACTATTGCTTTCTTTTGTTTCTTTCTGTTTGCTCTTTGAAGTGATTGATTTTTCTCGGAAAATCGGTGATAGTCTTAGCGCGTTTTCTTCGTGAGAACTCTGATTTCTGATATCGAACGAAGAAAATGCAACTCTTCGTTTTTCTGTTTGATCTCTGAGAGAGATTTTCTATAGGAAAATCCATGGAGTTTAGTGTTCCAGTGCTTTGTTCGATCTGATTTCTTCTTGAATGTGACTTTTCTTCCGTCGTCCCTGGTTTCTTTCTCTGGAATGTTTCGTCCCTGATATCGAAAAAATGCTGGCGTTGTTTGATCTTAGAGAGATATTCTCGGAAATCGTCGGAACTTAGTTTTCTGACGCTTCGTGCGCACTCTGATTTCTTCCTGACTGTTCCTCTCGTCCGTCCCTGGGTGGAACTCAGGATTTACGTGTTTTCTTTCTGCAGCATATGCATATGTGATTGACTAAATTTGTAATTATTTACACACGGAAATATTTTAAAGCTATGTAATTACGAAACTGTCACTGAGGATAAATTTTTAAATATATAAATATATATATATATATATATTATAAAGTGATTTCGTCAGTCTTCATATTATTATATTATCTTTTTATCACAGGATAATTTAGTCAATTTTCTAATTTTGTTTTTAATATATTTGTTAGGTGTCAACATCAAACTATTTTTGTATCAAGTCAAGTGATGAGGATTACAGATGAGAAAATAAGACAAAAAAACAAATGATTTAGAATAGTGACAAAAAGTTTTATTGAAATTTCTTCACTTAAATATAATAAGAAACGTAGATTTAAGTATGGCCTAGGTATGTAGCGTACTTTAAGCTACACTATTTGTAGACGAATTTTCTTTGCAAAAAAATAAAATAAAATAATAAATAAATAAAATTGTAGACTAACTTAATAGAGATTTTGTTTATTTTTATGAAATGTTTTGTAATTATCATGGTTTTCTTAAATGTCTGTTGATATCCATGCTTTTTTTAATTGACATCATTACGAAAATTTGGTATCTAGTTCCCCAAATTTGGTAGAAAATCATTTATATTTAGGTTCCGTTACATTAATTCAATGTGATTATGGAGCTATTGTTCTGTATTTTGCCCCAAAATATATATAGGCTATTTGGTAAACAATTTTGGAAAGGAAATTAAAGCATTTCAGTTTTCGAATCATGAATTTATTTTTAAAATAGTTTCGAAAAGTTGTGATTGGATAATTTTTAAAAATCTATGTTATTGTTGTGTTTCTTGAAGTGATATTAAAAAGAACAACGTTTTTTTTTAATAGAAAAAATTGGTTAATGTTTAGAACACACACTTGAAAGAAAACTAAAGAATACATGTTTTTGCATAATTATTATTGTTGTGGATTTTGAAATTATTGGTTCCAAATTTGGTATTTTTAAATAGGCTAAATATATAGTTTAGTCATATTTGAGTATTTCTCGTTTTAAAAGTTTCAATTAACCTATTATATTTTGATATTTTCAATTTAATGCGATGATGTGCAAATAATAGAATTGGTTCATGCTAAACTTATCTAACATAGTACTTGGTGAATTGATAGAAATTTAGAGGAGAAAAAGGTTGTGTAAGAGGAAAATTTCAGGTTTTCATCTCTTAGATAATTATTTTTGTTCTATAAATTTTACTAATTCGTTAAATACTATGTCATGTGAGTTTATCAACCAATTTTAACATTCATAAATTGTAAAAGACTGAAAAATGTTTATGCAAAAGAGATTAAATTGAAAATTTTTAAACAATAGGAACTTAATTGAGAAAACATCTCCTAATCTTAGGGAGTAAAAACATGTATTTTGCCTTTCTTCAAAAAAAAAAAATAGCATTTTAGATCCAATTTAATAACTATTTGGTTTTTGAAAATTAAATTAATAAACACTATTTTCAACTATGGATTTCTTTGGTTTGTAAATGTTTTCAAAATCTAAGTCATATTTTGAAAACTAAAAAAAAAAAGTAGTTTTTGTTTTTAGAATTTGACTAAGAATTCAAATCTTTACTTGAGGGGATGAAAACCATAATTTTTAAAAATTAAAAACCAAAATTCAAATAGTTTTTATGTTATGTTATTTATTCATGCGTGAGATTTCATTAAAAACATGCCAATTTAATTAAAAATAATTATCTTAATATATTTTTATAGAATTTTTATTTTTAAAAACCACTTTCAGATAGCTCTCCACCTAATTGATGCGAAATGCATAGGAACCAACTCCTTGTCTTTTTTCCCTTTTAAGGAAATATTAGGTTATCCAACATGGGCATTGGATGATGAAATGGTCCCTCGTTGTTTACGCTTCTTTCTGGTTCCTTCGTAGTTTTTGTTGCTGGGTCAGAAACATACCATACGTGTCATCAATAAATGCTCTCTTCTCTTTCTCCCTCTCGTCACCAGTCGACTTCATAGAAGTTGATTATCCATTTCCTCTGTTCACACCCAAGTCTCTAAGTTGCTGAAATGTTGCTTGTTTGTTCTTAGTTCCGCTAGGAAGTTTGGACACTTCATTTTGGATGCGTTCCTGTTGGATTCATAATGATTACTTTGACATTCATTTCACATGTGTCAAACACTTGTTTGAAAACATTGAATGATGTCAAATGCTTTCAACCCTTCTAAATATATAGAACAATAATTGAACATTCAATGAGTTCAATCTTTGATTCATTTCTTCATTTTCTAGCCATTGACAAAAATATAAAATATATATGAAAATCAATAAATTTTTTGAGTGAAAATGACAAACTTGTTTCTTAAGCATATAATTTCACAAGCATTGTTAATTAAGATTTTGTTACCATTAAAGATTAAACCATTAAAAAAATGTTAAGTTGGATTCAAAATATTAGGTAATTAGCTTCTTTAACCTCCTGAAGTATTGCATATTTTATTCTTTCATCTTTGTCTTTCAAATAAAAGATAACTAAAAACAATTTTCTACTAGAAATCATTGAAATGAATTAAAATAATCAACTATATATTTCCGAGAGATATTCTTGTTGTGTTCGAAATCTTACATTCATATAACTTGTTAAATTATGAGTGTCTAAACCATACCCATATCTTATGTATTATCCATGTCTTGTCATTTTGCCTAGGGCTTTTTTGGTAGATTATGGATTAGTGATGAGGATTTGATTTTCTTTCTTGTTATGAGTTGGTAACTTTTTTTTTTAAAAAAATTATAACTTATTTTGAATGCATTTAATATATAACTCATACCTACGAAGCTAAAACTATCCTGAATTGGCTTAGTAAACAAAGAGCTTTTAAGATGTTGAGATTATGGATTAGAGCTGAAATGATAAATTTCTTTATTTCCGAATCTAGGGTTGGAATGTTGATCAATTAAGACATGTTTGTAAATGGAAAAACTAGTTCAATTTTTTGGAGCTATGTAATTTTGATGATCTAATTAGCCCTACTGTGTGCCATTAAAGTCTAGGATATAGAAGATTGCCTTAGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGTTTTGAATGCGTGAGATTGCCTTAGCTATTAGTGGAGTATGGTAATTTTAAATCGAAAGTTGAATAGAAAGTGACTAAATTGGTAGTATATTTCCTTCTGGCTCATCATTATTTTTCTTGGAAATGATATTGATTAATAATTTAAAACATAAAACACCTTTTACCCGTATAGATAAGATTTCTCAAGATCTTGACAATAAAATATGAAAACACCTCCCTGACTTTGAAGTGCTGGATTAACGAGATAAGATCTTCTTCTCTGAAGAAATTTCAGAATAATAATTACTGCTTTCCATATGATAAAATATTGTAAAGGAAACTCTTCAACTCTCTTTTACACATCTGAGCATCCATTATTCTGATATACCTGACAGAATGCTCGTCTAGGCATTCCATCATCAAATTTATAGGGGCTTTTAGACCGCCTTAGTAACATTAGAAGAATAGCCGCACGCTATCTTCCTCTATCTCATGGAAATGTCTTTCCCTATTATCTGATGTTTCTCTTTTTACACAACTACCCATGAGCAATAAGAAGTCAAAAAGCCTCTAATTTTGGTAGAAAATTCATTTTACCATAAAAAATTCAGGCACCGATTGCTCCAATTTCCTTGACAGAAAGCCATTACCTACTGCACATTCCATCATCAAATTTATAGGGCTTTCAGTCCTTAGGTTTGGTGGCACATTTAGGGGTCTGTTTGGTTGAGTGAAATTCCGCTCTAGCTAACCTTCAGTTTGTATTTCCATACTGAGCTCCTTTACTAGATCATCGTACATTTGAATTGAAGGCTGCTTTCTTTTGAAAGATCTCTTGCTCGCAGCATACAGTTCCATCTATATAATTGCAGTAGCAGTTCACACTTCACTCGAAATAAGAAGGCCAAAAGAGTGGGCACTCAGGCTAATAATTGCAGAGCTTGGATACTTTTGGAATCTCGAAAATACCCTCTATTTGTAGGTCCAGAGGGTAGACTTGAGAAATTTAGTAGAACAAAATTGGGACGAAAATCAGCCGAGTTTGAATTCCTTTCCTTCCCGAAGCCTGGGACCAGTTGGACATTCTTGGAATATCATCTTTCTGAACTTGTTCGAACTTCTCTTTTAGCTTATGCCCAGCCCTAGAAATTGAAAGAATTTATTCTCATGTTA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BLAST of Lag0001962 vs. NCBI nr
Match: XP_023514717.1 (MADS-box protein EJ2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 238.8 bits (608), Expect = 7.7e-59 Identity = 122/151 (80.79%), Postives = 135/151 (89.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. NCBI nr
Match: XP_023004227.1 (MADS-box protein 04g005320-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 231.1 bits (588), Expect = 1.6e-56 Identity = 122/160 (76.25%), Postives = 138/160 (86.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. NCBI nr
Match: XP_022959860.1 (truncated transcription factor CAULIFLOWER D-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 226.1 bits (575), Expect = 5.2e-55 Identity = 123/162 (75.93%), Postives = 139/162 (85.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. NCBI nr
Match: XP_022155417.1 (MADS-box transcription factor 8-like isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 225.3 bits (573), Expect = 8.8e-55 Identity = 120/157 (76.43%), Postives = 137/157 (87.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. NCBI nr
Match: XP_023514206.1 (MADS-box protein 04g005320-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 1.2e-54 Identity = 122/162 (75.31%), Postives = 139/162 (85.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: K4BND8 (MADS-box protein 04g005320 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=Solyc04g005320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 117.5 bits (293), Expect = 3.4e-25 Identity = 63/145 (43.45%), Postives = 98/145 (67.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7Y040 (MADS-box protein EJ2 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=EJ2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 114.8 bits (286), Expect = 2.2e-24 Identity = 67/145 (46.21%), Postives = 100/145 (68.97%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SAR1 (MADS-box transcription factor 8 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 1.4e-23 Identity = 67/157 (42.68%), Postives = 95/157 (60.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P29383 (Agamous-like MADS-box protein AGL3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 1.2e-22 Identity = 61/145 (42.07%), Postives = 97/145 (66.90%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q03489 (Agamous-like MADS-box protein AGL9 homolog OS=Petunia hybrida OX=4102 GN=FBP2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 1.2e-22 Identity = 62/146 (42.47%), Postives = 93/146 (63.70%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KPU7 (MADS-box protein 04g005320-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497621 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 231.1 bits (588), Expect = 7.8e-57 Identity = 122/160 (76.25%), Postives = 138/160 (86.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H7I9 (truncated transcription factor CAULIFLOWER D-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460798 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 226.1 bits (575), Expect = 2.5e-55 Identity = 123/162 (75.93%), Postives = 139/162 (85.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DPA0 (MADS-box transcription factor 8-like isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 225.3 bits (573), Expect = 4.3e-55 Identity = 120/157 (76.43%), Postives = 137/157 (87.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DME3 (MADS-box protein FLOWERING LOCUS C-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 5.6e-55 Identity = 117/149 (78.52%), Postives = 134/149 (89.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRL9 (MADS-box protein FLOWERING LOCUS C-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 5.6e-55 Identity = 117/149 (78.52%), Postives = 134/149 (89.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. TAIR 10
Match: AT2G03710.1 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 8.6e-24 Identity = 61/145 (42.07%), Postives = 97/145 (66.90%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. TAIR 10
Match: AT2G03710.2 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 8.6e-24 Identity = 61/145 (42.07%), Postives = 97/145 (66.90%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. TAIR 10
Match: AT2G03710.3 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 8.6e-24 Identity = 61/145 (42.07%), Postives = 97/145 (66.90%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. TAIR 10
Match: AT5G65070.1 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 1.5e-23 Identity = 56/141 (39.72%), Postives = 91/141 (64.54%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0001962 vs. TAIR 10
Match: AT1G77080.4 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 2.5e-23 Identity = 60/141 (42.55%), Postives = 93/141 (65.96%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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