Lag0001334 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0001334
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 29692599 .. 29696404 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0001334
SyntenyLag0001334
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGCTTCCCATCGAGTTTCGATCTTATACGATAGCGTCTGGACACTGATTCCGTCACAGACCTTATTAGACTTGATGCTCGAAAGAAAATTTCACAAATCTACTAATGGTGAAGACAAGTTTCAGATTATAAGCTTTTCTGAGAACGAAGATCTTGTCTGGATGTTTGCTGGGGTATATAACAGGATGTACCACAATTGTTTTCCTTGTCGTATATGTTGAAAGTGTAGTTACTAGTATCCATAGGGACGATGCAAGCCTGAATTCAACAAAAAATACAAACAATAGAGGAGGATTTCGTGTAAGTGTACATATCAACACAATACAAAGACTGTGCTGTTAGTGTGGATGCTGAGCCTGTAGATACCATATACACAGAGGCAGTGTTCGACCAAATTCACTAGGGAGAATGCAACTCGGAGAAGGATAATGTTGGTTTCCTTAATTTAGTGGTAAGTTATGTGTTTTACACCAATAGATATGGTTAAATACAAGTTCTAGCTAAGTGATAGACCTTACATTTTTGGATTACAAGGTCCTTAAAGACGAAGTTTTTAAAGCATTTTACATTGTCAAAGAAGATGACGAAAACCAGGTAATGTTTTGTTATTGTATTAACTATATGTATATACCCTTATGTACATAGAGATTTTAGGACATATACTCTTATCCATATGCAAGCAAATGATAGGGTTATTGAGTATGATGTTTGTTTGTATATACACATATATATTTTTGTACTCATTGTGTTTTTGTACATAATTATTTCTGTGTTTTTATGTATACACACAAAATGTTAAGTAATTTTGTACGAAAAATGTATATTGACAGTTCAACATAAGTTTTTTTTTAGGATTAAGAATTTAGATTTATTGTGTTAAATGATGTTAATTACGGTTTTAGATTTAATGCAAGGTTGTTAAATCTTGTTCATGTTAAATTTGGTTTCTCCCCTCCTTAAAATGCTCATTTATTTGTTTTGATTTAGTTGGTTAGACTCTTGTTAAATTAAAATTAGATTGTCTTTCATACTTATTATTCTCCACAATTATAGTTTGCATTTCTCTTTCTAAAAAGTGGTTAGGGGAATTTAGTCTATTTTAATTTAGAATTTATTAATTAAAATCACGTTTAGCCATTTATTTAATTTCTAAACATGTTTAGCAATTTTTTCAAATCTCCCTATTAAATCTAGCATTTTTCTTGTTGCCCCTAATTTTTTTTCTTCACAAGTTCATCTCCCTTTTCTCTCCCACCATTTTTTACTCTCCCAAACAACACTCTTTTTTACCATTTTTTCCTATTTTTATCACATTCACAGTACAATAACAAGAAAGTGCACTTTGGTTCCACCATTAATTTTTTTCTTCTGGCCTTACACCATTTTTTTTTCTCCACCGCATTCACCTTCTATCGAATTCATCTTCTTCGATGAGGCTACCTTGAAGTGAAAAGCTAATCACTTGTCATTTTTTCCATAGTTAATCCATATATACCATCACCATCATGCAAAGTCAAGATGTAGGAGCTTTTGAAAAGAGCCCGGGGTAGAATACTTTTTTTATTATTTTATCTTCATCTTTCTTTCTTTATTTTTATTAAATGTCTTGCTAACATCTATTTGAGCTATTTTTCTTTAAATTTGGGGCTATTAAATCACAAAATGCTATATTCCCTATTTCTTCCAAAATTTTACTGATATCTTATTAACATTCTTTTTCTTTTCTTGCACGTTGTACTTTATGGTTGCATGTTGTACTTTATAGTTGAGAAACTAATGGATGATTGTTGTACTTTATAGTTGAGAAACTGATGGATGATTTACGAGTATTTTACAGCTAAAATTGAAAGTTAATTATTCATAATGTGATCAAGTAAAGTTCCTTTATATGCTTGAAAGTCTTCACATAAATTAGAGATCAAAGTATTACAATTTACCGAACTTAAATTTGATAAATTATAAGAAAAATGATCATATAAAAGGTTTGTTTGAAAAAAAAAATCTATGTTGAGGTTCGTTTGAAAAAAAAAAAGTTCTGTTGAGAATATAATTTTTCTTTTTGAAAAAAAAAACAAATCTGGAGTTTTTAAAGTGAGAAAAAAAAATCAAAATGTTTACAAGATATTGATGCTTTTACGAAAACAAGACTAATTTTTCTTTTCAATAACACTCTTTTTATTAAAAAAAAAAAGAGTTTCTAAAATTTATCAAAAACTCTAGGATAAACTTTTTTTTTAAGTGACAAACATTTGTTTTAAGTACCTTTTTTAATGAGTTGAGTAGTGTGTTTGAAAAATAAATTCTTATTACTCTTGAAGTGCATGAAAATCTTTTTTTAAAGGATTAAAATAAATTAAAAAAACAAGTCTAAAATATTTGAAATTCTATGATGGATTAGTGAAAAAAATATAAAATTTCTTAAACTCTTGAGACAATGAATTTTCTCATTAATTGAGAATAATTCTAAAATTGTACCAATAGACGGCTAATAACCCCACTCAAGTCGTTCAAATGTTTGCTTCATACTTGAAGTTCAAGGTATGACAAATTGAGACATTTTTAAAATAAAATTGACAAAATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTCAAAAGAACTATTCTTCTTTAATTAAGATTAATCGAGATGATGTGAGAAAATTGAGATTTTGGTAACCGTTTCTTTTACGGGTGTTGTAGGGTGCTAATACCTTCCATACGCACAAAAGACCTACAGGATTGGAATTCCGTAATTCCGTAAAGCGGAAGCGTGATTGGGATCGATTTGTAATTAATTTTGTTTAATCTAAAATAACAATACATTGACAATAATCTTAGAACTATTCTAAATTTATATTAAGGCTAAGCATACAAAATTATTATATCTAAATCTAATTTATATAGTAACAGATTACTTACTCTTGTTGACGACTCAGATTAAATTCACCAACTGCTTGTGAAATAATCATGAACAACTGCGAACACCACCACTATGACTACACCAATATGACTCTGAGACTTCTAGAGGTAGGAAACTGGCGGGAGTCTAGAGGGAGCCTTCAGGGGAATTCTCTAAGAGTAGGAGAATGAATGAGATGTCTTTCACCCCACCCGAGGGGTTCTATTTCTAGAAAAAGAATGTCATGAATAAGATCAAATCTATTATCTTATTCATATCTAATTTTAATAAATAATTAATTAATTACCCAATTAAATATCACATATTTAATCTTAGGGATTTTATTAAATTATTTACATTAATATGAATCCAATCCATATTAATTATTTGAACTCTTTCAAATATTTTTCTCAAGAATTAATTTTGAAATTAATTCAAAATTATAAAGTTTCATAAACTTTATATTATATATATTATATGATTCCCCTAAATAAATTGAACACTTTCAATTCACAATTTATACTTAATTGCCTCAAGTCTCTTTACGAGCTACCAGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATACGAGACTATTAACCAAGTTAGTCAACATTCGTTAACTGTGGGTCACTCCACTAAAGACCCACAACTGCAATCTTCTCAGTGTAGAATATTTCTGTGTCCATGGATATCGACCAATGCAGTAAGTCAATCCTTCACGTGTGTTCGTAACACCAGCTGGGTCAAATTACCGTTTTACCCCTGGGTTACCTCTGGTTCCTTAAGTACAACTGATCCCTCTAATGAACAAGTTGTTTAGGGTCCAACCACTAAGCAGGACTTCCTCTCGGGCCAGGAAAGGACGTCGCATCTTTGTTCAAGCCCTGGAATCAGCCCTTAA

mRNA sequence

ATGGCTTCCCATCGAGTTTCGATCTTATACGATAGCGTCTGGACACTGATTCCGTCACAGACCTTATTAGACTTGATGCTCGAAAGAAAATTTCACAAATCTACTAATGGTGAAGACAAGTTTCAGATTATAAGCTTTTCTGAGAACGAAGATCTTGTCTGGATGTTTGCTGGGGTCCTTAAAGACGAAGTTTTTAAAGCATTTTACATTGTCAAAGAAGATGACGAAAACCAGGGTGCTAATACCTTCCATACGCACAAAAGACCTACAGGATTGGAATTCCGTAATTCCGTAAAGCGGAAGCGTGATTGGGATCGATTTTCTCTTTACGAGCTACCAGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATACGAGACTATTAACCAAGTTAGTCAACATTCGTTAACTGTGGGTCACTCCACTAAAGACCCACAACTGCAATCTTCTCAGTGTAGAATATTTCTGTGTCCATGGATATCGACCAATGCAGGTCCAACCACTAAGCAGGACTTCCTCTCGGGCCAGGAAAGGACGTCGCATCTTTGTTCAAGCCCTGGAATCAGCCCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTTCCCATCGAGTTTCGATCTTATACGATAGCGTCTGGACACTGATTCCGTCACAGACCTTATTAGACTTGATGCTCGAAAGAAAATTTCACAAATCTACTAATGGTGAAGACAAGTTTCAGATTATAAGCTTTTCTGAGAACGAAGATCTTGTCTGGATGTTTGCTGGGGTCCTTAAAGACGAAGTTTTTAAAGCATTTTACATTGTCAAAGAAGATGACGAAAACCAGGGTGCTAATACCTTCCATACGCACAAAAGACCTACAGGATTGGAATTCCGTAATTCCGTAAAGCGGAAGCGTGATTGGGATCGATTTTCTCTTTACGAGCTACCAGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATACGAGACTATTAACCAAGTTAGTCAACATTCGTTAACTGTGGGTCACTCCACTAAAGACCCACAACTGCAATCTTCTCAGTGTAGAATATTTCTGTGTCCATGGATATCGACCAATGCAGGTCCAACCACTAAGCAGGACTTCCTCTCGGGCCAGGAAAGGACGTCGCATCTTTGTTCAAGCCCTGGAATCAGCCCTTAA

Protein sequence

MASHRVSILYDSVWTLIPSQTLLDLMLERKFHKSTNGEDKFQIISFSENEDLVWMFAGVLKDEVFKAFYIVKEDDENQGANTFHTHKRPTGLEFRNSVKRKRDWDRFSLYELPVGPNGPTDQKLQRYETINQVSQHSLTVGHSTKDPQLQSSQCRIFLCPWISTNAGPTTKQDFLSGQERTSHLCSSPGISP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 170..192

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0001334.1Lag0001334.1mRNA