Lag0000813 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0000813
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 17248888 .. 17257975 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0000813
SyntenyLag0000813
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGCTCAAATCTTCTTCTTCTCCTTTCTCCCTAAAAAAGATTCTTCTAAAAACTCTCTACACTAAGCTCATGCTCAATGCCTTTGTTGTTTCTTCTTCCTCACTCCCTCCATTTTATACTACAAAAGGTTGCTAATTTTGGGAGGAGGGATGGGTGAGACTTTAATGGGTAGCCATCCATGAATACCATTAGAATATGAATGGGGGTAAGAATAGGGGAAGAAGGAGAGTGGGGTGGAGACAAAAAAGGAAGAAGAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAGGAAAAATAATAATAATAATCATAAATAAATAATTAACCAAAATTAAAATTACAACTAAACTTTATAATTAAAAATAGAATGAAATTAAAACTTTTTATGCTATGGTTTCATTTTAAAAGAGAAACAAAATTAAAATTACTCAAACATTATTAAGAATTCGCCGGACCAAATACGGTGTCTACATGTTATATTAACATCTTCACTGCACAGATCAGAACAGTTATAGGGATAAGGGATGTAACGGCCCGCGTTTCGGGATCGACCCATTTTGGGATCTGTCGAGCGTTCTTATTCTAATTTGAAAAATTAGAATTAAACTTAGCCTTGGGTCGATAAATTAAATTTCTATAATTTAGGGAAAATAGATTTTTAATTAAATCTTTAAATTCCTAAAGTTTGGAGGTTTAATATTTGATATTTTAAATATCAAAAGACCAAAATTCTTAATAAATTGAGTTATTTTCTTTTCCAAATCTTTTAAGGGTTAAGTTTGGGATTTTAAATGAAATCCTAGGTAAGACCTAATTTGCTATTTAATTGGGTTTTCTTTCTTAGGGTTTTATTTTAAAAGAAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGCTAGAAAAAAAAAAGAGGAGAAGCCCTAACTCTCTTCTTCCCTCTCCTTCACGTTGAAGCCATCGATCCCCCCTGTGAATTTCTTCCGCCGGCAGCCTCCCTCCCTGTTTCTTTACACCGCCGCCGTCTTACTCGTCGCCATCTCCATCTCTCTCTCCCTCTCGCATGTTTTTCCGTTGGCAACAAGACTCGTGAGCAGTGGCCGTTTTTCTCCTCCCCTCTTGTAGCACCGGTGAACCCCGTGGAACTCGTGTTTGGCGTCTTCTCCGAGCGTGTCTTCTCGCTGCAAGAAGTCGTGGGTCCGTCTCTCTCCCTCTCGTGTGGTTGGTCAATTCGAGCAGCAAGCCCGCACGATTCTAGTCCCTTTTCGGTGTCATTTGGACGTTTTCGGTAAGTTTAGCTTCGTTCCACTCAATTTTCTTCAAGTTTCAAGCTTACCCATTCAGATTAGGACCTTGGATTGTGTTTAGAACATGACCCATTCATTATCAACTCTAGAATTTCAGGGATAAGCCTTGTTCGATCACCGTCCAGCTGTAAATTAGACTAAAAGCAGGCTTTGAGCATCCACAATCCGTGCGACCTTGAATTGAAGTGCTCTTAGTCCAACGGCTTTGGATTGTCGTTTCTGGAGCCTCTCGGTCATTGGGCATCAAGCTTCAAGGTCATTTAGGTGCTTTTCGGTAAGTTTCCTCGCCCTTAAACTTTTGAAATTCGTTTAGGTTGGCTTTGGAAAAGCTTATAAACCATGGGTGTTCTCTTAAGTTTTAGTTGGAGCCAAATAGAATCCCGGGCAATGCATATTTGATAGCGCAATTTATTGAGTTATATTTTATACTATTTTAGTGTTAGTTTTTAGGTTTATTTGGCCGATTTTATGTCTATTTGCTTTTGTTTTGTAGGAATCAAACATTTCAATGGAAATTGATGTTTTTGAAGATTACCGATGAATTGGGAGCGGTTTTGGAGAGAGAAAGTCAATTTTAGAGAGAGAAAAACGGATAAAACAGTGAGGAGACCAATGGAGCTTGATTTTGGGAGCTTGGATCGTGAGGATCGTGACAGGAACGCGCAGGAATCACGGCTAGCGAGTTTAATCTTTCTCCCTTGTTTCTTGTACTGATTTTTAGCATGTATTGGACTGGTTTTGATTGTATTTTCAGAGACATGACTAGCTAAATTTCGTTTCTTAGGGGCTTGATGTAGCCAATAGATTGTATGGATTGATTTAGGGATTTTTTAGGACGTGTAACGCGTTTCATTTATGCAATTTGAATGCTTAATGCTTATTATCTCTTGATCACGGATTGTATGTTTTCGTTTCTGAACTAATTGCTCGAGAGATGGTAGTTTAGATTATACTATCATTTGCATGACTTAGGTGATTCTACAATCGGGAGATTTGGGGTTGCTTGAGAAACCGTTGTAAGGATTGTTTTTAATGCTTATGCTTGTTGTTGAAATTAGATAGGGATATCAATTTCTTAATTTGCATAAATAATTAATTGTACTCGGGAGAGACTTTTAATAATTATTAAATCCTTGGTTTATGAAATTGTTACGTGTTCGTTCATAATTATTCTTTGAATTAATTCATGCATCTAATAGGTGAAATCAATTCCCTAAGGCTTTTCTCCATTGAGTTTCCATATTTTTATTGCTTTTAGTAGTTTTTCGATTATTTGCATCTTTCTCGATTGTTTTCTCTAAATAAAACTAGGCGAATATACCTTTAGTAATTAGGGGAACTAGAAAACCAATTCAGAGGACGACATTCGATTTTAAATCACTATATTATAACTTGGGCCCGTACACTTGAGGTTAGCTATTTGCGTATCAATATTCAAGGAGATTTTGTGCTGGTCGGCCAGTTCTACCAAGCATCTCATCTCGTAGCGTAGTTCGATAAGTGTTAGAGCTTGTTAACCTTGTTTGAAGTTTGGTTTTGGTGAGAAATTCTTGTTTAAGCATTCCTTGTCTGAATTAAGTTGTTGAGCCGATTCCGACCCTTAAGCTTTAATCTGTATATTTAGGAGCTTTTCGAGTTTTAGGGGCTTTTGAATTGTTCTTCAGAGTACTCGTAAGTTATAAGTAGTTACTATCTGATGAAGTCTGTTTGATTGCATGATGCACGCTGTTTGTTTACTCACTTTATAATTGTTCTCTTGCTTCTTGCTTCTATATATATTTATATATATATGAAATATATGAACTGTTGCTTATGATGATTGTTGCAAGGCATGTTGCAATTCGTGGGTTAAGCATGAGTCGAGAGCATGTTGTATGTATATGCTTGGTGGGCATAGTACATGAGTCTAGAAGCAAGTTGTAGGGCATATGTATTCTAGATAGGTGTGAGAAAAGAGGGCAGGGACCTAAAATGTGAGAAAAGGGAAAGATGGGTGAGTGTCAGTGCATCTCGGTTACAAATGGTCGAGGGGTGGCATGTCACCATTGGTTTAGAGAGGACTAGCTCTGTGATTGAGACATCAGGGCCTCAGGTATAAATGGTTGAGGGTTGATATTGTTTCGAGGAAAGTAAAGTGATTATCAAGGCCTCGGGTATAAATGGTCGGGGATTGACATATCACTAGTGGGTGTTGAGGCGTCGGGTATAAATGGTCAAGGGTTGATATGCCAATGTTAAATGAAGAGAAATGATAACTCTCCAAAAGGAAGTTATTTAGGCCTTAGTTTTATAGTGTTTTGTGTGTCATTTGTGTTAAATAGGGTTGCTTTTAGATGAATATTATATGTTGTAACCCATATAGAAGAATGGATGTTTTGGAAGTTATTTTGTGTAGAATATAATGTTGAGCGACTTGAGGGGGAAAATTTTGTGATCCAATAAAGCAAGGAGCAAAACTGCCACGTAAGCTGCACGTAATCCATTTTATGAGGTGGCGTTAGCTGAATTAATTTCGGATCTAGGAAGCTTGGAGAGCCCTCCACGTGTAAAGTTTGACCTAATTAGGGCTTGACTCCATTCTATAAAAGGAAGGAGCCGTCTCAAGTAAAAAACATTCCAATTTCGAGAAAGGAAAGTCCTATTCCATTCGTGGAGTCTCACTTTCCATCTTTGGGAGCCGAATGGAGAAGGAAAGATTGGAGACTTCAAGAAGACCATCAACTACGGACCTAATGAAGGGGATTAATCTTTTCTTGTAATTTCTTGTAGTTATGGATGCACATACTCAGATTTTAGCGTGTGTTATGATGAACCTTATGAACTAAAATTACTAGGTGTTGGTTAGGGATTATGTAATTGTCGTGCTTCATTCTCTATGCAATATATGTTGATTTGAGCATCTTGATTAATTGTTGTGTCTATTTCTATTTTGTGCCCGCTGGTGCGTCGGAGGTTGAATGGATGGATGTGAGATTAGATGACAAATATTAATAAAGACAAATTCAACCAACCTTTAGTGTAAGTATACACTGTCGCACGTAGTAATAAAAAACCTTAGAAGTATTCCAAGGGTATCGATCCCACGAGGACTAAACTGGAAATTCAGATTTGATGAAGAAACTGCTCAAATGATTGCTTTTGAAAAAGGTAACCAAAGAAAATAAGTTGATTGATTGGGTTTTCGAAAAGATAAATAAAACAAGCAAGTAAATAATAAAGAATAACAATAAGAAATAAACGAGGCATTCAACATGGATTCATCCCTAAGGCAATAACCATAGTCATGCAATCTCTAACTTAAGTGTATTCAATGCATTGGACCAAATTTAACTTCTATTTGGCCCTTGCTCCCAAGAACCGTTAGAAGGCTAAGCGAGTACTGTTATGCACATTTTTGTGACTCGACTCCGACATAGATAATTCACGAATGCAAGCTATAACCCTATAGCCGATATAGGGTGCCTTAGGCAGCTTGCCCTATACCACCGAACAATCTCTTTCGAGCTTTTTCTCCTATAACACCTTTATGAGAACCGATATTGTTTGTCCCTTTCGAGATCAAACTCACATAGCATGCAAAGTCTAAGTGATCAAGTTAAACTCAACAAGATTAGAATGATAATCAATAAAGAATGACATGCATTGAACACAACTTAAGAAAATAAAGCACTTCCAAGCCATTAAACCATAAGGGAATTCACCATATTG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mRNA sequence

ATGCTCAAATCTTCTTCTTCTCCTTTCTCCCTAAAAAAGATTCTTCTAAAAACTCTCTACACTAAGCTCATGCTCAATGCCTTTGTTGTTTCTTCTTCCTCACTCCCTCCATTTTATACTACAAAAGCCATCGATCCCCCCTGTGAATTTCTTCCGCCGGCAGCCTCCCTCCCTGTTTCTTTACACCGCCGCCGTCTTACTCGTCGCCATCTCCATCTCTCTCTCCCTCTCGCATGTTTTTCCGTTGGCAACAAGACTCGTGAGCAGTGGCCGTTTTTCTCCTCCCCTCTTGTAGCACCGGTGAACCCCGTGGAACTCGTGTTTGGCGTCTTCTCCGAGCGTGTCTTCTCGCTGCAAGAAGTCGTGGGTCCGTCTCTCTCCCTCTCGTGTGGTTGGTCAATTCGAGCAGCAAGCCCGCACGATTCTAGTCCCTTTTCGGTGTCATTTGGACGTTTTCGTGCTCTTAGTCCAACGGCTTTGGATTGTCGTTTCTGGAGCCTCTCGGTCATTGGGCATCAAGCTTCAAGGTCATTTAGGTGCTTTTCGATAGGTGTGAGAAAAGAGGGCAGGGACCTAAAATGTGAGAAAAGGGAAAGATGGGTGAGTGTCAGTGCATCTCGGTTACAAATGGTCGAGGGGTGGCATGTCACCATTGGTTTAGAGAGGACTAGCTCTGTGATTGAGACATCAGGGCCTCAGTGTGGGGAATGGTTGAGGAGCTGCGAAATAGGTACTGGAAGGTTGCCCAATCGGTTTTGGGGTCAAAACAACCAGTCAGGTGCGAAGAAGACTCGCCAACAACGAACTGCGCACGACTCGGAACGACTTCAGTTTTTCCAGAAATACGGACCATTAGGTTCCACCAAGCTCATAAAGGGTATTGAGAATCCTTCTGTGTCCACGGATATCGACCATACCGGATACCCTCACTCACATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGTTCAATGCATCTGTATCGAATACAAAGCGGGTCGTATCACATATTGTCGTCAGGATAAGGAAATGGTTGATTGGAGCTATAATGCAATATCAGAGTTAATCGGGTGCTCGGGGCGTGAAAAGATGCAAAGGAATGAAAAGAGTAAAAGTGGAGAAAAGTCAAATCTCGGTCAACAGCAGGCTAGCGTCGCTCACATTCCATATCAGATTAGGCGCGTAAAGCTTACAGCGTCGAGACGCTATGATAGGAAGCGTCCCGACGCTACTGTTTTTCCTTATTCAAAACGCGCGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCTCAAATCTTCTTCTTCTCCTTTCTCCCTAAAAAAGATTCTTCTAAAAACTCTCTACACTAAGCTCATGCTCAATGCCTTTGTTGTTTCTTCTTCCTCACTCCCTCCATTTTATACTACAAAAGCCATCGATCCCCCCTGTGAATTTCTTCCGCCGGCAGCCTCCCTCCCTGTTTCTTTACACCGCCGCCGTCTTACTCGTCGCCATCTCCATCTCTCTCTCCCTCTCGCATGTTTTTCCGTTGGCAACAAGACTCGTGAGCAGTGGCCGTTTTTCTCCTCCCCTCTTGTAGCACCGGTGAACCCCGTGGAACTCGTGTTTGGCGTCTTCTCCGAGCGTGTCTTCTCGCTGCAAGAAGTCGTGGGTCCGTCTCTCTCCCTCTCGTGTGGTTGGTCAATTCGAGCAGCAAGCCCGCACGATTCTAGTCCCTTTTCGGTGTCATTTGGACGTTTTCGTGCTCTTAGTCCAACGGCTTTGGATTGTCGTTTCTGGAGCCTCTCGGTCATTGGGCATCAAGCTTCAAGGTCATTTAGGTGCTTTTCGATAGGTGTGAGAAAAGAGGGCAGGGACCTAAAATGTGAGAAAAGGGAAAGATGGGTGAGTGTCAGTGCATCTCGGTTACAAATGGTCGAGGGGTGGCATGTCACCATTGGTTTAGAGAGGACTAGCTCTGTGATTGAGACATCAGGGCCTCAGTGTGGGGAATGGTTGAGGAGCTGCGAAATAGGTACTGGAAGGTTGCCCAATCGGTTTTGGGGTCAAAACAACCAGTCAGGTGCGAAGAAGACTCGCCAACAACGAACTGCGCACGACTCGGAACGACTTCAGTTTTTCCAGAAATACGGACCATTAGGTTCCACCAAGCTCATAAAGGGTATTGAGAATCCTTCTGTGTCCACGGATATCGACCATACCGGATACCCTCACTCACATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGTTCAATGCATCTGTATCGAATACAAAGCGGGTCGTATCACATATTGTCGTCAGGATAAGGAAATGGTTGATTGGAGCTATAATGCAATATCAGAGTTAATCGGGTGCTCGGGGCGTGAAAAGATGCAAAGGAATGAAAAGAGTAAAAGTGGAGAAAAGTCAAATCTCGGTCAACAGCAGGCTAGCGTCGCTCACATTCCATATCAGATTAGGCGCGTAAAGCTTACAGCGTCGAGACGCTATGATAGGAAGCGTCCCGACGCTACTGTTTTTCCTTATTCAAAACGCGCGTAA

Protein sequence

MLKSSSSPFSLKKILLKTLYTKLMLNAFVVSSSSLPPFYTTKAIDPPCEFLPPAASLPVSLHRRRLTRRHLHLSLPLACFSVGNKTREQWPFFSSPLVAPVNPVELVFGVFSERVFSLQEVVGPSLSLSCGWSIRAASPHDSSPFSVSFGRFRALSPTALDCRFWSLSVIGHQASRSFRCFSIGVRKEGRDLKCEKRERWVSVSASRLQMVEGWHVTIGLERTSSVIETSGPQCGEWLRSCEIGTGRLPNRFWGQNNQSGAKKTRQQRTAHDSERLQFFQKYGPLGSTKLIKGIENPSVSTDIDHTGYPHSHVSYMDALVQCICIEYKAGRITYCRQDKEMVDWSYNAISELIGCSGREKMQRNEKSKSGEKSNLGQQQASVAHIPYQIRRVKLTASRRYDRKRPDATVFPYSKRA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 359..382

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0000813.1Lag0000813.1mRNA