IVF0023196 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATCCAGAACAAACGTTTATTCGAGTTCAGGAACGGTTTTCCCAGATGCTGACTCCTAAAGTCAGAGCCACTCTGGAGTATATGAATCTCTGTATAGCCATTACTTTGTTCTGTATTCTTGTGGTCATGCACGCGAACTACGTACAACAGGTTCTTCTCAACATTACGATTTGATTTATATGTGTTTTGTATTTTGGGAGTTTTCTGTAATGTTTTTTAGTCCTGTCTTTAGGGTTGCAATATTTGTTTCCAAATTTAGTGACACTGCTTGTCTCTATGTGTGTGTGTATATATATTTTAAATCTAGTTCTGATTTTCGGAAATGTTTTTTTTTTTTTTAAAATTTTCCTCTTACTTTTCTTGACTTGGATTGAGCCTTGCAAACTGTGGTGTAATGTGTGAGATCGTGGCACTTCAATTATGGGTATTGTAAGTTATCGTTATAAAGTCTTATTGATGAATTCTGGATGCAGTCTTTTAGAATGAAGATGCTGAAGTCGGGAGGTCATAATCTGGTTGTAGTGGCTTTCAGAATGTTTGAATTTGAATGGTTTAGGTTTCGAGTTGAATTCTTTAGTGTTCAGGACTCTCTATGTTGAGTTCATAAAATGAGTTCTGAAAGAGAATGAAATGTAGAGACTCTATTTTGAGTTGAACTCTTTAATTTTTAGAACATGAGTTAGACATATGGTAGACTAGCTTCTCCATCTCTCTTTTAATTATTGTTTGGGCCCTTTCTTGTTATGTATGGACTACAGGTTAGTTATTTAGTTTTTATGTTGTTTTAATTAAGCTTTGTTCTTCCTGCATTCAAAGCCTGGTTGTTCAAGTGAGCTCTCTGGAGTTGAGACAACAGAAGCGCAACTTATTCAAATTAAGGTAAGTCTTGTCTCCAAGTAGTCAAAGTTTGAACTGTTTGTTGCTTTTGGTGATCGTTATTTGATGATTTTTGGGAGAGCAAGAATTTCATACACCAATGTTGTCATGGCTTTTCTTTGAAGGCTTTTTGTTTGATAAAAATGAGAGATTATCAAAGACTCATATACTTCTGTGAAAGACTTTATGTAGATTTGTTTTTTATAAGAATTCTATTTCCTTCTTTTTCTTTTTAAAAAACTGTAATACTTTTCTGATTTCTGCCGATGCAATTCCTTTTTTGTTTGTCCAATCGGTATCTTTGCAATTTATCGTTCCTGCTTTCCATCTCACTCTCTTTGATTACGAGTTATAATTTCCTGTTTAGAAAATGTTTGCTGTCGTTGAATCTAATTTCTTGTTTTGTGCCTAAGAAATTTCTTCCATTTTTCTTTGAACTTCTGTTGGTTTTTTTCCTAACCATCTTCTTTATCAATAAATAAACGTAAAAATGATTTTTATCAAATTATATGTTTCTAAAAACAAACATATAGACTATTCCTAATAATGGTCTCCTGATCATGGTATGTTATGTTTGTTTCTTTTCTCCCTTTCCTGACAGACAAGAAGAGGCACTTATTCCTAGAGACTGAACATTGGAATTAGATGAAATTTTTATTCTCAGTACTCAGTAGTAAAAATCTGATTTACTTTTCAGTATGATGGTCAAAATTAGAAATGCTCGAGTATTCTACTTTCTTTAGTTTATGTTCTTGGATTTCTACTATTGATTGTTTTAGTTTATAAATTTCTATTAGTCTACATCTTAAATTACTTTTCCTGCATTTTGTCTTCCGTGCTTACTTACATCTACTTCAGTGTATAACTGATAAATCTAAACTTGTGTCATTTTTCATAGATAACGACTGCAGGCTTGTGGTCGCAAAATGAATCTGAACTTAACATTCAAGATGTCCCTGGTGGGGAAACTGTGAGAGAAAGTCTGGAAGTGGCAAATGATGAGGATGAATTAACATTTTTGGCTGCCAAATTTTGGTTAAATTGGTTTGGTTCAGGTGCTAGGAGGGGTAAGTTTGCACCAAAGCTCTGGAAATCAGATACAGAGATTCTAGAACATCAAGCAGAGAATACTTGTGGGGATCAATGCTCAAAAGCAGCAGTTGATGATACAGTCATCAAAGAAAAAGAAGAGTTCCACATTAGTTTCCTGATATCAGTCAAGGAGACCTTTAAGGCAGCAATTGTTCACTTTGGTAAAAGGTGGAACCGACGAATTTTATTTATTTGTAGACATACAAAGCAGATCCTGACCAGCTTGTGGAAGCTATCTGTGAGTAAATTATTGATGGCATTACTTTAATCGTAAGGTTCAAGCATGCTCCTTTATTGGTCAATTTTAGTTTCAATATTTTATTGAGTTAGCATTCTACTACAACTGTAATATAATGTAAAGCTCGTAAAAGGTCCTTCCTTTTTGTTTTAGATTATTATTATTTTATTATTTCAAATACAATAATGGGGTTTATTTTCCTGTTCTCCTGTTTTGTTGTTTGTTCTAGACTTCTAAAGTCATTTTATCGATAGACGGGGAAGGGGAGATGATTTCTTGGAGTTGGTACTTGGGATACTCCATTTTCCCTAAATTTTCTTGATTCTTATGGAATACTTAATTGAATAGGGTCCGACTCAAAAAATTAGAAACATTCCTTTTATCTGATTGGATGGAAGTAAATGTTTAACCTCAGAAAAATTCTTGCCTTTTTGGACCCATAAAAAATATTGTAGCTTCGCTCCAGCTGGATAAACCCTCCGAATTGCCTTGGGAGCTGTTATCCACAAAGCCATACCGCTTCCTTTGAAAGAATTTCCTGTGAGATTGCACCAAGTCTTAAGATCTCATGCGACCTATTGGAGCCCATTATAGAAAATATGCCATTGGTGTTTTGGCAGTAATGTATCTCAGGACAGAGCAATGGGGCAAATAGCCACAATTGGATTCTATTGTTTGAATTGGTTTTACCAAGTTAAGGATCAAATCAAGAATTTAACCTCCACTAGGGTCTGTTAGATTTTATAATATGAATCGAAAAACCTTAGAAGAGGTGGAGGAATGGTGGATAAGAGATTTGCACATATATTTGGAGAAAAATGGTCCACTGTTGAGGCATGCACCTTCCTCGCGTATTTATTTACATTCTGGTTAGAATGCTTTTTTCTCCAGCATGGCTTTGCTGAAATTCTCTCATTTAGCTGTCTCTTAAATACCATCCCAACGTTTCATTGATCGTTGAGGCATGCACCTTCCTCATGTATTTATTTACATTCTGGTTAGAATGCATTTTTCTCCAGCATGGCTTTGCTGAAATTCTCTCATTTAGCTGTCTCTTAAATACCATCCCAACGTTTGATTGATTGTTGAGGCATGCACCTTCCTCGCGTATTTATTTACATTCTGGTTAGAATGCTTTTTTTCTTTTCCAGCATGGCTTTGCTGAAATTCTCTCATTTAGCTGTCTCTTAAATACCATCCCAATGTTTCATTGCTCCAAACCTCGAACTCTTTGGTTGTGTAAAAGAAACCTCATATACACTAAACAGTTCTCAGAAAACTTTATCCTCCTACCAACTTTAAGCCAATGAGCTGGGAAATTAGCCTCTTCACGTGGCAATAAATCTTCAAGGGTTTGTCTCACATGTCACAACCTTGGAGATCTCTTTATATTAACGACCTCTTAAGTCACCACTCAACTTGCCAATTTGAGTTTACCTCAGTTAATAAGACACCAGATTACCATCTTGGTTTGACCCCTACTTCCTGGCCCCAAAATTGTTTTACTCAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATTCACAACTAACCCAAAAGGTTACCTGAGGGTTTAGAAATTTGCAAAATACCCAACGAATGGGTTTCTCTTTGATTAGAAATCTGCAAACTACCCAACAAATGATGTATATATATATAATGAAGGAACTAGCCACATCTCTAATTAAACAGACACCAAATGGCCTAGAACAGCCTAAGCTAATAGATAAGAGGACAAGGTGGCCCTTCTATTTGACGTTACGTAAAGGCCCTCCAATCTAAGTTGATGGTAATAGGATTGCCAAAAAAGTTTGTGTTAGGTACTCCTTTTCTTTTTTTGAAATGGCAACAAGTCTTTGAAATGAGACGAATGCTCAAAGCACAAAGAGAGAGAAAATAGTATAGAGAGCTAAGGATTAGCAGGTGTACCCGAGCATCTTAACTAGGTTGACATCTTCTTAGCACCCTCATCATATCCATAATTGATCTAAACAAGCAAAAACCGAAAAACAAGGAAACAAGAACACAAAATCAAAATAGAACAATACATTGCTCAAACAAAACTTAAGTTGGAAAAATAAAAGCACACCCATTTGAACAAATGTCTTGAATGGAAAAGTCTTTGAATTGCTTGGAAAAAGTGCACCAAGGTGATGAATTTAGCTGAGCTACTTCAAAATGATCCATCCACCCAAGATGTATGGTGTGAAACACTCTTTGATTCCTTTGAAATCAAATTTCATCCAACAGCGCGTTAATCGCATTAGCCCAAATTAACCAAGGGCCTACTTTCAAAACTGGACCAGTAAGGAGTTGCCTAACATTATCCCCAAGCGACACTAAAAATACCGGACAGACTCCACCAGCACCGAGCAGCGTTGATGTTGGGTACAGTACAAGGTTACAAAAGCATTTAGAAAGAGTTAAACTTATCTGAAGATCCTAGCACTTTTTTTCTTTTCAAATAAAGCCTAAGATTGCTTTAGAAGGCATGGTCCCTAGCACTTTGGCCTTTTTCTATAAACCACCACTAGAGGGCACCTTTGAAAGCTGATGTTTGACAGGGTTCAAAGCTTTTGTAAAACTTCAGACTAGGAAAAAGATGAGCTATTTTGTTGAAGTACAACTAATAAGCCAACCCTCATAAAGTTGTAGCCTTAAGAAGGTCAATAACAAAATGCTTGGACCTCCTCCATATGCAAGTACATACACACTTAGATGATAGTTTGTAGAACTGGTGCGTGGTTGGTTCACTGGGCTCATGTCTTTTGATGCTTGGTTATTTTTAAA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ATGGATCCAGAACAAACGTTTATTCGAGTTCAGGAACGGTTTTCCCAGATGCTGACTCCTAAAGTCAGAGCCACTCTGGAGTATATGAATCTCTGTATAGCCATTACTTTGTTCTGTATTCTTGTGGTCATGCACGCGAACTACGTACAACAGCCTGGTTGTTCAAGTGAGCTCTCTGGAGTTGAGACAACAGAAGCGCAACTTATTCAAATTAAGATAACGACTGCAGGCTTGTGGTCGCAAAATGAATCTGAACTTAACATTCAAGATGTCCCTGGTGGGGAAACTGTGAGAGAAAGTCTGGAAGTGGCAAATGATGAGGATGAATTAACATTTTTGGCTGCCAAATTTTGGTTAAATTGGTTTGGTTCAGGTGCTAGGAGGGGTAAGTTTGCACCAAAGCTCTGGAAATCAGATACAGAGATTCTAGAACATCAAGCAGAGAATACTTGTGGGGATCAATGCTCAAAAGCAGCAGTTGATGATACAGTCATCAAAGAAAAAGAAGAGTTCCACATTAGTTTCCTGATATCAGTCAAGGAGACCTTTAAGGCAGCAATTGTTCACTTTGGTAAAAGGTGGAACCGACGAATTTTATTTATTTGTAGACATACAAAGCAGATCCTGACCAGCTTGTGGAAGCTATCTAATGTTGCAGGGATAAATTTGAGTCTTGATGTCTCCAAGTGGTCACACATTCTTCATCTGGACAGGATCCAGTCAGCTGCAGTGCAATGGCTCGTGAGAAGAAGTAAAAGTTTTGAACCAACATACTTGTATACTAGGGAAAAGTCTAGGCATAATATACAGACAGTGAATATAACTATACCAGCTCAACATTCATGCTTTGGAAACAGATGGCAGCAACTTCTCATTAACAGATTTGTTGGGTATGATACTATCTTGATGAACAGCTTACTTACCTTTCCAGGTCAAGGCTATCTTTACAATTACCAAACAAAGGAGTTTTACAATCTTATCTATGCATTTGAGCCGCCAGAGGGCCCTGCCAGATTTGGAGACTACTTTGTGACCAAGTGTGGTGTGCTCATGATGTCTCTCTTCGTTTTCTTCACTACCACCATGTCGGTGTCATTTACATTAAGGGAAACACAGACTCGCATGTTGAAGTTTACAGTGCAGCTTCAACACCATGCTCGACATCAACTCCCAACTTTTCAGTTGATTTTTGTGCATGTAATCGAGTCACTTGTCTTTGTTCCAATTATGATTGGTATACTATTTTTCCTGTTTGAGTTTTATGACGATCAGCTCTTGGCTTTCATGGTCTTGATCCTGGTGTGGTTAAGTGAATTATTTACACTAATTAGTGTACGGACTCCAATATCGATGAAGTTTTTCCCCCGCTTTTTTCTGCTCTATTTTTTGGTTTTTCATATTTATTTCTTCTCGTATGCTTACGGTTTTTCATATTTGGCTCTTTCTACAACTGCAGCCTTTATGCAGCATTTGATTCTATATTTTTGGAACCGCTTTGAGGTACCGGCTTTGCAGAGGTTCATGCAAAACAGACGATCTCAGATACATCAGCATCCAGACTTCCACATTACCTCTTCTACAATTCTAGCCTCCACATTGCATATCACAAGACCTGCATCTGGAACCACGCACACTGAACCTGGAGGCGGGACCGGAGAAGTTCCCCATCCTCTAGAGCAAACTGAAAACAATAGTCTCGATAGAACTGGGGACAGGATTCAAATTCCAGGACAGCATGAACTTGGGCAACCGAGGAATGTGAATTCTTTTAGTTCTCTGTTGTTTTGGATCTTAGGAGGGGCTACATCTGAAGGTATTAACTCATTGCGTTCGATATTCCGAGAGTCGAGGAACAATGGTCAAGTTTATACAGGATCACCTACTGAGGAGAACAATGGGAATCAGAATGTTCAGTAG MDPEQTFIRVQERFSQMLTPKVRATLEYMNLCIAITLFCILVVMHANYVQQPGCSSELSGVETTEAQLIQIKITTAGLWSQNESELNIQDVPGGETVRESLEVANDEDELTFLAAKFWLNWFGSGARRGKFAPKLWKSDTEILEHQAENTCGDQCSKAAVDDTVIKEKEEFHISFLISVKETFKAAIVHFGKRWNRRILFICRHTKQILTSLWKLSNVAGINLSLDVSKWSHILHLDRIQSAAVQWLVRRSKSFEPTYLYTREKSRHNIQTVNITIPAQHSCFGNRWQQLLINRFVGYDTILMNSLLTFPGQGYLYNYQTKEFYNLIYAFEPPEGPARFGDYFVTKCGVLMMSLFVFFTTTMSVSFTLRETQTRMLKFTVQLQHHARHQLPTFQLIFVHVIESLVFVPIMIGILFFLFEFYDDQLLAFMVLILVWLSELFTLISVRTPISMKFFPRFFLLYFLVFHIYFFSYAYGFSYLALSTTAAFMQHLILYFWNRFEVPALQRFMQNRRSQIHQHPDFHITSSTILASTLHITRPASGTTHTEPGGGTGEVPHPLEQTENNSLDRTGDRIQIPGQHELGQPRNVNSFSSLLFWILGGATSEGINSLRSIFRESRNNGQVYTGSPTEENNGNQNVQ Homology
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GWG6 (Membralin-like protein At1g60995 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g60995 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 719.9 bits (1857), Expect = 2.5e-206 Identity = 410/664 (61.75%), Postives = 474/664 (71.39%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4ZIN3 (Membralin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM259 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 2.4e-15 Identity = 75/262 (28.63%), Postives = 135/262 (51.53%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CIV2 (Membralin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tmem259 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 1.0e-13 Identity = 85/316 (26.90%), Postives = 149/316 (47.15%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3M8 (uncharacterized protein LOC103496115 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1237.6 bits (3201), Expect = 0.0e+00 Identity = 637/668 (95.36%), Postives = 637/668 (95.36%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LC25 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G219210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1207.6 bits (3123), Expect = 0.0e+00 Identity = 625/669 (93.42%), Postives = 629/669 (94.02%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7A5 (uncharacterized protein LOC111017680 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1092.8 bits (2825), Expect = 0.0e+00 Identity = 579/671 (86.29%), Postives = 599/671 (89.27%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JBM5 (uncharacterized protein LOC111482996 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482996 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1075.1 bits (2779), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/648 (86.73%), Postives = 585/648 (90.28%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E744 (uncharacterized protein LOC111430551 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430551 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1068.9 bits (2763), Expect = 8.1e-309 Identity = 559/648 (86.27%), Postives = 582/648 (89.81%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. NCBI nr
Match: XP_008456073.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496115 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1233 bits (3191), Expect = 0.0 Identity = 637/668 (95.36%), Postives = 637/668 (95.36%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. NCBI nr
Match: XP_004146263.1 (membralin-like protein At1g60995 [Cucumis sativus] >KGN57586.1 hypothetical protein Csa_010225 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1203 bits (3113), Expect = 0.0 Identity = 625/669 (93.42%), Postives = 629/669 (94.02%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. NCBI nr
Match: XP_038883767.1 (membralin-like protein At1g60995 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1176 bits (3041), Expect = 0.0 Identity = 612/669 (91.48%), Postives = 620/669 (92.68%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. NCBI nr
Match: XP_022149202.1 (uncharacterized protein LOC111017680 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1088 bits (2815), Expect = 0.0 Identity = 579/671 (86.29%), Postives = 599/671 (89.27%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. NCBI nr
Match: XP_022984829.1 (uncharacterized protein LOC111482996 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1071 bits (2770), Expect = 0.0 Identity = 562/648 (86.73%), Postives = 585/648 (90.28%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0023196 vs. TAIR 10
Match: AT1G60995.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membralin (InterPro:IPR019144); Has 172 Blast hits to 170 proteins in 70 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 110; Fungi - 0; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 24 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 719.9 bits (1857), Expect = 1.8e-207 Identity = 410/664 (61.75%), Postives = 474/664 (71.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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