IVF0022509 (gene) Melon (IVF77) v1

Overview


Name	IVF0022509
Type	gene
Organism	Cucumis melo L. ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Unknown protein
Location	chr05: 18102497 .. 18118494 (-)
RNA-Seq Expression	IVF0022509
Synteny	IVF0022509

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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ACTAATAACATAAGAATGACCATCTTGCTGTTAGTTTCCTTCTTTCAACATTCAAATTTTCAAGCCTTATTCTAAACTAAATTTGTTCCAATTTTCTTCTTAAAATAATTCAACCTTAAAGAATTGGCAATTAGATTTAAACTTATTTTTTACAACTTAGGAAATATTAATATAAATAAAAGGAGAAAGTGATGGGAGCTTACAGCGCGCATCTTCTCTGTTTCGCATTGCAGTGTTTCGCAGCTGTTGTTCCTTTTTCATCTTCAGCTTCTTCCCCATCCAGTCCTCTCCACTCCAAGCCACGCCCAAATTTGAGTCGTCGCCTCTGCCTTGCTGTGAGTCGTTGTGAGTTCTTTTCTCAATTTTTTATGTGGATTTAGATGGGTTTTGATTACTCATTAAAGTTTTCTTAAAGGTATTTAAGTTAATTAGTTTTGGAACTTATTTAGAGTCTTCTCAAAGGGATCACTTAGAGATTTTTTTCATAGCAGATTGGGAACCTTGACGTCAAGGAGTGATTTGGTTTCAAACTTAATTTGGTAAGTTAAATTAAAAATTTTAGGTGATGATCGTTAATAATTTATTAGGTAAAATTATTAACTTCTTATCCTTTATATATGTTTAAGATTGATTCATTTGGAAAATTTACCTTTCAACCAAGGAATTTAACTAAGTTCGAGGTAAGGGATTCTACTACTAGACTCATATTGAAGTTGGAATGTATTGAACGAGACGGTAGTTGGCATATATTGACTGAGATAGATCGACTGTTATGTGGAATTAGAAAGTATTGATGGTTTATATTATTAACTGAATTGAGATGGTTTAACTATTATGCGTAGTTTAAATATACTGATGGATTGTACTGCTGACTAAACAGCAATATGCTTTAGCGTGTTTGTTTTGACTGGTTATGTGTAGAGAATGAATTGTTAGTTCTAAATGTGTTTCGATGTGACTGTCTTGGATTGTTTAGAATAGACTGAGGGGTAACTGTTAGCTTTATCTATGGGGTAGTGTACCTTGCAAGCACGGTGTCCTATGGAATCACCACATGTTGTGCATCCTTCGGGATGACTAGACTGTTATGTGCATCCTACAGGATCACTAGACTGATACATGTATTCTACGAGATCACAAGACTGTTATGTTGCAAGATACTTTCTAATAGGAAGCTAACCATTTTTACCCCTAATGAAATCAATAGGGTCTCTTACTTATATTCACCCTTTTATGTTTAACTTTTTCAGGCAAAAGTAATGCGAGAGGTAGACCAGCGACGTACAAGGACTCTTGATCGCCATATGAGAACGTTTTTCTTTCAATGTTTCCGCTTAATGTTTTTACTGTTTTTAGTTTTGAGGATTGAAAATGAGTGTCATGTTTAAGACATCTATTTGTTTTTAATGATTTCATAAACGATGTTTGTGAACTTTTAAATTTGTTTGAAATAAGGCCCGAAGACAATTTTTCTTATGTTTGGATGTTCACTTTATTTTAAATAGATTTTTATGAACTTTATATTTACATGAAGTGTCTTAGTATTAAAGTAATGACCTCAGCTTAGTTTGAAAAGTTGGTTCGTTACGGGATAAACTAAATTAAATTAAATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTGTTAATTTTATCATTTTCCTTTTCTTTTCCCTTTTAATAAAATATTTGTCTTTTCCTCACCAAAATTCCAACAATAATAATAACACCCAAAATTTAAAATATAAACAAAATACAATTTAGGTTGGAGAAATACCTCAAAATATTTGGGGCGTTACAGTAAATCCCATGTCTGAGCGAGAATGAGTTGTGTACTTGAAAGCTAGATACAGGTGGAAGTGAATCCCAGATCTAGGCAAGGAATGAATTGTGAGGTGCTGGTGAAAGCGAATTCCAAGTCTATTGTAAGACGCTAGTAAAAGTGAATCCAAGGTTTAGGCAATGAGATGGTAGTGCAAGTGAATCTTAGGTGTGAAATGAAAATGTGTGCTACTAGATGCTGGTTAGAAATCCAAGTCTATCATAAGATGTTGGTGGAAATCCCATGTTTAATGCAAAGACGCTAGTGAAGTAAATCTAAGGTCCAAGCGGCTAAATGTTGGTGAAGTGAATCCCAAGTTTAGGTGATTAGATGTGGATAAGAGAATCTAAGGTCCCGGTGATGAATGATGAATGGTGATGAACTAAAATGTATGAGATTGTTTATGGTTGCTGTGATTGTCATTTGAACAATGAAAGTTGTGTTGACGTGATGTATGCTTATGTTCATGAGACTATGATTGTTGTTATGATTGTAATTGTTGTATTTTCCAAAAAGGTATTTTCTTAAACTCATCAGTCACTAAGTCTTCGACTTACGTTTTAAGTTTCCCCTATTCAGGTTATCAAACGTTGAAGTTAAGTAAAGAATGGCTATCAGACGTAGAAGTCAAGTAAATGAGGGAAAGGTAGGTGGTTATGTAAACTTGTGCAACAAGCAAGCTACCTTTTTCCATATTGCGTTTAAGGAGCAGTAGGTAAGAACTTCACTCTTTAACACTAAGAAATACAGATCAGCTAAGAAGAGAATTCGAGTGCAGCAGCAAAGTTCTGTGTGGCTAAAGATGATGAGTCGAAAAGCTTAGCAAATGGTGAAGAGCCTAAAGATTATCCTTGAGTTGGGTTTCTGGGTGATCAAGGATAAGGATAAGAAAAGGGTTCTAATACTCCTAAAGACCTTGACATGAAGAGTATCACCCTGTGGATGAAGGAAGGTGGGTGTTTAGAACTCAGGTTTTACTTTTGTACCATGCGAGAAAGGTACATAATTTTTAAGTGCAAACTCTGTGTAAAGTGTTAAGTTAATAAAGAGAAGTTATGTTTATTTCGTTGCATCATTACTTGTACTTATCGCTTGGTAGTTGAATTTGAGTTAAGTATCGAAACCTAGTCGATGGAGTACAATCCAAAGGTTAAGTATTTTCGCTACGATGAGCTGTGAAAGTCTATAAAGCCAAAGTAAAGTTTACAATGAGACAAGTTGAAGTGAGCTATTCCACTTACTAGGCGTTCAACGTATCATCTTGCAGTAAGATATGTGATGGGTGTCTTGGCGGTACGCTCCCATCTGGTCGCAGCAGGTGTCATTTGGGGTAGGGTGACATAAAGAGGATATGAGTGAATTCTGTCTTGCACCCTACATCCCCAGCTATCCATTCGGTTTTACACCTAAAATGGTGTGAGACTCTGATCACGTTCTGAAATTACGCATTAAAACCACATGCGTCAGAAATTGGCTGCATTGAGATTACACATGATGAGGGTTGGCGACTAGAAGTGTTTGTAAGGCATTTTATCTATGCGATATAAAAATGTTATGCGTTCAAATAGGAGGCAGTATAAGTTTCCTTTGCCATGAAGTAGCTGACATCATCCTTACGTAATAAGGTCAACATTTCAATTAACTTTGCTACCCACTTTGATCAGGATAAGGTAGTGGTAGTGGCCATGTGGCATTTTGATATTGAATGATCCTAACCGCCGGGCAGAGGTAATCTTTTCGGAATGGAAAACCTCACCAGAAAAGCCTATAAATAGGAGAAGTCCTCTAAGTTTAAGAGCTTATGTTCTACCTTGTGTTAACCTAAAAGAGTGAAGGAGTTGAAAAGAAGTTTGGGAGCTATCATGAGTTTAACTTCAGCAAAGAGCTCAAGGAAGAGGTTGTCCGATTGTGAGAGATTCTCTTTAAAAATGTTTACAAACTATAATGCATCAATGCGGAAATGCTTTTCTATGCAATGTGAGTTATGATGAAATGATTTTTCAAGGAAATGGTTCTTATGGATATTTGCCAATAAGATTTTAATCTCCTAACACAGCGAAATTATTTGATTTGAACTCATATGTTAATTGAAATGCATACTTATTTGTATCGCAGAGTATATGTGAAAAGAATTTTGCAACGCGTTATGATGTGAATGAATTCTTTTAAATGAGTTGAAGAAAATCCTTACTCACCAAACTCTTTTATATAATCTTCAAATATTTTATTTTATCCCCTCCCCCCAGGTAGAGAAGGACATCCATCATTTAACATGTCGTTTTGATCACCTACTATGCCACAACCTTGTTGCATCATCTTGTTAGTATTCATCAGATCGCATGGCATGAATTGTTAGGCAAGAAGAGGAAATGTTTGTTTTGGGAAAGAACTTATATATTCTATTTTATGAGAATTCACTTTGTATTTATTTCAAATGTAATCTTTGCTGACCTTTCAAAGCAAGATCTTCTGCAACCTTAATATGTCTTTAGCACGCGATTAGAGTAAATGTTGTTTATTTCGCTTACTAGATGTTTATTGTGTTATCTCGCAGGGAGATATGTGTTGACTGTCTAGGTGGTCACACCTCCACTTGATCACATAGAGTGACCTTTGGGGCGAGGCATGACAAGTTGGTATCATAGCATAAGTTCTTGGGAAGTTAGAATCATGCATATAGGAGTCACATGATAAGGTTATAAATGTCTAATGTAATGATGCGTTATAGGTAGTTATAGCACCACGAGGAAGGCCAAGGCGAGGCAGGCAAATCAGAGGCTTATTTAGCTATCACTAGTAAGTTACCCTCACAATCCAAATCTAAGGATAATCCTCTTTGAACATGACTTCATAGTTAGCTCAGAATTAAGATTAAGTTATCTAGGTCATCAAGAATCGAAATAAGTTTTATATAGTAGATAATCTTACAACATAAAAGCCACTATTTTATGGTTCAATCTTATGTAAACTCTTTACATAAGATAGTCTCAGTTTCATGTCTGTACATGAACGACTTAAGATCACATCATTTCTACTAACTACAAATCGGGTCGTATTCATAGTGTCCCCAGAATAAGATCGTTTAGGCTATATACTCGAACTTTATCCATGTTTATATCTTTAAATAAAGCTCAAGATTAATCGAGATAGCCTCGGAACCTTAGCTTATTGGATACAAG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mRNA sequence

ATGGCAACTCATAAGTTTATTATAATATCAATTGTTGTTATGATGACATTCGCCTGCATTGTATCAACAACAAAAGGAGACGTGTTGAATGTGCATTGTGTACGACCATGCTCTGACACTTATGATGACGAATCGTGTTACAATGATTGCATTCGAGAGAATCTTGGTGTTGGGTTTTGTTACCCTAAGCTACCTAGCACAAGCACAGATAAAGATTGTTGTTGTAAAGTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCAACTCATAAGTTTATTATAATATCAATTGTTGTTATGATGACATTCGCCTGCATTGTATCAACAACAAAAGGAGACGTGTTGAATGTGCATTGTGTACGACCATGCTCTGACACTTATGATGACGAATCGTGTTACAATGATTGCATTCGAGAGAATCTTGGTGTTGGGTTTTGTTACCCTAAGCTACCTAGCACAAGCACAGATAAAGATTGTTGTTGTAAAGTTTGA

Protein sequence

MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFCYPKLPSTSTDKDCCCKV

Homology

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LHG9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G071930 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 1.1e-29
Identity = 65/77 (84.42%), Postives = 67/77 (87.01%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          MAT K   ISIVV+M FACI STTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCI+ENLG GFC
Sbjct: 1  MATQKLATISIVVLMIFACIASTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIQENLGAGFC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCCKV 78
          YPKLP  STDKDCCC V
Sbjct: 61 YPKLP--STDKDCCCNV 75

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LJG5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G072430 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 134.4 bits (337), Expect = 2.0e-28
Identity = 63/75 (84.00%), Postives = 65/75 (86.67%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          MAT K   ISIVV++ F CIVSTTKGDVLNVHCVRPC DTYDDESCYNDCIRENLG GFC
Sbjct: 1  MATQKLATISIVVLVIFPCIVSTTKGDVLNVHCVRPCYDTYDDESCYNDCIRENLGAGFC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCC 76
          YPKLP  STDKDCCC
Sbjct: 61 YPKLP--STDKDCCC 73

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKF5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G070930 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 115.2 bits (287), Expect = 1.2e-22
Identity = 49/55 (89.09%), Postives = 50/55 (90.91%), Query Frame = 0


Query: 23 TTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFCYPKLPSTSTDKDCCCKV 78
          T KGD+LNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLG GFCYPKLP  STDKDCCC V
Sbjct: 2  TAKGDILNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGAGFCYPKLP--STDKDCCCNV 54

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L1R8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G339000 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 3.5e-09
Identity = 35/75 (46.67%), Postives = 46/75 (61.33%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          M T K  I+S++V +TF+C  S+ +GD L  +CV PCS+   D  C   CI ++ G GFC
Sbjct: 1  MVTQKLFIVSMLVAVTFSCFASSMEGDDL-WNCVIPCSNNNGDILCNTACIEQDEGAGFC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCC 76
           PKLP  S  K CCC
Sbjct: 61 VPKLPGISDMKVCCC 74

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TJH1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold1167G00010 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 5.6e-07
Identity = 31/75 (41.33%), Postives = 44/75 (58.67%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          M T K +++ + + +  AC V+ ++G  L  +C+RPCS+TY   SCY DC   N G G C
Sbjct: 1  MPTRKLLVVFVAITVLLACFVTLSEGQGL-WNCIRPCSETYKSLSCYVDCGALNKGTGAC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCC 76
           PK P  S +  CCC
Sbjct: 61 IPKRP-VSDEYVCCC 73

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. NCBI nr
Match: KGN61228.1 (hypothetical protein Csa_006463 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 137 bits (345), Expect = 1.94e-40
Identity = 65/77 (84.42%), Postives = 67/77 (87.01%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          MAT K   ISIVV+M FACI STTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCI+ENLG GFC
Sbjct: 1  MATQKLATISIVVLMIFACIASTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIQENLGAGFC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCCKV 77
          YPKLPST  DKDCCC V
Sbjct: 61 YPKLPST--DKDCCCNV 75

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. NCBI nr
Match: KAE8651697.1 (hypothetical protein Csa_006343 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 134 bits (336), Expect = 4.57e-39
Identity = 63/77 (81.82%), Postives = 67/77 (87.01%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          MAT K   +SIV++M  ACIVSTTKGDVLNV+CVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLG GFC
Sbjct: 1  MATQKLATVSIVMLMILACIVSTTKGDVLNVNCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGAGFC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCCKV 77
          YPKLPST  DKDCCC V
Sbjct: 61 YPKLPST--DKDCCCNV 75

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. NCBI nr
Match: KAE8651701.1 (hypothetical protein Csa_006400, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 107 bits (266), Expect = 1.62e-28
Identity = 45/51 (88.24%), Postives = 48/51 (94.12%), Query Frame = 0


Query: 25 KGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFCYPKLPSTSTDKDCCC 75
          KGDVLN+HCV+PCSDTYDDESCYNDCI+ENLG GFCYPKLPST  DKDCCC
Sbjct: 15 KGDVLNMHCVQPCSDTYDDESCYNDCIKENLGAGFCYPKLPST--DKDCCC 63

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. NCBI nr
Match: KAG6586428.1 (hypothetical protein SDJN03_19161, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 3.89e-22
Identity = 40/75 (53.33%), Postives = 53/75 (70.67%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          MA+ K   +  +VMM F    S+ KGD+  + C+RPC D +DD+SCY+DC+R N G GFC
Sbjct: 1  MASRKLFTVFAIVMMMFY-FASSAKGDMF-MECIRPCVDAFDDDSCYDDCVRANKGAGFC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCC 75
          YPKLPS + +KDCCC
Sbjct: 61 YPKLPSVTNEKDCCC 73

[Close]

BLAST of IVF0022509 vs. NCBI nr
Match: KGN54497.1 (hypothetical protein Csa_012842 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 69.3 bits (168), Expect = 2.01e-13
Identity = 35/75 (46.67%), Postives = 46/75 (61.33%), Query Frame = 0


Query: 1  MATHKFIIISIVVMMTFACIVSTTKGDVLNVHCVRPCSDTYDDESCYNDCIRENLGVGFC 60
          M T K  I+S++V +TF+C  S+ +GD L  +CV PCS+   D  C   CI ++ G GFC
Sbjct: 1  MVTQKLFIVSMLVAVTFSCFASSMEGDDL-WNCVIPCSNNNGDILCNTACIEQDEGAGFC 60

Query: 61 YPKLPSTSTDKDCCC 75
           PKLP  S  K CCC
Sbjct: 61 VPKLPGISDMKVCCC 74

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of IVF0022509 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of IVF0022509 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0LHG9	1.1e-29	84.42	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G071930 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A0LJG5	2.0e-28	84.00	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G072430 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A0LKF5	1.2e-22	89.09	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G070930 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A0L1R8	3.5e-09	46.67	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G339000 PE=4 SV=1	[more]
A0A5A7TJH1	5.6e-07	41.33	Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold...	[more]

BLAST of IVF0022509 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KGN61228.1	1.94e-40	84.42	hypothetical protein Csa_006463 [Cucumis sativus]	[more]
KAE8651697.1	4.57e-39	81.82	hypothetical protein Csa_006343 [Cucumis sativus]	[more]
KAE8651701.1	1.62e-28	88.24	hypothetical protein Csa_006400, partial [Cucumis sativus]	[more]
KAG6586428.1	3.89e-22	53.33	hypothetical protein SDJN03_19161, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori...	[more]
KGN54497.1	2.01e-13	46.67	hypothetical protein Csa_012842 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of IVF0022509 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PROSITE	PS51257	PROKAR_LIPOPROTEIN	coord: 1..19 score: 5.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
IVF0022509.1	IVF0022509.1	mRNA