IVF0020925 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATTGGTTGGAACACTCAAAAGCACATAAAGATTTCTCATGCCAAAAGAAGTTTCTATGCTCGAATTTTCTCTTCTCCTTGCCAGAACAAAAGCCTTCTACTACAGGAGCAACGGACACTGGGTATCTAGCCCATTAATTGGCTTAAATTTCATATATCCTTATCGAACTGCTCATACCCTTTGCCTTATTTTCATCAAACAATGATAATTCATTGTTCGTTTTTTTTTTCCCTTCTGCACTGAGTTTCCCAGTTAATTAGTACTTACTAGTCTTCGAGATTGCTTATTTTCCCTCCTGTTTGAATGCATGACATGGCAAGAGATCTGACTTTAATTATTTTGTTAACCAATGTCTCAGACCCATATTTTATTTTTAACCGTACACTATGTCTTGAATGACGTAATTAAAGCCATTTTATTGATTAAACGTTGGCTAGAACGACAATAGGGTTGTTAACCGTAGCAAGAGTGACAAAAGAAATAAAAAGGCTATATTCCTCATAAGCCTCTCTCCAGTCTCCCTCCCCTTTTATGTTTGGTAGCCTCCTTGGCTACCATCATGCCTCGGCTCCTCTCCTAAGCTATTTATAATTTTTTTTGATCTTTAATTTTGTTTCTTTTGGATTGGGATAGTAGGCCTTATAACTCAGATCTTTCTAGGTAACTGTAGAAAGGTTCAATTGAAGTTTTTAGTAAATTAGAGGATACCATACAAAAGCGGAAAAGAGATAGTTTCTCATGATTTACTAGTTTTTTCTTTTCTTGTGTTTAGGAATTTGGCCTGTCAGATGCAGAATCTTCAAAGAATACAAAGATCACAGATTGAAAAGGTAAAATCACAACTTCATTTAAAAATAAAAAGGTAAATCAAAAGAATGATTGCAACTAAAAATAATTTGTGGCAAGCTGGGTGTGTGACATTGCAAGATCATATTTTTTGGTTTGGTGGCCTTTTTGTTGGTTGCCTCCCGTTTTGTGGGCTCTTTCTTTGATTGTCCTTGTATTCTATTGTTTTTCTCGATGAAAGTTCAGTTGTTGATAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAGAGGAATGATTTGATGTCAATCTTATCTATTTCTATCTTTTTTTTATATGAATAAAAATTATAACTTAATAGTGTATACACAATGTGGGAAGGTAAGGGAAGGCAGTAGGTTATTTTATCGATTATGGTAGAATTATTTACAAGCAGGCAACATTGTCTTTATATGTAGCATTAACCGTTAGTCCTAACAATTAACCAATACTAAGAATATATGTACAAATACATACATATATATATGATATGAAGATAAGTTTATTTCTTATTGTTATTTTGTATAGAGTTTCAATTCTCAATTTAAAGAGGGGAGGGAAAACATACAAGCAAAAACTGAAAAACAAAAATAAAGCAAAAATTAAGGAAACATATTTAGAGAGAAGGAAATACTAGACAAGGAAAAACCAACGATATTAATGGGAGAATATTTTTCTATTCTCAACACTCCCCTTCAAGCTAGATTGTATATGTTGATTAAATCCCATTTTGTCTTTAATGTATGAAAAGTGTTCTTGAATAGAGCCTTGGTGAGTATGTTAGCAATTTGCATCTTGGTAGGCATATAGTTAAGGTTGTAGAAACTTAGGTGTCTATTTGTTCTTTAAGCAATCCCATTTTGTTGGGGAGTGTCTGGGCACATTCCGAAGTGAACAAATACCTTTTTATTTTGAAATGTCTATAAAGACATGTTAAAGTAATCCCTAGCATTATTAGAGTGAAGAATTTGGATTTTAGTGTTGCATACAAAATTCGAAATATGAAAATAACCTTATATTTTTCTTTCATTAAAAACACCCAAGTACTTGTAAGTCTAGTACGACTATTAATGAAGGAAACAAACCATTAAGCGCTTGTTAGGCTTTTCACTATACTTGCACCCCAAACATCACTATGCATCTTAGAAAAAGGATTAGAGAGTTTGTAGTTGCTTATCAAATATGAAGATTGAGTTTTCTTAGCCACATGACTCAGGTTGAAGAACTTGTGAACTTTTACTAAATATCTGGAAACAGCAGTTTCAAATATATAAAATTGGGATGACCTAAAATATTATGCCACAATATTATTCTTCTATAGCAATTGTGTTTAGAAATTTCTTCATACCTAACTTTTTAACTTGGCACTTAGGAATATTTAGGACTCAGGCATGAGGATTCTTTAGCATTGTCAATCGTTGTGCGCAAATTCAAATCCTGAAAAGTACGATTGTGAGTGAAATGTTGTTGCACTGAAATTTTTAACTAACTGCAAGTTTGCTTATGGATGAAATATTGCATATAAGGTTTGGGACATGCTAAACATTTTCTAAGATGAGATCTTTAGAGATAAAGACATTGCTCGTTCCCACTATTTTAGGGTAAGTCTCATCAACAATTCTCACCTCACATGAGGTTGGCCACTACAATGGGAGTAATTTGTTAAAAGGGAGACATCACCTGTCATATGATCTCACACTCCATAATACTAAAATTGGTAGTCGCATTAAGAGCACAAAAAGATGTACCTGATTGAGCCACTGATGCTACACTTGCTTCAGATGGCTTTTGCGTAAGTTTGGGTTGTACAAAGTGTTACCTTTTGAGATGTACTTGGTTGATATGCTCTACCTCGTTTGTCTCCAACTCCTTTGTTTGACTTTCAATCTGGAGGTTAACCATGAATATCCCAGTGACTTCTTTGTTGTATTCTGATTTTTTGCAATGATCACACTATGACCTAGGGTTTCATTGTTGGTTCTCATTTCCATTGTAGATCTGATTTATTGTGGTTACGATGAGTATTTATATTTGGAGTTTTTACCTCATTACCATGGTTTTGAATAAGGAGGGCAAATCCACCTGGTTCAAAATTTTTTATTACTGCCAACGTGAGTTTTTTTCCCTGCTTCTTTCTTTTCTCACTTTTGTCTAGTTTTAGATCAGGGTTTGATATCGTAACATATTAGCTATAAAGCATAATGGACACTTCAATTTGGCAAGGTATCTCTGTATGCCACTAACCTTGCTAAAGTAAAAACAATCGTTTATGGCCATTCTATTTCCTGTTAATTCTTAGCTAATTGTACTCTTTTTCTTGTGTGAGATGGAAAATTGGAGTTGTATATGTCCAGCGCAACTCTTGGAATACTCATTTTGAGTCAGAATAAATGTATTTCTTGTGTTTCCTAGCAGGCCTGGAATGCTCTTTCAAATTTCCAGATTTCTTGTAGACACTATGCCAAACTTGGAAACACTAGACAAGTTAAGGATGTTTTTTCTGACCGTCCTGCTGATAGCAGAAGAATTACATCAAATAGTTTGTCTGATGCCAATGCTAGTTCTCAACATAAGAAAGTACATAGACATTTTAGTGAATACAATGTTGATACAACTAAACCTTCAAGTTTCCGATCAAATCTTTCTGCATCAAGGAATATTAAAGTTATGGAGGACCAAAATGATGTAGATGGGAATAATATGGCCAGACTGCGAACAATCAATCATTCTCATTTTCAGAGGGTGGGTGACTCAGTCAGTTTTGCAACTAACCAGAAAAATATATGTCCCTCTTTTTTGGAGGATGAGGATGACGAGATTATAGAGGTAATCTTGATCCACATTTCTTATTTTTTGTTTATTATAAAGCAAATTTAGACTCACTTTGTTTTATGGATGACTTCTAACTATATTTCTCTCGGCAAACTTCCACATTTATCTGTAATTTGAAATGACCTTTTATTTTTGTAATCAGCTCAATTCTAATTTCTGTTCTATAGAAATAACGAACAGTTAGTTTATGGGTGGCTTAGTACACACACACATATAATTTTGTCCGGTGGATCCCAATTTGAAATTTCATGAATTGGGTACTCTTGGTTACAGAATATTGACGTGGACCAAATTGTTGAACAATACCAATCACAATCAGCCTGCACACCTCAACCTTCAGTTTCTAAGCTTCCACCAATTACTCCAATATTTGAGAAAGATAATGTTGCCAAGCAAGAGGAATCTAATTATCCAGATGAGTTGTGCACTAATTGCAGTCATGGTTTCAAGGTGTAGAACATTGTATTATATTTTTATCCAATGTTCAATCTGCTATTACGTTTTGTTCAGCTATTCATTGTTACCAACTTATGTTACAGATAGAACTATGCCCAGAAGCTTCAAGCCATTTGCAGGAGTTGAAAGATAGGCTAATCTCTATATCAAATGACCTGCTTGATAATGTTAATAACCTGAGCCCAGTGCAGATCGATAAGCTTCGGCAAGAAAGGTTTGCTATCCTGTATCCAATCCATTTTCTAAATAGGAGTATGTAAAATGTCTAACTTGCATGCACATATGTATATAAACAAGGACCGAAAGAACGTAACAGAATGAATTTTGGTTGGATCTATTTATGTACAAGTAGAAGAATTTTTTCTTTTGCCTTTTATATTGTAGTTTGTTTGTGTGTTGTTTATCTATATGCATAATACATAAGAAATGGGAACTTGAATTATCGTATCCATTCATTTGCAGGGTACATCTAAATAAACAAATTCAGCTACTAGAAAGACATATTTCTCTAGATGCAGTTAATGAGGAAAGGCGCAGGTCTCATCTTTTCGCGACAACAGTTACTCCGAAGACTTTTCATTTTGAAACACCTCAAGGAGCTGAATTCAGGACCGATGCAAAACTAAATACTTCTTACATTCACCAAGACCTTGAGCCTAGAAGGATTGAGCCATGGAATTCAATGGGTTCATCCTATGTAGATGAAAGATTTGGAATGTCATCTGGTCCGGTGGAGAGGGAACCATACATCCCCAAGGTGATTGATGTCAACTACATTGAAGGTTCTAATGACAAAAAGTGGAGCAGCCGGAATTTTTCTTGGACAAAAGAGTTGGAGGTGATACATTAAGGCTATTAAGCTTCTGTGTTTTTCTATGCTCATTGCCTTATC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MNWLEHSKAHKDFSCQKKFLCSNFLFSLPEQKPSTTGATDTGNLACQMQNLQRIQRSQIEKAWNALSNFQISCRHYAKLGNTRQVKDVFSDRPADSRRITSNSLSDANASSQHKKVHRHFSEYNVDTTKPSSFRSNLSASRNIKVMEDQNDVDGNNMARLRTINHSHFQRVGDSVSFATNQKNICPSFLEDEDDEIIENIDVDQIVEQYQSQSACTPQPSVSKLPPITPIFEKDNVAKQEESNYPDELCTNCSHGFKIELCPEASSHLQELKDRLISISNDLLDNVNNLSPVQIDKLRQERVHLNKQIQLLERHISLDAVNEERRRSHLFATTVTPKTFHFETPQGAEFRTDAKLNTSYIHQDLEPRRIEPWNSMGSSYVDERFGMSSGPVEREPYIPKVIDVNYIEGSNDKKWSSRNFSWTKELEANNKKVFGNHSFRPNQREVINATMSGYDVFVLMPTGGGKSLTYQLPALICPGVTLVISPLVSLIQDQIMHLIQANISAAYLSANMEWSEQQEIFRDLSSDCTKYKLLYVTPEKVAKSDFLLRHLESLNARHLLARIVIDEAHCVSQWGHDFRPDYQGLGILKQKFPKIPVLALTATATASVKEDVVQALGLINCIIFRQSFNRPNLWYSVIPKTKKCVDDIDKFIKENHFDECGIVYCLSRMDCEKVAERLQECGHKAAFYHGSMDPAQRSFIQKQWSKDEINIICATVAFGMGINKPDVRFVIHHSLPKSIEGYHQECGRAGRDGLRSSCVLYYSYSDYIRVKHMISQGATEQSPLVSGYNRTNLGSSGRILETNTENLLRMVSYCENDVDCRRLLQLKTCDNCLKSTNLIEKDVTDIAKQLVDLVRSMGQQFSSAHILEVYRGSLSQFVKKHRHEKLSLHGAGKHLLKSDASRILHYLVIEDILVEEVKKNDVYGSVSSLLKVNETKVQSLLNGGQRITLRFPSITKTNKLSKFEMTPAKGSLVFGKMYPNIDTPAQPQSEVDVQLSAKLYSSLRMLRTNLVKEAADGVMAYHIFGNATLQQISRRVPRSKEELLDINGIGKAKVSKYGDRILETIESTINEFYGAGKNGSNSNDSNDSGKRRRGGNKDKDEYLDENDATKSFDRSKKRATNIQNIDPKVHSSSRPEHPDQFFDSELDFDDSHYEIRDLELNNNLDHGNDGRVLPSWS Homology
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L840 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RECQL4A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1274.2 bits (3296), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/1196 (59.11%), Postives = 854/1196 (71.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FT70 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RECQL4B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1155.6 bits (2988), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/1138 (56.94%), Postives = 786/1138 (69.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q09811 (ATP-dependent DNA helicase hus2/rqh1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=rqh1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 461.1 bits (1185), Expect = 3.8e-128 Identity = 268/712 (37.64%), Postives = 401/712 (56.32%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VGI8 (Bloom syndrome protein homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Blm PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 439.5 bits (1129), Expect = 1.2e-121 Identity = 261/659 (39.61%), Postives = 369/659 (55.99%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9DEY9 (Bloom syndrome protein homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=blm PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 433.0 bits (1112), Expect = 1.1e-119 Identity = 288/763 (37.75%), Postives = 410/763 (53.74%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3L3 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2332.4 bits (6043), Expect = 0.0e+00 Identity = 1172/1189 (98.57%), Postives = 1175/1189 (98.82%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1X6 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2269.2 bits (5879), Expect = 0.0e+00 Identity = 1149/1189 (96.64%), Postives = 1152/1189 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2G2 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2256.5 bits (5846), Expect = 0.0e+00 Identity = 1137/1154 (98.53%), Postives = 1140/1154 (98.79%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L762 (DNA helicase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G221760 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2251.1 bits (5832), Expect = 0.0e+00 Identity = 1131/1189 (95.12%), Postives = 1151/1189 (96.80%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2C0 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2231.4 bits (5781), Expect = 0.0e+00 Identity = 1125/1142 (98.51%), Postives = 1128/1142 (98.77%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. NCBI nr
Match: XP_008456057.1 (PREDICTED: ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2326 bits (6029), Expect = 0.0 Identity = 1172/1189 (98.57%), Postives = 1175/1189 (98.82%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. NCBI nr
Match: XP_008456059.1 (PREDICTED: ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2264 bits (5866), Expect = 0.0 Identity = 1149/1189 (96.64%), Postives = 1152/1189 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. NCBI nr
Match: XP_008456060.1 (PREDICTED: ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2251 bits (5832), Expect = 0.0 Identity = 1137/1154 (98.53%), Postives = 1140/1154 (98.79%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. NCBI nr
Match: XP_011651280.1 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2245 bits (5818), Expect = 0.0 Identity = 1131/1189 (95.12%), Postives = 1151/1189 (96.80%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. NCBI nr
Match: XP_008456061.1 (PREDICTED: ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2226 bits (5768), Expect = 0.0 Identity = 1125/1142 (98.51%), Postives = 1128/1142 (98.77%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. TAIR 10
Match: AT1G10930.1 (DNA helicase (RECQl4A) ) HSP 1 Score: 1274.2 bits (3296), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/1196 (59.11%), Postives = 854/1196 (71.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. TAIR 10
Match: AT1G60930.1 (RECQ helicase L4B ) HSP 1 Score: 1155.6 bits (2988), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/1138 (56.94%), Postives = 786/1138 (69.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. TAIR 10
Match: AT1G31360.1 (RECQ helicase L2 ) HSP 1 Score: 402.1 bits (1032), Expect = 1.5e-111 Identity = 250/667 (37.48%), Postives = 360/667 (53.97%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. TAIR 10
Match: AT3G05740.1 (RECQ helicase l1 ) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 7.0e-101 Identity = 196/429 (45.69%), Postives = 264/429 (61.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020925 vs. TAIR 10
Match: AT1G31360.2 (RECQ helicase L2 ) HSP 1 Score: 344.7 bits (883), Expect = 2.8e-94 Identity = 220/605 (36.36%), Postives = 322/605 (53.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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