IVF0020013 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGTGAATGATTGGAATATAGTTTTGGTCTGGTTTGAGGTTCATGAAGCACATAGTGAGGTTAATGCAACTATAACAAGGTGCGGTGCCCATGTCACTGAAGAGCTCCATGTGATACAAAATGGATGTGAAGTGGCCGATGGTAAATTATGCCGATTTTTATCAACTAGAGAAATTGCAAAGCCTGTAAGTTGATTGTTTAATTACTTGTTACTTATTTACTTTCTTCCTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTGAATGTATGATAGATCTCAAAGGGGGACATGTGTATGTTATGATTAAGTTTGTTTAATGGCATAGGGATATTGAGGATCTTCTTCTCAAAAGCATTTTGAAACAATCTCCTGCTGGTCAAATTTCAAAGCAATGTTGCATGCAGGAAATTATGATCCAGAAGCAATATAATGGTGAAGCAGTGATATCTGGAATGGAAGGCATGGGAGATACTACACTCGCCAACTCTTTATGCAATAAATTTAAATGGATGAAGGATAACCTTTTCGGGATAAAGGAGCATCATCACAGTGAAGCTTTAGATAATTCTACAGGCTTTTTCCATATCAGAGGAAGAGAGCTCCAGTTATTTTCTTGGTCGTGGGCCCACCACCGTAAGCGTGGAGATGGTAAAAGAGGAACCAATATCACAACCCATACAATATCCTCCAAATGCTATTTGATGCTCTTTCATGAAGCCGAGAACTGTAATGATATATTTGACTGGGTTGGTACACAGCGTTGGATTAAAACTTCTGGCAGTTCTAACGGAAGAGGTGATGTTCAGTTTCTGATTAAAAAGGGTTGATATATCATTCCTCCGAAGCTCTCAATTTTTAGTAAAAATTTATATTTAAACAACCTTTTACTCATTTTGGGACTTGTATTATATTAATTTAAACACTATGATAATTAATATCAATTTAAACGCTCAACAACTTGTGTAAGTTTACATATTAATTGAACACCCTTCTTATTTAATTTAGATTTTGTTCAAAAATATCATGTGAAACATATTACTAAAATTTTAAATTGTTATATTAAAGTGAATCGATTTAAACTCTTTATTAGGATTACATTTGATCAGTATTCAATAGCTTCACTTTCTCCCTTAGCTAGCTAGTGATAGATATACCAATAACAATGTTTTTTTTTTTTAAGATGGAAACCGATGTGTTATATAGTGCTAGGCACACCAAAAACATCAAACTTCATTCGATTAAAATAAAGCATTTATACAAAGTTGTGTTCAAGAGGCTAGAGAGAGGCCTCAAAGTACGAGAGTTAATCTAGCAATCCACTAATATTTAAAGAGATTGGACTTGGAATATAGTCTTTTTAAGAGTTTGTTTCTGTTGGACCATAGACGAAGGGTTTTTGTGAGAAGTCGTACCAGAAGTAGCTTTGTGTCTTTGGATTTACTCGTACCAGAAGTAGCATTTCCCCATGTGTGTTCAAATTACAAGGGTTTAGACATGGATTAGTATTCACTTTGCTTCTCATTTTATATGAAGGATATTAACCTAATTCAAACTTCTTTCCTTGGATCTCTTTCATGACGCACCATTCACATTCACACATTGCCAAACTTTTTTTTTTTTACTTTTTAATTTTCTTCCATCCTGTCTTCTCTCTTGCATGTTTTCTCCTTTTTTCCCTTATTCATTTTAAAGATAAAAATAAAAAGAACAATGATTGTGTCATTTGTAGGCAAAAGATTTAAAATATGTATGGATATGTTGATATATCTTTAAATCTAAGGTTGGATATTTTCAACATTATCTTTTATAAATGTTCGTAAAAGAGAACATGTCATCTAGTCTAATATGAATAGAAATACTAATAACTATATTTTCATAACTTAGTTTGGGAGTAAAAATAACTTAATTATTTATCTAAATAAATTTTAAAATTTTGCAATTTTGAAAATATTTGTCGATATGTATGTTTCATCGATCTATCCATCAATATCATATGTTAATTGTTAATGGTGGGTCATCAAATTGTTCGCTCTATTGACTACTGTTTGGATCGGCCGTCATTGATGTTGAAGGAAGAAGATAAGAGAGACAAAGAAGTGCAAGCGATGGAAACAATAAAGAAAGGAAGAAAAAAAAATACATTTTTAATTATATCATTGAAAATATATATTTAGTAATAAAAAAAATCAGCTTTACCAAGAAAATGTCGAACAAATGGACTAAGAATGTTTAGAAACTCTTGAAATTTCCAAAATGGAAACGTTAAAAGTTATGGGACAAATTGCAAGAAACTTGAAAGTTTGGAAACAAAATAATATTCAAACACAAATTCTAATTTTATTTAGAAAAGTTGGATTCATATTGTTTGAGAACCCATCCAATTAAGAAGGGGAGAGCAAAGTTATAACTTATTTAAAACACCTTTCATTTTGATTTATTGGCTTTTGTGAGAAGTCGGTTAAATATACAAAAATCAATTTTAATTTATGAATAATGAAGTTGAAAATTGAATATTTGTTAGGGAGTCAAATCTAAATTTAACCATTGACTTCAACTTAGATAAAACATGGTTATATACTTTCTGTACACTGTTATTTTCTTAGAAAAACAAACTCAAATTTTGAAAACTAAAATGGGAGTGGCTAGAGAATACGATGAAATTGGAAGCTGTATTGTATCAATCAAATTCAAAATACAAAGCCCCACTTCTTCACTGCGATGCCAACTCAATCAACTTATATTGAGAGCCTACGTTTCCTTCCTCAAACAAAAAAATTATATTGATAGTTGAAGCGTTTGATTTTTTCTCTTTATCTAATACATCACTCTTCAATTTTTGCTCTGCATTATTCTTCACAAATATTGCTACCGGTGTTTTCAATTTCTCTTTTCTTTAGTCTATGCGTTTCTTTCCTAATGGATTCTTCCACTGTTGCAACAAAATCACCGACTTTCGGATGGAGTTATGATGTGTTTTTGAGTTTTAGAGGTGAGGATACTCGCACCAATTTCACCAGTCATCTTGATATGGCTTTGCGTCAAAAGGGTGTCAACGTCTTCATAGACGACAAGCTTGAAAGGGGTGAGCAAATTTCTGAAACTCTTTTCAAATCTATACAGGAAGCTTTAATTTCTATTGTTATATTCTCTCAAAATTATGCATCCTCTTCATGGTGTCTGGATGAATTGGTCAACATAATTGAGTGTAAGAAGTCCAAGGGCCAGATTGTTTTGCAGTTTTCTATAAGGTGGATCCGTCGGATATTCGAACACAAACTGGTAGTTTCGGAGAAGCATTAGCCAAACATCAGGCTAAGTTCCAAATAAAGACCCAAATTTGGAGGGAAGCTTTAACTACTGCTGCTAACTTTTCTGGTTGGGATCTAGGAACTAGGTATATATTTTCTTACCGACATTTTGTTTTTTCTATTCCAAATCTCATTTTTATGCTATGTTTGAATGTATGCATGTATATATGTACGTACATATGTATGTGTATGTATGTATTTTAATGAGCACACTGACCAATTAATTTTTATCTTAGAAGATTCATTCTCTCTCAAGATCCAATTTAATTAATTGTGTTCATCATCTTTTAATTTTGGTATATGATTATGCACTTACCAACAGGAAGGAGGCTGATCTTATTGGAGATCTTGTTAAAAAAGTGTTGTCTACATTAAATCGCACTTGCGCGCCTTTATATGTAGCTAAGTATCCGGTTGCAATTGATTCTATACTAGAATATATGAAGCTTCGTTCACATATTAATCTTTTTGAGAAGAGCAACAAATTCCATTATCAAACACAACATGAGTATGAGTTTGATACTGATGTTAACATGGTGGGGATATATGGCATTGGAGGTATTGGTAAGACAACTTTGGCTAAAGCTTTATACAACAAAATTGCTAGCCAATTTGAAGGTTGTTGCTTTCTATCAAATGTTAGAGAAGCTTCAAAGCAATTCAATGGCCTTGCTCAATTACAGGAAAGCCTACTCTATGAGATCCTAACGATTCATTTGAAAGTTGTCAATTTTGATAGAGGAATTAACATCATAAGGAATAGATTGTGTTCGAAGAAAGTTCTTATAGTTCTTGATGATGTAGATAGACTTGAGCAGTTAGAAGCATTGGTTGGTGGGCGTGATTGGTTTGGCCAAGGCAGTAGAATCATTGTGACAACAAGGAATAAACATTTACTTTCTAGCCATGGCTTTGATGAAATACACAATATTCTAGGATTGAATGAAGAGAAAGCTATTGAGCTTTTTAGTTGGCATGCTTTCAAGAAAAATCATCCATCAAGTAATTATTTAAACCTTTCAAAACGTGCTACAAGTTATTGTAGAGGTCATCCTTTGGCTCTCGTTGTTTTAGGTTCTTTCCTTTGTACCAGAGATCAAGTAGAATGGTGTAGTATATTAGATGAATTTGAAAACTCTTTGAACAAAGATATCAAAGATATTCTTCAATTAAGTTTTGATGGGCTTGAAGACAAAGTAAAGGATATCTTTCTTGATATTTCTTGTTTACTTGTGGGAGAGAAAGTTAAGTACGTTAAGAAGATGTTGAGTGCATGCCATGTAAATCTAGATTTTGTAATTATAGTACTCATGGATCTTTCACTTATGACGATTGAAAATGACAAAGTGCAAATGCATGATTTAATCAAACAGATGGGTCATAAAATAGTTTGTGGTGAATCTCTTGAGCTTGGAAAGAGGAGTAGGTTGTGGTTGGTACAAGATGTTTGGGATGTGCTTGTTAATAATTCAGTGAGTAACTCATACCCAAAGTATCTTTAATTTACTTATTTCTAAGACTTCAAATGATGACAAAGGTTTGTCAAATGTTGTTAATTTACTAAATATATGACTTTTTCAGGGAACAGACGCAGTTAAAGCCATAAAGTTGGACTTTCCTAATCCCACAAAGTTGGATGTGGATCTACAAGCTTTTAGAAAAATGAAAAATTTGAGATTA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ATGGAGGTGAATGATTGGAATATAGTTTTGGTCTGGTTTGAGGTTCATGAAGCACATAGTGAGGTTAATGCAACTATAACAAGGTGCGGTGCCCATGTCACTGAAGAGCTCCATGTGATACAAAATGGATGTGAAGTGGCCGATGGAAATTATGATCCAGAAGCAATAATTGATTCCAACATACAACCTATGATTTTCCCATTGCACGTAACATATAATGGTGAAACAGTAATATGTGGAATGGAAGGCATGGGAGATACTACACTCGCCAACTCTTTATGCAATAAATTTAAATGGATGAAGGAGCACCTTTTCGAGATAAAGGAGCACCATTACAGTGAAGCTTTAGATAATTCTACAAGCATTTTCCATATCCGAGGAAGAGAGCTCCAGAGATTTTCCTGGTCATGGGCCGCCCACCATCGTAAGCGTGGAGATGGTAAAAGAGGAACCAATATCACAACCCATACAATATCCTCCAAATGCTATTTGATGCTCTTTCATGAAGTCGAGAACTGTAATGATATATTTGACTGGGTTGGTACACAGCGTTGGATTAAAACTTCTGGCAGTTCTAACGGAAGAGGTGATGTTCAGTTTCTGATTAAAAGGGTTGATATATCATTGCTCTGA MEVNDWNIVLVWFEVHEAHSEVNATITRCGAHVTEELHVIQNGCEVADGNYDPEAIIDSNIQPMIFPLHVTYNGETVICGMEGMGDTTLANSLCNKFKWMKEHLFEIKEHHYSEALDNSTSIFHIRGRELQRFSWSWAAHHRKRGDGKRGTNITTHTISSKCYLMLFHEVENCNDIFDWVGTQRWIKTSGSSNGRGDVQFLIKRVDISLL Homology
BLAST of IVF0020013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: E5GB29 (LRR disease resistance-like protein OS=Cucumis melo subsp. melo OX=412675 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 417.2 bits (1071), Expect = 4.2e-113 Identity = 195/210 (92.86%), Postives = 200/210 (95.24%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TWU2 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold385G00320 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 404.4 bits (1038), Expect = 2.8e-109 Identity = 199/251 (79.28%), Postives = 202/251 (80.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D437 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold456G00140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 402.9 bits (1034), Expect = 8.2e-109 Identity = 198/251 (78.88%), Postives = 202/251 (80.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D427 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold456G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 322.0 bits (824), Expect = 1.8e-84 Identity = 150/162 (92.59%), Postives = 153/162 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D427 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold456G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 3.2e-12 Identity = 37/41 (90.24%), Postives = 38/41 (92.68%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 268.9 bits (686), Expect = 1.8e-68 Identity = 137/199 (68.84%), Postives = 142/199 (71.36%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. NCBI nr
Match: ADN33671.1 (LRR disease resistance-like protein [Cucumis melo subsp. melo]) HSP 1 Score: 412 bits (1060), Expect = 8.10e-145 Identity = 195/210 (92.86%), Postives = 200/210 (95.24%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. NCBI nr
Match: KAA0047972.1 (TMV resistance protein N-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 399 bits (1026), Expect = 4.31e-127 Identity = 199/251 (79.28%), Postives = 202/251 (80.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. NCBI nr
Match: TYK18305.1 (TMV resistance protein N-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 398 bits (1022), Expect = 1.63e-126 Identity = 198/251 (78.88%), Postives = 202/251 (80.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. NCBI nr
Match: TYK18295.1 (TMV resistance protein N-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 374 bits (959), Expect = 6.90e-125 Identity = 188/251 (74.90%), Postives = 194/251 (77.29%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0020013 vs. NCBI nr
Match: KAA0047980.1 (TMV resistance protein N-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 267 bits (682), Expect = 1.68e-84 Identity = 137/199 (68.84%), Postives = 142/199 (71.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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