IVF0019052 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATCATCGACAAATCCCGCCTTTTTAGCACTCAACACTTCACTTCCCATTTTTCCCTCCCTCTTCATTCTCGCTGTTTCTTATCCAAATTTCTGGGCAGCCATTAATGTCCAAACTCCTGCTCTCTCACGCTCACCTTCTCACACTTCCCTACAATCACCGTTCCTTTTCTCTCAACCATGGCCTCCTCCCCATTCGCTCAGTCCTCTCTGCTCCAGACAAGCGAGGTAGAAAGAAGCGGCAGTCTCGCCACCAACAACAATTGCAACTAAAGGACGATGATTCCACTTCACTTGAGAACTCCCTCCGTTTCACTTTCATGGAGGAACTCATGGACCGCGCTAGAAACCACGATCCACTTGGTGTTTCTGATGTCATTTACGATATGGTTGCTGCTGGATTGAGCCCTGGACCTCGCTCCTTCCATGGATTAGTTGTTTCTCATACTCTAAATGGCGATACTGAGGGAGCGGTGAGAACTCACAACCTCTCTCTCTCTCTCTAATTGTGTGTGTGTTTGTAAATTTGTTGGTAATGTTGTTCTTGTTTTTGGTGTGTTTTTAGGCAATGTAGTGGTATTGTATACGTGCAATTGAAGATCTAGTGCTTAAACTTATTCCCTATTCCTTCCTTTTTCGGTTATTGGATGTTTTGAATTATAGGATCTTTAACCCTTGTTTTCTCTTTCCCGTTCGAAAAACTTAGCTTCTCGGTGTCTTAATTAGATGATGAAGTTTTCTCCTCTAATATGTCCTTCGCATGCTCACCTGGTTAACAGAAGGCAGGGATATGTATAACGTTGACTGTATGGAAGTCTCTGGTCTATTTGTATATATGCGTGTGGGTGTCTATTCTTTTATTGAATCAGGTGTATCTGCACTCTTGCTCCATCCATTGTCATGTAGACGTGTGGGATACATTTTTGTCCTAACAAAGTAAAACTTGTTTTGGTCCCAATGTAATTTTTGTTTACAAATTCCCGGATAGATATGTATTTTTCTAAATCTTCTGGGTATGATGAATGTAGATGCAGTCTCTGAGAAGGGAATTAAGTTCTGGACTTCGTCCTCTCCATGAAACTTTTGTTGCATTAGTTCGGTTATTTGGTTCCAAGGGTCTTGCTAATAGAGGCTTAGAAATCCTTGCTGCCATGGAGAGATTGAATTATGACATCCGTCAAGCATGGCTCATTCTTACGGGTAATTGCCTGAACTTCCTGTTGAGAATGCTCCTAATAGATACTTTTTAGTTATGTTTATGTTTATGTCTTAGTTGCATGAATTATTTTGACTAGAGGAACTCGTAAGGAACAAATATTTGGAAGATGCCAATAAAGTGTTCTTAAAGGGTGCCAAAGCGGGTCTCAGAGCCACAGACAAAATTTATGATCTTATGATTGAGGAAGATTGTAAAGCTGGAGATCATTCAAATGCCTTAGAGATCTCATATGAAATGGAGGCTGCTGGGCGGATGGCAACGACCTTCCATTTCAATTGCCTTCTTAGTGTCCAGGTGATGTTTCTTACTATTGGATAATTTAGTGCATGTCTTTAAAAGTACAGGTCCAGTGATTTGAGGCTTATGTTTTTAGTTAGGCAAGGTAGAAACCTTATTATAATGGTTCTGGTAGCGTGCTAATATTTCTATATGTACGTTCTTCTAGGCTTTACTAATTTAACTTCCATCGGTTAGTGTCTAGCAATAAGAATTTTTTTTATTCAAATGTGTTACTCTTAAGATTCTAAACCTAAAACTCAGAAAAATCTCAACAAGGGCCAAAACAGATACAATACTCTGCATTAATATATTGATATCAAAATAAAATATTCAACAGCCAACCATTAACACAAATACAAGAAATAAAAGCAATAAATAAAGACAACCCAACTCTTTCGAGAAGGCCGGAAACTTCTCCTAGAGCCAATTGCAGACTTTAACCAAAATCAATACCTAAAAAACCCAATCCCCAAAAACATTCCCTATTTATACTCCCTTCACAGTGGGCGCTCGGGTGCTATTCTCTCTTTGGTACAGTGCATTCCCCTTTTTACCCCTTCTTTTATATGTGTGCAGAATCGGGGGTCTAACATTACCGCTCGACTCGGATTGCACCTTGTCCTCTAGGTGGAAAGATGGGAACTGTTGTTCTGTTAGGTGTACCATCTCCTAAGTTGCCTCACTATCCGACAGTCCCTTCTATTTCACTAACTATACGTTTGTTGCAATTTCTTTGTGCCATCTAATTCCCAACTCTAACTCTGGCCTCAACTGTAGTTCGAACTTCTCGGGCAGCGTCGGGAAATGATGTTGCACCTGCAGATACACCCAACTTAAGCTTTCGCTATGATATGTGGAAAACATCATGAATGCTAGCTTCCGGTGGCAATTCCAGGCGTTAAGCAACTTCTCCATTCCTTTCTATGATTTGGTATGGCCCAAAAAATTTTGGTGAGAGTTTCTCACTTCTCTTCCTTGTTAGAGATCTTTGTCAGTAGGGCCTCAGTTTTAGATACACCTCGTCCCTTGCTTGAAAGTTCAGATCTCTTTTTCTTAAATCTGCTTGCTTTTTTTTCATCTGGTTTTGAGCGATAACTAAGTTCTCCTTCAATGCATTGATGATCAAGTCTCTTTGTTGCAGCAGCTGATCAACACTATTGTTTTTTTTTGGAACAAGAACATTAAGCAACAAAATTTACTTTGAATAATGCTAATGGCCAAAACCAGAAACTAAGAAACTAAGAAACTAAGAAACAATTCCTTTCCATAAGTTTGGTAGCAAAAATTTAGAAGCATAATGAGAAAATTGTACTATTCATGCAGTTCAAAGATCAAACAGAAATAAGACGAAAAAACAGGGTAAAAGTTCAAAGAAGAGAAAATTCTGATAGCCACCCTTGAGATCATCAACCACATCGTAAGGAATAGGTGTCACAGTCTCCATTAAAGCACCTTCGACGATGAACCTTGGTTTGGGACCTTCTGGTTGCCTCTTGGTGCAAATGACTACACCTCCGGTCTTGGCTTAGGCCTTCAGCCGATCATTCTTCACCTTCCTCAAGTGGAATTCCTCAGTGCATCGAGAAAGCTGCATGTGCTCGACTCGAAATGAATTCTCTTAATAATTCTGTTCCCCACCTGCTTGTTGATCTCAAAACCAATGGTGCGTTTTGTATCATTTCATACGCGACCTGTGTGACCATGGTAAAAATGTTTTCACTCGCCGTCCAGGAAATATTTTGTCACTATGGATGTTACTTTCTATGAGGACTGACCCTACTTTCTTGTTAGCCATCTTTAGGGGGAGAGTGTGAGTGAAGGGTCTAACAACACTTTTGAATTTATCGAACCTCCTCCTAGTACCGTGTCTGACATTGATCCTCATCCCATAATCCTACACACAAACCAAGTTTCTTGGAAAATATATTACAGGGGGAATCTCAGAAAGGAAGTTGGGTCCCCTACTAGTCAGCGGCCGACTCTAGTCCAAGACTCCGACCCTTCTCGAGATTAAGGTATGGAAAATCCTACTGAACCTTGTACTAATAATACGATGAGTGAGAATGACAAGTTTGATGTTGCTATTGAAAATGTGGAAAAAAGAACAGTGGTGATGAAACTGAGGTCAGAACAGAAACCAATAACAATGAAGCTGAACAGGATCATATAGGGAAACTTGACAAGTATGATCCTTCTCTTGATCTTCCTATTGTATTGAGAAAAGGTACTAGGTCCTGTACAAAACACTCCATATCTAATTATGTGTCATATAAGAATCTCTCACCACAGTTCCGAGTTTTTATTGCCAACCTTGACTCTATCACAATACCGAAAAATATTTACATTGTTTTAGAGTGTCCTGAATGGAAGAATGCTGTCATGGAAGAGATGGAAGCTCTTGAAAAGAATAACTTTTGGGAGATTTGTGCTTTACCCAAGGGACACAAGTCTGTGGGATGCAAATGGGTGTTTACTCTCAAATACAGAGCAGATGGAACACTTGACAGACACAAGGTAAGGTTAGTTGCAAAAGGGTTTACTTAGACCAATGGTGTTGATTATTCAAAAACTTTTTTTCCCATTGCTAAGTTGAATACTGTTAGAGTTTTCTATTCTATTGCTGCAAACAAAGATTGACCTCTATATCAGCTGGACTTTAAGAATGCTTTTTTGAATGGAGATCTAGTAGAAGAGGTCTACATGAGCCCCCGCCTGGCTTTCAAGCCTAGTTTGGTCAGCAGGTTTGTAAACTCCAAAAATCCTTATATGGTCTGAAACAGTCACGCAGAACATGGTTTGACAGATTCACTACCTTTGTCAAGTCCCAAGGGTACTGTTAGGAACACTCTAATCATATTTTATTTACAAAAGTTTTCAAGACAGGGAAGATTGCAGTTCTGATAGTTTATGTGGATGACATCGTTTTGTTTGGAGATGATTGAGCAGAAATTAGTCAACTTAAGCAGAGAATGGGTAATGAATTTGAAATCAAAGATTTGGGAAATCTGAAATATTTTCTTGGAATGGAGGTGGCCAGATCCAAAGAAGGCATCTCTGTGTCTCAGAGAAACTATACCCTTGATTTGACCGAGATAGGTATGTTGGGATGTCATCCTGTTGACTCTCCTATTGAATTCAACTGTAAACTAGGAAACTCTGTCGATCAAGTTCCAGTTGATAAAGAACAATATCAACGCCTTGTGGGTAAATTGATTTACTTATCCCATACTCGTCCTGATATTTTCTTTGCTGTGAGTGTTGTCAGCTAGTTTATGCTGGTTCCCTATGAGAAACACATGGAAATTGTCAAAAGAATTTTGAGATACTTAAAAATGACACCTGGTAAAGAGTTGATGTTTAGAAAGACAGACAGAAAGACCAATGAGACATATACTGACTCGGACCGGATAGGATCTGTTGTTGACAGAAAGTCTACCTCTGGTTATTGTACCTTTGTTTGGGGAAATCTTGTAACTTGGAGGAGTGAGAAGCAAAGCAT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BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WPZ6 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g17140 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g17140 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.6e-09 Identity = 86/367 (23.43%), Postives = 151/367 (41.14%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LYZ9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g02860 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g02860 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 6.1e-09 Identity = 69/291 (23.71%), Postives = 126/291 (43.30%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GYP6 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g18900 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g18900 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 5.2e-08 Identity = 57/272 (20.96%), Postives = 120/272 (44.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIC9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g31400, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g31400 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 6.8e-08 Identity = 65/264 (24.62%), Postives = 115/264 (43.56%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LN22 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g20300, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g20300 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 4.8e-06 Identity = 36/135 (26.67%), Postives = 68/135 (50.37%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B8T6 (uncharacterized protein LOC103487261 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487261 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1760.7 bits (4559), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/899 (99.67%), Postives = 899/899 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B9H7 (uncharacterized protein LOC103487261 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487261 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1625.1 bits (4207), Expect = 0.0e+00 Identity = 824/828 (99.52%), Postives = 826/828 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DBV3 (uncharacterized protein LOC111019595 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019595 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1620.1 bits (4194), Expect = 0.0e+00 Identity = 833/902 (92.35%), Postives = 863/902 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EQ88 (uncharacterized protein LOC111436825 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436825 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1610.1 bits (4168), Expect = 0.0e+00 Identity = 821/900 (91.22%), Postives = 854/900 (94.89%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L2D9 (uncharacterized protein LOC111499221 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499221 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1602.0 bits (4147), Expect = 0.0e+00 Identity = 820/900 (91.11%), Postives = 854/900 (94.89%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. NCBI nr
Match: XP_008443746.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487261 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1751 bits (4534), Expect = 0.0 Identity = 896/899 (99.67%), Postives = 899/899 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. NCBI nr
Match: XP_011660243.1 (uncharacterized protein LOC101209618 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8653592.1 hypothetical protein Csa_007695 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1711 bits (4431), Expect = 0.0 Identity = 876/899 (97.44%), Postives = 888/899 (98.78%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. NCBI nr
Match: XP_038879291.1 (uncharacterized protein LOC120071230 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1682 bits (4356), Expect = 0.0 Identity = 860/899 (95.66%), Postives = 880/899 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. NCBI nr
Match: XP_008443747.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487261 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1615 bits (4181), Expect = 0.0 Identity = 824/828 (99.52%), Postives = 826/828 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. NCBI nr
Match: XP_022151680.1 (uncharacterized protein LOC111019595 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1610 bits (4170), Expect = 0.0 Identity = 833/902 (92.35%), Postives = 863/902 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. TAIR 10
Match: AT3G04260.1 (plastid transcriptionally active 3 ) HSP 1 Score: 1277.7 bits (3305), Expect = 0.0e+00 Identity = 647/878 (73.69%), Postives = 758/878 (86.33%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. TAIR 10
Match: AT2G17140.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.1e-10 Identity = 86/367 (23.43%), Postives = 151/367 (41.14%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. TAIR 10
Match: AT5G02860.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 4.3e-10 Identity = 69/291 (23.71%), Postives = 126/291 (43.30%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. TAIR 10
Match: AT1G18900.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 3.7e-09 Identity = 57/272 (20.96%), Postives = 120/272 (44.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0019052 vs. TAIR 10
Match: AT1G18900.2 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 3.7e-09 Identity = 57/272 (20.96%), Postives = 120/272 (44.12%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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