
IVF0015862 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACAACGTGAAAATTTATCATAAAAAAACCAACCCGCCAACCTTCGTTCACGCAAACCACCTAACCCTCGCGCACTCTCTCTCTCAGTTGCACACGTCTGCCGCCGCTCCCAGCTCCGATCACCGCACGTCCGCCGCCTAGTCCTACCGCCATTTTCGTCTGCCACTCGCCAGGGTTGTCGCCGCCAGTAAGTCTCCCCGGATTTCATTCTCTATCTCTAAGTTTTGTTCACTGCCAACACCTGAGCACTGCGGCCGCCCTACCCAACTGCCGCGCTGCAGTCACAACCGCCATCCAGATCTCTGCCACTGCCGTCTGCCATCGCCGTTCGTTAATTCTGAGTTTTTGGGTAGGTTTGATTTTTTTGGGGGATAATTTGAAGGTTTTCCTGGAATGATTTTGAGTACCCATTAAGTTTAGGCCTTAATTTTGATATACTCATGATTTTTGGATATTTTTATATATTTTATATTCTTTTTAGTTGATTTTCTGTATATTTTCTTAATTGTTTGGTTCTATCACATATGAGCAGAGTTTTATAAAAAAGCAAGACATACTTAAGCCTCGCAACTTTTTAGGGGATAAAACAATTATCTTTCCTTTTTTTGTAAAGTTTATGACAGAGAAGTACAAGATTTTTTTGTTTTTTAAATATAGTATCGGTGATAAATGATATAACAAAAAGTTTAAGAGTCAAGGTTTTTGTTAAGGTTGCTTGAAGAAAGAATTATGTTTCTCTGAGAAATATTCTGATTTCTGTTTAAATAATAATAATAAAAAATCTTATTTCTGTTGAATATCTATGTGTGTGTCATGTGTGTGTGTATTTTAAGTAAACCATTGAGGCCCATGAAGGTGTGTGGAGAAATTGGGGGTTGGGCTATAATTCACTATGTAAAAAGTCAAAACAGAACAGAAGGAAAAACATCGTTGAAAATAAATTATGGCTTCCTTGACTCACATTTACTCTTTACCCTCTTCGACTGAAATTCCATTTAGTGTACCCGGAGAGACCTATGAGCATTTCAGGTTCACACGAGGAGGAAGATGATCACGGTGAGGTCTTCCTTGATGAAGCTGACATAATCCATGAAGTTCCGGTTGATGAGGAAGGTCTGTCTTTCCTCCTGTTGATTTTGCATTTATGTTCCTGTGAAGTTTGCGTTACTAATTTGTAATTATTACATTTTATCTGTTGATTTAAGATCTTCCTGATGCTGTTGATGAAGAAGGCTCTGATGACGAATATTTTGGTATGATATGTTATATACCAGTAATCTTTGCCTGCTTAATGCTTCATGTTCTCGAAGAACTTTTCTATTGTATTGGTTTCATACTTTCTAAATTATGTTTTAAGGTTTTAGAAATTTATCTGAGTATTCTGCTCTGTAAATTGTTGCATTTATTGAATTTGTTGGTTTTCAGATGAGGCTGATGATTCAGTTCATACTTTTACTGGCCATACTGGTAAGAGTCTATTTTAATTGTTTCTAATTTTTGTGTGCCACTGCCAATTAGTTATATCGATACTATATTGCTTTCTTTTTCTTCTTTCACTGTCTTTGTAAAGTTCATATATTAAGTTAATGAATCAACTTATGACTATAATTACTCATGTCAAGAAGGTTTAAATCTAAATGTAGTAATAGCTCTAAGAAATTTTCCTAATGGAAGTGAAGCTTACCCTTGATTCATATTCTGAGTGCAGGTGTCTTTTCATGCATATGTCAAAGTTAATGTGAATGTTTAAATCTGTTCTTCATGTTAATGGAAGTTTATATTGGGGTATCCATTTTCAGGTGAGGTTTACACGGTGGTTTGTAGTCCAATAGATGCCACATTAGTTGCAACAGGTGGTGGAGATGACAAAGGATTTATGTGGAAGATTGGCCGAGGAGATTTTGCACAGGAGCTTAGTGGTATGTGCATGATACTCCAAATAGTTATATATATTTTTTGTTTTACCTTTCACTTCCAAAACCAAAAGTGTTATAATATGCTTCCTACATACCAGTTCCACCTTCTTTGCATTGGCTAAATCTATGAATTAGCATAGATCTTATATCTGTTCATCTTTTCCTAACTTATTTAAGGAAAACTGCTGCAGGTCACAAGGATTCCGTGTCTAGCTTAGCATTTAGCGCAGATGGACAACTACTTGCATCGGGGAGTTTTGATGGAATTATCCAAATTTGGGATACTTCATCTGGGAATCTTAAATGCACACTTGAAGGTCCTGGAGGGGGAATTGAGGTAAAGCTATGGTTATATTTGATAAAACTAGTAATTTGATCAAGTCATTCAGTCTTGTGGATATTATGGTTTAGATGCATGAATAATAAGTATTTGGGAGGTGGTTGGAAAGCCAAAGAACATTAGCAATATAGAATTAGGGAATCTAAAGGCTAGGGACAAAGTCTTTTTGGCCAAACAGTTGTGGCATTACTCCTTTGAGTGTCTTACCCTGTGGTATAGGATTATAGCAAGCTAGTATGGTTCTCATCAGTTGAGTGGGTACCAAGTGAGGTCAAAGGCACTTGTAGGAAACCTTGGGTAAATAATTCTATTAACCTCCGTTCTTTCTCTCATTTGGTCTATTGTTTTGTGGGGATGAGAAGGCAACATACTTTTAGGGGATAGATTCTTTGCTCTATGTTTTCTTGTTTATACCACAAAGTTTTATCAAAAATTGCTTGATGGTTAATGCCGTTGTTTGTGCAAGGATCTAGCTCTTTATCTCTTGGGTCATCTCTCATTTGTTTGATAGAGACAACAGATATCATGGCTCTCTTATTTTGAGGAGATTGAACTTAGATGATGGAGAAGAGATTTTAATCTTTGGACACTTGACCCCTCTAGGGGTTTTTCTTGTAGCTCTTCGTTTTGTTATTTGTTGAACCTTTCTTTGTCTAGTAAGTCGGTCTTGTCCTCTCTAGATGTTGAAAATTTTAAAGAAGGTTAAGTTCTTCATTTGGGAGGCTATACATGAAAAAGTTAATATACTTGATAGGCTTTTGAGGAAGTTGCTTTCATTGATAGGTCCTCTTTGTTGTATCCTTCCTCGGAAAGTGGAGGAAGATTTGGATCATAACATTTAAAGTTGCAAAGTTACTCAATCTACTTGGACTTGCTTTGTGGGGCCCTTTGGGCAAAAAGGAACATTGAGCAATAGTATCTTTTGAGGTTTAGAGAAGCGTCCTAGTGATGTTTAGTTCATTGTTAGATTTTATGTTTCTCTGTAGCTTTTAGGCATTGGTGATGTCATAATTATACTTTATTGTTTTTTATCGGAATCCCTTCCTTTAAGGAACTTCTTTCTGTGTACTTGGTTTTTTTTTTTTTTTATTTATTTATTTTCCTTTCCTTTGTTATGCTTTTTATACTTTCTTTCTCATTGGTTGTTTGGTTCTTTATAAAATAAATAAATAATTAGCATTGTGTATTTCAGTGGGTAAGGTGGCATCCAAGAGGACATTTGGTTTTGGCTGGTTCTGAAGATTCCACCGCTTGGATGTGGAATGCTGATAGAGGCGTTTATCTTAATATATTTTCTGGTCACGGTGCTACTGTTACATGTGGTGATTTTACTCCGGATGGTATTGAACTAATTTTCTTCTTTTATTTCTTCCTATTCCAAGTAATTAATTAATAGATTCTGTGATCTATACCATATTCTAATAATTCTGCTAAGGAAACTACTTATAAAAAGAAAATATATAATAATTAATCAAAAGCTTCTCCTTTGGATCATTTTGAACTAGCTCGGTTGAAGCTTTTGGTGCTTCTTATTTAAGGTGATCGTGAGTTTCTTTTAGCAGCATATTTGCTTCAATTGTAAAACTTCTATGTCACGCATAGATTTTTATTGTCTTTATTTTGGTCCTGTTGTGGTTATTATACTTCGTTTCTTTTTATTATGTTTTCTTTTCTTTCGGGAGTTTGTATTTTTCAGCAATAGTCTTTTTTATGTAATCAAATTTTTTGTTTCTTATTAAAATAATAATAACAAAAATAATAATAAATGAAAAGGATCAATATCTAATCTAAATTCAACAAGAATATGTACAAATCTACCCTCTTTTTTAATAGTGGATTGTGTATGGAGTACAATCCAAGCTTGGATTTGAACTCATGCCTTTTTTTCTCTTTCTAATGACCATGATGTCATTAAAAGCTTTTGTTGCTCCAGGTAAAATTATATGCACAGGTTCTGATGATGCGACAATGAGGATATGGAATCCAAGAAGTGGTGAGAATATTCATGTCGTGAGGGGTATGTTAGAAACTTGCTCATACGATTCATTTTAAATTAGCCCTTATAAGTCATAAATTTGTTGAAATTTTATACTAAGGAGAGATTAAAGTTGAAATCCTTCGACTGATTTTGGAACTTGACCATCAATCTTTTGTAGTTTACTATTTGGGAGTAAAATTTCAATTGGACAGATGATGTATGGGTTAGGAGGTGTCGAGAATTTAGTTTCCAGTAATTGCCAATTTGTGAAAGTTAGGTGCGGTCTTATTCCAACTGCTTCTGAATATGTAAGCTCATAACAAGCTCTTATAACATAAAGGATGAATTTGCTGGTATGAGAGATCGAACTGCAAGAGATTAGGGGATGTTTGGCAACTTGGGTAATTTGGGAGAGTTGGGTTGGGTAAAAAAAAACCAACTCACCATTTCTTTCACCAATAATTAAAGAGGTTTATCACCTTGTTATTTGCATCAACTCATATTTCTCACTAAAACACTCACATTTCTCGCTTCGTTATTTATGTCAACTCCCTCAATTACTTTCCCATAATTATTACCAATTCAACTCAACACTTAGTTTTTATCGCTAACCAAAAGCCCTCTTGGTGATATAGACTTGCTTGATCTTGAAATTGATTCATTCTTTCAAATTTTACAAATGATACTTTCTTATTTATTTATTTATTTATTTTTATAAGAAACAAAATTTATTGATGAATTAAACTACAAAAAACAACTG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ATGAGCATTTCAGGTTCACACGAGGAGGAAGATGATCACGGTGAGGTCTTCCTTGATGAAGCTGACATAATCCATGAAGTTCCGGTTGATGAGGAAGATCTTCCTGATGCTGTTGATGAAGAAGGCTCTGATGACGAATATTTTGATGAGGCTGATGATTCAGTTCATACTTTTACTGGCCATACTGGTGAGGTTTACACGGTGGTTTGTAGTCCAATAGATGCCACATTAGTTGCAACAGGTGGTGGAGATGACAAAGGATTTATGTGGAAGATTGGCCGAGGAGATTTTGCACAGGAGCTTAGTGGTCACAAGGATTCCGTGTCTAGCTTAGCATTTAGCGCAGATGGACAACTACTTGCATCGGGGAGTTTTGATGGAATTATCCAAATTTGGGATACTTCATCTGGGAATCTTAAATGCACACTTGAAGGTCCTGGAGGGGGAATTGAGTGGGTAAGGTGGCATCCAAGAGGACATTTGGTTTTGGCTGGTTCTGAAGATTCCACCGCTTGGATGTGGAATGCTGATAGAGGCGTTTATCTTAATATATTTTCTGGTCACGGTGCTACTGTTACATGTGGTGATTTTACTCCGGATGGTAAAATTATATGCACAGGTTCTGATGATGCGACAATGAGGATATGGAATCCAAGAAGTGGTGAGAATATTCATGTCGTGAGGGGTCATCCCTATCATACTGAAGGATTGACTTCTCTAGCACTCACTTCTGATTCAACCCTTGCTCTTACTGGTTCAAAAGATGGTTCTGTTCATATTGTGAACATAGCAACTGGAAAGGTGGTGAATTCTCTGGTTTCCCATTCAGATTCAATTGAATGCATCGGTCTGGCACCAAGCTCCCCATGGGCTGCAACTGGAGGAATGGATCAAAAGCTCATTATCTGGGATCTTCGACAATCAACGCCACGCAGTACATGCGAGCATGAGGATGGAGTAACATGTCTTACTTGGATTGGCACATCAAGATACCTTGCTACTGGATGTGTCGATGGAAGAGTACGGATTTGGGACAGCCTCTCTGGAGAATGTGTAAAAACCTTCTCCGGGCACTCTGATGCCATCCAATCTCTCGCGGTGTGTGCCAACCTTGAGTATCTTGTTTCTGTTGCTCTTGACAATACAGCTCGGATTTTTGAGATTGCAGAGTATCATTAA MSISGSHEEEDDHGEVFLDEADIIHEVPVDEEDLPDAVDEEGSDDEYFDEADDSVHTFTGHTGEVYTVVCSPIDATLVATGGGDDKGFMWKIGRGDFAQELSGHKDSVSSLAFSADGQLLASGSFDGIIQIWDTSSGNLKCTLEGPGGGIEWVRWHPRGHLVLAGSEDSTAWMWNADRGVYLNIFSGHGATVTCGDFTPDGKIICTGSDDATMRIWNPRSGENIHVVRGHPYHTEGLTSLALTSDSTLALTGSKDGSVHIVNIATGKVVNSLVSHSDSIECIGLAPSSPWAATGGMDQKLIIWDLRQSTPRSTCEHEDGVTCLTWIGTSRYLATGCVDGRVRIWDSLSGECVKTFSGHSDAIQSLAVCANLEYLVSVALDNTARIFEIAEYH Homology
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3SZK1 (Angio-associated migratory cell protein OS=Bos taurus OX=9913 GN=AAMP PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 237.3 bits (604), Expect = 3.0e-61 Identity = 132/394 (33.50%), Postives = 201/394 (51.02%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7YR70 (Angio-associated migratory cell protein OS=Canis lupus familiaris OX=9615 GN=AAMP PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 1.1e-60 Identity = 134/390 (34.36%), Postives = 197/390 (50.51%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q13685 (Angio-associated migratory cell protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AAMP PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 235.0 bits (598), Expect = 1.5e-60 Identity = 132/394 (33.50%), Postives = 199/394 (50.51%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RCG7 (Angio-associated migratory cell protein OS=Pongo abelii OX=9601 GN=AAMP PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 235.0 bits (598), Expect = 1.5e-60 Identity = 132/394 (33.50%), Postives = 199/394 (50.51%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q00808 (Vegetative incompatibility protein HET-E-1 OS=Podospora anserina OX=2587412 GN=HET-E1 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 6.1e-54 Identity = 126/353 (35.69%), Postives = 184/353 (52.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CIC4 (angio-associated migratory cell protein isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501304 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 809.7 bits (2090), Expect = 5.4e-231 Identity = 392/392 (100.00%), Postives = 392/392 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KBX7 (WD_REPEATS_REGION domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G016980 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 804.7 bits (2077), Expect = 1.7e-229 Identity = 387/392 (98.72%), Postives = 392/392 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DN15 (angio-associated migratory cell protein-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022602 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 747.7 bits (1929), Expect = 2.5e-212 Identity = 357/392 (91.07%), Postives = 373/392 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EQW6 (angio-associated migratory cell protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436976 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 743.4 bits (1918), Expect = 4.8e-211 Identity = 353/392 (90.05%), Postives = 375/392 (95.66%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IRV7 (angio-associated migratory cell protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479949 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 738.8 bits (1906), Expect = 1.2e-209 Identity = 351/391 (89.77%), Postives = 373/391 (95.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. NCBI nr
Match: XP_008463066.1 (PREDICTED: angio-associated migratory cell protein isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 804 bits (2076), Expect = 6.48e-294 Identity = 392/392 (100.00%), Postives = 392/392 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. NCBI nr
Match: XP_004138371.1 (angio-associated migratory cell protein [Cucumis sativus] >KAE8646588.1 hypothetical protein Csa_005442 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 799 bits (2063), Expect = 6.22e-292 Identity = 387/392 (98.72%), Postives = 392/392 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. NCBI nr
Match: XP_038884723.1 (angio-associated migratory cell protein [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 772 bits (1993), Expect = 8.18e-279 Identity = 374/392 (95.41%), Postives = 385/392 (98.21%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. NCBI nr
Match: XP_023535004.1 (angio-associated migratory cell protein-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023535005.1 angio-associated migratory cell protein-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 757 bits (1955), Expect = 1.80e-275 Identity = 368/392 (93.88%), Postives = 379/392 (96.68%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. NCBI nr
Match: XP_022155468.1 (angio-associated migratory cell protein-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 742 bits (1915), Expect = 2.25e-269 Identity = 357/392 (91.07%), Postives = 373/392 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. TAIR 10
Match: AT1G71840.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 579.3 bits (1492), Expect = 2.3e-165 Identity = 267/387 (68.99%), Postives = 325/387 (83.98%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. TAIR 10
Match: AT4G02730.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 125.6 bits (314), Expect = 9.0e-29 Identity = 82/297 (27.61%), Postives = 147/297 (49.49%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 5.0e-27 Identity = 78/297 (26.26%), Postives = 138/297 (46.46%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. TAIR 10
Match: AT5G52820.1 (WD-40 repeat family protein / notchless protein, putative ) HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 1.1e-26 Identity = 98/344 (28.49%), Postives = 160/344 (46.51%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015862 vs. TAIR 10
Match: AT5G25150.1 (TBP-associated factor 5 ) HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 1.1e-26 Identity = 66/220 (30.00%), Postives = 113/220 (51.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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