IVF0014590 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GACCCGCCAAAATAAATTAAGCATTTTTCTTATAAAAAAGTATTAAAAGACAATGAAAACCGAAATTTTCTCTTTTGGCTGATGATTTACAATTTACGAGACTCGCACCGACGCTACGGAAGCTTCATCTTGATCGAATCAGGTCTTTGATTTCCTCTAACTGATCATTTGATTAATCTTTCCTTTTTATCTCTCAGTTTGATCAATCCCCAAAGCACTTTCTAATTCGTCGAAATTATTTGCTTAGATTTTCTGTATTCTCCCCATTTTGCATGATTTCTGAGTTTTAGCTACCGGGTTTTGTGGGGTTTTCTTTTTCAATTTTCAAGTTTTATGATATCTAATCACGGGTTGGATTGAATTTGTTGCATAGCGTTTTGATGTTCTGAGCGATATTGCTCGAGCTGGCCCTCCTCTTTTATTCTCTATGCCGGTTGAATTTACAGTCTACTCTGTTTGATGAATTACTTTAATACTCATCTTCTTGAGATTTTATAACAATCATGGAATTGAGTGAGTTTTTGAATGCTTAAGGTTATATTGAAGAAATGATACATATATCCAGTAACTTCTACTGTTGCGTTATTTAAATTTATCAAGAGGTTTCTTAACTCGAACCTGGGTTTTTGTTGATTTGAGAAATTCTCTTTCTAGATGTGGCAATTTCAGCTGATGTTATTAATGACAGGTACTAGTTTTTTGGCTCGGAGGGTTGCAGCAAATAAATTGATTCAGAAGCTGAGGATAAAGCTAGGCTCCTTGTTTTGTTCCATGCTCTGATGATGATGCTGAGTATTAGTATCAGAGAACAATGCAGCTTCCATTGTGATGGTTTTGCTGAATTTTGGTCATAGTGAAGTTACTAAAACTAACATCAATGGGTGTCAGCTATATAGCAATTTCTGCGGCATGTACAGCATTAAGTTTTATTGGTCTCCAGTTATGGACAGAATTATCAATAGATAACCTAAGGTCAGAAAAAATAATTGGCGAAAATCCCTTCAAGACAGAGAATGCTGCCCCTGTCGTTGATTTGCTCTTAAGTTCCTATGTTACGGTTGGACTGCTGGCTAATTTTGCACTTAATGTGTTTGTTCTACTCATACTATTTCTAAAGGTAAGTTTGTTATTTATTTTGGGAGCATTGTGTTTCAAAAAAAGCATGCAGCTATGAACTCTCAAGTTTAAAGCAATACTACATAATGGCTGTAGCCTGCTTTTGGAAGGTTCATTGAAATTGTTTTGTGTTAGTTTTTCCTGTGGCCAATCATTTTTTTTATACGAATGACGTGGTTTAAGTATATGCAAATTTGAATGAACTTTTAGATAAGATAAAGATGACACGGTTGAAAGAGCTGCTAAATGTAGCACACTGACAGTTAGTCTGCTAAAATTTTACCGATCAGCTTCCTCACTAACCAATGATCGACTTTTAACTACTAACTCAGCTCAATTTTTTGATTATCCAACTACACTTGTATTATGAACACTAAGCAAAGGAACATAGATATATTTCATCAAGTTAGTTTTGAGCTTGCGGTGGCAGTGTGGTTCTACTGTCTTTGTGATGTGGTGGGAGCCTGGGAGGCACACATATTTACAAGTATGCAAGGGTTGTATTGTACCAATAGCTTGGTTAGGCCTTGGTTTGCTCAGAAATTTAAATACAATGAACATATTCGATCTTTTATTTCTTGGCTTTCGATCTAGGTATCTGTGATAAATTTGACTCTTGCTCAAAATTATCATATTTATTATCTAGTTTAGCGAGAGTAGAGTTATTGTCCTTCTATTTAAAGTAGAATTAGTTCAATTTCGATGTTTGGGTTAGAATTAAATACAACATTTTTATTATATCAAATTATCTTGAGAATTAAATTCAACATCTAGTTGCTGTACACATCTATCCTTTTCCGAGAAAGTGAATGTTTATTCTATACATAAGTAGATGCAATTGAATGCACCAAAAATTTCTGTAGCGTGTAAAGGGTGGCATATGGGTTGTAGGAATGGAGGTGGAAGTAGAAGTTGATCCTTTTTAAAGCCACAAGCTTTGTTGGGCAAGGAGGAAATGATGAACTTTATGTCAGGAAGATTACTATTAGATTAACTTGAGGGAGGAGGAAATGGGGGAGTTTTGTTTTTTTTCCCTTTTTGGTAAAAGAAACATTTCATTGATATATGAAATCAGGGTCGAACCCCAAACACCAAAGGTGCTTACATCAGAGAACATCAATTACCGACTGAAAAGGATAAACTGTAATGAGTCAAAGGGTGCTTTGAAATGCACCAACAAAAATCCATAAACAAAACCAATTCCATAAAGGGGAAAAAGAATCAGTAAAGAGCCATCTGTTCTGTTCACTTCATGAACTCCAAAAGAGCCATCTGTTGAAGGATTATATGGTGCAGGCAAGAGAAGCCACCCGAGTTTGGAAGATGGATTCTTCGGACAACTTACCAGAATAGTCTCAATAATTTTCCTAATATTTCCGAAGCTTTATTAAGAAGCTTGTTGGATGTCAAAATCTCCGAGGAAGGAAGATATTCTCATATGGATTTTACAAAATGGAGGTGTAAATACTGTAGAAAAGTTGCAAAGAAAATTGTCTTCAATACCCTTGCAGTCTTCAGTTTTTTGCTAGAAAAGGATACTTTACTTTACCTTTTCATTAAGGAAATGAAAAAGAGACCAATGCTCCAAATTACAACTTGCAGCCCCCACTTTGTGTTTTGTGTATGAAAGCAAGTGAAGACCTAGATCAAGTGTTTTCCTATTGCTTGTCTGTACAAAATATTGGATGAAATGTTTCAATACCCCAGTCTTTCAGGGATGATGGACAAGTCTACTAAGAATAAATTTAAATTACTCTTCTTCTTGGTCTCAAGTGTAGAGGTAAAGAAGCTACTGACGATATCACAAGATCCAAATGCCTCCCACCAATGACAAGGTTTGTACCAACTTTGAGACAAAAATATAGCCAAGGGTTCTGTTTTAGATGACTTCAAAAAATTTTCCAGACACCCATCTAGTTTGACTGCCCCACTTCTATGGTTTCAGATAGAATTAAATCAAGTAATCGATTTGATACCGGAAAAATTTCATCTTTAATCAAAGCATGTGGTCTGCGATATAAAGAGCTTCCCTCTTTTGTTCCTGGGTGGTAGGTTGAAAGCTTAATTATTATGTGTGGGATTTTATATTCCAATGCATGCATACAAAGGAGATTGGGGTGATTTATAAGACCTATTAATGTGGATTGAGTTCTATTGGGGTGATTTAAGATGTTCTCTCTCCAAGCCATTTGCTGAATTTTCTTTATTGAAGGCTTGGTTAAATTGTGACGGTTTTACTTTTTCTTTGTAATTGCTTAATTTGTTTACTCCTTCCTAGAGTTTGTATCTTTTGAACACTAGTCTCTTTCTATTGTTTCAATGAAAATTTTTGTTTCTTGTTAAAAAAGCAAATGAGTTTGATTTCATCAAAATTGACATGTATGATTCCACTAAAATCCAAATATATGATATGATCAGTGGCATAGCTAGGGTTTAAAATCCCATCAGAGCTTGTATTTTCTCCCAAGATGTTAGTTTTGATGCTTGTAGATTTATTTTGTCAGCAGACCATAATTTTTGTTGAGCTGTATTCATCTGAGAGTCGGAAAATGGTGGAGCGTCTTGTTAATTATGTCATTTACAAGGTTAGTATCTTCCAACTTGATCTCCATTAAATTTTGTCTTGTTATTTTGTACAACATTTCACGTCCTTTTGGTGGGAACACATTATTCTTGATTTTTAATAATTTTATATTTTATTATTTTATTACTTAAACTTTTAAGAAAAACTAATTTTGTTGATGAATGAAATTTTGGGCTCTCAACGCAAATAGGCGAATTACATAAGAGATCTCCAATTAGAAATCAAAGAAGAAAGACTAATAATGAAAAGGATGTAAATGTTTCAAATGAAGGATATGTTCACCAACACATAGCATGAAACAAAATTAAATCTAGAAAGTGATCAACGTTAGAGATACCAGAAAAAAACTGTTTGTGGCCAATTCTTCTTGTTGATGTTCAGCTCACTTCTCTAACTTCACATTGGCTTTAGCCTATTGCTGCTTTGCACACTTACTACAGGCTTGCATGTAGACAATGAGTTGTTGCATGTTAACCTATGGATGTTTTTGTTTATAATCTCAAATCAAATTAGAGGATATTAAAAATTAGAAAGCAAACTTACCTTTCAGCAAACAGAGATTCTATTGGAATGGCCCATCTCCACTCAAACACTGAATTAAATTACATGCCCCAAAGTCCCTGGGTCATCCTACATGGATGCGGTTTCAAAACCTAACTCAATTGACCATTTAACTTAAAATAAAACTTTCCAAATAGATCTTTCCTAACATCGAGTATGGGATCTTGTTTACGATTTTGTAAATTTGTATTTGTTAATGAACATCGGACAGGGAACATTTCTGCCTCTGGTTGTTCCTCCAACAAAATATCATGTTGCATTGTGGTCTATCTGGTTGGCTGTCTTATGTTCATTGAAGGTAACATAATGCAATTTTCAGCTGGATTTTGATTTGTTAGTTTCATGTAAATACCTGGCTTATTGCATCAAAACATATTGTACAGATGTTTCAAGCATTGGCTAGAGATCGTCTCGAACGTCTGAATGCATCGCCTTCTGCCACATCATGGACATATTTCTGTGTATATTCTGTATTATTGCTGGTCCTCATTGTTGATCTTTCTGGGTAATGATTAATATCTTTTCTTAGCTTAAAGGTATTCAAAATTGCGGGGACAAATCTTTGGTTTCATTAATATCTATTCATTATCTTAACAAACAGGCATGTTTTCTTTTTCTTTTTAAAAAAGGATGTTCATTTGTTTATTTTTCTTTTTCATTTACTTGATTTTGGTTTTCTTTTTTTCGAAAAGAAAACGAGTCTCTTTATTCATATAGATATAAATTGAAAGAG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MGVSYIAISAACTALSFIGLQLWTELSIDNLRSEKIIGENPFKTENAAPVVDLLLSSYVTVGLLANFALNVFVLLILFLKTIIFVELYSSESRKMVERLVNYVIYKGTFLPLVVPPTKYHVALWSIWLAVLCSLKMFQALARDRLERLNASPSATSWTYFCVYSVLLLVLIVDLSGIRFCLMIYRTLGLSLFLLLFFEPLSIAFETLQAILVHGFQLLDIWLHHSAGNNTNCQFSKFFNMTIPGLLWELKGTLIRNLGFFLDMATLLMALGHYVYIWRLHGMTFNLVDAVLFLNIRALLSAIVKRIRGFMKLRKALGALNAALPDATPEELQAYDDECAICREPMAKAKKLNCNHLFHLACLRSWLDQGLNEYYSCPTCRKPLFVGRQENDVNPRAGETFSDEQLARQISAGLNRQNATIPTLPTGIFPNQTQNPVEGSPWRSTSLDPSWLHDWTSQSMDGAGPSNAARSVGLGRVQMMMRHLASVGETYAQTSIEDSAWSLWPLNPSQVVAGGSQVPRNVVGRHPGSMGGLNMNVARASNENLANILAMAETVREVLPHVPDELIFQDLQRTNSVTVTVNNLLQM Homology
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VYC8 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RIN2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 760.8 bits (1963), Expect = 1.2e-218 Identity = 390/587 (66.44%), Postives = 470/587 (80.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W4Q5 (E3 ubiquitin protein ligase RIN3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RIN3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 742.3 bits (1915), Expect = 4.3e-213 Identity = 378/586 (64.51%), Postives = 463/586 (79.01%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9R049 (E3 ubiquitin-protein ligase AMFR OS=Mus musculus OX=10090 GN=Amfr PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 142.9 bits (359), Expect = 1.2e-32 Identity = 138/540 (25.56%), Postives = 218/540 (40.37%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UKV5 (E3 ubiquitin-protein ligase AMFR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AMFR PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 7.5e-32 Identity = 136/540 (25.19%), Postives = 216/540 (40.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q803I8 (E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin OS=Danio rerio OX=7955 GN=syvn1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 3.8e-20 Identity = 112/426 (26.29%), Postives = 180/426 (42.25%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMI6 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491275 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1150.6 bits (2975), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/586 (100.00%), Postives = 586/586 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMT7 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491275 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1116.3 bits (2886), Expect = 0.0e+00 Identity = 574/586 (97.95%), Postives = 574/586 (97.95%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KG75 (RING-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G408180 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1104.4 bits (2855), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/571 (97.90%), Postives = 565/571 (98.95%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H0A8 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459248 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1070.1 bits (2766), Expect = 3.3e-309 Identity = 543/586 (92.66%), Postives = 561/586 (95.73%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K4H8 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491111 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1065.8 bits (2755), Expect = 6.3e-308 Identity = 540/586 (92.15%), Postives = 561/586 (95.73%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. NCBI nr
Match: XP_008449376.1 (PREDICTED: E3 ubiquitin protein ligase RIN2-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1147 bits (2968), Expect = 0.0 Identity = 586/586 (100.00%), Postives = 586/586 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. NCBI nr
Match: XP_004140081.1 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1130 bits (2924), Expect = 0.0 Identity = 575/586 (98.12%), Postives = 581/586 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. NCBI nr
Match: XP_008449377.1 (PREDICTED: E3 ubiquitin protein ligase RIN2-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1113 bits (2879), Expect = 0.0 Identity = 574/586 (97.95%), Postives = 574/586 (97.95%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. NCBI nr
Match: XP_011657512.1 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2 isoform X2 [Cucumis sativus] >KAE8647313.1 hypothetical protein Csa_004069 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1096 bits (2835), Expect = 0.0 Identity = 563/586 (96.08%), Postives = 569/586 (97.10%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. NCBI nr
Match: XP_038888614.1 (E3 ubiquitin protein ligase RIN2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1094 bits (2829), Expect = 0.0 Identity = 556/586 (94.88%), Postives = 570/586 (97.27%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. TAIR 10
Match: AT4G25230.1 (RPM1 interacting protein 2 ) HSP 1 Score: 760.8 bits (1963), Expect = 8.3e-220 Identity = 390/587 (66.44%), Postives = 470/587 (80.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. TAIR 10
Match: AT4G25230.2 (RPM1 interacting protein 2 ) HSP 1 Score: 760.8 bits (1963), Expect = 8.3e-220 Identity = 390/587 (66.44%), Postives = 470/587 (80.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. TAIR 10
Match: AT5G51450.1 (RPM1 interacting protein 3 ) HSP 1 Score: 742.3 bits (1915), Expect = 3.1e-214 Identity = 378/586 (64.51%), Postives = 463/586 (79.01%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. TAIR 10
Match: AT5G51450.2 (RPM1 interacting protein 3 ) HSP 1 Score: 731.1 bits (1886), Expect = 7.0e-211 Identity = 378/604 (62.58%), Postives = 463/604 (76.66%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0014590 vs. TAIR 10
Match: AT1G65040.3 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 2.0e-19 Identity = 73/250 (29.20%), Postives = 117/250 (46.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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