IVF0008309 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGCAGCTGGAAGAGTCTTCTTCTCCGAATTGGTGACAAGTCCCCGGAATATGGCACCTCCTCCGACTTCAAAGATCACATTGTTCGTCACTTTCTCTCACCCTTCTCCCATTTATGCTCCAGTATTCGACTACTTGTCGTTGATTTCTATCTGGGTCTTGCAGGAAACCTGCTTTGGTGCGATTCGGCGGGAGCTAGATCATTATGGAGATGAAATTTTACCTGTAATCATTTGCCTCTACACATTCATAGTCTATTTGGGTGTTGTTTATATTTTGAGTTCTTGTGTCGATTGAAATTATACTGGTTGGGTCACTGTATTAGTAGTATTTGCGAACTGAGATTTTCTGCTGGTTACTTTACTTTTTTAGGTGCAACCCTGTGTGGCAAGCGTAAGTTGTGTCTAACGTACTCTATTCTTATGGTTTTTACACTATTTTTTGTTCATCGTGTTACAGTTCCTTCTGCAATGTGTTGAACAATTGCCGCACAAGACTCCTTTGTACGGGACATTGGTAAACTACATTACGCACTTTAGACCTCAGTGGATGTTTTTTCTTTTCATCTATGAATTGCATCGAACAAATAATATTGCTAGATAGCTTTCTCAATTATTTGTTACATGCATGGTATCTTTGTAAGTCTTATTTAATGAAATTTCTGAATGTTTCCTATAAAAAGAGCATATTTAAGATTAACGCAATAGCTTTCATTGTGCTATTGCCTTTTATGTTTTTGTGTATTGTTTTGTGCTGCGACTGGAGATTGTCTTTAGAGCTACGTAGGTTGGACAATTCCCTTTCGTCATTTGTTTTATTTTTTTTACTTTTTTGTTTAACAAAATGGTGTGTTCCGTAAAAAATAACCTTCTCAAAGTTGTAGATACTTGGAGCCCTTTTCTCCCCTTTTCCTAGTCAGGTTTGTTGCCTTGGATCTGTTTGATCTGTGCCCCTTTCTTAATTAAATATTCTCTTTGTTTATTCTTTCATTTTCTCTATGAAAGTGTTTTTCTTTTATTTTTCTTAAAAAAAAAGAAAGAATTAGTTTGGCTTCTTTTTGTTGGGCTATCCTTTTGTATGTCTCTTGTTTCTTTTATATATCCTTTGCATCTTCTTTCATTCTTCATGAAAGTGTGGTTTTTATCTTAAAAGAAGCAAGACTTAGTTTGACTTCTGTTGTGGGGCTATCTTTTGTATGCCCTTGTTTCCTTTATAATCTCATTCCAATTGATAAATGATCTTTCTTGTTTAATATTTAGCAGATTTAACATTACTTTAAAATATTTTGTGGCAATACTCTTATAATTCTTAGTGATGTTTTTAGTTTGCTTTAGCATGTCTCTCTTATTGTATCCAGATTGGATTAATGAATTTGGAAAATGAAGACTTCGTGAAGAAAGTTGTGGAAAAAACTCACAAAAGTTTTCAGGTTAGTGATTCTGCAGATAATGTGGTTTAGGCATTTTCATTTCCTGTGGTATTTTGGCTCAATCCCTTCCTTTCAAACTCCTCTTATCAATGTCCAAAATCACACACCTATGAGAACTCAGTCCTGTTGTCTCTTGACAATTTGGTCCCTTGATTGCTTCAAGGCAAGAGGTGACAAAAGAGACATTGTCATTGTGTTAGTGAAGAAAGACACCTTTCTATTTGCTAATTCTTACATCCCTTGTGTGACCCTAGATCTTTCTTGGAAGTTTTAGTCTGACGTCCTATTTTGGAGAGTCCTTGCTTGTCCTATTTAGAGTTCTCCAGGAGCTTTTGTTGTTGGAAGCAAATGTTAGACCAAGTGTTGAATGTTGATTGTTAATGAAGCCACTAAGGATTATAGGCAAAGAAGGGAGGGAAAATGATATTTACAATTAATAGGTTGTTGAGCCTTCAATTTGTGTCTAATGGGTTTTTAAACGTTCAAATTCCTGTCTAAATTATTAACCTATTCAAATTTTTTTAAAATTTATGGAGAGATGAAATATAAAATCAAAATGTTAGGTCAAGTATCAAATAGGTCTGTGTCATTAAAAAAGATTATTAAATAGGGCACAATTGAAAGTTATGGGATCTATTGGATATTCTTAGATTTTTTTTTTCTTTGGATAAGGCACTATTTAAATTTCAATTATTTCATTGGAATATTTTGTTGATCTCACTTTTAGTTCTTTTTCAGGATGCCTTAAACTCTGGACATTGCCACAAGATCCGAATTTTGTTACGGTTTCTAACTGCATTGGTATGCTTGATTTTGATATTAACAATTTATGATTGAGATTATCATTTTTCAAAATTGGAAAACCCTAAATGTTAGCCTTTTGTTTTTGTTATCTCGAGACAATAATCTGACCTGCAATTTTGTTGTTTGATGTAGATGAGCAGTAAAGTCCTACTATCCACATCTCTTGTAGTTGTTTTTGAAACATTACTCTCTTCAGCTGCCACAACAGTGGATGATGAGAAGGGAAACCCTGCATGGCAGGCACGGGCTGACTTTTACATAACTTGCATTCTTTCTTGCTTTCCCTGGGGAGGTGCTGAACTGGTTGAGGTATTGTTGTTTCATCTCTGGATAATTTCTTTGCTTGGTGGATCATCTTTCTCAACATTGTTCTTTCCTCCCATTCTTGTTATGAATTTTAGTTATATGCTAGATTAGAAAATCGGATGGTGGGCGTCTTTTGAACACTACCCTCTCATTTTTGTTACAAGCTGCATTAATATCCAAGACTAGAACATTGGGCCTTGTTTTGATGGACTTTAATGGATTCAGGTACATTTTATGGCTTGCTTGGGTTGTGTGCGATCTTATGGGCTTTGTGGGGAGAGTTGAATGGTAAGGTTCTTGAAGGGGTGGAAAGTGACCTTAGTGAGGTTTGGTCTCTTGTTCGGTTTCATGTTTCTTTGTGGGTTACGATTTCAAAGACCCCTTGTAACTATTTTATAGGCATTATGTTGCATAGCTAAAGGCCCTTTTGTAGAGACTAAGAGAGGTTCTTTTTTTTTGTGGACTTGTTTCTTTTTGCCATGTATTCTTTCTTTTTTCTCAATAGAACCCTTAATTGCTCATCAATGTTGCAACATAAACTCCAAGTCCATTATTATTTTTTTTGGATAGAAACAACAACTTTCATTGAGAAAGAATGAAAGAATACAAGGGCATACAAAAAAACCTGACCCAACAAAGCACCCCACCTATAAAACGGGTTTCCAAATAATTAAGATGTTTCCCGATTTTCCCTATTTGTCACCCACAGTCTTCCCTCTCTGTCAAGCAAATAGTGAAGAACACTTGTTTTTTGATCGTCATTTCTCCAGTATGTGTTGGTGGACCATTTTCTTTCTTTTTTCTCAATGAAAGTTGTTTTCATAAAAAAACCTACTTAATGAATTTTTTTTTCTTGATATATAGTTTTGTATAACTATTAAAAGTTATCTATATATATATCTCAGTGGAAGTTGGTTCCATCATATATATTTACAATGATGTATACCGTCTTTGAAAAGACAGCGGTTGAAGGTTTGGTGAAATCTCTGGATTAAACCAAGTGGTAATTGTTTGACTTGGGGACTCTTCGGCTTGAGATATTGAAGTCTTATTTGATAATGTTCTCACTTTTGTGTTTTGCGTTTGATTCAGTTACTTCTTCTTTATGGTTTTCTTGAAGAAAAAATTTCCATTTTCTCTATTTTTTTCATTTTCATTTTTGTATGGATAAAGATCAATTTCTCCATTTCCCTCTCATTTTTAGAGTGTCAATGGGTCACCGATAACTAGTCAAATTTACCTTCTCATTGAGAATTTTCTTTGGATTTTTTTGTCAATCTGGTGTCTTTGAAAATTTTGATAGAATTATTTAAATTCTTATTCTTTTTTGCGCTCCAACTTTGGTTCTTGTACTAGTTGATTGCTCTAAAAAGAATTATTTGTAGTCTCTACTATTTTTATCATATTACAACACACTGTACATCTTATTAGAGAAAGCCCATGTTTGCCAAATAGTCTCTGCCATTGATAACTCGTTTTTACATGCAGCAAGTTCCTGAAGAGCTTGAGCGGGTTATGGTTGGAGTAGAAGCATACTTAAGCATTCGAAGACAGACCTTGGACACTGGCTTATCCTTTTTTGAGGAGGATGGTGAAGTCGAGAAAACTCTTAACGAGAAGGTAAATATGACTAGTTGTCATTATTTGTTATCATCATTCTAAGTTTACTGCCAAAGAAAATTTGACACTAGTGGAATCCTTTTCCGTAGCCAGGTTGGAATCCTTTTTTGTTTGGGCTTGTTTATTTGTCTGCTCTTGTATATTCTTTCATTTCTCCCAATAAAGCACAATTTCTTCCAGCGAACAAAGGAGATTATTCTAAGTTTTCGACTTATTTCATTGTATTTGATTTTTGAAAAAGAAGAATGACTTTTCATTCATATAACGAAAAGAGTCTAAACAAAAACTTACAAAACTGAACTTACCAATATAAGAAACGTTGACATTAAACCAAGAAGATAAGAGCTTTCCTATTCAAACTAATGTCCTGAATAGAAAAATTTGGAAAAGCCTTGGAAAGAGAACAAGGGGAGACAAAATGACAGTTAGAATCCAATTGAGGCGACCAAGGAAGTGGCTTATCGTGAAAAAACCCTCTGAGCATGTTCAAACCAAATTTATGATAAAAGAGCTGTAACTGCATTGGACCATAAAAAAATCTGAGAGCTAGAGGCCAAAGGAGGGCCAACCAAGGCCTGTAGTATGTAGCTTTGAAAAGACTAGTAAAAAACCCATTGAATTTGGAAAATAGAGAATAAAAACGACCAAGATGATTGAGAGAAACTACACTCAAAAAACAAATGCTGTAGATCATCATATGCTGAGCAATAAGTGCACATAGAGGGAGAAAGATAATGATGTTGGAGCTTATGTGGGAGAGTTGCCGACTATTTAAGGATCCAACCAGCATATTCCAAACAAGAATATTAATTCTCTTTGGGCTTTTGGATTTTC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BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIU2 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABH1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1200.7 bits (3105), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/860 (68.14%), Postives = 710/860 (82.56%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10LJ0 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ABH1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1076.6 bits (2783), Expect = 0.0e+00 Identity = 532/865 (61.50%), Postives = 677/865 (78.27%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7PX35 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Anopheles gambiae OX=7165 GN=Cbp80 PE=3 SV=4) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 1.0e-82 Identity = 210/762 (27.56%), Postives = 375/762 (49.21%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q16UN6 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Aedes aegypti OX=7159 GN=Cbp80 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 308.9 bits (790), Expect = 1.8e-82 Identity = 209/763 (27.39%), Postives = 378/763 (49.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DIE2 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=ncbp1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 306.2 bits (783), Expect = 1.2e-81 Identity = 204/712 (28.65%), Postives = 350/712 (49.16%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQ48 (nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492007 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1728.4 bits (4475), Expect = 0.0e+00 Identity = 864/864 (100.00%), Postives = 864/864 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M082 (MIF4G domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G616300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1701.8 bits (4406), Expect = 0.0e+00 Identity = 847/862 (98.26%), Postives = 854/862 (99.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DWR2 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold225G001130 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1673.3 bits (4332), Expect = 0.0e+00 Identity = 842/865 (97.34%), Postives = 845/865 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EU52 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437775 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1598.6 bits (4138), Expect = 0.0e+00 Identity = 791/867 (91.23%), Postives = 835/867 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KQ76 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497696 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1596.3 bits (4132), Expect = 0.0e+00 Identity = 787/867 (90.77%), Postives = 837/867 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. NCBI nr
Match: XP_008450385.1 (PREDICTED: nuclear cap-binding protein subunit 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1722 bits (4459), Expect = 0.0 Identity = 864/864 (100.00%), Postives = 864/864 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. NCBI nr
Match: XP_004139050.1 (nuclear cap-binding protein subunit 1 [Cucumis sativus] >KGN66512.1 hypothetical protein Csa_007431 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1695 bits (4390), Expect = 0.0 Identity = 847/862 (98.26%), Postives = 854/862 (99.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. NCBI nr
Match: KAA0067225.1 (nuclear cap-binding protein subunit 1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27755.1 nuclear cap-binding protein subunit 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1667 bits (4317), Expect = 0.0 Identity = 842/865 (97.34%), Postives = 845/865 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. NCBI nr
Match: XP_038878426.1 (nuclear cap-binding protein subunit 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1651 bits (4276), Expect = 0.0 Identity = 823/866 (95.03%), Postives = 844/866 (97.46%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. NCBI nr
Match: XP_022931611.1 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1592 bits (4122), Expect = 0.0 Identity = 791/867 (91.23%), Postives = 835/867 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0008309 vs. TAIR 10
Match: AT2G13540.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1200.7 bits (3105), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/860 (68.14%), Postives = 710/860 (82.56%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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