IVF0007543 (gene) Melon (IVF77) v1

Overview
NameIVF0007543
Typegene
OrganismCucumis melo L. ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr03: 22357220 .. 22364599 (+)
RNA-Seq ExpressionIVF0007543
SyntenyIVF0007543
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGTAGGAAAATTAAATTCAAGAAGCTAATTACAAGCTTTCAGCAACTGGACCTCATACCGGTAGAAAATTGCTTAAGTTCAAATCTTAGAGGGTGTTTGGGGTTAGGGTTTGGGCTGTGGGGTTAGGTTAGCCCAACCCTAACCCCCGTTTGGGCCCAATGTTAAGGAAACCCTAGTTTTAGGGTTTCCTTAACACGATTTCACTCTTCCCCTTTGAACGGCGATACGCGTGTTCGTGAATCCGGTTTCGTTCTTCAGCGCAATCCGTCCTCGATTTTTCCTTCAAACCGATTTCATCTTCTCCTCAACCCTTCTTCCTCCATATTTTTTCCTTTTTCTTTCTTTCTGTCATCTCCCTCATGGAAACCATGTTTCGTTTCGTCTTCTCCCTCAAGTTTTCTAGGGTTTGTGTTCGTTCTCTTTTGTCCGGTCGATTTTGGTTTTTTTCGTTTCATCCTTTAATCCATTCGTTCGTTTCGTCTTCTCCCTCAAGTTTTCTATGGTTTGTGTTCGTTCTCTTTTGTCCGGTCGATTTTGGTTTTTTCCGTTTCATCCTTTAATCCATTCGATCGTTTCGTCTTCTCCCTCAAGTTTTCTATGGTTTCTGTTCGTTCTCTTTTGTCCGATCGATTTTGGTTTTTTCCGTTTCATCCTTTAATCCATCGTTCCTTTCGTCTTCTCCCTCAACCTTTAATCCATTCTGCCCTTGCGTTTTCGTGATGAAACCGGATTTCGTTACGCCGAATCTCTCTCTAAATCTCTCTCATCCGTCTCTCTCACTCCGAAAGGGCTTCTGCGTTCGTTGAAGCCGACGAATTCGTTGGCTCCGAACACGATTTCCTTTTTGGAATCGTGGGTTTTGGCTCCTTCAAACCTCCTTGCCGCCGTGGTTCGTTTATGCTCTCGGGTCCTTCGATTGGCAATAGGACAGATTCTTCACTCTGCCATTGGAGCTTGGTAGGGAGGTTTGGAGTTCTCAATCCACTTTTTTTTAAAGCCGATGATGAGTTCTAATTTGTGCTGAATTGTTCTGTATTGTTTACCAATGTGTTATGTGTTCTGTATTGTTTACCTATGTGTTGTGTGTTCTGTATTGTTTACCTATGTGTTGTGTGTTCTGTATTGTTTACCTTTGTGTTCTCTGTTCTCTATTGTTTACCTATGTATTATGTGTTCTGAATTCTTTACCTATGTGTTATTTTTTAATGAATGTATGTAGTTCCGGCCATGATGAGTTCGAATTTGTGTAATACTCAATTTGTGTAACATGTCTTCTCTGTATTCTTACCAATTTTCTTACAATTGTTGTTTTTTTTACAATTGTTTTATTCTTACCTTTGTCTGTACAATTGTTTCATTTTAAAATTTGTTACATTCTTTTTCAATTCTTGTATTGTTCTGTATATGTATTCTTTGTATTCTTTTGCCATGTCCTGTTGTCTCTTCCATGTCTTTTTAGTGTATGGATTTGACTTCACATTTGGTTACAAAATTTATTACAATCCTTCTATTCTGTTTTATTGTTCTGTTCATTTACTTCCATTTAGTTTAATTTACAAAATTTGTTTGTCTGTATTGTTACATTGTTAATTTATTTCTCTGTATTCTTTCTGTCCAGTGTTGTCTCTTCTTCCTTTCTGTCCAGTGTTGTCTCTTCTTCCTTTCTGTCCATTGTTTTCTCTTCCATGTTTTTGTAGGGTATGGTTTTGGTATAGGTTTCAGTATATAGCCTTTGACTATGCTATGCTTTATGTCAGTTGTAGCAGAGAGATAGGGCCTGTATTTTATTGATAGTTGGCTGTACTTTGCTATTTTGGTCTTTATATTTTTGTTTACCTCCCTCCAAGTCCTATCAACTTGCCCCATCTTTCCCCTATATATTGCCACCTTTCCTCTTTTGATTCACTGCATTCTTCTCCCTCTTTTTATCATCTCTGTGGTTCTAAGTTATATTTTGTAAGTCCTCTTCTTCTTTACTGTTACCATGTATCTTTTGTACCCTCTATGTGCTTGTAACTTATTTTTTGTATTCATTACCGTTACCATGTAGGTTGTCTCTTCCATGTCTTTTTAGTGTATGGTTTTTGCGATATGTTTTCTATACATTTCTGTCCTTTATTTCTTTTTCTATAACTATGATGGAATTCCATTCATTATTTTGAATGGAATCAAAACTCTGAGGCTACTAAATTAAAATCAATCTTATTTTTACGGTTTCCCGATTCAATCTTCATTTGGAGTTTAATTTTTCGTCCTAAAAAGGTATGTATATTTAATTTTTTTTTCATACGTTTTTTATTGTGTTTTAATTACAAATAATAATCATATTCTTCTCTTATGTAGGACGTTGCGACGAAGGAGTTCGAAATTATTTGAAGAGGTACTCTTGTAATAGCCGTTTGTAGGCTTTGATAATGTATTTTATTTTTGTTCATTTTTTTCCGGTTTTGTATAATTTTATAATTAACATTTTGTATATAGAACATTCGGGTTAATTTTGTTACATAATGTATCCTTTTAATTTTCTGTTTTTTAACAATTTTTTTCTATATAGTAATAAAGTTTGTACAAATGTGTTTGAAGCTTTGAAAATTTAGTACACACGTTCCAAAGTTTAATCACATTTTTGTTTTAATAATTTACTCCAAAGCGTTTTAAACATAAATTCTAACTTTTATTTTTCTACCAACAAATAATTCAAAAGTCTAATAAAAACTATTGTATATACAATTGAGAGTTCGTGGCCTTATAAAAAGTTTTGCAAGTTGTAAGACCTAATAAAATGGACATAGGTTGAGAAAATAGAGATACAAAAACTCTCCAAGGAAAATGTATTTATTTCTTTCATAAAAAAAACAGAAATGATATATTATTTATTTCACTTGAAATATTTGGTATTTTGTTAATTTATATTTAAAGATCAAATATTGAGATTAGTAATTATGAGCAATATAGAAGTCATAAAAAAATTCATATACATTCTAAATAATTTAAAATTAGTTAAAAATATTCTCTTCATCTAAAAATTTAAAATTTAGTTAAAAAATATATATACATTGAAAATAGGTTTTTTCCTAAAAAGAAAAAAGAAAATAGGTTATGTAGCATATTGTGACGTTAAAGAAAGAAAATAAATGTTGGTGATTTTCAAACATTTTTCCTATTCTCCATTCTAATGTTCTTAAGCCTCATTTAATACCAATTTTTATATTTAATTTAAAACTAATGAAACTTCAACTATTTGTAAAGTTATTTTATTCTCACACATTTGTATGAAATTGTATTTTAACCACAAACTTATTAATATGTTTTCACCACATACTTTTTTCTTTTATTTTAACCTTCTTTATGTTTTGTTGAATTTTTTTTTTCAACCAATTTCATTTCTATTTTTAAAATACTTATTTTAGAACTAAAATAGATTGTAAAAATTGTTGAAATAACCTTCTTTATTGTTCGGTTTTCAATGTTCTCGTCAGTCATAATCTAATTTTTTTGTTCTATGTTTATAGTTTTACTAAATATGGATATTACTAAGTTTACATATCTTTTCACAATATATCGATATTGTACCAATTTAAATAGTACATGTTTTTAGGGAACTTTACATACATTGTAATGGATGAACAAACACTTATTGGAGTTCTAACTGCATTCACGTTGGCCCAACGTCAGATTTTACTAACGTTGGAGCTATTAATGAACAACAATAAGCGTCTCTCACATACACCGCCCGATACACGCCATAGAATTAGGGAGCTTGCTTACTTTCGCATGATACACGAGTCAGATCTTGTGTGTCGGCAAAGCACGCGGATGGATAGGCGAACATTCGCAATTCTATGTCATTTACTTAGAAATGTCGCTGGTCTTTCTTCAACTGAAATTGTCGATGTTGAGGAAATGGTAGCAATGTTCTTGCACGTCCTCGCTCATGACGTGAAGAACCGCGTCATACAACGAGAATTTGTACGCTCCGGTGAGACAGTATCTCGACATTTCAACATCGTATTGTTGGCTGTTCTTCGACTGTACGAGGAGTTGATAAAGAGACCTGTTCCGGTAACAAGTAACTGCAATGATCAACGTTGGAAGTGTTTCGAGGTGGGCATCGTAGAAGTTCACTATAATTGACCTTTAGGTACATCGCAGTTAATTCATCGTGTTTCTTTCAACCTGCAGAACTGCCTTGGCGCGTTAGACGGGACGTACATAAAGGTGAACGTCCCCGCAGGAGATCGGCCTACTTTCAGAACGCGTAAGGGGGAAATTGCCACAAACGTTCTTGGGGTCTGTGACACGAAAGGGGATTTCGTTTATGTCCTCGCCGGTTGGGAAGGATCTGCAGCAGACTCGCGGATCCTACGTGATGCGATTTCACGAGAAAATGGACTACAAGTGCCAAAGGGTATATCTTGTTTATAATAAAACACCGTCGCTTCCTACTTACCTATTTAAAGTTCATAAACAAACCATTTAATAACAGGATATTATTATCTGTGCGATGCTGGATATCCAAACGCGGAGGGGTTTCTCGCCCCGTACAGAGGCCAGCGGTACCATTTGCAAGAGTGGCGTGGTGCTGCAAATGCGCCAACAAATGCAAAGGAGTACTTCAACATGAAGCACTCCTCCGCAAGGAATGTTATTGAGCGGGCGTTCGGTGTTCTAAAGGGTCGTTGGGCCATTCTTCGTGGAAAGTCGTACTATCCCCTGCAAGTCCAGTGTCGCACCATTCTAGCATGTGCCTTGCTTCACAATTTGATCAACAGGGAAATGACATATTGCGACGACGTTGAGGACGAGGACGAGGGGGACTCCACGTACGCAACGACCACCGCTTCAGAAGACATTCAGTACATTGAGACAACAAACGAGTGGTCTCAGTGGCGCGACGACCTAGTCGCATCGATGTTCACCGATTGGCAGTTCCGTAACGCTTAGCTAAGACAAATTTAGATAACAAGTTTTTTATGACTTCGTCGCAATTCTATCGTGTCTAACATGTACTGTAAAAACTAATATGGCCTGTTGCATATGTATTGTACGCGTGCCATAATTTGTATCATGCCTATTTTATTTTGGAGTTTAATGGTGAAATTACTTATGTACTGCATGTATTTTTTCTAATTTCTGATTCTCAGTATGTCAACCTCAAATCGTGCCCCGAGACATGTTTGGACGAGGGAGGAGGAGGGGACTCTTGTCGAATGTTTAATGGAGCTAGTGTCAATGGGGGGCTGGAAATCAGATAATGGTACATTCCGCCCAGGATACCTTGCGCAGTTGGTACGCATGATGGCAGAGAAACTACCTGGATGTCAGGTACGAGCAACAACTGTAATTGATTGTAGGATCAAGACACTGAAGCGAACGTTCCAGGCCATTGCCGAAATGCGGGGCCCAGCGTGCAGTGGCTTTGGGTGGAACGATGAAGAGAAATGTATCGTTGCGGAGAAGGAATTATTTGATAATTGGGTTAGGGTATGGAATATAATTTAAACGTGACACAACGTTCACAATTTACATTTAGTAAACAATTTTTCAATTAGTACTCATACGTCATATTTTTTTTTCTGCCCGCAGTCGCATCCTGCAGCGAAAGGACTCCTGAACAAACCATTCCCGTATTACGACGAGCTTACATATGTATTTGGTCGCGATAGGGCGACCGGTCGGTTCGCTGAGACATTCGCGGACGTGGGGTCTAACGAGCCAGGTGGCGGATATGACAGATTTGATATGGGGGATGGAAACGAGGACTTCCCGTCCGTGTACAACCAGGGAGTTGACATCTCGCAGGACGATGTACGTGCATCCCGACCTTCTCACGCTTCAGAGGGTAGGACCGGATCAAGTGGATCGAAGAGGAAGAGGGGAAGTCAGCGAGACTTCAAGCTTGAAGCAATACATCTGGCGCTCGACCAAACAAAGAGCAACTCAGGCAGATTGCGGAGTGGCCAGCACGCAACCTTGCAAATGACAACCACGTGCGCACGGAATTTTTCCGCATATTGCGTGAGATGCCAGAACTTACGAGTTTGGATAGGGCGTTATTGCAAAGGCATCTTTTGTCTCGTATGGACGACCTTCGGGGTTTCGTACTCATGCCTGAGGATGAAAGGGAGGGATTCTGTAGAGTCCTCCTATGAGACATAGAGAGATAGTTTCTGTTTGTAGTGACCTGTGTTGCTTATTATTTCCTTACGTTTTTTTTTGTATCATGTTGACTATTTATGCATTTTCTATTGTCAAAAACTTTTTTCTTCATTGGTAATGTTTATTTTAAATGAAAGAAAATAGTCACAATTTTCCAAAAGCGTTATAACGGCTATTTATATAGGTTTAAAATTGGATGACTTCGCTATCGCCCATTAGAAATATTGAATAATTTTTTTATCTTTATAAGAAATTAATTGTAATAAATTTATCACAATATGTTCAGAAATTTATTTTAATTTGGGCAACTGTATGTATTAATTTAATAACATTACACATACAACAAATAAAATAGGAGAATAATACGGATTCGAGGATTTCGTAAAAAAATATGCAATAATTTTTTTATGATATTTACAATTTAATTTAAAAATATTATACCACATAAAAAATTAATTAACCCAACCCATTTAACAATTTTCCCAAATAAAATTTATCACAAAATCCACATAAACCTACCCACCTAACCCTTCCCCCAAACACATTTTATCATAAAATCCCCATTAAACTACCCACCTAACCCTTCCCCCAAACACATCTTATCATAAAATCCCCATTAATCCTCCCCACCTAACCCTTCCCCCAAACACATTTTATCATAAAATCCCCATTAACTCTTCCCACCTAACCCTTCCCTCAAACACATATTATCATAAAACTACCTTTTTAAACCCTTCCCCCAAACAAGGGTTATGATAAAACTAGGTTTAACTTAACATTAGTTTTATCTTAACACTAACCCTTCCCTAAATCAACCCTTCCCCCAAACGCACCCTTAGGGTTTTTCCCCTATTCGAATATTTATCAATAACCGAAATGCATCTTGCACGATTTGATGTTGTTACCGATTGTACTCCCTGCCGTCCGCTTAATCTTTTTCGAACTGATAATGGAATATTTGACTCTACCCTATTTTCATTCTCCCACCTACATTACCTGCCTGTCTCTTTTAAAGACTTGTTCGGTTCTCACTACTCTCTCTATCGTGTTTTCTCTTTCTTCCTGCCATGTTTATCCTTAATTGCGATTCTTAAATATGGGTTTGACCACAGTTCAAACTTTGAGAGGAAATTATCAAACGAACACAATCCAACTAGTGAAAAATATCAAACTGAATACGTTGTCGAATTCAATGTCTACGAACTTCAAGACAAATAA

mRNA sequence

ATGGGTAGGAAAATTAAATTCAAGAAGCTAATTACAAGCTTTCAGCAACTGGACCTCATACCGGTAGAAAATTGCTTAAGTTCAAATCTTAGAGGGGTTTTTCCCCTATTCGAATATTTATCAATAACCGAAATGCATCTTGCACGATTTGATGTTGTTACCGATTGTACTCCCTGCCGTCCGCTTAATCTTTTTCGAACTGATAATGGAATATTTGACTCTACCCTATTTTCATTCTCCCACCTACATTACCTGCCTGTCTCTTTTAAAGACTTTTCAAACTTTGAGAGGAAATTATCAAACGAACACAATCCAACTAGTGAAAAATATCAAACTGAATACGTTGTCGAATTCAATGTCTACGAACTTCAAGACAAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGTAGGAAAATTAAATTCAAGAAGCTAATTACAAGCTTTCAGCAACTGGACCTCATACCGGTAGAAAATTGCTTAAGTTCAAATCTTAGAGGGGTTTTTCCCCTATTCGAATATTTATCAATAACCGAAATGCATCTTGCACGATTTGATGTTGTTACCGATTGTACTCCCTGCCGTCCGCTTAATCTTTTTCGAACTGATAATGGAATATTTGACTCTACCCTATTTTCATTCTCCCACCTACATTACCTGCCTGTCTCTTTTAAAGACTTTTCAAACTTTGAGAGGAAATTATCAAACGAACACAATCCAACTAGTGAAAAATATCAAACTGAATACGTTGTCGAATTCAATGTCTACGAACTTCAAGACAAATAA

Protein sequence

MGRKIKFKKLITSFQQLDLIPVENCLSSNLRGVFPLFEYLSITEMHLARFDVVTDCTPCRPLNLFRTDNGIFDSTLFSFSHLHYLPVSFKDFSNFERKLSNEHNPTSEKYQTEYVVEFNVYELQDK
Homology
[Close]
BLAST of IVF0007543 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KDF8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G399750 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 4.0e-26
Identity = 79/135 (58.52%), Postives = 82/135 (60.74%), Query Frame = 0 

Query: 1   MGRKIKFKKLITSFQQLDLIPVENCL-SSNLRGVFPLFEYLSITEMHL--------ARFD 60
           MG+KIK KKLITSFQQLDLIPV+NC  SSNLR VFP FE LSI EMHL        ARFD
Sbjct: 1   MGKKIKLKKLITSFQQLDLIPVKNCFRSSNLR-VFPQFESLSIIEMHLANCCWSINARFD 60

Query: 61  VVTDCTPCRPLNLFRTDNGIFDSTLFSFSHLHYLPVSFKDFSNFERKLSNEHNPTSEKYQ 120
           VVTDCTPCRPL                            +      KLSNE NPTSE  Q
Sbjct: 61  VVTDCTPCRPLEF--------------------------EVETLRGKLSNEPNPTSENGQ 108

Query: 121 TEYVVEFNVYELQDK 127
           TEYVVEFNVYEL DK
Sbjct: 121 TEYVVEFNVYELHDK 108

[Close]
BLAST of IVF0007543 vs. NCBI nr
Match: KGN47750.1 (hypothetical protein Csa_003497 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 127 bits (318), Expect = 6.33e-35
Identity = 79/135 (58.52%), Postives = 82/135 (60.74%), Query Frame = 0 

Query: 1   MGRKIKFKKLITSFQQLDLIPVENCL-SSNLRGVFPLFEYLSITEMHLA--------RFD 60
           MG+KIK KKLITSFQQLDLIPV+NC  SSNLR VFP FE LSI EMHLA        RFD
Sbjct: 1   MGKKIKLKKLITSFQQLDLIPVKNCFRSSNLR-VFPQFESLSIIEMHLANCCWSINARFD 60

Query: 61  VVTDCTPCRPLNLFRTDNGIFDSTLFSFSHLHYLPVSFKDFSNFERKLSNEHNPTSEKYQ 120
           VVTDCTPCRPL                            +      KLSNE NPTSE  Q
Sbjct: 61  VVTDCTPCRPLEF--------------------------EVETLRGKLSNEPNPTSENGQ 108

Query: 121 TEYVVEFNVYELQDK 126
           TEYVVEFNVYEL DK
Sbjct: 121 TEYVVEFNVYELHDK 108

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of IVF0007543 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of IVF0007543 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KDF84.0e-2658.52Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G399750 PE=4 SV=1[more]
BLAST of IVF0007543 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN47750.16.33e-3558.52hypothetical protein Csa_003497 [Cucumis sativus][more]
BLAST of IVF0007543 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
IVF0007543.1IVF0007543.1mRNA