IVF0007336 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAAGAATTGCGTTGAACTGGGACGCGGTTCCTATTGACTTCTTCTTCCATTCTCTCATTCTCTTGCATTTTTTCCGATCTCTATTTCTTTTTCCGTCACTATCAATTTCCATTCTCAATTTCTTTACCGATCGCTTTGCTTCAACAAACTGTCCGATTAATCGAAATCCATCTCACCGGCATTGGAGAAATAGTTTCTGTAACTGTCAAACAAACATTGATCCAAGTTGAGAGTTTTAGTTTTGATCTCATTTTTTGCGTATTGGAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCCGGGGGAGGCAAGGGCGGTGATGTCGTGGCTTAGAGCAGCGGTGATCAGGGCGGTGGAAGCAGGTGCCGGAGGGAAGGATAACATCACCCGCACTGTCCGTAACGTTGCCGGCACCGTCGTTTACCATGCAGGAAATGCTGTTGTGGAGGGCGCCAAGATCATTCAAGATCGCATTGTAATTTCATTCTCACTTTTCCTCTCAATTCTTAATGCGTCTGATGCCGTTTGGTTCTGTCAGTTGTTATCGTTGTGAATATTTGAACGTTTATTTCTAGGGCATGGAACCGTACGGTATTGTTCTCTGCTTCATGTGCAGCTTTGTTTGTATTACGTTACGTCTGTGGGCAATGTGCATAATGTGCATTACTAATTATCTTTTTGTATCCGCATTTGTTACTTGTTGCAATCTCTGCTTCTCAGACGAGTTAATTTTAAGGTTTGATTTTTGAGGCAGGGACCGAGGAATATGCAGGGCTTCAAACAGACAGTAAAAAGGCTGGAAGAAATATCTGTTTCATCTAGAGGCATAGAAAGAGTTCAGTTATTGAGAAGGTGGCTAGTTGCGCTCAAAGAGGTGGATAGATTTTCACTAGGTTCAATCGATGGTGGTAAAAATAGTCCGACAGATCAGCTTAATGAGGAAAATAAAGATTCTCCGAAAAAACCTACATTGGTGTGTATATCAATTAGTGTTCTGTTCCTGAACATTTTTGCATGCCTGATTTGATCGAAGAATTTATGGTTGTTTTTTTGTTCGTTTTCTCCCCCAGCATTGAATGTCATGAAATGCTGCTTGATATCTTACGCAGGTCTATTATGTGGACCCAGATATGGGAGGTGAGCTAAAAACTTTTCGTGATGTATTTCTCACAAGCCAAGCTCTAGAAGGCATTACGCTGTCTATGGTGAGTCGATTCAAGTGCATGACGACATCCATTTGTTTGCAAAACATTGGTATGCGAAAATATGCTAAGTTGTTCCAACTTCCAAATATATCAACATTCATTTACTTTGTCTCTGTTGGAAATATGTAATAATCTAACGAGCATGAAAGGCCTCGAGTTTGAACCTGATTTATTTTATATGTAATTTATTGTATTTTACCCCCACCCGAGAATTGAGGGATCTCTTGTTCTTAACTACTTTTGTGGGTTTTGTTTTTGCTGATCATAGAGCTTAACCGCTGGTTAACTCTTTTCTATGACTCAGATTCTCGAAGAACCTAATGACGAAGAAGAATCACTACTTCTAGAAATTTATGGGTGAATATTCATTCTCAGTTAGGCCTTACGTGTTCTTTATGCCCTGCAGCTGATTTCAGTAATTCTTCTCACGTTACTTTTGCCGACAAGAAGAAATATTATTAGAAACTTCTATGCCTCACGATCATTTTCCCACTCATATCTTTAGATTTTAAGTTCCCTTTATCATGGGTATATTCAGGCTCTGTCTTTCAGGAGGAAAGGAAGTACGTCAAGCGGTAATGACGAGTGTACACAATTTGGCAAAAGCATTTTCAGAATACCAAGATGAAATACTGGTAATGTCATGAAGGCATGAATTAATTTCAGCATAAAATTAGCATGGGCAAAGCAGTCACTTCCGTCTGTCGCTGCCATTTTTAGGTAAAACGAGAAGAATTGCTCCAATATGTCCAAGATGCAATTGCTGGGCTGAAAATAAATGCTGATTTTGATAGGTGGTGAAAAAGCATATCTTTCATATCTTTCATATCTTTCATATCTTTCATTGGTATGCATGCACGAACTTTTATGGACAGACTTACAACTGAACTAATTGAAATCTATATTACGTGGTGGGTGTTAGCTCTAATGAGACTTCCAAGTTTGTATGACAAAAAAGGGGAATGTCCATGGAGAAAGCAAGAATTAATGTCCAAAGAGAACATTCAATCAAACTTGATCATAAACCTGATCCTTATCTCACTTATAAATTTAGTGTCATTAAATTTATATTTGTTTTTGTCAATAGAGAAAACTACACAAACGAAGTGCACACACGTAGCTTTCTATTCTTTTATATGTGATCGAATAAAATCACTTTGTTTTTCTATGTAACCTCGAGCTTGTTATTATCCAGTGAAAAAAGGGATTTGCTATAGACAATTCACCATAAGAGAAAGTAACATCCCACTCTGAAAGGATTACAAAAAGCTTCAGTTCACTGATGGTTTTATTAGACTGATTGACTAATTATAATTTCCAATTTCATATTAATGAAGCTTGTAAGTTTTTCTTTTGATGTTGCGTTCCTGGGTATATCATTTTGTATGATCAATTTGGTGGTGCCCTAGATGTATTCTATGTGAAGTTATAATGGTTTATTCCTATTTTTACTCTTATCTTTCTTTCTTTAACAAGAAGCAAAATGTTTCCTTAATGGTTGAAAAATTATAAAAGACTTCAAGAATTTAAGGTCTACAAAGTGTAGACATGAGAAAATAAAAAAAACTAAGCTCTTCCAACTAGATCGTATTTTTGGTAAAAAATAATTTTGGGTTATTCAGAAATGTTAAAAGATTAGGAATTTCATGAAGCCTTTTGTGAAATACCATGAAAACCTTGAAACTACAGTTAAGAATTTTTCTTCAATAAAGTTGGTAATGGTATGTTATCAAGACTTTTCTCTGGCATGATTCTGTTAGACCCCCAATCAATTTCGTTTACAGTAGAAGGAATAAAAATAAATAAAAAAATAGTTAGTTAACACGTGTTAAATGTGGGTGGAGGGAGAGTCGGTGAGTGTTGTATATAAATAGGAGTTTGGGCGGGAAAAGAGGAAGAAAAATATGAGATAATTGAGGAAAAGGCAGCCGAAGAGAAGACATTAGCAGTGCTGCAAGTAGAGGAGGAACAGAAGGCTTATGCAGAGTTATCTATTAACTCTGTTGTTGGATTAAATGATCCTGAACAATGAAAGTCAGAGATAAGTTACAAGGAAGAGAACGTGATCATATTGATAGATTGTGGAGCTACTCACAATTTCATATCCGAGAAGTTGGTAAAATCTTTACAATTGCCAATTAGAGACACTGCTCATTATGGAGTTATTTTGGGATCGGGAACAGCAATACAAGGCAAGGGCGTATTTGAAGATGTAGAAATTCAATTAATGAATTGGAGTGTGAAAGAAGAGTTTCTGCCACTTGAGCTTGAAGGTGTGGATGTTATTTTGGGTATGCAATGGCTTCATTCTTTGGGAGTAACAGTAGTTGATTGGAAAAATTTAACCCTCACGTTTTCTGCCGAAGGAAAAGAAATCTGTGTTAGGGGGATCCTAGTCTTACAAAAGCTCGAATAAGTCTTAAGAGTATGTTTAAGACTTGGCTGGATCAAGATGAAGGGTATTTAATTGAATGTAGAGCAGTAGAAGTTTGTGAGGAACTTGAGCAGAGCAGTACAGAGATTGTTCAATCTGAATCTGGGCCGGTGCAATTGATGTTAAAGCAATTTGAAGATGTTTTCGAATGGCCTGGGAAGTTCCCACCTAGGAGAAAGATTGAGCATCAAATAACATTTGAAGGAGGGTACTAATCCGATCAATGTAAGACCATATAGATATGGATATCAACAAAAGGCAGAAATGGAAAGATTGGTGGAAGAGATGCTATCATCAGGAGTTATTCGGCCAAGTAATAGCCCATTCTCGAGTCCAGTACTGTTGGTTAAAAAGAAAGACGGCAGCTGGCGTTTTTGTGTCGATTACCGTGCAGTAAACAATTCTACTGTCCCTGATAAGTTCCCAATTCCCGTGGTAGAAGAGTTATTTGATGAATTGAACGGCGCATCCGTATTCTCAAAAATAGATCTCAAATCGGGGTATCATCAAATAAGAATGGTTGATGAAGACATTCCTAAAACGGCTTTTCGCACTCATGAGGGTCATTATGAGTTTCTTGTTATGCCGTTTGGATTAACTAATGCCCCGGCCACCTTTCAAGCTTTGATGAATACTATTTTCAAACCGTATTTAAGAAAGTTTGTTTTGGTATTCTTCGATGATATCTTAATTTACAGCAAATATGAGAGAGATCATGTCGAGCATATTGAAAAGGTCTTTCTAACATTGAGAAGACATGCTTTGTTTGCTAATAAGAAAAAGTGTAGTTTTGCTCAGCAAAAGATTGAATATTTGGGACATGTCATATCAGGGGAAGGAGTAGAAGTTGATCCTGATAAAATCAAAGCAATTGCTGACTGGCCATGTCCAACAAACGTAAGAGAAGTTCAAGGTTTCCTTGGGTTAACGGGCTACTATAGGAGATTTGTTCAACATTATGGCTCCATAGCTGCTTCTTTGACCCAACTACTTAAGAAGGGTGGATTTAAATGGAATGAAGAGGCTGAGGAAGCGTTCTTGAAGTTAAAAACTGCAATGTTAACTGTACCGGTATTGGCATTACCCACCTTTGACCATCCTTTTGAAATTGAAACAGATGCTTCTGGCTACGGAGTGGGGGCAGTGTTAGTTCAGTCTAAAAGGCCTATTGCTTTCTACAGTCATACTTTATCAATGAGGGATAGAGCTCCGCCAGTGTACGAATGTGAGTTGACGGTTGTTGTACTGTCTGTACAAAGATGGAGGCCTTATTTGCTGGGAACGAAGTTTGTTGTAAAAACAAATCAAAAGTCATTTAAATTTCTATTGGAGCAGAGAGTTGTTCAACCACAGTATCAAAAAT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MSWLRAAVIRAVEAGAGGKDNITRTVRNVAGTVVYHAGNAVVEGAKIIQDRIGPRNMQGFKQTVKRLEEISVSSRGIERVQLLRRWLVALKEVDRFSLGSIDGGKNSPTDQLNEENKDSPKKPTLVYYVDPDMGGELKTFRDVFLTSQALEGITLSMILEEPNDEEESLLLEIYGLCLSGGKEVRQAVMTSVHNLAKAFSEYQDEILVKREELLQYVQDAIAGLKINADFDRIDAKACSLKETLDENHEELPLSREDQDNTSDGETRASKILQEILSQVQLCSKLEELLLKKKLFNDGDSPQLHAEKVEKLRILSESLANSTLKAEKRIVDHREQKEEALNFRVAKSKEMVQAEKELTDDIGELENQKDRLEAELKKVNTLLSAARMRLHNAREEREHFDEASNQILVHLKTKEDELFKSVASYKVEAGAVNACKNFLEHTWNLQISQRQLKEEHVDGELEKYGDYFVKLVISLLSSYKGKLEPALSCIRKLEENLSSMKESDVSPDIDDRSLNVHKQRRKLEEEYLDMESKFVSTLSTVDTVRMQFYETKGVVRNLDEKVQETFDALEKIKQEFESIKRPKLMIETVRRKPELPINEKPHIENSNPSFTLEQTAKVRKLNFEEIDESLAKQTKNFSMEAEMAKLDSDEGVDTIDSNEEINDWEFDELGRDYETTSNHQKR Homology
BLAST of IVF0007336 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BI64 (uncharacterized protein LOC103489834 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489834 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1289.2 bits (3335), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/681 (99.85%), Postives = 681/681 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BI59 (myosin-11 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489834 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1284.6 bits (3323), Expect = 0.0e+00 Identity = 680/682 (99.71%), Postives = 681/682 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRU2 (uncharacterized protein LOC111013735 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013735 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1082.0 bits (2797), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/684 (84.80%), Postives = 625/684 (91.37%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQU3 (uncharacterized protein LOC111013735 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013735 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1077.4 bits (2785), Expect = 0.0e+00 Identity = 580/685 (84.67%), Postives = 625/685 (91.24%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GG85 (myosin-6-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453873 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1057.0 bits (2732), Expect = 3.4e-305 Identity = 573/689 (83.16%), Postives = 623/689 (90.42%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. NCBI nr
Match: XP_008447377.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489834 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1289 bits (3335), Expect = 0.0 Identity = 680/681 (99.85%), Postives = 681/681 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. NCBI nr
Match: XP_008447372.1 (PREDICTED: myosin-11 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1284 bits (3323), Expect = 0.0 Identity = 680/682 (99.71%), Postives = 681/682 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. NCBI nr
Match: XP_011653612.1 (restin homolog isoform X4 [Cucumis sativus] >KAE8649520.1 hypothetical protein Csa_018134 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1254 bits (3244), Expect = 0.0 Identity = 660/681 (96.92%), Postives = 670/681 (98.38%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. NCBI nr
Match: XP_011653611.1 (golgin subfamily B member 1 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1249 bits (3232), Expect = 0.0 Identity = 660/682 (96.77%), Postives = 670/682 (98.24%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. NCBI nr
Match: XP_031739540.1 (uncharacterized protein LOC101209774 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1248 bits (3229), Expect = 0.0 Identity = 660/685 (96.35%), Postives = 670/685 (97.81%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. TAIR 10
Match: AT2G37370.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G13560.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 577.4 bits (1487), Expect = 1.5e-164 Identity = 344/675 (50.96%), Postives = 462/675 (68.44%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0007336 vs. TAIR 10
Match: AT5G13560.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G37370.1); Has 12055 Blast hits to 8846 proteins in 811 species: Archae - 217; Bacteria - 1046; Metazoa - 6104; Fungi - 1115; Plants - 528; Viruses - 14; Other Eukaryotes - 3031 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 537.0 bits (1382), Expect = 2.3e-152 Identity = 324/686 (47.23%), Postives = 450/686 (65.60%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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