IVF0004977 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTCCCTTATTTTCTCCTTTCCTTTTCGTTTCACTTCTCCTTCTTTTCCTTTCCACCGATTCATCTTCCTAAAACCCGTTTCTTTTTTTCGTCCTTATTTTTTTCCAACCCATTTCTTCCTACCCCACCCACGATCTTCCAACCCAGCTAGCTCCCGACACCCTACAACCCAGCTGTTGTCGCCGCTGTCACGCCCTACTACCGCCACCTCCGTCAAACTCAGCTGCTGCCGCAGTCGTCACACCTAGCTGCCACCGTCAACCCAGCAACTCGTCGGAAGATTCCTCTTGTTGGTTAGTCTCCATTATCCTTTTTATGGCTTCTTCTTGTGATTCTGGTAAGTGAGGAGATTTTTCATAGATGGGACTAAGTGGGTTTTGGTTTTTTTTTCTTAAAAAGTTTTTACTACTTTGAATTTCATCTTTTTGACAATGCGATCGAGGGTTTTTGTTCTATTTGATTGATACCTAATTAGTGCATGGATTGATGGTTTGTGTTTTTTGTATGGGTTCTTTTTAAAAGAAATTGAAGAAGAATAAGAAGCAAGAAGAAGTTAACATTTGAAAATGGTATGAACCAAACTTTTGAACTAGTTTCAAATCTTGCTTGCATAAATTTGTGTGTACAGAAAGGGCCTTTTTTGAATGGACACTTATAAATCTTGCTCGAATCCTCCTACTTTGTTCGATATAATGATTTCCTAATGAAAAAATGCAATTAAAAATTCTTTGGTATGTCTGTAAAGCTTTACATAATCCCTAGCTTTGTATGGACACTTAGAAATTTTGTTGACTGAAGGAGTAGAGAGATTGAAGCATTTAGATGAGATGATGAATATGCAAGTTTCATTCTTAGATGGCTTTGAACCCACTCCCAAGACATGTGACCACTCCTGAAACATTGAGTTGGACCTTGAACTTAAGGTATGTATTTTATAAATTTCTAATTGTTTTTTTATTGGGGATAGATAGATTTATTTCAAATGATTCGTTTTGGCTATTCTGCCGTCCTTGTGTAAGGTTACTTTGAGAACGTCACTTTGAAGGTCTCAATGTAATTGTGATGTTGGGTGGCATGCTGAAGTGAGTTCTTGTGTAAGGAGTCAAGGTTTAGCGATTCTATTGTCATTAGATTTGTGGAAAGTGAAGTTGAGAGAGGTTGGATTGTTATGGTGTAGTTTGATCATGGAGCGAGTTTGAGGGGGCTTAAACATCACTTTTAAAGTCTCAATGTTATTGTTACCTTGGGTTGGCACGCCGAAGTTAGTTTTTGTGTAAGGAGCAACATATTATATTGGTGTTACATTTGTACAAAGAGTCAAAGTTGTTACATTGGGTTGTTATGAGCTAGGTTGATGTTGGAGTGAGTTTGTTGGGTTGTTATGGGGTAGGTTGATCATGGGAGTTAGTTTGATCATTGTTAGTGAAAAAGTTTTGGTTTTTGGCATCCATTTTGGTTTTTGGTTTTTGGCATCCATGTGAATAAATATCATATTAATTTCTAATTACATCATTACCTTGCAAAATTTCATAATTTAAACACCTTGGATGTTCTTTTGGATAAGATTTGGACGATAATGTTGTTCTAAGTTCTTTTTGGATTGGATTTCAATGTTTTAGAATTGTCCTTAACATTTTCTCATTCTTTCTCTAATTAAGCAACTAATAAATATTGTTTTCTTCCTCTCACAGGATTCAACAACTTTCCAAGTTTCAACAAATTAGAGACTTTGTTGAAGAAGTTGTTGCTTAATAGAAATAAGTTGAATGGATCTATCACTTTACTTGGTTAGTTGTTGCTTTAATTCTTTTCTATATAAGTTGCTTTAGTTTATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGTATATATATGATGTAATGAAGAAGTTGTTGCTCAATAGAAATAGTTACGTTAATGAAAATGTTCATATATCTAAATGTTGATTGTGATCAAAATTGAAGATGCCAGAGGCCTTATGGACTTTGATGACTAGGAGAAGCTTGTTGATAGTCTTGTTTAGTGAGCCTCATCTTTTCAAGGCGAGGTGCCTAGGCATGTGCTCTCGAGAGGGCTTTTTAAAAGACTGTTAATATATACATACATATGTATGTGTGTGTATAGATATCTATAGATACATATGTATGACAAGAATTGATTTTAAGTTGTTTCTCGTTCAAAATTCCTATATACCTTAAAAAAAAGAAAAAAACAAGGGTTGAATCCTTCCCCTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAATCCATTGCTTGCAGTTGGTATAATCAATTAGAATTTAGAGCCCATGGGTTTGATTCCTTCAAACTCTAACCTAGTTGAAAGAAAAACGAAATCTAGAACTTCAACTGTTTTAAAACAATCTCATTTCACAGTTGGGTTAAGAACTTCAATAATTCTCAGAAGAAATATAGAAATTCACATTTCTTCCCTCCCTTTGAAAATTGTAGAATACAATTCTAATAACTATTAACAAGTATTCCCCAGAAAGAAAAAGAAAAAAAATGAAAAAGAATGTTGTAAACACTCTCGTCCATTAATAAGCAACAATCAATTTGGGACTGATGCTTTCTTAATAACAGCAATTGCCATCCAGATAGCAGTTTTGAAAAATCCCAAGCTACAATTTACGCTTGAACAAACAACAAGCAATAAAACAACCAGACTCATAGAATGTGAGTTTACCATGACGATGGTTTAGAATTTGGCACTACCGAGTAATTCCTATGCGCTCGGGACGGCAAAGTTGGGCTAGCAGAAACCTTGTCAAACTCTCAGCCTTAGCATAGCTTCGAGTTCAAAGTCCCGTAAACGAGGGGAACATGACGAGAGGGTACTTTATCAATGTCGAAATGACCAAAAATAGTCCAAAAACATAAGAGTTAGAGAGATTTAGGATTCTTGGGTATATGAAATTACTAACATGCCCTACACAGATTAAAAAAGTTTGGATAATTATAATAGATAGCAATTTTAGAAATAATAATTAAGTGTGTAGCAACATTTTAAAAAAGTTATAAATGTAGTAGAATCATCAAAAGGCCTCCTTCATTAAAATTTGAAAGATGAGCCAAATTTCATTTGAGCTTCCAAAAAGAGGAAGCTTCCCATTCTCAGCCTTAGCATAGCTTCGAGTTCAAAGTCCCGTAAACGAGGGGAACATGACGAGAGGGTACTTTATCAATATCGAAATGACCAAAAATAGTCCAAAAACATAAGAGTTAGGGAGATTTAGGATTCTTGGGTATATGAAATGACAAACATGCCCTACAAAGATTAAAAAAGTTTGGATAATTATAATAGATAGCAATTTTAGAAATAATAATTAAGTGTGTAGCAACATTTTAAAAAAGTTATAAATGTAGCAGAATCTATTGACGATAAATTTCTATTGTTGATGGGCTCTAATGGTCTATCAGATAGACTAATAATTTTAACATGGTCTATCAGTGTTAAACTTTTATCTTTGATAGACTTTGACAGATTTTGTTCTATTTGCAATTTTTTTAAATGTTTCTATATATATGCTAATATTTTGAATCTAATTTTTATATTTCGCAACTATCCCTTTTCTAAAGCTTCCAATTTTCATGGGAAGCTTCCTCCTTTTGGAAGCTCAAATGAAATTTGGCTCATCTTTCAAATTTTAATGAAGGAGGCCTTTTGATGACGTCGGCCGCCTACGAATTTACCAAAAAAACCTCATATGCACATGAAGTTAATCCGCTTCGACAATATTCTCACTTCTCTTTCTCGTTCTTGTCCTCGTTTGGTGTTATGCATTCTTGCTCAACCCAATTTTGCCCGTTTGAAAAGTTAAAGTTGAAGCAAATTTCTCGTCTATTTATTTCTTGTCTCATTTTGCTCTTGTACATTTTCTCTCTCGTTCATTCCTCCCATTCTTTCTCATTCATTAGAGTTCCAATTGTCCATTCGTCTCATAAGCATACCTTCCACAAGTATCTATTGAAGTTATTAGTGATAACATGTTTCCCACTTTACACTTCTAATTTCAGTGCTTGTGTACTATTTAGGTTGTGGCGTTAGGGCTTGCACGTGACATTTGAATCCACATCACAAAATAACTCATCATAACACAAACACAGAACGAACAAGAAATCAGAGTACCTATCGATTCACGAACAAGACATATGATTAGAAATGAGAAGTAGGAATTGAAATAAGGAAGATCTAAGTGAAACTCATCAGATTAGGAAATGAAAAGCCCAAATAAGAAATAGGACTTAGACACGAGAAAGAGAAATGAGAAATATGTAGTGGAAACAAGAAAACACAACAAGAAAACGAATAGTCGGCTAACAGGATGGATCGACTTGTGAGGAAGATGCCTTCGCTGGTTGGACCTTTTTGTTGTATTAGTTGTTGGTATGCAGGGGATTTGGATCATATTCTCTGGCGCCAGTAGTATCTGAGAGACCTTTCAGACGTTTGGGTTGATGTATACTCATCATAGTCATGTTAGTGCTATGATTTAGGAGTATTTCCTAGGGAGAAGGGTTGTTTCTTACAGTGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGTGTTGTGATTTTATAGGTCATGTGGCGGAGCAGAATAGTAGGGTGTTTAGGGGTTTGGAAATGGATCCTACGGAGATTTGGTCCCTCATTCGCTTTCATACCACTTTGTGAGCTTCGATTTCGAAGACCTTTTGTAACTCTATTGGCACTATTGTGCATAGTTGGAGTTTTCCTTCCTTTAAAGGGTGCTTCCATCTTTTGTGGGCTTTTTTTTCTGAATGATCGTGTCTTCCTTCTTTTTTTCTTAATTAAAGTTGTTTTTATAGGAAAAAGTCATGCAGCCGTGTTCTTCTTCTTATCTCTCTCAATTTGTTTTTTATTTACAGGAAGAGTTCCGAAAGGCCATACTGCAAGTGGGGCCACCAGAAAATTTTGCTCTGCAGACAGTTCA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ATGGATCTATCACTTTACTTGGAAGAGTTCCGAAAGGCCATACTGCAAGTGGGGCCACCAGAAAATTTTGCTCTGCAGACAGTTCAAGATGTTATTAGACCTCAGAAGCACACAAAATTGGCCCAAGATGAAAATCAGTTGTTGGAAAATATTCTACGGCGACTACTTCAAGAATTAGTGTCATCTGCCGTCCAATCAACAGAGCCAGTAATGCAGTATGGGATGTCTATTGATGAAAAGGAAACTTCACAGGGTCATATTCCACGTCTTCTTGACATTGTCCTATATCTTTGTGAGAAAGAGCATGTCGAAGGAGGCATGATATTCCAACTGTTGGAGGACCTGACTGAAATGTCAACATTGAAGAACTGCAAAGATATTTTTGGTTACATTGAGAGTAAACAAGACATATTGGGAAAGCAAGAGCTTTTTGCTCGCGGAAAACTCGTCATGTTGAGAACGTGCAATCAATTGCTCCGTCGTCTATCAAAGGCAAGTGATGTGGTGTTTTGTGGACGCATTCTGATGTTTCTAGCACATTTTTTCCCTCTATCTGAACGCTCCGCTGTGAATATAAAAGGAGTGTTTAACACCTCCAACGAAACAAAATATGAGAAACAACTCCCTGATGGTTTTTCTATTGATTTCAACTTTTACAAGACCTTTTGGAGTTTACAGGAATTCTTTTGTAATCCTGCTTCCCTTGCACTCGCTTCGACGAAGTGGCAAAAGTTCGCATGTAGTTTAATGGTCGTATTGAATACATTTGATGCACAACCTTTGTCTGATGAAGAGGGAGATGCTAACATCTTGGAGGAAGAGTCAGCAACCTTCAGCATAAAATATCTTACTAGTAGTAAACTGATGGGTTTAGAATTGAAGGACCCAAGTTTTCGGCGTCATGTTCTTATGCAGTGCCTTATATTGTTTGATTATCTAAAGGCCCCAGGAAAAAATGAGAAAGATATTCCATCTGAAACCATGAGAGAGGAAATTAAATCTTGTGAAGAGCGTGTGAAGAAGTTGCTTGAGGTGACACCGCCCAGGGGGAAAGATTTCCTTCAGAAGATTGAGCATATATTACAACGGGAAAATAATTGGGTATGGTGGAAACGTGATGGTTGCGCTCCTTTTGAAAAGCAACCGATTGAAAAGAAAACCATCAATGACGTAACTAAAAAACGTAGGCCAAGATGGAGACTGGGGAATAAAGAACTCTCTCAATTGTGGAAATGGGCAGATCAGAATCCGAATGCTTTGACTGATCCTCAACGTGTTCGCAGTCCTGCAATTTCTGAGTATTGGAAACCCTTGGCAGAAGATATGGACGAGTCTGCTGGGATTGAAGCTGAATATCATCATAGAAATAACCGAGTTTATTGCTGGAAAGGCCTTCGGTTTTCAGCTCGGCAGGATTTAGAAGGATTTTCTCGGTTCACCGACCATGGCATTGAAGGTGTTGTGCCATTGGAACTCCTGCCACCTGATGTACGAGCCAAGTACCAAGCCAAACCAAATGAGAGATCTAAACGTGCTAAAAGGGAAGAAGCAAAAGGGGCAGTCCAGCAAGTTGATGAAAATCAGATGGCAACTCCAGCTAGTGAGAATGATGGCGAAGGAACCAGAAGTGATCCTGATGGGCCATCGGCAGGGATGGATGTCGATACAGCTATTGCCACGGGCAATGTATCTCAAGGTGGTATTTCTACTCCAGAAGAAAATAAACTAAGCTCTGACACGGATATTGGTCAAGAGGCAGGCCAGTTGGAAGCCGATGCTGAGGTAGAGCCGGGCATGATTGATGGCGAGACAGATGCAGAGGTTGATTTGGACACTGCAGGTTGA MDLSLYLEEFRKAILQVGPPENFALQTVQDVIRPQKHTKLAQDENQLLENILRRLLQELVSSAVQSTEPVMQYGMSIDEKETSQGHIPRLLDIVLYLCEKEHVEGGMIFQLLEDLTEMSTLKNCKDIFGYIESKQDILGKQELFARGKLVMLRTCNQLLRRLSKASDVVFCGRILMFLAHFFPLSERSAVNIKGVFNTSNETKYEKQLPDGFSIDFNFYKTFWSLQEFFCNPASLALASTKWQKFACSLMVVLNTFDAQPLSDEEGDANILEEESATFSIKYLTSSKLMGLELKDPSFRRHVLMQCLILFDYLKAPGKNEKDIPSETMREEIKSCEERVKKLLEVTPPRGKDFLQKIEHILQRENNWVWWKRDGCAPFEKQPIEKKTINDVTKKRRPRWRLGNKELSQLWKWADQNPNALTDPQRVRSPAISEYWKPLAEDMDESAGIEAEYHHRNNRVYCWKGLRFSARQDLEGFSRFTDHGIEGVVPLELLPPDVRAKYQAKPNERSKRAKREEAKGAVQQVDENQMATPASENDGEGTRSDPDGPSAGMDVDTAIATGNVSQGGISTPEENKLSSDTDIGQEAGQLEADAEVEPGMIDGETDAEVDLDTAG Homology
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93VM9 (THO complex subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=THO1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 892.1 bits (2304), Expect = 3.5e-258 Identity = 444/604 (73.51%), Postives = 508/604 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R3N6 (THO complex subunit 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Thoc1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 220.3 bits (560), Expect = 6.0e-56 Identity = 137/411 (33.33%), Postives = 194/411 (47.20%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96FV9 (THO complex subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=THOC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 218.8 bits (556), Expect = 1.7e-55 Identity = 136/411 (33.09%), Postives = 193/411 (46.96%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9URT2 (Uncharacterized protein P25A2.03 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPCP25A2.03 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 1.3e-26 Identity = 124/506 (24.51%), Postives = 219/506 (43.28%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P59924 (THO complex subunit 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Thoc1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 47.8 bits (112), Expect = 5.3e-04 Identity = 28/92 (30.43%), Postives = 45/92 (48.91%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC63 (THO complex subunit 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499294 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1223.8 bits (3165), Expect = 0.0e+00 Identity = 614/614 (100.00%), Postives = 614/614 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KTL0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G407100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1207.6 bits (3123), Expect = 0.0e+00 Identity = 605/614 (98.53%), Postives = 610/614 (99.35%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CC37 (THO complex subunit 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010121 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1141.7 bits (2952), Expect = 0.0e+00 Identity = 565/608 (92.93%), Postives = 589/608 (96.88%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G1S6 (THO complex subunit 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449893 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1137.9 bits (2942), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/608 (92.43%), Postives = 585/608 (96.22%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HPE8 (THO complex subunit 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466514 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1133.2 bits (2930), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/608 (92.11%), Postives = 583/608 (95.89%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. NCBI nr
Match: XP_008460496.1 (PREDICTED: THO complex subunit 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1223 bits (3165), Expect = 0.0 Identity = 614/614 (100.00%), Postives = 614/614 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. NCBI nr
Match: KGN51016.1 (hypothetical protein Csa_007827 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1207 bits (3123), Expect = 0.0 Identity = 605/614 (98.53%), Postives = 610/614 (99.35%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. NCBI nr
Match: XP_011655214.1 (THO complex subunit 1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1207 bits (3123), Expect = 0.0 Identity = 605/614 (98.53%), Postives = 610/614 (99.35%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. NCBI nr
Match: XP_038892203.1 (THO complex subunit 1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1166 bits (3016), Expect = 0.0 Identity = 581/608 (95.56%), Postives = 595/608 (97.86%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. NCBI nr
Match: XP_038892204.1 (THO complex subunit 1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1144 bits (2960), Expect = 0.0 Identity = 574/608 (94.41%), Postives = 588/608 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. TAIR 10
Match: AT5G09860.1 (nuclear matrix protein-related ) HSP 1 Score: 892.1 bits (2304), Expect = 2.5e-259 Identity = 444/604 (73.51%), Postives = 508/604 (84.11%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0004977 vs. TAIR 10
Match: AT5G09860.2 (nuclear matrix protein-related ) HSP 1 Score: 886.7 bits (2290), Expect = 1.0e-257 Identity = 444/604 (73.51%), Postives = 507/604 (83.94%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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