IVF0003094 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTGAAGTGCATAGCATGTTAGTTGAAATTTAATATTGATTCTGATCTTGTTTTTATTTATAATCTTATTTTTGAGAGGTCAAAACACTTGCTATATTTATAGGCTTCATAGCGCCAAGAATGATCTAAAATTCTAATTCCTTCGCCCAGCAGTAATCTATCCCATGGCGGAAACGGACACGGCGGGCCCTCCGACCACAGATTCTACTCCTTCTTGGTTCACCCCCAAAAGGTGCCTATCTATCCGTTCTTCATGCTTTCAGATTCGTTTTGTTGTTTGGCTGGCGAGAAATACCTTCGTAATCGAGGAAGTCAAAACTTATGTTGACTTTTGAATTAAGCTTACTCAATTAGGGAAAAAGGATGTTTCTCGGAGATTTTGTTGTTTTATTCGTTTTCATCTGGTTTCTGAGCTGGTTACTTCGGTTATTTTGTCCGTGAATGTTCATGATTTGGTGCCTGATTTATTTCGTTATAGAAGAAGCAATTAGTTGGAGTTTTGGAGGAGGGAAATGGATATTTTGTATGCTATAGTTGATCACTTACCTCTGGAAATACAAATATTCCTATAATCGATACTCTCTTGTTCATTTTTTAAGGGAATGGTGCTGAGGTAACAATGTGAGAATTAATTTTGGAAATTCCGAGATATCTGGTCAATGGCATTGCTAGTAAACAAGGGTCACCTGGAACTCAATTGGTGGAATAGTCATTCTGTAAAGTCGCATATTGTCCTGTTTTATCTGTCAGTCCATCCCTCTGGTTTTGACTTTGGTTACTTGATAGTTGATATCTTTTGTTTGCAATGATTCTTCCCAATAATTTAACAAAGGCTCTTTTTCAATTTGCCTGTGGTCGTAAGTTCAAAGACAGGGCCAAGGACTTGTAGGGCAATACCGTTGATATGCTTTTTTGGGAAGAACGAGCGGAGAGACTTCTTAAAATCAAAGAAGCATAAAGGAATTTATGGAATTTAACTAGATTCCTTGGGTTGAATTAGTATGATCTCTAATCAGTTTTGTCCATTCTATCTTCTTGTATATCTTGCCCAATTGTGGAGCCTTTTGGTAACTTATTTGGAGATGTCCTATTCTTCTGGGCATGCTTTGTTCAATAATATTCAGATTCATATGAGAAATTTACAGGAATGATTCAGGGTTTGTTTAGTTTGGTGCTCATTGAGTAAGCATTACCTATTGCCTATTGGCGTAATGTACGAGAAGTACTAAATATTTATTAATTGACTCAGGGATGTATATTGAATGGTCAAGTCAGTACACAAATCATTATAATTTCATTTGCTTTATTGGATTTTGGTTTTTAATTTTCACTTTTAGTACTATGGTTAATTGGAAATGCTATCCATTTATTTGGGACTTATAGGAGATAAGGGGTCTGCGTAGTAGTCGTTGAAACTGAAGATAATGGAACTTTTCATATTGGTCATAGGAATGATGGGTTCATTGTAAATTATCCAGAAAGGTTTCAGTACCAGCCTTCTAGTAAGTCTTGGACTGCAATTAAGTACTATTATTAGCATTATGATCTTTATGCCTTTTTGAAGTTGAAGTGGCTAAGTAACATAGACCAGATCAAACCAAAGGATAAATATAGAGTTTGAAATTTCTAAGTTAAATTTATGTCATGCTACAAAATTTTCAAGTTTTCAGTATATCATTTTTAGTTGTGATCAGTAATCAGTTCATTGAAATTTATCTAGGGTGCACGCCTTTTCAATTGTTATGTGGTTGTAACTTGTAAGTAGTTTTAGTTATCAGAACTTTGGATAAATAAGTGTTATGTACTGTGAATTAATAACTTGAGAATTTTCTCCTCTTTCTTGATCTCTGCAGGCTTCTTGCTGTCTTTTGTGTAATTAACTTGTTAAATTACTTGGATCGAGGAGCAATAGCTAGCAATGGTGTGAATGGAAGTCAAGGAAGTTGCACTGCAAGTGGTACATGCACATCTGGTACTGGGATACAGTAAGATATGATGCCTTTCAAAATGAATGGGGTTGGATAGTCACCATGGCATTGGCAATTTTCTTTGTGGTTCAAAATAGTTAGAATATAAAACAGATCAAAACTCTGAAAAATTATGGAATAGCAAGAATTATAATTTGTGAATCTACCCTTCTTGGCTTAAAATATTTAAACAGATAAGAACTCTTAAAATTTACATACTTAATAATAAAAAAGGTTCTCATGGGCAATGTTATTCATTCTATGCTATTCATTTCCCAAATTAGTCACTTCTAACTTGTAAGTAGTGTTTGACTAATTAAATCTATTTAGTGTTTCATGTTATGTAGGCTGTATGGTGGTTGGTTTTGACACCCTTGTATTTAAATTCTATTGGTATAAAATTAACCTGTTGGCATAAGCTATTTCTTTACCTGACTTCTTTTTGGTCAAACTATTTATAGAGGCGAGTTTAGCTTGACCAATTTTGAGGATGGTGTTCTTTCTTCAAGTTTCATGGTTGGACTTTTGGTTGCTTGTCCAATATTTGCAACACTAGCAGAACGGTAAGTCAATATATTCTATTCTGTTAACTTTCATGGATTGGCCTAGTAGTAAAACAGGAAACATAGTCTCAATACCTAATTTAGAGATCATGGATTCAATTTGTTGTGCTACCTAGGAATTAATTCCCTATGAGTTTTCTTGACACCCAAACGTTGTTGGGTCGAATGGGTTGTCCCATGAGATTAGTCGAGTTATGCCTAAGTTAGCTCAAACACTCACAGATGTAATAGAAAACCTAGTAGAAAATTATAAAAATCCCTGGTAACCAACGTTCAAGTGGAAGAATCAAGTATAGCAAGCAATCCCTTCTCCCCTCCCAAGTTCTCTCACAGCCCCTTATAGTTCCTATTATGCCTCTCGATCCAAAGATCCCAAAGGACTGTGAAAGAACTAGCCTGTCTTAAAATCCAATCCCTAACATGGAAATGTGGATGCAAAGAACGTATTCCAGCATACAATGACAATTCCTATTCCTTGCCAAACAAACATTCAGAAATGAGGGAAAAGATTTTGTCCCAAAAAGACCCGGGCCTAGTATATGATCCGTGCAAGTTCTCCACATAACCCTTGGGGATTCACTGCAAAGGAAGAACCCCCAAAGATTGTTTTCTGAGGTTACAGTGAAGTGAAGCATCTGAATGTGATTAATGTTGTAGCTTGATCTCAATTCTTTGTATTAATGGAGATGTTGAGCGAGTGGATGTGTTTTCTTCTGATTCATCTTACTTTATTTTTTTCCGCAGTGTTAAACCATTTAGGCTAATTGGGGTTGGATTATCAGTTTGGACTTTTGCTGTTATTGGTTGTGCTGCTTCATTTAATTTCTGGTCCATCACAATATGCCGCATGTGAGTAATGTTCTTTTCCTTTCCTTCTTCCCTTCACGTTTCTTTTTTATTTTTCAATTTCAATTTTTGCAGTTTGTTTATTGTCTATCGAGTTTACCATTTTAAAGAACTTTATTTGATTTGAGCTATTTTGATTGAATTTTGGTTCTTGCACTCCATTGCTTGCTTTAGGTTGGTAGGTGTTGGTGAAGCATCATTTGTAAGTCTTGCTGCACCATTCATCGACGACAATGCACCTGCTGCTCAGGTTACATTGCTTTCCAGTTAGGGAATTGCCAGTTAATATTTCCCAATTCATATTTTTGCCATTTGATATTCAAATTCTAAATTTCTGTACACTGACATCATGTTTTTAGTACAAGATTATGAATTTTTCAAAGTTTAAAACAATGGATCGTTGGTATGCAGTATACTTTTGTTTTTTCTTCTGTTCAACGGGACATCAGTTGCATTAATTTTATCAAACTGGTGATATATCAATTTTGGAGCTCAAAACTAAAATGTAAAATAAAAAATGCTACTGGAAATATGTAAACGCTTCTAGTTAAAAGTTATTTTTACTTTGTTTTGTTTCTGCTCAACATTTTGATTCTTGCGGAGTCGATGCTTTCCATTTTTCTTATTTCCTGCAGGCATAGTTACCTTCTAGTTTTGTTTGTTAGTTCTTTATACTTTTGGTTCTTTTTTCCTTTCAGAAAACAGCTTGGCTTGGAATATTTTACATGTGTATACCGAGTGGGTATGCAGTTGGCTATATCTTTGGTGGACTGGTAAATTCTTTTCTCATTGTTTTTCCTCCCTCCTTGTGAAGGACTTTTTACATCATTTTTCTTTTAAACTTTTTGAATATATTGAATGAATTCAAAACATTCATTCTTTGAGCGATTTCTTGTTCATGTCTCTAATAAAGCGGGCATCCATGGGTTTTATTTCATCACTCATGCACTAATCTTCAATAAATATAGGTTGGGGGTAATTATAGTTGGCGCATTGCTTTTATTGGAGAGGCCATATTGATGCTTCCATTTGCTGTTCTGGGGTTTGTTATAAAGCCTTTGCAGTTGAAAGGTACACCTAGAACTGTAATCTTCAAGCAACTTAATGGTTTCTAAATAACTTTAATTACAGGATTTTCTTCTTCTGGATCATATGGAAAGCTGCGATCTGTGGATTTGGTTGCTTCGGATGTTCAAGGTAATCTGTTTCAGGACTTCATCAAGTGCTATCGTTGATACATAAGAAAAATATTGAAGAGAGAAGTTGTACCCCTTTTAAGCTATATCACCTTTGCAAAGAACTTTATAAAAAATGGATAATTACAGAACAGTTTGTCAAGGGTATAGCAAGGTACTTTTCCCTGCAATTCCCTTCCAACCAGAAATCTCAAAATAGTTTTGACTCTTGCCTACATTCAACTGGGTGTTCTTCTGCATGTGAACCATATAATAGTTGTTCATGAAGACTTGATATTGTTTTTTTAATCCCACAGCGGCATAAAATCACAGAAGCATGAGCTAAACTTGCGGCAAAAGAAACATGGTCCCTAAGTTTTGCTCTTTTGTTTTCCCAAAAGAAACAGATTTGGATGGAGAGCTGTATCCGGAATCTTTTATGT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ATGGTTGGACTTTTGGTTGCTTGTCCAATATTTGCAACACTAGCAGAACGTGTTAAACCATTTAGGCTAATTGGGGTTGGATTATCAGTTTGGACTTTTGCTGTTATTGGTTGTGCTGCTTCATTTAATTTCTGGTCCATCACAATATGCCGCATGTTGGTAGGTGTTGGTGAAGCATCATTTGTAAGTCTTGCTGCACCATTCATCGACGACAATGCACCTGCTGCTCAGAAAACAGCTTGGCTTGGAATATTTTACATGTGTATACCGAGTGGGTATGCAGTTGGCTATATCTTTGGTGGACTGGTTGGGGGTAATTATAGTTGGCGCATTGCTTTTATTGGAGAGGCCATATTGATGCTTCCATTTGCTGTTCTGGGGTTTGTTATAAAGCCTTTGCAGTTGAAAGGATTTTCTTCTTCTGGATCATATGGAAAGCTGCGATCTGTGGATTTGGTTGCTTCGGATGTTCAAGAGACGGAAGCTTCATATGGTAATGGTGGTGCATTCTCCATTGCCGAAGATAGCTCAGCAAAATCTTCCAGTTTAGCTACTAACGCGAGGAATCAGCTCTCAAAATTCGTGAAAGAAATCAAAGAACTTTTGGTTAATAAGGTTTATGTTATTAACGTTTTTAGTTTTGTTTTAGGTTATATTGCATATACTTTTGTCCTAGGCGCGTATTCATATTGGGGACCTAAAGCTGGTTACAGCATCTATCATATGGACAATGCTGACTTGATCTTTGGAGGAATAACGGTCGTGTCTGGAGTATTCGGCTCGCTAGGAGGAGGCTATGTCCTAGATTTTATGAGCAACACCATCTCAAATGGTTTCAAGCTTCTCTCTGCAACAACCTTTATCGGTGCAATACTTTGCTTCAGTGCCTTCTGTTTTAAGAATGTTTATGTCTACCTAGCCCTGTTTGCAATTGGTGAACTATTTGTTTTTGCTATTCAGGGTCCTGTAAATTATATCAATCTGGAGGCCGTTAAACCAAGTCTGCGACCATTATCTATGGCTATGTCTACTGTTGCAATCCACATCTTCGGAGATGTGCCATCCTCACCTCTTGTTGGAGTTCTTCAGGACTATATTAACAATTGGAGGGTGTCTGCTCTTATTCTGACAGCTATTTTGTTTCCAACCGCTCTAGTATGGTTTGTTGGTGTATTTCTACCCATTGTAGGCTCATCGGATGGAAACGATCATCTTGAAGATTCCGCAACCAACCAGTCGAGCACAACACCATTACTCGAAGGAAGGTTAATTAAGATAGCTGAATCTTCTTCTGAACCATAA MVGLLVACPIFATLAERVKPFRLIGVGLSVWTFAVIGCAASFNFWSITICRMLVGVGEASFVSLAAPFIDDNAPAAQKTAWLGIFYMCIPSGYAVGYIFGGLVGGNYSWRIAFIGEAILMLPFAVLGFVIKPLQLKGFSSSGSYGKLRSVDLVASDVQETEASYGNGGAFSIAEDSSAKSSSLATNARNQLSKFVKEIKELLVNKVYVINVFSFVLGYIAYTFVLGAYSYWGPKAGYSIYHMDNADLIFGGITVVSGVFGSLGGGYVLDFMSNTISNGFKLLSATTFIGAILCFSAFCFKNVYVYLALFAIGELFVFAIQGPVNYINLEAVKPSLRPLSMAMSTVAIHIFGDVPSSPLVGVLQDYINNWRVSALILTAILFPTALVWFVGVFLPIVGSSDGNDHLEDSATNQSSTTPLLEGRLIKIAESSSEP Homology
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FLG8 (Probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g64500 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 505.4 bits (1300), Expect = 6.5e-142 Identity = 267/420 (63.57%), Postives = 317/420 (75.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IKF6 (Probable sphingolipid transporter spinster homolog 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g22730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 448.4 bits (1152), Expect = 9.5e-125 Identity = 230/390 (58.97%), Postives = 297/390 (76.15%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NMN6 (Probable sphingolipid transporter spinster homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g65687 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 424.9 bits (1091), Expect = 1.1e-117 Identity = 223/413 (54.00%), Postives = 291/413 (70.46%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2CER7 (Protein spinster homolog 3 OS=Danio rerio OX=7955 GN=spns3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 89.0 bits (219), Expect = 1.5e-16 Identity = 107/411 (26.03%), Postives = 169/411 (41.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8WGF7 (Protein spinster homolog 1 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=spns1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 2.1e-15 Identity = 103/406 (25.37%), Postives = 164/406 (40.39%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BYL8 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494846 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 817.8 bits (2111), Expect = 2.2e-233 Identity = 427/433 (98.61%), Postives = 428/433 (98.85%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KZT1 (MFS domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G179120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 781.2 bits (2016), Expect = 2.3e-222 Identity = 402/433 (92.84%), Postives = 418/433 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FMT4 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447236 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 743.4 bits (1918), Expect = 5.3e-211 Identity = 378/433 (87.30%), Postives = 406/433 (93.76%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J8R8 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484474 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 741.9 bits (1914), Expect = 1.5e-210 Identity = 377/433 (87.07%), Postives = 405/433 (93.53%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D6D9 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017695 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 738.0 bits (1904), Expect = 2.2e-209 Identity = 378/433 (87.30%), Postives = 403/433 (93.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. NCBI nr
Match: XP_008454440.1 (PREDICTED: probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 815 bits (2104), Expect = 1.75e-295 Identity = 427/433 (98.61%), Postives = 428/433 (98.85%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. NCBI nr
Match: XP_011653441.1 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 [Cucumis sativus] >KGN53877.1 hypothetical protein Csa_011855 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 778 bits (2009), Expect = 4.95e-281 Identity = 402/433 (92.84%), Postives = 418/433 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. NCBI nr
Match: XP_038904116.1 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 759 bits (1960), Expect = 6.75e-275 Identity = 396/434 (91.24%), Postives = 413/434 (95.16%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. NCBI nr
Match: XP_038904115.1 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 759 bits (1960), Expect = 1.54e-273 Identity = 396/434 (91.24%), Postives = 413/434 (95.16%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. NCBI nr
Match: XP_023547548.1 (probable sphingolipid transporter spinster homolog 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 744 bits (1920), Expect = 1.76e-267 Identity = 380/433 (87.76%), Postives = 407/433 (94.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. TAIR 10
Match: AT5G64500.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 505.4 bits (1300), Expect = 4.6e-143 Identity = 267/420 (63.57%), Postives = 317/420 (75.48%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. TAIR 10
Match: AT2G22730.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 448.4 bits (1152), Expect = 6.7e-126 Identity = 230/390 (58.97%), Postives = 297/390 (76.15%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0003094 vs. TAIR 10
Match: AT5G65687.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 424.9 bits (1091), Expect = 8.0e-119 Identity = 223/413 (54.00%), Postives = 291/413 (70.46%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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