IVF0002129 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTTGAGTGATTGCATCCCACAATCTTTGTAATATCTTTAGAAATACATCATAGTTCAAGATTAGGACAAAAAACGGGCGTGCCGGTCGCCTCGAAACGATGCTGGCAGTGTCCCCAAGCTCGTACTTGCTTGTTTCGTCTCATACATAACTCCATCAATCTGCACCTCACCGACTCCCATTTACATAGCGACGGGAGGCTTTCTTCATTGCAATGTATGGGGTGCTGCCATTCTCTTATCAGCCACCGCCGGAGCTGATTCCACTACGGCGAGTCTATGTCGATGTCTTGAGCTACGTACCAGTCCGCCGTTTTCACCATTGCTTGGATTCTTCTATGCGAAGGTCATGCAAATCACTACGACCTCCTCTTAGCGTATTTCCTCACTTTCTTAAACCCGCAAAACTCTTCCGAGGTTATTCCTCTCCTTGTAATGGAACTAGAATCAAACCTGCTCTCGTTCATTCTCCTTTGCTGGCTGGTGACGGCTACGGTTGTGATGGAAATAACAATGGTGGCTGGAATAATTCGAATCCTTTTGGGGTTTTGGATGGTGGCAGTATGACAGTGATTCTCCCCCATGGTCGGACAATGCCTTCCTTGCCCTCTTTTTTACCTCCATTCTGGGTTGTTTCTGCCTTTTTCAATTGGCAGTAGCGCTAGCACGTAACGATATGAAAACCGAGTCTATTTGGGAAGTAAAAGGAGGTAAGCGAATCCGCCTCATTCTCGATACGTATAGAGATGAGTTCCATGTTGCAACTGGCATGCCGTCGTCTTCGTTATCCTTTTCCTTTGTCAACGTTTGGCTTCGTTGCAGCGATATATTCAAGCGTTTGATGCTTCCGGAGGGTTTTCCAGACAGTGTCACCAGCGACTATCTGGAATATTCTCTTTGGCGAGGCGTCCAGGGGATTGCCAGCCAAGTTAGTGGGGTGCTTGCAACTCAGGTGCCCATTTAAGTTCATCTGTGGTTTCTCTTTCCAATTTCTCATCCAACAAAAATGTAATTTACTGAATTTTGCTTGAACCCTCGTTGGGAACCAGGCACTGCTTTATGCTGTTGGATTGGGGAAAGGAGCTATTCCGACTGCTGCTGCAGTGAATTGGGTACTGAAAGATGGATTTGGATATCTAAGTAAAATTTTTCTCTCAAAATATGGACGGCACTTTGATGTTCATCCGAAGGGATGGAGATTGTTCGCTGATCTTCTGGAAAACGCTGCCTATGGAATGGAAATGTTAACTCCCGCATTTCCCCTCCATTTTGTCGTGATCGGTGCTGCTGCTGGAGCCGGACGATCTGCAGCTGCGCTGATTCAGGTTATTGGAAGTTGATACGTAATTTAATTTACAGACGATATTAGAAGTTATGCCCCATTCCTTGTGTTTGTTGCCTTATGTTTGTATATTTATTCTGCTGGTAAGTTTCTTCGAATGCATAGCTTAATTTGATTTAGATAGTGAAATGCAGAAGTATTAAGTGAAACCAATGGATGGGCAAATTTCTAAGCTTTTGATAGGTCGTGGAGGATCTTGGTTCATGGAATGAGAAGAAGATCAAGATCACAGATCTATTAGATCGCCTTCTCTTTAACAATAGAAGTGGAGGTGGGTAGTAGAGAAGAAGTTTCAGTTTCAAATGTTTATGTTCCTTCAAATTATAGATCAAGAAAGGTGTTTTGGGAAAAACTATAGGGCGTGTCTTTAAAGATATTGTGAGCGACAATTGTAGAGAATCCCCGAAAAAACAAGCCCAAAATGGATCCTGCCTCATCTTTTGACTCTTAAAAATTTTGCCACGCACATATGCCATCATTAGCTAAAAATAACAAATTATCCTTAAATTTGTTTTGCCTTCTTCTCTTCTCGATTTTCTCTTTCTCCACTTTTTCCCCCTCTTCAGTTGCAAGGGTCATTGAATGTGGATTTTCACCAGAGAGGGGGCCGTTGAAAAGTGGGTTTTCTGCCCTGAGTGTGCTCCACTCGCCACTCAACATGGGCCCCTTGACATGTCATGTGTTGCGAGACTTGGGGATTTGACACTTGCTGACGATAATCCTTTACTAAAGAGAAGATGACTGATAGAACACCAATAGACGTGTTAAGGATTACAAGATAGAATTGATGATCTCAATTCTTGAAGGAAGATACAAAACAAACTAAGAACAAAGCAAAAATAAAGAACAATGATAAACGAAACCACCCTCTCTGCCTTTCCTTTCTCTCAAGGAAACTTGCAGAATTCTCCCACCAAATGATCTCTCCTTCTCTCTCCCAAGCTCGGCATATTTAACTACCTCTTTCCTCTAACTAACTATGGTCCCTGGTCCCCACTCTTAGTGCCTTCACTCTCACTAACATGTAGTGTGCCCTCATCCCGGCTAACACGAGCACTATCTTTCTTCCTTCTTCTACTATGAGGTCTAACATTGCATTCCTCCTCCAAAATCACCTTGTCCTCAAGGTGAAATCGGGGAACTGTTGTGTAAAATCATCCCAATCCTCCCAAGTTGCTTCGTGTGGTGGCAGATCTTTCTAGCTGATCAGTACTTCCCAGTTCCCACTCCTTTGTTGTAGGATTCTTTCAATACCCAAACACTTCTTCTGGCATTGTCATCCATTCAAGATTCTCAGTTACATATGGCAGCAGCTGTTGGACCTTGGTGTGATCACCTATCATCTTTTTGAGTTGGAAATCGTGGAAAATTGGATGTATTGAGGTGGTGGCCGGCAGTTCCAATTTATAGGCAACAGAACCTATTCTTTCAATTACTTTGTAAGGTCCAAAGAGTTTTGGAGATAATTTTTCATTCCTTTTCTTTCTCAAGGATGTCTGATGGTACAACCTAATTGCTTTTTTCTCATTCTCCTGTTCAATCACTTTCATCTATGTTTCGCCCTAATTATAGTCTTCCTCAATTATCTCTACTTCCTCCCCATTTTCTCGCACCACCAGGACCCTCAATTCCTCCTGTTCCTTCACTTTACAACGGTGGCTGACATGATATTTTTCTTCACATCGTAAACAAAGGCCCTTTTCCCTCTGAGCTTGGAATTCAGCATTTGTTAGCCTTTTTGATGGTCCTTCACATTGATTCTCACCCGCAGTCACACCTCGCAAGGTTATAGGTTGCATTGGAAAGTTCCCTCCCGTATTCGATTCATTTACATTCACTGGTAAGTTAGTTTTAACGGTAGGGATACTAGTTTGGACCTTACCTCCAGGACTCCCTTTGAAGCCGACTTCTCTCCTTGTAATCTCCTTGTTTTCAATGCGTGGGCCAATTTCATCATTTGAGCGAGCCCAACTGAATTCCAACATTCCATTTCAACCTTGATATGTGGGCTAAGCCCATTCATGAACATTTCCTTCAGTACTTCGTTCGGCAAGTAAGGCAATAGAGCCACCAACTTGTTAAACAAATTTCGATATTCTTCGATAGTCGTTTCTTGTTTAATGGCCAAAAACCTCCCACAAATGGATCCCTCCCTCACCGATGGAAATTGAACTAATAACTGTGGCTTTAGGTTTGCCCAATCCTGGAAGAGTTCACGCTCTTCTTGTGATCTATACCAATCCAATGCCAGACCGTCGAAATTGATCACAACCACCATTCTCTTCTTTGAATACGTTAACTTTTGTTTCTGAAAGTAACGATCAGCCCTGCACAACTACGAATCTGGATTCTTGCCGCTGAAGACCGGCATTTCCACCTTCTTGAATTTGTTTTGATCGGCCAAATTAACCTCTCCTTCAGATTGACTTTTCTTCCCTTTGGATGTCACTTCCTTCATCGTTGCATTTCCCCCTTCAATGAATCTTTCAATCGAATGTCCCTTACTTGATGAGCGTTCCATGCCTTCACTAATATTTGACTTCGCCTTCACCATTCCTTCAATGTATTTCAGAAGCAATTGTTGCTGGTGTTGTTGTTTCTTCGCTTGGATGCCTAGTCTTTCGATGCTCTTTGCCATTGATTCTCTTCAATCGTTGGCAGCCTGTGTAACTCCACTCGTATTTCGAAATGTCTTGATCAAACGCCTCAAGCTTCTCTTCAATCCGTTTCTGTGCCATGGCTAATCAATTCCCATGTACGTACGCTCTGATACCAATATGATAGAATACCAATAGATGTGTTCGCATATATTGATATATTTTTTTGAAACGGAGACAAACCTCTTTATCAATAATAATAATAGAGACTAATGCTCAAAGTTCAAGAGAATTATACAGAGAGTAAAAGGCCTAAAACAGATGCAAACAATAACTAAATCAAACTCAATAATAACAACGAGCTAATCAAAATCCTCTAAATTGAAACCACAAATGAAATCTAGAAAGTAAACTAGGTACAAAGTAATTAAAATAGATGTCAAAAGGAGCCCAAAGTAAGCTGACACGCCCACAAAAGCTTCGAGTTGAGTGGAGAGGGAACATCAAAAGATCAACAAACAGCAAAGCTGAATCTTCACTAAGATAAAACCATAAAACTGCTAAAAATCAATACTTGTTCAACCGGTTGGAAAATAGTTCTTGAGCTTAACTTCTCCTTTGATTCTTGGGAGAGTACTAGTACAAATTGATTTATTTACGAAAGTTCAGTGTTTAAATTGTTAAAAAAATTGATACAATTATGAGTTTGGGATTTTTGTTGATACAACCCTCAAAGATAAGTGTAAATTGACCTTTTCCCGTTATTATTATTATGTTTCTCCTTCCTGTACTTTTCTTTAAAGTTTTCCTTTCATGTGTATTAACATTTTTAATCTACTATGTACACTTGGCCTGCTAGGTTCTTTATCAAAAAAATTATATTAATAGAATACAAACATATAAGTTTTCTCATATTCATCTTTTTTTTTTGACGTATCCAACCGCACATGCATCTTTATTTTTTGTAACTTCAACTCTTCAAGTCATTGATATCTCCCTCGACATCTACATTTAGCTCTTGATTTCAAGTTGAATAACATATATTGCCATTTTACTT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ATGAAAACCGAGTCTATTTGGGAAGTAAAAGGAGGTAAGCGAATCCGCCTCATTCTCGATACGTATAGAGATGAGTTCCATGTTGCAACTGGCATGCCGTCGTCTTCGTTATCCTTTTCCTTTGTCAACGTTTGGCTTCGTTGCAGCGATATATTCAAGCGTTTGATGCTTCCGGAGGGTTTTCCAGACAGTGTCACCAGCGACTATCTGGAATATTCTCTTTGGCGAGGCGTCCAGGGGATTGCCAGCCAAGTTAGTGGGGTGCTTGCAACTCAGGCACTGCTTTATGCTGTTGGATTGGGGAAAGGAGCTATTCCGACTGCTGCTGCAGTGAATTGGGTACTGAAAGATGGATTTGGATATCTAAGTAAAATTTTTCTCTCAAAATATGGACGGCACTTTGATGTTCATCCGAAGGGATGGAGATTGTTCGCTGATCTTCTGGAAAACGCTGCCTATGGAATGGAAATGTTAACTCCCGCATTTCCCCTCCATTTTGTCGTGATCGGTGCTGCTGCTGGAGCCGGACGATCTGCAGCTGCGCTGATTCAGGCTTCTACTAGGAGTTGTTTCTATGCTGGCTTTGCTGCTCAAAGGAATTTTGCCGAGGTGATTGCGAAAGGTGAAGCACAAGGAATGGTGAGCAAGTCTATTGGTATGATGCTTGGCATTACATTGGCCAATCATATAAGGTCCTCAACATCACTTGCTCTTGGGTGCTTTAGCATAGTGACCTTAATCCACATGTTCTCCAATCTAAAATCATACAAGTCCATTCAACTAAGGACATTAAATCCTTATCGTGCAAGTTTGGTCTTCAGTGAATATCTGTTTAGTGGTGAGGTGCCTTCGATTAAAGAAGTGAACAATGAAGAACCTCTTTTTCCGGCTGTACCACTCCTTAATACAAGGCTTGGTTGTGATGAGCCAAAATTGGGCTTACTATCTGCTGAAGCAAAGGAATCAGCAGCTAATATTGACCAGCGACTGCAATTGGGTTCGAGGCTCAGTGATGTGGCCACCTGTGAGGCGGATGTTCTTGAACTCTTAAGTCTGTTTAATAAAGAAAATTATATTCTATCAGAGCACAGGGGAAAATATTGTGTAATGCTTAAAGAAAGTGCTTCACCTGTAGACATGCTGAAGGCGGTGTTTCATGTCAATTATTTGCATTGGTTAGAGAGAAACGCAGGAATAACAGCAAGAAGTGCTTCTAATGACTGCAGACCAGGAGGAAGGCTACAAATGTCTTTGGAGTATGTGGAGAGGGAATTCAAGCATGTCAAATATGATGGGGAATTGGCTGGTTGGTTGACTGATGGCCTAATTGCAAGGCCCTTAACTACTAGGATTTGTGAATGTCATGTAACTTAG MKTESIWEVKGGKRIRLILDTYRDEFHVATGMPSSSLSFSFVNVWLRCSDIFKRLMLPEGFPDSVTSDYLEYSLWRGVQGIASQVSGVLATQALLYAVGLGKGAIPTAAAVNWVLKDGFGYLSKIFLSKYGRHFDVHPKGWRLFADLLENAAYGMEMLTPAFPLHFVVIGAAAGAGRSAAALIQASTRSCFYAGFAAQRNFAEVIAKGEAQGMVSKSIGMMLGITLANHIRSSTSLALGCFSIVTLIHMFSNLKSYKSIQLRTLNPYRASLVFSEYLFSGEVPSIKEVNNEEPLFPAVPLLNTRLGCDEPKLGLLSAEAKESAANIDQRLQLGSRLSDVATCEADVLELLSLFNKENYILSEHRGKYCVMLKESASPVDMLKAVFHVNYLHWLERNAGITARSASNDCRPGGRLQMSLEYVEREFKHVKYDGELAGWLTDGLIARPLTTRICECHVT Homology
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7X6P3 (Protein root UVB sensitive 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 612.1 bits (1577), Expect = 5.2e-174 Identity = 304/448 (67.86%), Postives = 369/448 (82.37%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84JB8 (Protein root UVB sensitive 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 180.6 bits (457), Expect = 3.9e-44 Identity = 129/438 (29.45%), Postives = 219/438 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YU2 (Protein root UVB sensitive 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 1.8e-41 Identity = 124/436 (28.44%), Postives = 199/436 (45.64%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91W34 (RUS family member 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rusf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 2.9e-39 Identity = 92/257 (35.80%), Postives = 146/257 (56.81%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q499P8 (RUS family member 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Rusf1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 3.8e-39 Identity = 91/257 (35.41%), Postives = 146/257 (56.81%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BP56 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491686 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 910.6 bits (2352), Expect = 2.6e-261 Identity = 455/457 (99.56%), Postives = 457/457 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F2S0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 823.2 bits (2125), Expect = 5.5e-235 Identity = 406/452 (89.82%), Postives = 431/452 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F1U0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 818.5 bits (2113), Expect = 1.4e-233 Identity = 406/453 (89.62%), Postives = 431/453 (95.14%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7M2 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482094 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 814.3 bits (2102), Expect = 2.6e-232 Identity = 402/452 (88.94%), Postives = 429/452 (94.91%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D4K5 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016908 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 4.4e-232 Identity = 405/456 (88.82%), Postives = 425/456 (93.20%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. NCBI nr
Match: XP_008449956.1 (PREDICTED: protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 910 bits (2351), Expect = 0.0 Identity = 455/457 (99.56%), Postives = 457/457 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. NCBI nr
Match: XP_011651345.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650562.1 hypothetical protein Csa_009558 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 882 bits (2278), Expect = 0.0 Identity = 441/457 (96.50%), Postives = 447/457 (97.81%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. NCBI nr
Match: XP_038881395.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 876 bits (2263), Expect = 0.0 Identity = 435/456 (95.39%), Postives = 445/456 (97.59%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. NCBI nr
Match: XP_031738101.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 835 bits (2157), Expect = 7.57e-302 Identity = 423/457 (92.56%), Postives = 428/457 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. NCBI nr
Match: XP_022934442.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 822 bits (2123), Expect = 1.76e-296 Identity = 406/452 (89.82%), Postives = 431/452 (95.35%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. TAIR 10
Match: AT3G45890.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 612.1 bits (1577), Expect = 3.7e-175 Identity = 304/448 (67.86%), Postives = 369/448 (82.37%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. TAIR 10
Match: AT1G13770.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 180.6 bits (457), Expect = 2.8e-45 Identity = 129/438 (29.45%), Postives = 219/438 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. TAIR 10
Match: AT5G49820.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 171.8 bits (434), Expect = 1.3e-42 Identity = 124/436 (28.44%), Postives = 199/436 (45.64%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. TAIR 10
Match: AT2G31190.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 150.6 bits (379), Expect = 3.1e-36 Identity = 85/250 (34.00%), Postives = 140/250 (56.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0002129 vs. TAIR 10
Match: AT2G31190.2 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 150.6 bits (379), Expect = 3.1e-36 Identity = 85/250 (34.00%), Postives = 140/250 (56.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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