IVF0001076 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GACAGTCGTAGAATTTTTTTTGATTTCTGGTAATATCGTGTAATTTTACCTCCTTTTCTGTCTCGCCTTCTCCCACCGTCCTCTTTCTGCCGTGGCCGCTCCATCTGCCCTCCCCACCGTCTTCTTACTGCGGCACCCACGTCCGCAGCCGCACCGACGCCGCCTTCACATCGTTGCCATTGGTAAGCTCCGTGGGTTTCTTCCTTTCTTTCTCGTTCGGTCTTCTTCCTCTCCCTCGCTTTTCACTTCCGTTTCCCTCTTTTTTAAAACCTTGCCATTCCAATGTGCTTAGTAACAAAAAGGAACCACCGCCAGAAACACCTGGCGAAAGTTGGCAGCACCTAGAACTTGGGAGCAGGCAGCCGCATAGCAGGTTAGGCTGAGCTCCTGGGATGAGTAGCAGCATCGAATACATCAACGAAGGGGTGAAAACGACAGCAAAGAAAATGGTTAAAGAGGGTGAGATTTTTGCGTCTTGTACTTTCGCCAGCCTCGGTCTGGACCCTACTCTATGCGACCAACTCCGAGGTGTGTTGTGTGCCGACTTTATTCTCTTCTTTTTCCATGTCTATTTATTACCTGCCTTCTGCTACGCTAATCGTTCTAGATTTTTACTTCAAGAGCTGTTGAAGATCTAGGGTATTTGATTAATTGCACTGATTCTCATCTTGGCCTGCATCTTTTGGTGTCACGTTTCTTCCATCTGGACAGATAAAATGGGATTTGAAGTTCCTACGCTTGTACAGGCTCAAGCAATTCCGGCTATTTTATCCAGGCGTCATGTGTATCCTTTGAGGTTTTTGCCCCCTCAATGAAAGTTGTTGCCTGATCAATCAAATTATTTATGATAAGAAACTGATATTCTATTATAGAAAAACACATACAAAAAGGGGCTATTTGGATATGGACATTGATTCTCTATCTTGATCACATGTAATTGCATTGAAGGGTGCATCTATCTTTTGATATTTAGTTTTCTTAACTTCGTCATGTAGTCTTGTTAATGCAGCCACAGGCACAGGCAAAACAGTTGCGTATTTGGTTCCAATCATCCATCACTTGCAGAAATCCACTCGTAGGACTCAGCGCGCTGATGGAACTTTCGGTGCGTAACATCAATGAATTTTTTTCACTCTCAATTTTGCCTTTGCCTAATTATTTGTGGGATGTTTTCAAATGTAATAAAATGGACCAAAATATTTACAAATCTAGCAATATGTCACTGTCTAGACACAAATAGTAGTCTATCCCAATTAGACTATGATATTTTGCTATATCTGTGAATACTTTCAACAATTTTATCATTTATAATAATTTTAAATTATTTATTTATATAATTTCTTCCCAATTATTTTTAAATATGCATACATATTTATAAGTATAGTATAGAAAACAAGAGACTAGTGCCTCCTCCCTAAAGGGGGTCAAACAAAACCTTCTCATTCTAGTTTTTTCAGTGAGGAGTTCTAATTAGCCTACAAAAATCTGGATTCCTTCTGTAACCACCAATCGGATTTCATGTTACCAAGTACATATATCGTTAGGATTGGAGTGGGCCAAATGAACTAGAAGAACTTGACATGCAAGTTCCATACCTCTTCAATCCTATGATTGATTGGATCTTGAGAGAGGTAATAACGCAAGATGGGTTTTCATTTTTCTCTCTGATTTACAATTACCTTGGGGAGGCACATCGTTTTTTTTTTAAACGGAGACAAACTTTTTTATTAATGATAGAAACTCAAAATACAAGAGAGATATACAATGAGTGTAATAAAGAAGCCTAAAGAGCAAAAAGCAGACAAGATCAGGAGGGGCACTCGGACATCTCAACTAGGTCGACACCCCATAGCACCAAAACATCATATTCCAAATAAAACACAAAGCGAACAGACGAAGTAATGGATAATAATCAACAATGTCCAACTAAAATATAGAGGGCCAAGACAAAGGAAAAATGGAAAGAAATAGAAACAAAACAGAACCAAAACCAGTATCGAAAAAACTGAGCCTAACAAAACAACTATAGTCAAAACAAGACCAAATAAAAAAACTAAGCTCCAAAGAAGGCCTACCGAAGAGTCGACACTCCTCTCTGAATTCCAAACTTCTAAACTTGGTATTTGACGCAACAAATCCCGATGATTACTGAAACCCCCTTGACATTTTCAATTATGCTGTAATTCTGCTCCCACGACAACATTTAAAATTATGTCATCAATCAAAACAGATAAAATTTTCAAATGCACAACGCTCATGTCTGTTTTACTCCCAAAAATCCACTGAAATGTGTTCTGAACGGTAATATGGACAATATCAAGCTTCAAAGAATCAAGACTGACTGATCTTCGGGGCATTAATATTATAGGCTTTGAAAGAGAAAGATCCAACTTTGAAGCAGGCTAACCTTCTATTTCAGTAGTGGTAAACCGCTACTCTGAATTCGTTACTTTATCTTTTAACTTGACAACACCCTCAACATTTTCAGGGACAAGATCCACAAAGTAACTAACAACCTCTTGGACAAATCAATTCAAAGATGCAACAGACACTCTGAAAGGTTCCCCAGAAGATTGTATTCATAACTTATGTAATCTTCCTCATCAAAATTGAATGAAGAAAAGAATAGCTCAACGAAAGAAACTCCACCAGGATTTCTCATATCACATGCCCAATAATACATGTGGCTGCTTGAAAGACTATCATCACTTATTCTTAGATTTCCGAGAGTACCCTCTATACTAAAAGAGGACAGAAACACCTTGATATTAGCAAGCAAGTTTTCCTGAAGCAAACTTGCTAGATTACTTTCATTTTCCTTCACTAGAAAAATTTGTGCACAAGACAACTTCAATTCTAAATTGAATACAACTCTAGACCTCCCTTTTCCTAGCAAACTTTTCACAATGCCATCCTCCGTGTTCTTTGGAAACTGTTAATCGTCTTCGATTTGGATATCATGCTTTATGATGCCTAATGATGAATTATCACCGAATGTTTAACAACTTTCTTCCTCTAGGTTAATGGCATTGGCGAACTCAACGAGGGCTAAGACAAACTTTAAGTTCATCAAGAGAACCAGTCAAAAATACCCTCTCTATAGATGAATCCATGGTACCATCACTTTCATTTGGTTCCATTTTAGAGTCCTTAGAGTTTGAGGAAGTTTTAGATAGACCCAAAATAGGAGCAGAGGCCTCAATAACCGAAATCGAACTGTCGTCCCATATAGTCAGAATTCCCCCTGAAGAGCCAACTGATTCCACAAAGTCCCAACCAATATCTCTAGAGCTCTGTAGAGATTTTATAAAGATAGCATTTATAGCTTCCATTTTTCATTCTTGAATCATGAAAATGTCCGGATTGCAATTTTTGTGAATTTTTTAGAGCTGCTCGCTTAGGGGTGTCTTTTAGGCCTCTTGTGTTCCAGGAAACTAACTTCATGAGGTTGAATGAAAGAAAATAATACTAGATTGTCTCCTTAGACCAAAATAATACCAGTCATTGACTAAAGACAGCATATCCTTGGGCAAATCCGAAGGGACTTTGATAGGAGGGAAGACAACTTCATCAAATAGTGCAGTAAGGTTTTCCCCTTCATTCTCTGCATTAATCTTATGATCAAAAGCACTTAGGATACCCACTGATTCTTCATTGCTGACATTGAAAGGTGAATGTAAAGCCTTAGCAAGATGCTTCTCAGAGGAGTTGGTGAATGACGAGGGGAGCCTCGCAACAGAGTTACATTTGTGTTAGAGTTGGGGGGTTTATAGTAGTGAAAAGACTTGGTAGGGGAGCCTGTGGAAACTGACCTGTTGAAGCAATCAGAGGATTGAGTTTTAGTGCTACACACTGCCAAGATATCAGGGTCTTTTTGCTGAGATGGATGGCTTTGTTCGGTGGATGCAAGAAGGGGCTGAAAGTGGAGCTTTGAGAGAGCAAAATTCGTTCAGTTCAAATTTTAAGAGGGCTGTCCATAAGTTGTTGAAAGAAGTTTGCTTTCTGATGTAGTGCTTAAGAATTTTTGGGGCTTGGAAGGTTTTTCCTCCTTTGGGTGGGCCCTTGGGCTGACAGTAAAGGGAATTGCAGTGGCCGAATTAGAGATTAGTAGCTGTTTAGGAGTGGCCGAATCTTTAATTACTATGGAGGAAAAATCATAATTACTCATGATAGTAATTAAAGGGGCTTTTCCCTTGTTTCTTTCACTTACTGGCTCTTTAACAGCTGGATTAATAAGGTTTAAACTATTTCCACTGGGCTCCATTACTTTTTGAAACAGCTATGTTGATTGGGTTTGACATTAATCAAAGACTGTTTAGTTGCTCGCCTAATTAGATCATTTGCCAACTGTATGCTGGCACTTGTCTTCTCCGGCACCGGTGAGGAGGTCGGAAAATGTGGCGTTTTACAGAAGAAGGTTGCGTTTTAAGGAAAGACAACGCAAGGTGAAAGTTTGTGGCAGTGAAGTAGGCGTTCGATAGACCACCGGTTGTTATACAATATAGTAGGAGGAAAAAGGGTGAATTGGCACGTGCACAAGAGGAAAGAAGTGGAGGAAGTGGAAACCACCTTGGTGGGGACCATGATTAGTTACATGGGAAGAGGTTGAAAGGGAAAGAAGGAAGGGAAGATGGGGGTGGTTATTCTGATTTGGAAGTGAAAGGCTGTGGTTTCCTGAAGATGGGGGTGGTTATTCTGATTTGGAAGTGAAAGGCTGTGGTTTCCTGAAGAACAGGAAATGCAGAAAGTGTTCGGTTACTTGAAGTTTCTTAACAGTTATTTCCTTTATCGTGTTGTATTTTTCTATCTTTGATGTTTTTACTTTGAATTTGGTTAATGTTGGTAGGAAGTATTGTGTTGTACCGTGTTTAAAGACTGGTTTTGAGTACTTTTTCCTGTAATATTTTGGTTGTTTAATGAATACATAAACACATTACTTGGTGTTCTATCATTTTGGTATCAGAGACATTCGAATCTGTGAAGATTATTACCAT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ATGAGTAGCAGCATCGAATACATCAACGAAGGGGTGAAAACGACAGCAAAGAAAATGGTTAAAGAGGGTGAGATTTTTGCGTCTTGTACTTTCGCCAGCCTCGGTCTGGACCCTACTCTATGCGACCAACTCCGAGATAAAATGGGATTTGAAGTTCCTACGCTTGTACAGGCTCAAGCAATTCCGGCTATTTTATCCAGGCGTCATGTTCTTGTTAATGCAGCCACAGGCACAGGCAAAACAGTTGCGTATTTGGTTCCAATCATCCATCACTTGCAGAAATCCACTCGTAGGACTCAGCGCGCTGATGGAACTTTCGCGTTGGTTCTTGTACCGACGCGAGAGCTATGCATGCAGGTCTACGAAAGTCTACAAAAACTATTACAACGTTATCACTGGATTGTCCCTGGTTACATAACAGGTGGAGAAAGTCGGTCGAAAGAGAAAGCGAGGTTGCGGAAAGGTATATCAATTTTAGTTGCAACACCAGGTCGGCTCTTGGATCATTTAAAGAACACATCATCCTTTTTGTACTCAAATTTGCATTGGATAGTGTTTGATGAGGCAGATAGAATTTTCGAATTAGGATGTGGCAAAGAAGTTGAGGAAATACTGGATCATTTGGGCTCAAGAAGGAATATTCATGTCAAAAAGGATAATGCAATTTCAAGTTTTGGATTCCCGCAGCAAAATTTGCTCTTTTCAGCTACCTTAAATGAAAAAGTAATTCATTTTGCCAAAATTAGTTTAGAGAATCCCATTATGATTGGTCTTGATGCTGGCGACAGTGCCCTTGAATTTCAACCATCTGAACGTGGTCGATTTTTGGGACAAGACATAAATGATGAAGTCCAACCCATACGGAAGGAAAAGAGCTTTTCAATTGCAGATTATAAAATTCCAACCCAGTTAGTTCAGAGTTACGTGCAAGCACCTTGTGGTTCTCGGTTGACTGTGCTTTTTTCTGTCCTGAAGTATTTATTTGAGAGAGAATCCTTTGAGAAGATTTTGGTACTCTTTTCAACATGTGATGCTGTAGATTTCCACTACTCCCTATTTGGTGAGTTCAAATTCTCCTCTTCAGAATCAGAATCGAGGCCTGAACATTTGTTTCTTAAATGCAAGATTTTCCGGTTGCATGGGAGTATGAAGCCGGAAGATCGTAGAACAACATTTCAGGCCTTCAAAACAGAGAAGCTGGCTCTTCTTCTATCCACTGATATTGCTGCTAGGGGGTTGGATTTTCCAAAAGTTAGGTGTATCATTCAATATGATCCTCCAGGAGAGGCAATTGAGTATGTGCATAGGGTTGGAAGAACTGCTCGCTTAGGGGAAAGAGGAGACTCGTTGTTATTCCTGCAACCAACTGAAACAGATTATTTGCAAGATTTGCAGAACCATGGTGTATCTCTTACTGAATACCTCTTGTCAAGGTGTTGGATAGTTTTCCAGCTCGTGGCAGGAAGCAGTTTGTAG MSSSIEYINEGVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSRCWIVFQLVAGSSL Homology
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XJN0 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RH17 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 575.1 bits (1481), Expect = 7.6e-163 Identity = 289/457 (63.24%), Postives = 357/457 (78.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DLB9 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=RH17 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 551.2 bits (1419), Expect = 1.2e-155 Identity = 274/473 (57.93%), Postives = 356/473 (75.26%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9H8H2 (Probable ATP-dependent RNA helicase DDX31 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DDX31 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 5.7e-94 Identity = 192/476 (40.34%), Postives = 281/476 (59.03%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NZQ2 (Probable ATP-dependent RNA helicase DDX31 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ddx31 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 332.0 bits (850), Expect = 1.1e-89 Identity = 187/464 (40.30%), Postives = 269/464 (57.97%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q869P0 (Probable ATP-dependent RNA helicase ddx31 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=ddx31 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 314.3 bits (804), Expect = 2.4e-84 Identity = 194/538 (36.06%), Postives = 277/538 (51.49%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CB30 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498955 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 948.7 bits (2451), Expect = 9.3e-273 Identity = 475/476 (99.79%), Postives = 475/476 (99.79%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G427 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450551 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 842.8 bits (2176), Expect = 7.2e-241 Identity = 426/469 (90.83%), Postives = 438/469 (93.39%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G419 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450551 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 842.8 bits (2176), Expect = 7.2e-241 Identity = 426/469 (90.83%), Postives = 438/469 (93.39%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ICQ6 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111474473 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 835.5 bits (2157), Expect = 1.2e-238 Identity = 423/469 (90.19%), Postives = 434/469 (92.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IGD1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111474473 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 835.5 bits (2157), Expect = 1.2e-238 Identity = 423/469 (90.19%), Postives = 434/469 (92.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. NCBI nr
Match: XP_008460014.1 (PREDICTED: DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 943 bits (2438), Expect = 0.0 Identity = 475/478 (99.37%), Postives = 476/478 (99.58%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. NCBI nr
Match: XP_004141076.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 [Cucumis sativus] >KGN60526.2 hypothetical protein Csa_019328 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 903 bits (2333), Expect = 0.0 Identity = 455/478 (95.19%), Postives = 464/478 (97.07%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. NCBI nr
Match: XP_022946514.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X2 [Cucurbita moschata] >XP_023546294.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 837 bits (2162), Expect = 2.33e-303 Identity = 426/471 (90.45%), Postives = 439/471 (93.21%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. NCBI nr
Match: XP_022946513.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_023546293.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 837 bits (2162), Expect = 4.23e-302 Identity = 426/471 (90.45%), Postives = 439/471 (93.21%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. NCBI nr
Match: XP_022975312.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 830 bits (2143), Expect = 1.82e-300 Identity = 423/471 (89.81%), Postives = 435/471 (92.36%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. TAIR 10
Match: AT2G40700.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 575.1 bits (1481), Expect = 5.4e-164 Identity = 289/457 (63.24%), Postives = 357/457 (78.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. TAIR 10
Match: AT5G65900.1 (DEA(D/H)-box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 2.0e-65 Identity = 167/459 (36.38%), Postives = 236/459 (51.42%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. TAIR 10
Match: AT3G18600.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 229.2 bits (583), Expect = 7.3e-60 Identity = 160/470 (34.04%), Postives = 232/470 (49.36%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. TAIR 10
Match: AT5G05450.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 195.7 bits (496), Expect = 8.9e-50 Identity = 131/442 (29.64%), Postives = 209/442 (47.29%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0001076 vs. TAIR 10
Match: AT1G71370.1 (DEA(D/H)-box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 190.3 bits (482), Expect = 3.7e-48 Identity = 128/429 (29.84%), Postives = 201/429 (46.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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