HG10022558 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10022558
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	extensin-3-like isoform X2
Location	Chr05: 25472699 .. 25473934 (-)
RNA-Seq Expression	HG10022558
Synteny	HG10022558

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGGGAAATCTAGGTCTTCAATGGCCTATCTTGTGGCCACAATTTTGGTGGCGACTCTAAGTTTGCCATCGGTATTCGCAGCTGATTATGTTTATTCTTCTCCTCCACCTCCTTATTATGCATACAATTCACCTCCTCCTCCTCCTGTCTATTACTCTCCCCCGCCACCAAAAGTGAAATATGAGTACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTATTCTTCTCCACCACCAGTTTACCACTCTCCACCACCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCACCACCGCCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCCCCACCAAAGAAGTACGAGTATAAATCACCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCGCCTATTTACCATTCTCCTCCACCACCAGTTTACAAATCACCACCGCCACCGAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCCCCACCTCCACCTAAGAAGGACTACGAATACAAATCTCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCTCCACCTAAGAAGAACTACGAATACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTATGAGTATAAATCTCCTCCACCTCCCAAGAAAGACTACGAGTACAAGTCTCCATCTCCACCTAAGAAGGACTACGAATACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAATCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAAAAGGATTACGAGTATAAGTCTCCTCCGCCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCTAAGAAGGACTATGAATACAAGTCTCCTCCACCCCCCAAGAAGGACTACGAGTATAAATCTCCCCCACCGCCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCTCCACCTCCTAAGAAGGATTACGAATACAAATCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCAAAAAGGACTACATTTATGCCTCACCTCCACCACCTCCTTACCACTACTAG

mRNA sequence

ATGGGGAAATCTAGGTCTTCAATGGCCTATCTTGTGGCCACAATTTTGGTGGCGACTCTAAGTTTGCCATCGGTATTCGCAGCTGATTATGTTTATTCTTCTCCTCCACCTCCTTATTATGCATACAATTCACCTCCTCCTCCTCCTGTCTATTACTCTCCCCCGCCACCAAAAGTGAAATATGAGTACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTATTCTTCTCCACCACCAGTTTACCACTCTCCACCACCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCACCACCGCCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCCCCACCAAAGAAGTACGAGTATAAATCACCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCGCCTATTTACCATTCTCCTCCACCACCAGTTTACAAATCACCACCGCCACCGAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCCCCACCTCCACCTAAGAAGGACTACGAATACAAATCTCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCTCCACCTAAGAAGAACTACGAATACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTATGAGTATAAATCTCCTCCACCTCCCAAGAAAGACTACGAGTACAAGTCTCCATCTCCACCTAAGAAGGACTACGAATACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAATCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAAAAGGATTACGAGTATAAGTCTCCTCCGCCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCTAAGAAGGACTATGAATACAAGTCTCCTCCACCCCCCAAGAAGGACTACGAGTATAAATCTCCCCCACCGCCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCTCCACCTCCTAAGAAGGATTACGAATACAAATCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCAAAAAGGACTACATTTATGCCTCACCTCCACCACCTCCTTACCACTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAAATCTAGGTCTTCAATGGCCTATCTTGTGGCCACAATTTTGGTGGCGACTCTAAGTTTGCCATCGGTATTCGCAGCTGATTATGTTTATTCTTCTCCTCCACCTCCTTATTATGCATACAATTCACCTCCTCCTCCTCCTGTCTATTACTCTCCCCCGCCACCAAAAGTGAAATATGAGTACAAATCACCACCACCTCCAGTTTACTATTCTTCTCCACCACCAGTTTACCACTCTCCACCACCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCACCACCGCCTCCAGTTTACTATTCTCCTCCCCCACCAAAGAAGTACGAGTATAAATCACCACCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTCCGCCTATTTACCATTCTCCTCCACCACCAGTTTACAAATCACCACCGCCACCGAAGAAGGACTATGAGTACAAGTCTCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCCCCACCTCCACCTAAGAAGGACTACGAATACAAATCTCCTCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCTCCACCTAAGAAGAACTACGAATACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTATGAGTATAAATCTCCTCCACCTCCCAAGAAAGACTACGAGTACAAGTCTCCATCTCCACCTAAGAAGGACTACGAATACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAATCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCACCACCACCCAAAAAGGATTACGAGTATAAGTCTCCTCCGCCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCTAAGAAGGACTATGAATACAAGTCTCCTCCACCCCCCAAGAAGGACTACGAGTATAAATCTCCCCCACCGCCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTATGAGTACAAGTCTCCACCACCTCCCAAGAAGGATTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCAAAGAAGGACTACGAGTACAAATCTCCTCCACCTCCTAAGAAGGATTACGAATACAAATCTCCCCCACCTCCCAAGAAGGACTACGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCCAAAAAGGACTACATTTATGCCTCACCTCCACCACCTCCTTACCACTACTAG

Protein sequence

MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPPVYYSPPPIYHSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPPPPYHY

Homology

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. NCBI nr
Match: XP_023535223.1 (extensin-3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 691.4 bits (1783), Expect = 4.7e-195
Identity = 390/426 (91.55%), Postives = 395/426 (92.72%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYY+YNS PPPPVY+SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNS-PPPPVYHSPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKS-PPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYE-----Y 120
           YEYKS PPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP  Y      Y
Sbjct: 61  YEYKSPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVY 120

Query: 121 KSPPPPVYYSPPP-----IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 180
            SPPPPVYYSPPP      Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP
Sbjct: 121 HSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 180

Query: 181 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 240
           PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPP
Sbjct: 181 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 240

Query: 241 PPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 300
           PPKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP
Sbjct: 241 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 300

Query: 301 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 360
           PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP
Sbjct: 301 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 360

Query: 361 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPP 412
           PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDY Y SPP
Sbjct: 361 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 420

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. NCBI nr
Match: XP_022976065.1 (extensin-3-like isoform X2 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 685.6 bits (1768), Expect = 2.6e-193
Identity = 387/425 (91.06%), Postives = 393/425 (92.47%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYYAYNS P PPVY+SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNS-PSPPVYHSPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKK-YEYKSPPP 120
           YEY SPPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKK YEYKSPPP
Sbjct: 61  YEYMSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPP 120

Query: 121 P----VYYSPPP-----IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           P     Y SPPP      Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 PKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPP 412
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY Y SPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. NCBI nr
Match: XP_022976064.1 (extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 683.3 bits (1762), Expect = 1.3e-192
Identity = 383/420 (91.19%), Postives = 390/420 (92.86%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYYAYNS P PPVY+SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNS-PSPPVYHSPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPP 120
           YEY SPPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP    Y SPPPP
Sbjct: 61  YEYMSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP---VYHSPPPP 120

Query: 121 VYYSPPP-----IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 180
           VYYSPPP      Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY
Sbjct: 121 VYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 180

Query: 181 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 240
           EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY
Sbjct: 181 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 240

Query: 241 EYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 300
           EYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY
Sbjct: 241 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 300

Query: 301 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 360
           EYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK Y
Sbjct: 301 EYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGY 360

Query: 361 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPPPPYHY 412
           EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY Y SPPPP   Y
Sbjct: 361 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 416

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. NCBI nr
Match: XP_022936362.1 (extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 681.0 bits (1756), Expect = 6.3e-192
Identity = 383/425 (90.12%), Postives = 387/425 (91.06%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLS+PSVFAADYVYSSPPPPYY+YN         SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSMPSVFAADYVYSSPPPPYYSYN---------SPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYE-----YK 120
           YEYKSPPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY SPPPP  Y      Y 
Sbjct: 61  YEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYQSPPPPVYYSPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPP-----IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPPPVYYSPPP      Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPP 412
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY Y SPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 416

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. NCBI nr
Match: KAG6592186.1 (Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 669.5 bits (1726), Expect = 1.9e-188
Identity = 376/416 (90.38%), Postives = 383/416 (92.07%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLSLP VFAADYVYSSPPPPYY+YN         SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPLVFAADYVYSSPPPPYYSYN---------SPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPP 120
           YEYKSPPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY SPPPP    Y SPPPP
Sbjct: 61  YEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYQSPPPP---VYYSPPPP 120

Query: 121 VYYSPPP-IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 180
           VY+SPPP +Y+SPPPP     YKSPPPPK DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS
Sbjct: 121 VYHSPPPQVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 180

Query: 181 PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 240
           PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS
Sbjct: 181 PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 240

Query: 241 PSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 300
           P PPKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKS
Sbjct: 241 PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKS 300

Query: 301 PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 360
           PPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS
Sbjct: 301 PPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKS 360

Query: 361 PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPPPPYHY 412
           PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK Y Y SPPPP   Y
Sbjct: 361 PPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDY 404

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 375.6 bits (963), Expect = 7.4e-103
Identity = 287/450 (63.78%), Postives = 299/450 (66.44%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVATILVATLSLP--SVFAADYVYSSPPPPYYAYNSP----PPPPVYYSPPPPKV 65
           S MA LVAT+LV T+SL   S   A+Y YSSPPPP   Y  P     PPPVY+SPPPPK 
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  KYEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPP----VYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKK-YEY 125
            YEYKSPPPPV + SPPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPPVY+SPPPPKK Y Y
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVY 122

Query: 126 KSPPPPV-YYSPPPIYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPP 185
           KSPPPPV +YSPPP+YHSPPPP    VYKSPPPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPP
Sbjct: 123 KSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPP 182

Query: 186 PPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKNYEYKSPPPPKK 245
           PP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y     Y SPPPPKK+Y YKSPPPP K
Sbjct: 183 PPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVK 242

Query: 246 DYE----YKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE- 305
            Y     Y SPPPPKK Y YKSP PP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y  
Sbjct: 243 HYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSP 302

Query: 306 ---YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 365
              Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPP
Sbjct: 303 PPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPP 362

Query: 366 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 412
           P      Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SPPPPK+ Y YKSPP
Sbjct: 363 P-----VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKEKYVYKSPP 422

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 223.4 bits (568), Expect = 4.7e-57
Identity = 228/428 (53.27%), Postives = 244/428 (57.01%), Query Frame = 0


Query: 15  ILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVKYE----YKSPPPPV 74
           +L  +L+  S   A+Y YSSPPPP   Y+   PPPVY SPPPP   Y     YKSPPPPV
Sbjct: 6   VLAFSLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYS---PPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 65

Query: 75  YYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKY-----EYKSPPPPV-YYS 134
            + SPPPVY SPPPPV Y  PPPVY SPPPPVY SPPPP K+      YKSPPPPV +YS
Sbjct: 66  KHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYS 125

Query: 135 PPPIYHSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPK 194
           PPP+Y SPPPPV    PPP     YKSPPPP K Y     YKSPPPP K   Y SPPP  
Sbjct: 126 PPPVYKSPPPPVKHYSPPP----VYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVK---YYSPPP-- 185

Query: 195 KDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKNYE----YKSPPPPKKDYE----YKSPPPPK 254
               YKSPPPP K Y     YKSPPPP K Y     YKSPPPP K Y     YKSPPPP 
Sbjct: 186 ---VYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 245

Query: 255 KDYE----YKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 314
           K Y     YKSP PP     + SPPP      Y SPPPP     + SPPP      Y SP
Sbjct: 246 KYYSPPPVYKSPPPP----VHYSPPP----VVYHSPPPP----VHYSPPP----VVYHSP 305

Query: 315 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP 374
           PPP     + SPPP      Y SPPPP     + SPPP      Y SPPPP     + SP
Sbjct: 306 PPP----VHYSPPP----VVYHSPPPP----VHYSPPP----VVYHSPPPP----VHYSP 365

Query: 375 PPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP---KKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIY 410
           PP      Y SPPPPKK YEYKSPPPP        Y SPPPP   Y      PP + Y+Y
Sbjct: 366 PP----VVYHSPPPPKKHYEYKSPPPPVHYSPPTVYHSPPPPVHHYS-----PPHQPYLY 373

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M1G9 (Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 213.4 bits (542), Expect = 4.9e-54
Identity = 234/436 (53.67%), Postives = 240/436 (55.05%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYA------YNSPPPPPVYYSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSSPPPVY 89
           YVYSSPPPPYY+      Y SPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP  YSSPPP Y
Sbjct: 325 YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPTYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 384

Query: 90  HSPPPPV-YYSPPPP-VYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPP-VYYSPPPIYHSPPPPV 149
           +SP P V Y SPPPP VY SPPPP Y   P PK Y YKSPPPP VY SPPP Y+SP P V
Sbjct: 385 YSPSPKVEYKSPPPPYVYSSPPPPTY--SPSPKVY-YKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKV 444

Query: 150 -YKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKS 209
            YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKS
Sbjct: 445 YYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKS 504

Query: 210 PPPPKKDYEYKSPPP----PKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDY 269
           PPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPPP     Y SPSP     
Sbjct: 505 PPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPP-----YYSPSP---KV 564

Query: 270 EYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKS 329
            YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKS
Sbjct: 565 HYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVHYKSPPPP---YVYNSPPPPYYSPSPKVYYKS 624

Query: 330 PPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPP- 389
           PPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPP 
Sbjct: 625 PPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVYYKSPPPP 684

Query: 390 ---PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP-----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP---- 411
              P     YKSPP P   +    PPP     P     YKSPPPP   Y Y SPPP    
Sbjct: 685 YYSPSPKVYYKSPPHP---HVCVCPPPPPCYSPSPKVVYKSPPPP---YVYNSPPPPYYS 719

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P06599 (Extensin OS=Daucus carota OX=4039 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 202.6 bits (514), Expect = 8.6e-51
Identity = 176/336 (52.38%), Postives = 196/336 (58.33%), Query Frame = 0


Query: 60  KYEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPP 119
           KY Y SPPPP +  SPPP  HSPPPP +Y  PPP  HSPPPP          Y+YKSPPP
Sbjct: 33  KYTYSSPPPPEH--SPPPPEHSPPPPYHYESPPPPKHSPPPPT-------PVYKYKSPPP 92

Query: 120 PVYYSPPPIYHSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 179
           P++  PPP +   PPP   SPPPP   Y+YKSPPPPK        P P   Y+YKSPPPP
Sbjct: 93  PMHSPPPPYHFESPPPPKHSPPPPTPVYKYKSPPPPKHS------PAPVHHYKYKSPPPP 152

Query: 180 KKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPP 239
              Y+YKSPPPPK        P P+ +Y+YKSPPPPK        P P+  Y+YK     
Sbjct: 153 TPVYKYKSPPPPKHS------PAPEHHYKYKSPPPPKHF------PAPEHHYKYK----- 212

Query: 240 KKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 299
                YKSPPPP   Y+YKSPPPP   Y+YKSPPPPK        P P   Y+YKSPPPP
Sbjct: 213 -----YKSPPPPTPVYKYKSPPPPTPVYKYKSPPPPKHS------PAPVHHYKYKSPPPP 272

Query: 300 KKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 359
                YKSPPPP+      SPPPP   Y+YKSPPPP       SPPPP   Y+YKSPPPP
Sbjct: 273 TP--VYKSPPPPE-----HSPPPPTPVYKYKSPPPP-----MHSPPPPTPVYKYKSPPPP 303

Query: 360 KKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP 396
                  SPPPP       SPPPPK  Y Y SPPPP
Sbjct: 333 -----MHSPPPP-----VYSPPPPKHHYSYTSPPPP 303

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 149.1 bits (375), Expect = 1.1e-34
Identity = 190/412 (46.12%), Postives = 206/412 (50.00%), Query Frame = 0


Query: 21  SLPS------VFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSS 80
           SLPS      +F+     +SPPPP       PPPPVY  PPPP        PPPP  YS 
Sbjct: 406 SLPSPPPPAPIFSTPPTLTSPPPP------SPPPPVYSPPPPP--------PPPPPVYSP 465

Query: 81  PPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYY----SPPPPKKYEYKSPPPPVYYSPPPIYH 140
           PPP    PPPPVY  PPPP    PPPPVY     SPPPP    Y  PPPP    PPP+Y 
Sbjct: 466 PPPPPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPPSPPPPPPPVYSPPPPPPPPPPPPVYS 525

Query: 141 SPPPPVYKSPPPPKKD-----YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEY 200
            PPPPVY SPPPP        Y  + PPPP       SPPPP+      SPPPP + Y Y
Sbjct: 526 PPPPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPPPPPP-----HSPPPPQ-----FSPPPP-EPYYY 585

Query: 201 KSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEY 260
            SPPPP       SPPPP       SPPPP   Y Y SPPPP        P+P       
Sbjct: 586 SSPPPPHSSPPPHSPPPP------HSPPPP--IYPYLSPPPPPTPVSSPPPTP------V 645

Query: 261 KSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEY 320
            SPPPP    E   PPPP    EY SPPPP     Y SPPPP     Y SPPPP   Y  
Sbjct: 646 YSPPPPPPCIE---PPPPPPCIEY-SPPPPPPVVHYSSPPPP--PVYYSSPPPPPVYYSS 705

Query: 321 KSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP------- 380
             PPPP     Y SPPPP  +  Y SPPP      Y SPPPP      +SPPP       
Sbjct: 706 PPPPPP---VHYSSPPPP--EVHYHSPPP--SPVHYSSPPPPPSAPCEESPPPAPVVHHS 760

Query: 381 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPPPPYH 411
           P     + SPPPP     ++SPPPP  +YE   P PP     YASPPPPP++
Sbjct: 766 PPPPMVHHSPPPP---VIHQSPPPPSPEYE--GPLPPVIGVSYASPPPPPFY 760

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IIH0 (extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 685.6 bits (1768), Expect = 1.2e-193
Identity = 387/425 (91.06%), Postives = 393/425 (92.47%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYYAYNS P PPVY+SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNS-PSPPVYHSPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKK-YEYKSPPP 120
           YEY SPPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKK YEYKSPPP
Sbjct: 61  YEYMSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPP 120

Query: 121 P----VYYSPPP-----IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           P     Y SPPP      Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 PKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPP 412
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY Y SPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IMG6 (extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 683.3 bits (1762), Expect = 6.1e-193
Identity = 383/420 (91.19%), Postives = 390/420 (92.86%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYL+AT+LVATLSLPSVFA DYVYSSPPPPYYAYNS P PPVY+SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLLATVLVATLSLPSVFAVDYVYSSPPPPYYAYNS-PSPPVYHSPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPP 120
           YEY SPPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP    Y SPPPP
Sbjct: 61  YEYMSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPP---VYHSPPPP 120

Query: 121 VYYSPPP-----IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 180
           VYYSPPP      Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY
Sbjct: 121 VYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 180

Query: 181 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 240
           EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY
Sbjct: 181 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 240

Query: 241 EYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 300
           EYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY
Sbjct: 241 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 300

Query: 301 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 360
           EYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY+YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK Y
Sbjct: 301 EYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYKYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKGY 360

Query: 361 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPPPPYHY 412
           EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY Y SPPPP   Y
Sbjct: 361 EYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY 416

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F886 (extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 681.0 bits (1756), Expect = 3.0e-192
Identity = 383/425 (90.12%), Postives = 387/425 (91.06%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLS+PSVFAADYVYSSPPPPYY+YN         SPPPPKVK
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSMPSVFAADYVYSSPPPPYYSYN---------SPPPPKVK 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYE-----YK 120
           YEYKSPPPPVYYS PPPVYHSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY SPPPP  Y      Y 
Sbjct: 61  YEYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYQSPPPPVYYSPPPPVYH 120

Query: 121 SPPPPVYYSPPP-----IYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
           SPPPPVYYSPPP      Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYYSPPPPKKDYEYKSPPPPKMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPP 412
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDY Y SPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 416

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FD20 (extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 624.8 bits (1610), Expect = 2.6e-175
Identity = 373/437 (85.35%), Postives = 376/437 (86.04%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSP---------PPPPVY 60
           MGKSRSSMAYLVATILVATLS+PSVFAADYVYSSPPPPYY+YNSP         PPPPVY
Sbjct: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSMPSVFAADYVYSSPPPPYYSYNSPSPPPPVYHSPPPPVY 60

Query: 61  YSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPP----VYYSPPPP----VYHSPPPP-- 120
           YSPPPPK  YEYKSPPPP         Y SPPPP     Y SPPPP     Y SPPPP  
Sbjct: 61  YSPPPPKKDYEYKSPPPP----KMDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 120

Query: 121 --VYYSPPPPKK-YEYKSPPPPVYYSPPPIYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180
              Y SPPPPKK YEYKSPPPP        Y SPPPP     YKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 121 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP---KKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 180

Query: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPP 240
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK+YEYKSPPP
Sbjct: 181 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 240

Query: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSP PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 241 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 300

Query: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360
           PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 301 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 360

Query: 361 PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 412
           PKKDYEYKSPPPPKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP
Sbjct: 361 PKKDYEYKSPPPPKKGYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP 420

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRA7 (extensin-1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013522 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 562.8 bits (1449), Expect = 1.2e-156
Identity = 346/419 (82.58%), Postives = 353/419 (84.25%), Query Frame = 0


Query: 1   MGKSRSSMAYLVATILVATLSLPSVFAADYVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVK 60
           MGK RSSMAYLVA ILVATLSLPSV A DYVYSSPPPPYYAYNS PPP +YYSPPP    
Sbjct: 1   MGKPRSSMAYLVAAILVATLSLPSVMATDYVYSSPPPPYYAYNS-PPPHIYYSPPP---- 60

Query: 61  YEYKSPPPPVYYSSPPPVYH--SPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPP 120
             Y SPPPP YYS PPP Y   SPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYYS PPP KYEYKSPP
Sbjct: 61  -VYHSPPPPAYYSPPPPKYEYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYS-PPPAKYEYKSPP 120

Query: 121 PPVYYS-PPPIYHSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 180
           PPVYYS PPP+Y+SPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPP     Y SPPPP     Y SPP
Sbjct: 121 PPVYYSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPKKDYEYKSPPPP----VYHSPPPP----VYYSPP 180

Query: 181 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPS 240
           PP     Y SPPPP     Y SPPPP     YKSPPPPK DYEYKSPPPPKKDYEYKSP 
Sbjct: 181 PP----VYYSPPPPM----YHSPPPP----VYKSPPPPKNDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 240

Query: 241 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 300
           PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP PKK YEYKSPPPPKKDYEYKSPP
Sbjct: 241 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPLPKKVYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 300

Query: 301 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 360
           PPKKDYEYKSPPPP KDYEYKSPPPPK DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP KDY+YKSPP
Sbjct: 301 PPKKDYEYKSPPPP-KDYEYKSPPPPKNDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPMKDYDYKSPP 360

Query: 361 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK-----DYIYASPPPPPYHY 412
           PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP K+Y+YKSPPPP K      YIYASPPPPPYHY
Sbjct: 361 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPP-KEYKYKSPPPPVKMPSPPYYIYASPPPPPYHY 390

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 375.6 bits (963), Expect = 5.3e-104
Identity = 287/450 (63.78%), Postives = 299/450 (66.44%), Query Frame = 0


Query: 6   SSMAYLVATILVATLSLP--SVFAADYVYSSPPPPYYAYNSP----PPPPVYYSPPPPKV 65
           S MA LVAT+LV T+SL   S   A+Y YSSPPPP   Y  P     PPPVY+SPPPPK 
Sbjct: 3   SPMASLVATLLVLTISLTFVSQSTANYFYSSPPPPVKHYTPPVKHYSPPPVYHSPPPPKK 62

Query: 66  KYEYKSPPPPVYYSSPPPVYHSPPPP----VYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKK-YEY 125
            YEYKSPPPPV + SPPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPPVY+SPPPPKK Y Y
Sbjct: 63  HYEYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVY 122

Query: 126 KSPPPPV-YYSPPPIYHSPPPP----VYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPP 185
           KSPPPPV +YSPPP+YHSPPPP    VYKSPPPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPP
Sbjct: 123 KSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPP 182

Query: 186 PPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKNYEYKSPPPPKK 245
           PP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y     Y SPPPPKK+Y YKSPPPP K
Sbjct: 183 PPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVK 242

Query: 246 DYE----YKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE- 305
            Y     Y SPPPPKK Y YKSP PP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y  
Sbjct: 243 HYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSP 302

Query: 306 ---YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYE----YKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 365
              Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y     Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPP
Sbjct: 303 PPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPP 362

Query: 366 PPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPP 412
           P      Y SPPPPKK Y YKSPPPP K Y   SPPP      Y SPPPPK+ Y YKSPP
Sbjct: 363 P-----VYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHY---SPPP-----VYHSPPPPKEKYVYKSPP 422

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 291.2 bits (744), Expect = 1.3e-78
Identity = 255/398 (64.07%), Postives = 260/398 (65.33%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVKYEYKSPPPPVY-YSSPPP---VYHSPPPP 89
           YVYSSPPPP Y Y SPPPPP  YS PPP   Y YKSPPPP Y YSSPPP   +Y SPPPP
Sbjct: 55  YVYSSPPPPPYIYKSPPPPPYVYSSPPPP-PYIYKSPPPPPYVYSSPPPPPYIYKSPPPP 114

Query: 90  --VYYSPPPP--VYHSPPPPVY-YSPPPPKKYEYKSPPPP--VYYSPPP---IYHSPPPP 149
             VY SPPPP  VY SPPPP Y Y+ PPP  Y YKSPPPP  VY SPPP   +Y SPPPP
Sbjct: 115 PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPP 174

Query: 150 --VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 209
             VY SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP  
Sbjct: 175 PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP-- 234

Query: 210 DYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKK 269
            Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SP PP   Y YKSPPPP  
Sbjct: 235 PYVYKSPPPPP--YVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP-- 294

Query: 270 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 329
            Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP  
Sbjct: 295 PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP-- 354

Query: 330 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 389
            Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPP    Y YKSPPPP  
Sbjct: 355 PYVYKSPPPP--PYVYNSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPP--SPYVYKSPPPP-- 407

Query: 390 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYIYASPPPPPYHY 412
            Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y+Y+SPPPPPY Y
Sbjct: 415 PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPPPYVY 407

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. TAIR 10
Match: AT1G26250.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 255.8 bits (652), Expect = 6.1e-68
Identity = 244/407 (59.95%), Postives = 250/407 (61.43%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYAYNSPPPPPVYYSPPPPKVKYEYKSPPPPVY-YSSPPP---VYHSPPPP 89
           YVY+SPPP  Y YNSP PPP  Y PPP    Y Y SPPPP Y YSSPPP   VY+SPPPP
Sbjct: 40  YVYNSPPP--YVYNSPSPPPYVYKPPP----YIYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYNSPPPP 99

Query: 90  --VYYSPPPP--VYHSPPPPVY-YSPPPPKKYEYKSPPPP--VYYSPPP---IYHSPPPP 149
             VY SPPPP  VY SPPPP Y YS PPP  Y YKSPPPP  VY SPPP   +Y SPPPP
Sbjct: 100 PYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPP 159

Query: 150 --VYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 209
             VYKSPPPP   Y Y  PPPP   Y Y+SPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP  
Sbjct: 160 PYVYKSPPPP--PYVYSPPPPP--PYVYQSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP-- 219

Query: 210 DYEYKSPPPPKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYEYKSPPPPKK 269
            Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSP PP   Y Y SPPPP  
Sbjct: 220 PYVYSSPPPPP--YVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP-- 279

Query: 270 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 329
            Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y Y SPPPP  
Sbjct: 280 PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYSSPPPP--PYVYSSPPPP-- 339

Query: 330 DYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKK 389
            Y Y SPPPP   Y YKSPPPP   Y Y SPPPP   Y YKSPPPP     Y  PP P  
Sbjct: 340 PYVYSSPPPP--PYVYKSPPPP--PYVYTSPPPP--PYVYKSPPPPPYVDSYSPPPAP-- 399

Query: 390 DYEYKSPP----PPKKDYEYKSPPPP----KKDYIYA-SPPPPPYHY 412
            Y YK PP    PP   Y Y  PP P       Y+Y+ SPPP PY Y
Sbjct: 400 -YVYKPPPYVYKPPPYVYNYSPPPAPYVYKPPPYVYSYSPPPAPYVY 401

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. TAIR 10
Match: AT3G28550.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 4.5e-63
Identity = 236/429 (55.01%), Postives = 249/429 (58.04%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYA------YNSPPPPPVYYSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSSPPPVY 89
           YVYSSPPPPYY+      Y SPPPP VY SPPP    P  K +YKSPPPP  YSSPPP Y
Sbjct: 192 YVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPY 251

Query: 90  HSPPPP-VYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPP-VYYSPPPIYHSPPPP-V 149
           +SP P  VY SPPPP  +S PPP YYSP P  K +YKSPPPP VY SPPP Y+SP P  V
Sbjct: 252 YSPSPKIVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVV 311

Query: 150 YKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSP 209
           YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSP
Sbjct: 312 YKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPTPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSP 371

Query: 210 PPPKKDYEYKSPPP----PKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYE 269
           PPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPPP     Y +PSP      
Sbjct: 372 PPP---YVYSSPPPPYYSPSPKIVYKSPPPP---YVYSSPPPP-----YYTPSP---KVV 431

Query: 270 YKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSP 329
           YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSP
Sbjct: 432 YKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSP 491

Query: 330 PPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPK 389
           PPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP 
Sbjct: 492 PPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVLYKSPPPP- 551

Query: 390 KDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYI 410
             Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y+
Sbjct: 552 --YVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPP---YV 577

[Close]

BLAST of HG10022558 vs. TAIR 10
Match: AT4G08400.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 2.9e-62
Identity = 233/429 (54.31%), Postives = 249/429 (58.04%), Query Frame = 0


Query: 30  YVYSSPPPPYYA------YNSPPPPPVYYSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSSPPPVY 89
           YVYSSPPPPYY+      Y S PPP VY SPPP    P  K  YKSPPPP  YSSPPP Y
Sbjct: 87  YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSLPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVNYKSPPPPYVYSSPPPPY 146

Query: 90  HSPPPP-VYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKYEYKSPPPP-VYYSPPPIYHSPPPPV- 149
           +SP P   Y SPPPP  +S PPP YYSP P  K +YKSPPPP VY SPPP Y+SP P V 
Sbjct: 147 YSPSPKGDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSP--KVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPTPKVD 206

Query: 150 YKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSP 209
           YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P     YKSP
Sbjct: 207 YKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVNYKSP 266

Query: 210 PPPKKDYEYKSPPP----PKKNYEYKSPPPPKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPSPPKKDYE 269
           PPP     Y+SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPPP     Y SPSP     +
Sbjct: 267 PPP----YYRSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPP-----YYSPSP---KVD 326

Query: 270 YKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSP 329
           YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSP
Sbjct: 327 YKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPTPKVDYKSPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSP 386

Query: 330 PPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPK 389
           PPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP   Y Y SPPP    P    +YKSPPPP 
Sbjct: 387 PPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP---YVYNSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPP- 446

Query: 390 KDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYEYKSPPP----PKKDYEYKSPPPPKKDYI 410
             Y Y SPPP    P     YK+PPPP   Y Y SPPP    P     YKSPPPP   Y+
Sbjct: 447 --YIYNSPPPPYYSPSPKVNYKTPPPP---YVYSSPPPPYYSPSPKVNYKSPPPP---YV 471

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10022558 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_023535223.1	4.7e-195	91.55	extensin-3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
XP_022976065.1	2.6e-193	91.06	extensin-3-like isoform X2 [Cucurbita maxima]	[more]
XP_022976064.1	1.3e-192	91.19	extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita maxima]	[more]
XP_022936362.1	6.3e-192	90.12	extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata]	[more]
KAG6592186.1	1.9e-188	90.38	Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9FS16	7.4e-103	63.78	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q38913	4.7e-57	53.27	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9M1G9	4.9e-54	53.67	Extensin-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT2 PE=2 SV=1	[more]
P06599	8.6e-51	52.38	Extensin OS=Daucus carota OX=4039 PE=2 SV=1	[more]
Q9T0K5	1.1e-34	46.12	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]

BLAST of HG10022558 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1IIH0	1.2e-193	91.06	extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1IMG6	6.1e-193	91.19	extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476579 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F886	3.0e-192	90.12	extensin-3-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV...	[more]
A0A6J1FD20	2.6e-175	85.35	extensin-3-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443006 PE=4 SV...	[more]
A0A6J1CRA7	1.2e-156	82.58	extensin-1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013522 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of HG10022558 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	5.3e-104	63.78	extensin 3	[more]
AT1G26240.1	1.3e-78	64.07	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26250.1	6.1e-68	59.95	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT3G28550.1	4.5e-63	55.01	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT4G08400.1	2.9e-62	54.31	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR006706	Extensin domain	PFAM	PF04554	Extensin_2	coord: 281..335 e-value: 5.3E-7 score: 29.6 coord: 29..69 e-value: 1.3E-4 score: 22.0 coord: 203..251 e-value: 1.4E-7 score: 31.5 coord: 243..299 e-value: 9.4E-8 score: 32.0 coord: 299..347 e-value: 9.8E-7 score: 28.8 coord: 155..203 e-value: 2.5E-7 score: 30.7
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 210..393
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 134..411
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 397..411
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 143..203
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF21	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE FAMILY PROTEIN	coord: 170..264 coord: 12..179
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF21	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE FAMILY PROTEIN	coord: 231..335
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF21	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE FAMILY PROTEIN	coord: 314..411
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 170..264 coord: 12..179
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 314..411
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 103..231
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE	coord: 231..335
None	No IPR available	PANTHER	PTHR36586:SF21	PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE FAMILY PROTEIN	coord: 103..231

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10022558.1	HG10022558.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall