HG10021924 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10021924
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr05: 18385573 .. 18393228 (-)
RNA-Seq Expression	HG10021924
Synteny	HG10021924

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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ATGCGTCGTAACCCTAGATCGACTACTTCTACTATCTCCTCCAATATACCAGCCGCCATCGCATGGTTCTTTGGTTGCAACCCCCCTCGCCCATCTCTTGGTAATATTTGTTGCAAATTACTTTACCAAAACCCCAGCTTTAAAAGTCCAAATCCAGACTTTTTTTTCTGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCAAAAGTTTTGAAGTTGTAAATAAAATAGTAAATCAACTCATGAAGTTTGATTATGATAAAAAATCCCACTTCTTCTCATCTCTGTTCTTTCATATCCTCAAAGGAGATTCATCCTCCATAGATTGAAATGATGTCTATCTACATTAACCAGGTTTAAATTTCATAAAACCCATCTATCTAGCTATGATATTGAAACTCTAACATTTCGACGTCCTTCTTATAGAAATGAAGCCTTTGGATGGTTTGTCGATATTAGAGGATGTCAACAAATTATCTAAACTATTTTAACTTCTACTCTCAATAGTTTACTTTAATTAATTTTCAATGTAATGTGCCAAGTAATCAAATAAAATAGACATGTCAATGTCAAGTGTATCTTTTCAAACTTAAGAGACCAAATAGACGTTAACCCCAAATCTTAGAGACCAAAAGTGTATTTTGCCTAAAAAAAAATAATTTTCTTATCTTCTTAATTTCCTCATAGCCCTCTTCTTTCTACCTAGCACCTAGTGGAAGAAAAAAAAAGATTGAAGAATTAGAAGGAAAAGAAAGAAGAAGAAAGGATGAAGATATGAATACATTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTATTGCTTAATTTTTTTTAAAGTTTAAGATGTCATTGTTAAAAAATGTCAAACATCTCAATTTAACAAGAACGTTAATAGAAATATTCATAAAATTACAATGTTGATGGATATTTTCCAAATATTATAAAATAAAAAATTCAAAGAATCATTTTAATTGATAAATAAATACTTTATATTTCTAAACAAGTCATTAGATTTATTATTTATATTATATTTATATTAGTAATAATTTTTATATTTTATATTTTATATTAAATTTTTAAGGATATAATGGAAATGTCAATGTGGAACCATGAAAATGTAAAAAATATATCATTGAAAATGTTAGATAAAAATTTAATACCAACTTCTTTTGTGCTTTTATTTTTCTTGTTAGTTTTTTTTATGGGTTGTTTTTAAATATAGAAAAATGAGTCAAACTATTTATAAATATAAAAAATTTTACTATCTATAGACTTCTATCGCAGTCTATCGCTGATACACAATCAAAATTTTCTATATTTGTAAATAATTTGATATTTTTCTATTTATAGTAATTTCTTTTTTATTTAATAAGTCTTGCATGAATAAACTCGTATGGTTGAGTTCTAATTCAACTTTTCTTGAGGCTCGTCTGCCAATCTTTCAATCTGTGAAATTGGTTGTTAATTTGGGCTACACAACTGTTAAATTTAACTTGATCTTCTCAATTCCACTAACCTAATTGGGGTAATTTGAACCAAACCAATCATACTCTCTAAATTGCCCGGCTCAAAGGTGATTCCAATAGTAAGATTACTTTCCTCAAATTTAAGTCCAAAACAGTTAGCAGCCAACCTCCTTTTATTTCAAGTAAAAATTCTTGAATTATCCTCTCAACACAAATTAAAATCAACTTACACACTTTGAGTCTAAACCAAACATAAAATTCATGTCTCCAAGAAAAACTTACCAAAATTAGCTTCATTCGAAAATCACCTCCATTCTCTCAAATCAACACGTTCCTAATCCAACATAAAACATAGGGCTTAAAACCCAATTCATAGTCTTAATTGAAGGATACATGAACCTGCAATGGAAGCGAATTAGGATGCATTACACTCCAACATGTTCAATTTTAAGGATAAACATTCATGCAAAAGAGGGGGAAAATAGAGAGTTATAAATTACAACATCTGTGTAGATCAAATTCTCCTTGATTTCTCCACGAATTGGAACACCAATTGCTTGTAGACCACCACAAAAGTCAACTCTACTATTCTCTGGCCTTAGATTGGATGGTGGGATCCAATTTTGTGGTGAATTTATGAAGGAATGAAGGTTGGAGAAGAAAGAGAGCTCTAGAGAAATTGCGCAAAATTTTCCTTTAAATCCCAAAATTCGTAACCCCAAATGCAGCATAAATTATCCTTATTTATCAAGGATTAACATGCAATCCAATTGCATATCAAATTAATAACAAATCTCTTCAATTTTGTTGGGTAATTGAGGAGTTAACAACCTAAGCTTCTTGCGTAGTTAGTGAGAAGTTCCAATTTTGAAAATTCAATTCTAATTTGAATTTCAAATTCAATTTTAAGATTTAAAAATTCAATATTAATTTGAATTTTAAAATTTAAAAAATAATTAAAAATTAATTTTAAAATAAATATAATATTATTTTAATATCAAATAATAAAATAATATTTTTTTCTAAAAAAATCAATATGAATCCCTATTCATATAAATCATATTTAAATATTATGTTCCTCTCTTTATCCATTTAATTCGTAATTAAATGTTAATACTTTAGATATATCGCATATACCCAACGTTCATTTCCTAAGCCGATTTTGAACGTTTCAAAATTATTCACCATTTTTCTAAGGTTTTATCCATTTGTGAGCTACCAGGGGGACCTAATGGACCTAAAGATCATGAGCTCCAACAATCCAAGATTAACAAGCTAAACTCTTTAACCTAGTTAACCAACATTCGTTAACTAACGAGACACTCCACTAAAGCTCGTAGTTGCCCTCTTCTCACTGTAGGTATATTTCTATCCACTTGATATAACCATAATTAGTAAGTCAGTGCTTCACAGGTTGTCCGTAATCATAGCTAGGTCAAAATTACCATTTTACCCTGTGAATACATCTTGTTTCTTAAGTCCAACTGATCCTCTAATGAACAATTAGTTTGTGATCCTATCACTAAATCGAGTCCCTCTCGGGCTAATGAGAGAGTGGGGCCCTTTATTCAAGACCCGAAATCCGTACTTAAGGGAACAACCTATCCACTAACCCTAAGTGGGGTAGGAGTGAATTCTGATTCGCATGATTATGTCCCCAGCTATCTACTCAGTCGTACCCTTGAAATGGGAAGCATATTGAGTCGGCGAATCCGAGCCACTCTCACCGATGCAGATCTAAGAATAATTTCAAATAAACAGGAGTTTATAGTTAGCTCAGGATTGAGATCGAGTTACCTAGGTCATCTAATTAAAAGTATTTAACAGTAAACGGTGTTATAAAGTAATAGTTGTTGGCTTTTTGGCCCTTAATCTCAAATTAATTAATTTTAATAATAATTAATTAATATTTTGATGATAACAAACCTCCTTTTATACACTAATAATTTTAGTATTTTGAAGTATCGAATGTAGAGTTCGGAACAATGGTTTCAACGCAATTTGAATCACCTAAATCGGAGAACAAACGAAAAAGATATCGCCAAAACAAGCTTAACGGAGAAATACCTGATGTCGATGATGTGGCGGCCAAATCATCAAAGCGGAGCTCTAGAGGATGACAAGTGGAGCAATAGATAAATGACACCTGGTGGACTTTTGATTTTTAGATTGGTTTTAAAAAGAAAATGAATTTAAAAGAAAATGAATTTAATATATTATATATTTGTGTCGAACGGCTAGTTGTCTTTAAAAGAAAAAGAATTTTATATTATTTTATGTTTGTGTCTAACGGCTACTTGAGTTTAAATCTCCACCATTGAATTTTTTTTTAACATCATCCAAATGGTCCAAAATAATGTGGTTTCCAACAACTTTTTTCTCTTTTTAAACACTTCATCTTCTCCAAATTTTCACAACAATTTCATATTATTTTCAATCCTCCATAATTCACCAAGCCACCATTGTTGCTCTCTCTCCAAGCTTCATTTTTTCTTTTCACCTTATTCTTGAGAGAGACATATTGTATTGTGGGGATTTATTTGTTGAGTGCTTAAACTTGCAATTCCACTCTTGAAGAAAGTTTTTAATCTTGTTCTTCATTTCCAAATCTATTGTAAAGGGTTACTCTTGAACCCATAACAAGAGTGTTGTAACGGTTCGATTCTAAGCCGTGGAAAGAGTCAAGTTTGTAGTGACATACCCAAGAGGAGCTTGAAAAGTGGATGTAGGGCGATTGTGCCAAACCACTATAAAATTTTCAGTATCAATTTCTCTATCCCTCTCCTATTTATTTTTTTAATTAATATGTTATTTAATTTTAATTGCATGCTTTTGTTGGTTGAGATTGATTGAGTTGTTTACTTTGATTGCTAGTTCTAAATTTGCATATTTTTTACCAATCTTATTATTAGAATTAAATAGGTGCCTAAAAGGGTATTTTAATTATTTTCATAAAATTCTTGTTTAAATTACTTTATAGTGAAAAATGTATTAATCTGTTTAATTGGACCCATATTAGCAAAAAAAAAATTCATTAGTTTGAAGAAACCCTATTCACCCCTCTAGGGTTGACATACCGATCCTACAATAGTGACTATTTCGTGGTCCAATCTTCTGCACACTCATTGCATAGAACACTCCCACTCACATGTCTACACATGAATGACTCAGGATCATGTATCAAATACAAAGTGGGCCACATTCAATAGTGTCTCCAAGATAAGGTGCATTATCCCTATATTATAGATCTCCCTATATTATAGATCGTTTTGGCTATTTACTCGAACTTGATCTACTTTTATGTGACTACATATAGTTCAAGTATTCATACTATAGCCATGGGCTCTTAGTTTATTAGATTTAGAGTTATATTAACAACCATTCATTTATTCAATAACAAGTTTACTGAATAACCTCGATAACAACTTTATTGATAAATAAAATGCACTTTAGTGTTTACGAGTTTGACATAAAACCCAACATTAATAACAACCCAAAAGGTTTAGAAACCTTGAAGACTTACAAAAAATGTGCCAAAACCTCAGT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mRNA sequence

ATGCGTCGTAACCCTAGATCGACTACTTCTACTATCTCCTCCAATATACCAGCCGCCATCGCATGGTTCTTTGGTTGCAACCCCCCTCGCCCATCTCTTGTGGCAACGCGCAGTGGAGTTGTTGTTGAGAATGCTAGTCGGCTGGAGTTCGAAAATAGGAGGGAGAGGGCGGCTTTGGGGCTGAAAATTGTGAAAGGGAAAGAGGAAGGGGAAGAAGATAAAGCTCATGGAGCTGCTTGCGGCTTGACTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCGTCGTAACCCTAGATCGACTACTTCTACTATCTCCTCCAATATACCAGCCGCCATCGCATGGTTCTTTGGTTGCAACCCCCCTCGCCCATCTCTTGTGGCAACGCGCAGTGGAGTTGTTGTTGAGAATGCTAGTCGGCTGGAGTTCGAAAATAGGAGGGAGAGGGCGGCTTTGGGGCTGAAAATTGTGAAAGGGAAAGAGGAAGGGGAAGAAGATAAAGCTCATGGAGCTGCTTGCGGCTTGACTTGA

Protein sequence

MRRNPRSTTSTISSNIPAAIAWFFGCNPPRPSLVATRSGVVVENASRLEFENRRERAALGLKIVKGKEEGEEDKAHGAACGLT

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10021924 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10021924 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10021924 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10021924 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PROSITE	PS51257	PROKAR_LIPOPROTEIN	coord: 1..26 score: 7.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10021924.1	HG10021924.1	mRNA